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Fusion gene ID: 6804 |
FusionGeneSummary for CEP170_PRKACB |
 Fusion gene summary |
| Fusion gene information | Fusion gene name: CEP170_PRKACB | Fusion gene ID: 6804 | Hgene | Tgene | Gene symbol | CEP170 | PRKACB | Gene ID | 9859 | 5567 |
| Gene name | centrosomal protein 170 | protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta | |
| Synonyms | FAM68A|KAB|KIAA0470 | PKA C-beta|PKACB | |
| Cytomap | 1q43 | 1p31.1 | |
| Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
| Description | centrosomal protein of 170 kDaKARP-1-binding proteinXRCC5 binding proteincentrosomal protein 170kDa | cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit betacAMP-dependent protein kinase catalytic beta subunit isoform 4abprotein kinase A catalytic subunit betaprotein kinase, cAMP-dependent, beta catalytic subunitprotein kinase, cAMP-dependent, catalytic, | |
| Modification date | 20180522 | 20180519 | |
| UniProtAcc | Q5SW79 | P22694 | |
| Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000366542, ENST00000366543, ENST00000366544, ENST00000468254, ENST00000481987, ENST00000490813, | ENST00000370689, ENST00000370685, ENST00000394838, ENST00000370682, ENST00000394839, ENST00000370688, ENST00000470673, ENST00000370680, | |
| Fusion gene scores | * DoF score | 8 X 6 X 7=336 | 6 X 5 X 5=150 |
| # samples | 8 | 6 | |
| ** MAII score | log2(8/336*10)=-2.0703893278914 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | log2(6/150*10)=-1.32192809488736 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | |
| Context | PubMed: CEP170 [Title/Abstract] AND PRKACB [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
| Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation | Kinase involved fusion gene, inframe and retained kinase domain. | ||
| * DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
| Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
| Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
| Tgene | PRKACB | GO:0006468 | protein phosphorylation | 12420224|21880142 |
| Fusion gene information from three resources (ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018)) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| Data type | Source | Cancer type | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| TCGA | LD | BRCA | TCGA-BH-A1EO-01A | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| * LD: Li Ding group's fusion gene list RV: Roel Verhaak group's fusion gene list ChiTaRs fusion database |
| Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| In-frame | ENST00000366542 | ENST00000370689 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366542 | ENST00000370685 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366542 | ENST00000394838 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366542 | ENST00000370682 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366542 | ENST00000394839 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366542 | ENST00000370688 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| 