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Fusion gene ID: 6766 |
FusionGeneSummary for CENPI_LANCL3 |
 Fusion gene summary |
| Fusion gene information | Fusion gene name: CENPI_LANCL3 | Fusion gene ID: 6766 | Hgene | Tgene | Gene symbol | CENPI | LANCL3 | Gene ID | 2491 | 347404 |
| Gene name | centromere protein I | LanC like 3 | |
| Synonyms | CENP-I|FSHPRH1|LRPR1 | - | |
| Cytomap | Xq22.1 | Xp21.1 | |
| Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
| Description | centromere protein IFSH primary response 1follicle-stimulating hormone primary response proteininterphase centromere complex protein 19leucine-rich primary response protein 1 | lanC-like protein 3LanC lantibiotic synthetase component C-like 3 | |
| Modification date | 20180522 | 20180523 | |
| UniProtAcc | Q92674 | Q6ZV70 | |
| Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000218507, ENST00000423383, ENST00000372927, ENST00000372926, | ENST00000378621, ENST00000378619, | |
| Fusion gene scores | * DoF score | 1 X 1 X 1=1 | 1 X 1 X 1=1 |
| # samples | 1 | 1 | |
| ** MAII score | log2(1/1*10)=3.32192809488736 | log2(1/1*10)=3.32192809488736 | |
| Context | PubMed: CENPI [Title/Abstract] AND LANCL3 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
| Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation | |||
| * DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
| Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
| Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
| Fusion gene information from three resources (ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018)) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| Data type | Source | Cancer type | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| TCGA | LD | SARC | TCGA-DX-A8BT-01A | CENPI | chrX | 100403150 | + | LANCL3 | chrX | 37514941 | + |
| * LD: Li Ding group's fusion gene list RV: Roel Verhaak group's fusion gene list ChiTaRs fusion database |
| Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| In-frame | ENST00000218507 | ENST00000378621 | CENPI | chrX | 100403150 | + | LANCL3 | chrX | 37514941 | + |
| In-frame | ENST00000218507 | ENST00000378619 | CENPI | chrX | 100403150 | + | LANCL3 | chrX | 37514941 | + |
| In-frame | ENST00000423383 | ENST00000378621 | CENPI | chrX | 100403150 | + | LANCL3 | chrX | 37514941 | + |
