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RelatedDiseases

Fusion gene ID: 9014

FusionGeneSummary for CUX1_DGKB

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: CUX1_DGKB
Fusion gene ID: 9014
HgeneTgene
Gene symbol

CUX1

DGKB

Gene ID

1523

1607

Gene namecut like homeobox 1diacylglycerol kinase beta
SynonymsCASP|CDP|CDP/Cut|CDP1|COY1|CUTL1|CUX|Clox|Cux/CDP|GOLIM6|Nbla10317|p100|p110|p200|p75DAGK2|DGK|DGK-BETA
Cytomap

7q22.1

7p21.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionprotein CASPCCAAT displacement proteincut homologgolgi integral membrane protein 6homeobox protein cux-1putative protein product of Nbla10317diacylglycerol kinase beta90 kDa diacylglycerol kinaseDAG kinase betadiacylglycerol kinase, beta 90kDadiglyceride kinase beta
Modification date2018052320180519
UniProtAcc

Q13948

Q9Y6T7

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000437600, ENST00000292538, 
ENST00000393824, ENST00000547394, 
ENST00000360264, ENST00000425244, 
ENST00000292535, ENST00000549414, 
ENST00000556210, ENST00000550008, 
ENST00000546411, ENST00000560541, 
ENST00000399322, ENST00000258767, 
ENST00000403951, ENST00000402815, 
ENST00000407950, ENST00000444700, 
ENST00000406247, ENST00000403963, 
Fusion gene scores* DoF score20 X 18 X 9=32409 X 7 X 7=441
# samples 229
** MAII scorelog2(22/3240*10)=-3.88041838424733
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(9/441*10)=-2.29278174922785
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: CUX1 [Title/Abstract] AND DGKB [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotationOncogene involved fusion gene, in-frame and retained their domain.
Tumor suppressor gene involved fusion gene, in-frame but not retained their domain.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneDGKB

GO:0046486

glycerolipid metabolic process

22627129

TgeneDGKB

GO:0046834

lipid phosphorylation

22627129


check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGALDGBMTCGA-14-0790-01BCUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000437600ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000437600ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000437600ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000437600ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000292538ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

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-
In-frameENST00000292538ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000292538ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292538ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000393824ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000393824ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000393824ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000393824ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-3CDSENST00000547394ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-3CDSENST00000547394ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

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-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-intronENST00000547394ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
intron-5UTRENST00000547394ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000360264ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000360264ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000360264ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000360264ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000425244ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000425244ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000425244ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000425244ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000292535ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000292535ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000292535ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000292535ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000549414ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000549414ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000549414ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000549414ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000556210ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000556210ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000556210ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000556210ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000550008ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000550008ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000550008ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000550008ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000546411ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
In-frameENST00000546411ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-intronENST00000546411ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
5CDS-5UTRENST00000546411ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-3CDSENST00000560541ENST00000399322CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-3CDSENST00000560541ENST00000258767CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000403951CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000402815CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000407950CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000444700CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-intronENST00000560541ENST00000406247CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-
3UTR-5UTRENST00000560541ENST00000403963CUX1chr7

101671425

+DGKBchr7

14881075

-

Top

FusionProtFeatures for CUX1_DGKB


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
CUX1

Q13948

DGKB

Q9Y6T7

May be involved in intra-Golgi retrograde transport.{ECO:0000269|PubMed:15718469}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
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- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
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Top

FusionGeneSequence for CUX1_DGKB


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
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* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
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>In-frame_CUX1_ENST00000292538_chr7_101671425_+_DGKB_ENST00000399322_chr7_14881075_-_222nt
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>In-frame_CUX1_ENST00000292538_chr7_101671425_+_DGKB_ENST00000258767_chr7_14881075_-_222nt
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>In-frame_CUX1_ENST00000393824_chr7_101671425_+_DGKB_ENST00000399322_chr7_14881075_-_111nt
ATGGCGGCCAATGTGGGATCGATGTTTCAATATTGGAAGCGCTTTGATTTACAGCAGCTGCAGGATTTGCGCAAGCAGGTAGCGCCGCTG