5CDS-3UTR | ENST00000366542 | ENST00000470673 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| 5CDS-3UTR | ENST00000366542 | ENST00000370680 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366543 | ENST00000370689 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366543 | ENST00000370685 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366543 | ENST00000394838 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366543 | ENST00000370682 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366543 | ENST00000394839 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366543 | ENST00000370688 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| 5CDS-3UTR | ENST00000366543 | ENST00000470673 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| 5CDS-3UTR | ENST00000366543 | ENST00000370680 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366544 | ENST00000370689 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366544 | ENST00000370685 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366544 | ENST00000394838 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366544 | ENST00000370682 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366544 | ENST00000394839 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| In-frame | ENST00000366544 | ENST00000370688 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| 5CDS-3UTR | ENST00000366544 | ENST00000470673 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| 5CDS-3UTR | ENST00000366544 | ENST00000370680 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000468254 | ENST00000370689 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000468254 | ENST00000370685 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000468254 | ENST00000394838 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000468254 | ENST00000370682 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000468254 | ENST00000394839 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000468254 | ENST00000370688 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3UTR | ENST00000468254 | ENST00000470673 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3UTR | ENST00000468254 | ENST00000370680 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000481987 | ENST00000370689 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000481987 | ENST00000370685 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000481987 | ENST00000394838 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000481987 | ENST00000370682 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000481987 | ENST00000394839 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000481987 | ENST00000370688 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3UTR | ENST00000481987 | ENST00000470673 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3UTR | ENST00000481987 | ENST00000370680 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000490813 | ENST00000370689 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000490813 | ENST00000370685 