| In-frame | ENST00000423383 | ENST00000378619 | CENPI | chrX | 100403150 | + | LANCL3 | chrX | 37514941 | + |
| In-frame | ENST00000372927 | ENST00000378621 | CENPI | chrX | 100403150 | + | LANCL3 | chrX | 37514941 | + |
| In-frame | ENST00000372927 | ENST00000378619 | CENPI | chrX | 100403150 | + | LANCL3 | chrX | 37514941 | + |
| intron-3CDS | ENST00000372926 | ENST00000378621 | CENPI | chrX | 100403150 | + | LANCL3 | chrX | 37514941 | + |
| intron-3CDS | ENST00000372926 | ENST00000378619 | CENPI | chrX | 100403150 | + | LANCL3 | chrX | 37514941 | + |
Top |
FusionProtFeatures for CENPI_LANCL3 |
| Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
| Hgene | Tgene |
| CENPI | LANCL3 |
| Component of the CENPA-CAD (nucleosome distal) complex,a complex recruited to centromeres which is involved in assemblyof kinetochore proteins, mitotic progression and chromosomesegregation. May be involved in incorporation of newly synthesizedCENPA into centromeres via its interaction with the CENPA-NACcomplex. Required for the localization of CENPF, MAD1L1 and MAD2(MAD2L1 or MAD2L2) to kinetochores. Involved in the response ofgonadal tissues to follicle-stimulating hormone.{ECO:0000269|PubMed:12640463, ECO:0000269|PubMed:16622420}. |
| Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at . * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
| - In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| - In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
Top |
FusionGeneSequence for CENPI_LANCL3 |
| For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. (nt: nucleotides, aa: amino acids) |
| * Fusion amino acid sequences. |
| >In-frame_CENPI_ENST00000218507_chrX_100403150_+_LANCL3_ENST00000378621_chrX_37514941_+_896aa MSPQKRVKNVQAQNRTSQGSSSFQTTLSAWKVKQDPSNSKNISKHGQNNPVGDYEHADDQAEEDALQMAVGYFEKGPIKASQNKDKTLEK HLKTVENVAWKNGLASEEIDILLNIALSGKFGNAVNTRILKCMIPATVISEDSVVKAVSWLCVGKCSGSTKVLFYRWLVAMFDFIDRKEQ INLLYGFFFASLQDDALCPYVCHLLYLLTKKENVKPFRVRKLLDLQAKMGMQPHLQALLSLYKFFAPALISVSLPVRKKIYFKNSENLWK TALLAVKQRNRGPSPEPLKLMLGPANVRPLKRKWNSLSVIPVLNSSSYTKECGKKEMSLSDCLNRSGSFPLEQLQSFPQLLQNIHCLELP SQMGSVLNNSLLLHYINCVRDEPVLLRFYYWLSQTLQEECIWYKVNNYEHGKEFTNFLDTIIRAECFLQEGFYSCEAFLYKSLPLWDGLC CRSQFLQLVSWIPFSSFSEVKPLLFDHLAQLFFTSTIYFKCSVLQSLKELLQNWLLWLSMDIHMKPVTNSPLETTLGGSMNSVSKLIHYV GWLSTTAMRLESNNTFLLHFILDFYEKVCDIYINYNLPLVVLFPPGIFYSALLSLDTSILNQLCFIMHRYRKNLTAAKKNELVQKTKSEF NFSSKTYQEFNHYLTSMVGCLWTSKPFGKGIYIDPEILEKTGVAEYKNSLNVVHHPSFLSYAVSFLLQVLTPAQIKSICQAILDSGKQYA