>In-frame_CUX1_ENST00000393824_chr7_101671425_+_DGKB_ENST00000258767_chr7_14881075_-_111nt
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GGGGGGGTTGGGGGAGCAGGGGCCGGGGCCGCGCGCGCGAGGCCGGGCCGCGGCCGCCGCGCCCTGGGGCTGCGACTCCGGCTCCGGCTC
GGGCTCGCCATGGCTGCGGCGGTGCCGTGAGGAGGAGTCCGCGTCCTCGGTGGCGGCGGCGGCGGCCGGCTCCAGGCCGGGTTTTGGCGC
CGCCCGCCTGCTGCCTCCTGGCGGCTCCTGAACTCCAGCCCCCTCTCTATCAGCCGCTCACTCCGTCTCAATATGTCTCAAGATGGCGGC
CAATGTGGGATCGATGTTTCAATATTGGAAGCGCTTTGATTTACAGCAGCTGCAGAGAGAACTCGATGCCACCGCAACGGTATTGGCGAA
CCGGCAGGATGAAAGTGAGCAGTCCAGAAAGCGGCTTATCGAACAGAGCCGGGAGTTCAAGAAGAACACTCCAGAGGATTTGCGCAAGCA
GGTAGCGCCGCTGCTGAAGAGTTTCCAAGGAGAGTTCTTTAACACATTATTGAAATTACAAGCATCCAAAGCAGTTTCATGTGGACAGAT
TGCATATTTTGAAAGCCTGAGGTATTTTATCATGAAACATGCCATGTGGAATCTTTGAAGCATAGACCTCTGCGCAACACCTGAATAAAG
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TTTCCATTGGCGTGGATGCCTCCATTGCACACAGATTCCACATCATGAGAGAAAAACACCCAGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAACA
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GGGGGGGTTGGGGGAGCAGGGGCCGGGGCCGCGCGCGCGAGGCCGGGCCGCGGCCGCCGCGCCCTGGGGCTGCGACTCCGGCTCCGGCTC
GGGCTCGCCATGGCTGCGGCGGTGCCGTGAGGAGGAGTCCGCGTCCTCGGTGGCGGCGGCGGCGGCCGGCTCCAGGCCGGGTTTTGGCGC
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TGGTGAAACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA
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CTCAAAAAAAAAAAGGAAAATGTACTTTTCATGGCACGTATAACCCCCAAAGGATTATTCAATACTGAACAATTAAATAATAATTGAATA
ATATTGAATCATGTTCTCCGTTATTTTTCAAATAACTGAATAATATCTCTATTAAAAGATTAAACCCTTGTAACATATATTAAAGCTGTA
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CTGCTATATTTAAATAAAGTTTGAGTAAACTCACATTTGAGAGATTCTGTATAACCTTATTGTGTTTAAAAACATGGAACTTAATTATAG

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TTTATCATGAAACATGCCATGTGGAATCTTTGAAGCATAGACCTCTGCGCAACACCTGAATAAAGAATCTTTTACCTGGTATGTGACAGA
GCTTCTCACCACCACCATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC
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CCAAACAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAGCTTCCTGATGATTTCACTGCACACCTTTTCAT
GTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAAAAGTAAGCCTGCTCTCCTATCAGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGC
CATCACCCCTCCCCGGACTACTTCTCCTGCAAATACGTGTTCCCCAGAAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCT
TGAAAGAGGAAGACCTGAGGATAAGCTTGAGTTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGAGCTAGA
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GAGAGATTCTGTATAACCTTATTGTGTTTAAAAACATGGAACTTAATTATAGTACCTTAATTATTTTCTCAGAAATGATATATACAATAT


Top

FusionGenePPI for CUX1_DGKB


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
CUX1RB1, CREBBP, KAT2B, BIN1, ELAC2, RECQL5, CDK7, CCNA1, CDK1, SATB1, TLE4, MAX, SOX2, KCND3, EHMT2, ECT2, TP53BP1, SUMO2, MAGEA10, HLA-DQA1, STX6, WDR83, PTH1R, GABRE, SLC39A4, NIT1, NTRK1, TACC3, SPATS2L, NFATC1, RBPJ, FOXD3, FOXE1, FOXG1, FOXJ2, GAN, FOXK2, FOXN1, FOXO1, FOXP1, FOXQ1, SLC39A12, EXT2, RAB30, LAMP1, POTEB3, TRIM25DGKBKRT31, PCDHB5


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for CUX1_DGKB


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for CUX1_DGKB


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
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HgeneCUX1C1269683Major Depressive Disorder3PSYGENET
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