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000490813 | ENST00000394838 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000490813 | ENST00000370682 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000490813 | ENST00000394839 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3CDS | ENST00000490813 | ENST00000370688 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3UTR | ENST00000490813 | ENST00000470673 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
| intron-3UTR | ENST00000490813 | ENST00000370680 | CEP170 | chr1 | 243362362 | - | PRKACB | chr1 | 84644860 | + |
Top |
FusionProtFeatures for CEP170_PRKACB |
| Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
| Hgene | Tgene |
| CEP170 | PRKACB |
| Plays a role in microtubule organization(PubMed:15616186). Required for centriole subdistal appendageassembly (PubMed:28422092). {ECO:0000269|PubMed:15616186,ECO:0000269|PubMed:28422092}. |
| Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at . * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
| - In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Hgene | CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366542 | - | 7 | 20 | 23_73 | 210 | 1585 | Domain | FHA |
| Hgene | CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366543 | - | 7 | 19 | 23_73 | 210 | 1461 | Domain | FHA |
| Hgene | CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366544 | - | 7 | 19 | 23_73 | 210 | 1487 | Domain | FHA |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370682 | + | 2 | 12 | 299_351 | 19 | 356 | Domain | Note=AGC-kinase C-terminal |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370682 | + | 2 | 12 | 44_298 | 19 | 356 | Domain | Protein kinase |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370685 | + | 0 | 10 | 299_351 | 62 | 399 | Domain | Note=AGC-kinase C-terminal |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370688 | + | 0 | 9 | 299_351 | 15 | 258 | Domain | Note=AGC-kinase C-terminal |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370688 | + | 0 | 9 | 44_298 | 15 | 258 | Domain | Protein kinase |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370689 | + | 0 | 10 | 299_351 | 15 | 352 | Domain | Note=AGC-kinase C-terminal |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370689 | + | 0 | 10 | 44_298 | 15 | 352 | Domain | Protein kinase |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000394838 | + | 3 | 13 | 299_351 | 22 | 359 | Domain | Note=AGC-kinase C-terminal |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000394838 | + | 3 | 13 | 44_298 | 22 | 359 | Domain | Protein kinase |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000394839 | + | 2 | 11 | 299_351 | 18 | 322 | Domain | Note=AGC-kinase C-terminal |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000394839 | + | 2 | 11 | 44_298 | 18 | 322 | Domain | Protein kinase |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370682 | + | 2 | 12 | 50_58 | 19 | 356 | Nucleotide binding | ATP |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370688 | + | 0 | 9 | 50_58 | 15 | 258 | Nucleotide binding | ATP |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370689 | + | 0 | 10 | 50_58 | 15 | 352 | Nucleotide binding | ATP |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000394838 | + | 3 | 13 | 50_58 | 22 | 359 | Nucleotide binding | ATP |