IKKRKPFPLMYSYYGTEYLGAAHGLSSILQMLLSYHEHLKPSDRELVWQSVDFLMEQEQNCNWPPELGETIERENELVHWCHGAPGIAYL >In-frame_CENPI_ENST00000218507_chrX_100403150_+_LANCL3_ENST00000378619_chrX_37514941_+_928aa MSPQKRVKNVQAQNRTSQGSSSFQTTLSAWKVKQDPSNSKNISKHGQNNPVGDYEHADDQAEEDALQMAVGYFEKGPIKASQNKDKTLEK HLKTVENVAWKNGLASEEIDILLNIALSGKFGNAVNTRILKCMIPATVISEDSVVKAVSWLCVGKCSGSTKVLFYRWLVAMFDFIDRKEQ INLLYGFFFASLQDDALCPYVCHLLYLLTKKENVKPFRVRKLLDLQAKMGMQPHLQALLSLYKFFAPALISVSLPVRKKIYFKNSENLWK TALLAVKQRNRGPSPEPLKLMLGPANVRPLKRKWNSLSVIPVLNSSSYTKECGKKEMSLSDCLNRSGSFPLEQLQSFPQLLQNIHCLELP SQMGSVLNNSLLLHYINCVRDEPVLLRFYYWLSQTLQEECIWYKVNNYEHGKEFTNFLDTIIRAECFLQEGFYSCEAFLYKSLPLWDGLC CRSQFLQLVSWIPFSSFSEVKPLLFDHLAQLFFTSTIYFKCSVLQSLKELLQNWLLWLSMDIHMKPVTNSPLETTLGGSMNSVSKLIHYV GWLSTTAMRLESNNTFLLHFILDFYEKVCDIYINYNLPLVVLFPPGIFYSALLSLDTSILNQLCFIMHRYRKNLTAAKKNELVQKTKSEF NFSSKTYQEFNHYLTSMVGCLWTSKPFGKGIYIDPEILEKTGVAEYKNSLNVVHHPSFLSYAVSFLLQVLTPAQIKSICQAILDSGKQYA IKKRKPFPLMYSYYGTEYLGAAHGLSSILQMLLSYHEHLKPSDRELVWQSVDFLMEQEQNCNWPPELGETIERENELVHWCHGAPGIAYL FAKAYLVSKKPQYLDTCIRCGELTWQKGLLKKGPGICHGVAGSAYVFLLLYRLTGNSKYIYRAQRFAQFLFTEEFKAGSRVLESIYSLYE >In-frame_CENPI_ENST00000423383_chrX_100403150_+_LANCL3_ENST00000378621_chrX_37514941_+_896aa MSPQKRVKNVQAQNRTSQGSSSFQTTLSAWKVKQDPSNSKNISKHGQNNPVGDYEHADDQAEEDALQMAVGYFEKGPIKASQNKDKTLEK HLKTVENVAWKNGLASEEIDILLNIALSGKFGNAVNTRILKCMIPATVISEDSVVKAVSWLCVGKCSGSTKVLFYRWLVAMFDFIDRKEQ INLLYGFFFASLQDDALCPYVCHLLYLLTKKENVKPFRVRKLLDLQAKMGMQPHLQALLSLYKFFAPALISVSLPVRKKIYFKNSENLWK TALLAVKQRNRGPSPEPLKLMLGPANVRPLKRKWNSLSVIPVLNSSSYTKECGKKEMSLSDCLNRSGSFPLEQLQSFPQLLQNIHCLELP SQMGSVLNNSLLLHYINCVRDEPVLLRFYYWLSQTLQEECIWYKVNNYEHGKEFTNFLDTIIRAECFLQEGFYSCEAFLYKSLPLWDGLC CRSQFLQLVSWIPFSSFSEVKPLLFDHLAQLFFTSTIYFKCSVLQSLKELLQNWLLWLSMDIHMKPVTNSPLETTLGGSMNSVSKLIHYV GWLSTTAMRLESNNTFLLHFILDFYEKVCDIYINYNLPLVVLFPPGIFYSALLSLDTSILNQLCFIMHRYRKNLTAAKKNELVQKTKSEF NFSSKTYQEFNHYLTSMVGCLWTSKPFGKGIYIDPEILEKTGVAEYKNSLNVVHHPSFLSYAVSFLLQVLTPAQIKSICQAILDSGKQYA 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| * Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region). |