| Tgene | >PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000394839 | + | 2 | 11 | 50_58 | 18 | 322 | Nucleotide binding | ATP |
| - In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Hgene | >CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366542 | - | 7 | 20 | 1467_1495 | 210 | 1585 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Hgene | >CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366543 | - | 7 | 19 | 1467_1495 | 210 | 1461 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Hgene | >CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366544 | - | 7 | 19 | 1467_1495 | 210 | 1487 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Hgene | >CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366542 | - | 7 | 20 | 1113_1584 | 210 | 1585 | Region | Note=Targeting to centrosomes |
| Hgene | >CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366542 | - | 7 | 20 | 853_1584 | 210 | 1585 | Region | Note=Targeting to microtubules |
| Hgene | >CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366543 | - | 7 | 19 | 1113_1584 | 210 | 1461 | Region | Note=Targeting to centrosomes |
| Hgene | >CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366543 | - | 7 | 19 | 853_1584 | 210 | 1461 | Region | Note=Targeting to microtubules |
| Hgene | >CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366544 | - | 7 | 19 | 1113_1584 | 210 | 1487 | Region | Note=Targeting to centrosomes |
| Hgene | >CEP170 | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000366544 | - | 7 | 19 | 853_1584 | 210 | 1487 | Region | Note=Targeting to microtubules |
| Tgene | PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370685 | + | 0 | 10 | 44_298 | 62 | 399 | Domain | Protein kinase |
| Tgene | PRKACB | chr1:243362362 | chr1:84644860 | ENST00000370685 | + | 0 | 10 | 50_58 | 62 | 399 | Nucleotide binding | ATP |
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FusionGeneSequence for CEP170_PRKACB |
| For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. (nt: nucleotides, aa: amino acids) |
| * Fusion amino acid sequences. |
| >In-frame_CEP170_ENST00000366542_chr1_243362362_-_PRKACB_ENST00000370689_chr1_84644860_+_547aa MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFG YDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP SWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSVKEFLAKAKEDFLKKWENPTQNNAGLEDFERKKTLGTGSFGRVMLVKHKATEQYYAMKIL DKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVRLEYAFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIY RDLKPENLLIDHQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGK VRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCA >In-frame_CEP170_ENST00000366542_chr1_243362362_-_PRKACB_ENST00000370685_chr1_84644860_+_547aa MSLTSWFLVSSGGTRHRLPREMIFVGRDDCELMLQSRSVDKQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFG YDTNLFTVVQGEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKSEEKAMDISAMPRGTPLYGQP 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| * Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region). |
| >In-frame_CEP170_ENST00000366542_chr1_243362362_-_PRKACB_ENST00000370689_chr1_84644860_+_1641nt ATGAGCTTAACATCCTGGTTTTTGGTGAGCAGTGGAGGCACTCGCCACAGGCTGCCACGAGAAATGATTTTTGTTGGAAGAGATGACTGT GAGCTCATGTTGCAGTCTCGTAGTGTGGATAAGCAACACGCTGTCATCAACTATGATGCGTCTACGGATGAGCATTTAGTGAAGGATTTG GGCAGCCTCAATGGGACTTTTGTGAATGATGTAAGGATTCCGGAACAGACTTATATCACCTTGAAACTTGAAGATAAGCTGAGATTTGGA TATGATACAAATCTTTTCACTGTAGTACAAGGAGAAATGAGGGTCCCTGAAGAAGCTCTTAAGCATGAGAAGTTTACCATTCAGCTTCAG TTGTCCCAAAAATCTTCAGAATCAGAATTATCCAAATCTGCAAGTGCCAAAAGCATAGATTCAAAGGTAGCAGACGCTGCTACTGAAGTG CAGCACAAAACTACTGAAGCACTGAAATCCGAGGAAAAAGCCATGGATATTTCTGCTATGCCCCGTGGTACTCCATTATATGGGCAGCCG TCATGGTGGGGGGATGATGAGGTGGATGAAAAAAGAGCTTTCAAGACAAATGGCAAACCTGAAGAAAAAAACCATGAAGCTGGAACATCA GTGAAAGAGTTTCTAGCCAAAGCCAAAGAAGACTTTTTGAAAAAATGGGAGAATCCAACTCAGAATAATGCCGGACTTGAAGATTTTGAA AGGAAAAAAACCCTTGGAACAGGTTCATTTGGAAGAGTCATGTTGGTAAAACACAAAGCCACTGAACAGTATTATGCCATGAAGATCTTA GATAAGCAGAAGGTTGTTAAACTGAAGCAAATAGAGCATACTTTGAATGAGAAAAGAATATTACAGGCAGTGAATTTTCCTTTCCTTGTT CGACTGGAGTATGCTTTTAAGGATAATTCTAATTTATACATGGTTATGGAATATGTCCCTGGGGGTGAAATGTTTTCACATCTAAGAAGA ATTGGAAGGTTCAGTGAGCCCCATGCACGGTTCTATGCAGCTCAGATAGTGCTAACATTCGAGTACCTCCATTCACTAGACCTCATCTAC AGAGATCTAAAACCTGAAAATCTCTTAATTGACCATCAAGGCTATATCCAGGTCACAGACTTTGGGTTTGCCAAAAGAGTTAAAGGCAGA ACTTGGACATTATGTGGAACTCCAGAGTATTTGGCTCCAGAAATAATTCTCAGCAAGGGCTACAATAAGGCAGTGGATTGGTGGGCATTA GGAGTGCTAATCTATGAAATGGCAGCTGGCTATCCCCCATTCTTTGCAGACCAACCAATTCAGATTTATGAAAAGATTGTTTCTGGAAAG GTCCGATTCCCATCCCACTTCAGTTCAGATCTCAAGGACCTTCTACGGAACCTGCTGCAGGTGGATTTGACCAAGAGATTTGGAAATCTA AAGAATGGTGTCAGTGATATAAAAACTCACAAGTGGTTTGCCACGACAGATTGGATTGCTATTTACCAGAGGAAGGTTGAAGCTCCATTC ATACCAAAGTTTAGAGGCTCTGGAGATACCAGCAACTTTGATGACTATGAAGAAGAAGATATCCGTGTCTCTATAACAGAAAAATGTGCA >In-frame_CEP170_ENST00000366542_chr1_243362362_-_PRKACB_ENST00000370685_chr1_84644860_+_1641nt 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AGTTTTCAGTAATCAAAAAGATTTCTATGAATTCTAAAAAATATTTTTTTCTATGAAATTACTAGTGCCCAGCTGTAGAATCTACCTTAG GTAGATGATCCCTAGACATACGTTGGTTTTGAGGGCTATTCAGCCATTCCATTTTACTCTCTATTTAAAGGCCGTGAGCAAGCTTGTCAT GAGCAAATATGTCAAGGGAGTCAATTTCTGACCAATCAAGTACACTAAATTAGAATATTTTTAAAGTATGTAACATTCCCAGTTTCAGCC ACAATTTAGCCAAGAATAAGATAAAAACTTGAATAAGAAGTAAGTAGCATAAATCAGTATTTAACCTAAAATTACATATTTGAAACAGAA GATATTATGTTATGCTCAGTAAATAATTAAGAGATGGCATTGTGTAAGAAGGAGCCCTAGACTGAAAGTCAAGACATCTGAATTTCAGGC TGGAAAACTATCAGTATGATCTCAGCCTCAGTTCTCTTGTCTGTAAAATGGAAGAACTGGATTAGGCAGTTTGTAAGATTCCTCCTAACT TTCACAGTCGATGACAAGATTGTCTTTTTATCTGATATTTTGAAGGGTATATTGCTTTGAAGTAAGTCTCAATAAGGCAATATATTTTAG GGCATCTTTCTTCTTATCTCTGACAGTGTTCTTAAAATTATTTGAATATCATAAGAGCCTTGGTGTCTGTCCTAATTCCTTTCTCACTCA CCGATGCTGAATACCCAGTTGAATCAAACTGTCAACCTACCAAAAACGATATTGTGGCTTATGGGTATTGCTGTCTCATTCTTGGTATAT TCTTGTGTTAACTGCCCATTGGCCTGAAAATACTCATTGTAAGCCTGAAAAAAAAAATCTTTCCCACTGTTTTTTCTGCTTGTTGTAAGA ATCAAATGAAATAATGTATGTGAAAGCACCTTGTAAACTGTAACCTATCAATGTAAAATGTTAAGGTGTGTTGTTATTTCATTAATTACT TCTTTGTTTAGAATGGAATTTCCTATGCACTACTGTAGCTAGGAAATGCTGAAAACAACTGTGTTTTTTAATTAATCAATAACTGCAAAA >In-frame_CEP170_ENST00000366544_chr1_243362362_-_PRKACB_ENST00000394839_chr1_84644860_+_5058nt TTGGAACTGGGCAGGAGGGGATAGGGTCCGGCTCCTCGCCCTTTCCCGAGGCGCCTGCGCACTAGGCAGTCGGTCTTTGCCGTTACCGCT ATGTGTGGGGCGTGTGTGGAATAACGTTATTGCCCAGCGGAGCTGAGGGCCCCGGAGCTCGACCGCAGCGGCAGCGACGACAACAGCGGC GACGACGACGACGACGAGGTGGGGGGAGGACGGCGTGCGAGAGACTCACGGGACGCGACGCGCCCCGCCTCCCCCGTCCGGTCCCTCTCT CCACGGTAAGGGGATGACGTAGCTTTGCCAAAGACTTAGAAGCTAAGCAGAAAATGAGCTTAACATCCTGGTTTTTGGTGAGCAGTGGAG GCACTCGCCACAGGCTGCCACGAGAAATGATTTTTGTTGGAAGAGATGACTGTGAGCTCATGTTGCAGTCTCGTAGTGTGGATAAGCAAC ACGCTGTCATCAACTATGATGCGTCTACGGATGAGCATTTAGTGAAGGATTTGGGCAGCCTCAATGGGACTTTTGTGAATGATGTAAGGA TTCCGGAACAGACTTATATCACCTTGAAACTTGAAGATAAGCTGAGATTTGGATATGATACAAATCTTTTCACTGTAGTACAAGGAGAAA TGAGGGTCCCTGAAGAAGCTCTTAAGCATGAGAAGTTTACCATTCAGCTTCAGTTGTCCCAAAAATCTTCAGAATCAGAATTATCCAAAT 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GTTCCTTAAGGATTTTAGCCAGTATTTTAATAGAACATGATTAATGAAAGTGACAAATTTTAAATTTTCTCTAATAGTCCTCATCATAAA CTTTTTAAAGGAAAATAAGCAAACTAAAAAGAACATTGGTTTAGATAAATACTTATACTTTGCAAAGTCAAAAATGGCTTGATTTTTGGA AACAATATAGAGGTATTCATATTTAAATGAGGGTTTACATTTGTTTTGTTTTGTAACCGTTAAAAAGAAGTTGTTTCCAGCTAATTATTG TGGTGTACTATATTTGTGAGCCTAGGGTAGGGGCACTGCTGCAACTTCTGCTTTCATCCCATGCCTCATCAATGAGGAAAGGGAACAAAG TGTATAAAACTGCCACAATTGTATTTTAATTTTGAGGTATGATATTTTCAGATATTTCATAATTTCTAACCTCTGTTCTCTCAGTAAACA GAATGTCTGATCGATCATGCAGATACAATGTTGGTATTTGAGAGGTTAGTTTTTTTCCTACACTTTTTTTTGCCAACTGACTTAACAACA TTGCTGTCAGGTGGAAATTTCAAGCACTTTTGCACATTTAGTTCAGTGTTTGTTGAGAATCCATGGCTTAACCCACTTGTTTTGCTATTT TTTTCTTTGCTTTTAATTTTCCCCATCTGATTTTATCTCTGCGTTTCAGTGACCTACCTTAAAACAACACACGAGAAGAGTTAAACTGGG TTCATTTTAATGATCAATTTACCTGCATATAAAATTTATTTTTAATCAAGCTGATCTTAATGTATATAATCATTCTATTTGCTTTATTAT CGGTGCAGGTAGGTCATTAACACCACTTCTTTTCATCTGTACCACACCCTGGTGAAACCTTTGAAGACATAAAAAAAACCTGTCTGAGAT GTTCTTTCTACCAATCTATATGTCTTTCGGTTATCAAGTGTTTCTGCATGGTAATGTCATGTAAATGCTGATATTGATTTCACTGGTCCA TCTATATTTAAAACGTGCAAGAAAAAAATAAAATACTCTGCTCTAGCAAGTTTTGTGTAACAAAGGCATATCGTCATGTTAATAAATTTA AAACATCATTCGTATAAAATATTTTAATTTTCTTGTATTTCATTTAGACCCAAGAACATGCTGACCAATGTGTTCTATATGTAAACTACA AATTCTATGGTAGCTTTGTTGTATATTATTGTAAAATTATTTTAATAAGTCATGGGGATGACAATTTGATTATTACAATTTAGTTTTCAG TAATCAAAAAGATTTCTATGAATTCTAAAAAATATTTTTTTCTATGAAATTACTAGTGCCCAGCTGTAGAATCTACCTTAGGTAGATGAT CCCTAGACATACGTTGGTTTTGAGGGCTATTCAGCCATTCCATTTTACTCTCTATTTAAAGGCCGTGAGCAAGCTTGTCATGAGCAAATA TGTCAAGGGAGTCAATTTCTGACCAATCAAGTACACTAAATTAGAATATTTTTAAAGTATGTAACATTCCCAGTTTCAGCCACAATTTAG CCAAGAATAAGATAAAAACTTGAATAAGAAGTAAGTAGCATAAATCAGTATTTAACCTAAAATTACATATTTGAAACAGAAGATATTATG TTATGCTCAGTAAATAATTAAGAGATGGCATTGTGTAAGAAGGAGCCCTAGACTGAAAGTCAAGACATCTGAATTTCAGGCTGGAAAACT ATCAGTATGATCTCAGCCTCAGTTCTCTTGTCTGTAAAATGGAAGAACTGGATTAGGCAGTTTGTAAGATTCCTCCTAACTTTCACAGTC GATGACAAGATTGTCTTTTTATCTGATATTTTGAAGGGTATATTGCTTTGAAGTAAGTCTCAATAAGGCAATATATTTTAGGGCATCTTT CTTCTTATCTCTGACAGTGTTCTTAAAATTATTTGAATATCATAAGAGCCTTGGTGTCTGTCCTAATTCCTTTCTCACTCACCGATGCTG AATACCCAGTTGAATCAAACTGTCAACCTACCAAAAACGATATTGTGGCTTATGGGTATTGCTGTCTCATTCTTGGTATATTCTTGTGTT AACTGCCCATTGGCCTGAAAATACTCATTGTAAGCCTGAAAAAAAAAATCTTTCCCACTGTTTTTTCTGCTTGTTGTAAGAATCAAATGA AATAATGTATGTGAAAGCACCTTGTAAACTGTAACCTATCAATGTAAAATGTTAAGGTGTGTTGTTATTTCATTAATTACTTCTTTGTTT AGAATGGAATTTCCTATGCACTACTGTAGCTAGGAAATGCTGAAAACAACTGTGTTTTTTAATTAATCAATAACTGCAAAATTAAAGTAC >In-frame_CEP170_ENST00000366544_chr1_243362362_-_PRKACB_ENST00000370688_chr1_84644860_+_2631nt TTGGAACTGGGCAGGAGGGGATAGGGTCCGGCTCCTCGCCCTTTCCCGAGGCGCCTGCGCACTAGGCAGTCGGTCTTTGCCGTTACCGCT ATGTGTGGGGCGTGTGTGGAATAACGTTATTGCCCAGCGGAGCTGAGGGCCCCGGAGCTCGACCGCAGCGGCAGCGACGACAACAGCGGC GACGACGACGACGACGAGGTGGGGGGAGGACGGCGTGCGAGAGACTCACGGGACGCGACGCGCCCCGCCTCCCCCGTCCGGTCCCTCTCT CCACGGTAAGGGGATGACGTAGCTTTGCCAAAGACTTAGAAGCTAAGCAGAAAATGAGCTTAACATCCTGGTTTTTGGTGAGCAGTGGAG GCACTCGCCACAGGCTGCCACGAGAAATGATTTTTGTTGGAAGAGATGACTGTGAGCTCATGTTGCAGTCTCGTAGTGTGGATAAGCAAC ACGCTGTCATCAACTATGATGCGTCTACGGATGAGCATTTAGTGAAGGATTTGGGCAGCCTCAATGGGACTTTTGTGAATGATGTAAGGA TTCCGGAACAGACTTATATCACCTTGAAACTTGAAGATAAGCTGAGATTTGGATATGATACAAATCTTTTCACTGTAGTACAAGGAGAAA TGAGGGTCCCTGAAGAAGCTCTTAAGCATGAGAAGTTTACCATTCAGCTTCAGTTGTCCCAAAAATCTTCAGAATCAGAATTATCCAAAT CTGCAAGTGCCAAAAGCATAGATTCAAAGGTAGCAGACGCTGCTACTGAAGTGCAGCACAAAACTACTGAAGCACTGAAATCCGAGGAAA AAGCCATGGATATTTCTGCTATGCCCCGTGGTACTCCATTATATGGGCAGCCGTCATGGTGGGGGGATGATGAGGTGGATGAAAAAAGAG CTTTCAAGACAAATGGCAAACCTGAAGAAAAAAACCATGAAGCTGGAACATCAGTGAAAGAGTTTCTAGCCAAAGCCAAAGAAGACTTTT TGAAAAAATGGGAGAATCCAACTCAGAATAATGCCGGACTTGAAGATTTTGAAAGGAAAAAAACCCTTGGAACAGGTTCATTTGGAAGAG TCATGTTGGTAAAACACAAAGCCACTGAACAGTATTATGCCATGAAGATCTTAGATAAGCAGAAGGTTGTTAAACTGAAGCAAATAGAGC ATACTTTGAATGAGAAAAGAATATTACAGGCAGTGAATTTTCCTTTCCTTGTTCGACTGGAGTATGCTTTTAAGGATAATTCTAATTTAT ACATGGTTATGGAATATGTCCCTGGGGGTGAAATGTTTTCACATCTAAGAAGAATTGGAAGGTTCAGTGAGCCCCATGCACGGTTCTATG CAGCTCAGATAGTGCTAACATTCGAGTACCTCCATTCACTAGACCTCATCTACAGAGATCTAAAACCTGAAAATCTCTTAATTGACCATC AAGGCTATATCCAGGTCACAGACTTTGGGTTTGCCAAAAGAGTTAAAGGCAGAACTTGGACATTATGTGGAACTCCAGAGTATTTGGCTC CAGAAATAATTCTCAGCAAGGGCTACAATAAGGCAGTGGATTGGTGGGCATTAGGAGTGCTAATCTATGAAATGGCAGCTGGCTATCCCC CATTCTTTGCAGACCAACCAATTCAGATTTATGAAAAGATTGTTTCTGGAAAGAACTTTTGATATGAACAAAACAAAACTTTGAGAAAAA TTAACAGACAAGGCAGTGATTTATTTTTGAAGAATTTGAGAAGTGTAGACTCTCAAGAGGACTAAAGGTCATATGAAGAATGATGAGAGA ACCAAAATACATTAAAATCACAAATGGAAGAAGAATATTTTACTAATACAAAAACTAAGAATGTAAATGTTATAATAATTGTTTCAAATC ATTTAATTGACAGTAATTATAAAGTTCTTGAATCTTTACTATATTACTTTTATTTATATTCATATAAGAAATCCAATTTTCTAACAAGGA TACTGTCATAACTAAATTTACATTTATTAAGAAAAACTGCTTTAGTTAAAATTAATGTGTCTTCATTTTTATGCATTGGCCTCGATTTGC CAATCATTCTCTATTGGTTAAATTTTATATTCAGCTGTTTATGAATATATATTCATTTTATATCAAACTTTAAAATTTTGTATCTAATAA TCAGCATATATTCTAAAATCATAACAGTCTAAATCCTGGGCACCTTAGAAGAATGACACCAGAAAACCTTATTATATCACAATATTCTGT TTTCCCCTTCATTTATTTAGAAATATGACAGGATATTTGGTGTACTTTTGTTTTTTAACTAAAAGTACCAGATTATCTCTCCCCATGTGG GATATAAAATTATCCCCATCTCTTACTCCCTTTACTCATCTAAAGTAGAAGTCATGAAAGTGGAATTTTTGCCATTAAAAGGCTCTGTAT TATGTGAAGTTAGATTGTATTAACCATTTCCCAATAAATCATCTGTTTCAAAACTCAAATTCAAACTAGAATGTGTCTCTATTCACATTG CAAAAATATTATTGTCTCTCTGGTTAGTGGCTAAAAGCCAAATTGGAAACTAACTAGTTTTTTAAATTTTTTAAATTGTGCAAATTATTA |
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FusionGenePPI for CEP170_PRKACB |
| Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in . |
| Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
| Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
| CEP170 | DISC1, NDEL1, PPP1CA, VAV2, SIRT7, HERC2, NEURL4, YWHAQ, CFTR, PAN2, YWHAB, AGO2, AURKB, CEP57, HAUS2, TUBGCP3, CCDC8, CCAR2, OIP5, PCYT1A, SYNE2, AKAP9, KIFC3, PSPC1, PKD2, ASB7, NIN, RUFY2, CEP170P1, CEP170B, DSTYK, NHSL2, DAPK3, CEP250, SPAG5, PDE4DIP, KNSTRN, STX8, CORO1B, BEGAIN, RFWD3, CCDC6, TNKS, MIS18A, VTI1B, SNAPIN, VAMP8, CCDC68, TEKT2, NTRK1, IFI16, MED4, SRPK2, CEP162, CEP290, RPGRIP1L, LCA5, PCM1, OFD1, AGFG1, ARHGEF2, ASCC3, CEP131, CAMSAP1, CBL, CC2D1A, CCNB1, CKAP2, CRKL, CSNK1A1, DCLK1, DCTN1, FAM83D, HAUS3, HAUS8, HSPA1B, IFT74, KIF2A, KIF2C, KLHL9, NCK1, SHC1, TRIP6, TTK, UNC45A, WDR62, YWHAH, ACTR2, ARRB2, CAMK2D, CCDC138, CCDC77, CSNK2A2, DRG2, GOPC, GPX4, GRB2, GTSE1, HAUS6, HMMR, HS1BP3, LASP1, LIMD1, ERVK3-1, LUZP1, MAP7D1, MAP7D3, MAPRE1, MB21D2, MTAP, MTMR6, MTPN, NARS, NCK2, NEBL, NECAP2, NEDD1, NME7, OCRL, PEA15, PPP1R21, RRM2, SDCBP, SETD7, SKA1, SKA3, SLAIN2, SMAP2, SNX17, SUGT1, TCHP, TMSB10, TXNDC9, UPF1, WRAP73, XIAP, ZC2HC1A, KIAA0753, CEP104, CEP120, CEP128, CEP135, CEP44, CEP89, CNTRL, FBF1, NINL, NPHP1, ODF2, SCLT1, SASS6, CENPJ, C1orf86, XPO1, PRKAR2B, SMC3, FGFR1OP, EGFR, KIF2B, CCDC120, PPP2R3A, C1orf106, EMILIN1, CPN1, VPS53, CCDC151, CBY1, CSNK2A1, CSNK2B, YWHAE, KIFAP3, DCAF7, INPP5E, RAB3IP, KIF3A, NCL | PRKACB | NGFR, RYR2, TNP1, TNP2, SPP1, PRKAR2A, PRKACA, HSP90AA1, CSNK2A1, ARFGAP1, RPS6, RPL27A, ACVR1B, KIAA1279, ACTR2, ACTR3, ARPC1B, ARPC2, ARPC4, PFDN1, SUMO1, TP53RK, TPRKB, VAPB, HSP90AB1, PRKAR1A, AKAP5, PRKAR1B, PRKAR2B, DCAF7, DYNLL1, TRAP1, DYRK1A, MAPRE1, PDE4DIP, AKAP1, CDK5RAP2, AKAP9, VAPA, AKAP7, AKAP11, APPBP2, MLF1, NAPG, PER1, TALDO1, RABGGTB, C11orf49, AP2M1, DCLRE1C, CCNL2, AKAP14, ARF1, RPE, NTRK1, XPO1, FGFR1OP, CEP170P1, GPR161, PRKACG, HSP90AB4P, FKBP5, PKIG, BMP1, MRPS15, ETFB, NPAS1, DFFB, RAPGEF5, KLHL28, DNA2, TRIM25 |
| - Retained PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
| - Lost PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
| - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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RelatedDrugs for CEP170_PRKACB |
| Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02) |
| Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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RelatedDiseases for CEP170_PRKACB |
| Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
| Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
| Tgene | PRKACB | C0005426 | Biliary Tract Neoplasm | 1 | CTD_human |
| Tgene | PRKACB | C0033578 | Prostatic Neoplasms | 1 | CTD_human |
| Tgene | PRKACB | C0206698 | Cholangiocarcinoma | 1 | CTD_human |
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