| >In-frame_CENPI_ENST00000218507_chrX_100403150_+_LANCL3_ENST00000378621_chrX_37514941_+_2688nt ATGTCACCTCAAAAGAGAGTTAAGAACGTCCAGGCACAAAACAGGACTTCACAAGGTAGTAGTAGTTTTCAGACCACGCTTTCAGCCTGG AAAGTAAAACAGGATCCAAGCAACTCGAAGAACATCTCAAAACATGGACAAAACAATCCAGTGGGAGATTATGAACATGCTGATGATCAA GCTGAAGAAGATGCTTTGCAAATGGCAGTGGGATATTTTGAGAAAGGTCCCATTAAAGCTTCACAGAATAAAGATAAAACCTTGGAAAAA CACTTGAAAACTGTGGAAAATGTGGCTTGGAAGAATGGGTTAGCTTCAGAAGAAATTGATATTCTATTAAATATTGCACTCAGTGGCAAA TTTGGAAATGCTGTAAACACACGGATATTGAAGTGCATGATCCCAGCAACAGTAATATCAGAAGATTCTGTGGTTAAGGCAGTCTCCTGG CTTTGTGTTGGCAAGTGTTCTGGTAGCACCAAGGTACTTTTTTATCGTTGGCTGGTTGCAATGTTTGACTTCATTGATCGTAAGGAGCAA ATTAACTTGCTCTATGGCTTCTTTTTTGCTTCATTGCAAGATGATGCACTGTGCCCTTATGTTTGCCATTTGTTATATTTACTTACCAAA AAAGAGAATGTCAAACCATTTCGTGTGAGAAAACTGCTTGATCTTCAGGCCAAAATGGGAATGCAGCCTCATCTCCAGGCTTTGTTGTCA CTGTATAAGTTCTTTGCTCCTGCTCTGATTTCAGTATCTTTGCCTGTAAGGAAGAAGATATATTTTAAGAATTCAGAGAATCTATGGAAG ACGGCTCTGCTTGCCGTGAAGCAAAGAAACCGGGGACCTTCTCCAGAACCTCTGAAGTTGATGTTAGGTCCAGCTAATGTTCGTCCTCTA AAAAGAAAGTGGAATTCTCTCTCAGTTATACCAGTGCTCAATTCCAGTAGCTACACTAAAGAATGTGGAAAAAAAGAGATGAGTCTTTCT GATTGTCTGAATAGAAGTGGATCATTTCCACTAGAACAACTTCAAAGCTTCCCCCAACTTTTACAGAACATCCATTGCTTAGAGCTGCCT TCTCAGATGGGCTCAGTGCTAAACAACTCTCTGCTGCTTCACTACATTAACTGTGTCAGAGATGAGCCAGTCTTGCTGAGGTTTTATTAC TGGTTGAGTCAAACATTACAAGAAGAATGTATTTGGTACAAGGTGAATAATTATGAACATGGAAAAGAATTTACCAACTTCCTGGATACC ATCATCAGGGCAGAGTGCTTCTTACAAGAGGGGTTTTATTCCTGTGAAGCATTCCTGTATAAGAGCCTTCCTCTCTGGGATGGCCTTTGT TGTCGGTCACAGTTCCTTCAGCTTGTGAGCTGGATTCCTTTTAGTAGCTTCTCTGAGGTGAAACCACTTCTTTTTGACCATCTAGCGCAG CTCTTCTTTACATCAACCATTTATTTCAAGTGTAGTGTGCTTCAGAGTCTGAAAGAGCTATTGCAGAATTGGCTGTTGTGGCTTTCTATG GACATTCACATGAAACCTGTTACAAACAGTCCTCTAGAGACAACTTTGGGTGGATCCATGAACTCTGTGTCTAAACTGATCCACTATGTA GGGTGGCTATCCACTACTGCAATGCGCTTGGAGAGCAACAATACTTTCTTGCTGCACTTTATTTTGGATTTCTATGAGAAGGTGTGTGAC ATATATATAAATTATAACCTTCCATTAGTGGTATTGTTTCCTCCTGGGATCTTCTATTCTGCACTCCTCAGCCTGGATACCAGCATCCTG AACCAGCTGTGTTTTATTATGCACAGATATCGTAAAAATTTGACTGCCGCAAAGAAAAATGAGTTGGTACAAAAGACAAAATCAGAGTTC AATTTCAGCAGCAAGACTTATCAAGAATTTAATCACTATTTGACATCAATGGTTGGTTGCCTGTGGACGTCCAAACCCTTTGGGAAAGGA ATATATATTGACCCTGAAATCCTAGAAAAAACTGGAGTGGCTGAATATAAAAACAGTTTAAATGTAGTCCATCATCCTTCTTTCTTGAGT TACGCTGTTTCCTTTTTGCTACAGGTGCTGACTCCAGCACAGATCAAGTCAATTTGTCAGGCAATTCTGGACTCTGGGAAGCAGTATGCC ATAAAGAAGAGGAAACCATTCCCCCTGATGTATTCTTACTATGGAACCGAATACTTGGGGGCAGCTCACGGCTTGTCGTCTATTCTTCAG ATGCTTCTTTCTTACCATGAGCATCTCAAGCCCTCAGATCGGGAATTGGTATGGCAGAGCGTGGACTTTCTCATGGAACAGGAACAAAAC TGCAACTGGCCACCTGAGCTCGGCGAGACCATCGAGAGAGAGAATGAGCTGGTGCACTGGTGCCATGGCGCTCCAGGAATTGCCTATCTG TTTGCCAAAGCTTATCTGGTTTCCAAGAAACCGCAGTACCTGGACACATGTATTCGGTGTGGGGAACTCACATGGCAGAAAGGCCTGCTA AAGAAGGGGCCTGGGATTTGCCATGGAGTAGCCGGCAGTGCCTATGTCTTCCTGCTGCTGTACCGGCTCACGGGAAACTCTAAATACATC >In-frame_CENPI_ENST00000218507_chrX_100403150_+_LANCL3_ENST00000378619_chrX_37514941_+_2784nt 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GATTGTCTGAATAGAAGTGGATCATTTCCACTAGAACAACTTCAAAGCTTCCCCCAACTTTTACAGAACATCCATTGCTTAGAGCTGCCT TCTCAGATGGGCTCAGTGCTAAACAACTCTCTGCTGCTTCACTACATTAACTGTGTCAGAGATGAGCCAGTCTTGCTGAGGTTTTATTAC TGGTTGAGTCAAACATTACAAGAAGAATGTATTTGGTACAAGGTGAATAATTATGAACATGGAAAAGAATTTACCAACTTCCTGGATACC ATCATCAGGGCAGAGTGCTTCTTACAAGAGGGGTTTTATTCCTGTGAAGCATTCCTGTATAAGAGCCTTCCTCTCTGGGATGGCCTTTGT TGTCGGTCACAGTTCCTTCAGCTTGTGAGCTGGATTCCTTTTAGTAGCTTCTCTGAGGTGAAACCACTTCTTTTTGACCATCTAGCGCAG CTCTTCTTTACATCAACCATTTATTTCAAGTGTAGTGTGCTTCAGAGTCTGAAAGAGCTATTGCAGAATTGGCTGTTGTGGCTTTCTATG GACATTCACATGAAACCTGTTACAAACAGTCCTCTAGAGACAACTTTGGGTGGATCCATGAACTCTGTGTCTAAACTGATCCACTATGTA GGGTGGCTATCCACTACTGCAATGCGCTTGGAGAGCAACAATACTTTCTTGCTGCACTTTATTTTGGATTTCTATGAGAAGGTGTGTGAC ATATATATAAATTATAACCTTCCATTAGTGGTATTGTTTCCTCCTGGGATCTTCTATTCTGCACTCCTCAGCCTGGATACCAGCATCCTG AACCAGCTGTGTTTTATTATGCACAGATATCGTAAAAATTTGACTGCCGCAAAGAAAAATGAGTTGGTACAAAAGACAAAATCAGAGTTC AATTTCAGCAGCAAGACTTATCAAGAATTTAATCACTATTTGACATCAATGGTTGGTTGCCTGTGGACGTCCAAACCCTTTGGGAAAGGA 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GCTGCCTTCTCAGATGGGCTCAGTGCTAAACAACTCTCTGCTGCTTCACTACATTAACTGTGTCAGAGATGAGCCAGTCTTGCTGAGGTT TTATTACTGGTTGAGTCAAACATTACAAGAAGAATGTATTTGGTACAAGGTGAATAATTATGAACATGGAAAAGAATTTACCAACTTCCT GGATACCATCATCAGGGCAGAGTGCTTCTTACAAGAGGGGTTTTATTCCTGTGAAGCATTCCTGTATAAGAGCCTTCCTCTCTGGGATGG CCTTTGTTGTCGGTCACAGTTCCTTCAGCTTGTGAGCTGGATTCCTTTTAGTAGCTTCTCTGAGGTGAAACCACTTCTTTTTGACCATCT AGCGCAGCTCTTCTTTACATCAACCATTTATTTCAAGTGTAGTGTGCTTCAGAGTCTGAAAGAGCTATTGCAGAATTGGCTGTTGTGGCT TTCTATGGACATTCACATGAAACCTGTTACAAACAGTCCTCTAGAGACAACTTTGGGTGGATCCATGAACTCTGTGTCTAAACTGATCCA CTATGTAGGGTGGCTATCCACTACTGCAATGCGCTTGGAGAGCAACAATACTTTCTTGCTGCACTTTATTTTGGATTTCTATGAGAAGGT GTGTGACATATATATAAATTATAACCTTCCATTAGTGGTATTGTTTCCTCCTGGGATCTTCTATTCTGCACTCCTCAGCCTGGATACCAG CATCCTGAACCAGCTGTGTTTTATTATGCACAGATATCGTAAAAATTTGACTGCCGCAAAGAAAAATGAGTTGGTACAAAAGACAAAATC AGAGTTCAATTTCAGCAGCAAGACTTATCAAGAATTTAATCACTATTTGACATCAATGGTTGGTTGCCTGTGGACGTCCAAACCCTTTGG GAAAGGAATATATATTGACCCTGAAATCCTAGAAAAAACTGGAGTGGCTGAATATAAAAACAGTTTAAATGTAGTCCATCATCCTTCTTT CTTGAGTTACGCTGTTTCCTTTTTGCTACAGGTGCTGACTCCAGCACAGATCAAGTCAATTTGTCAGGCAATTCTGGACTCTGGGAAGCA GTATGCCATAAAGAAGAGGAAACCATTCCCCCTGATGTATTCTTACTATGGAACCGAATACTTGGGGGCAGCTCACGGCTTGTCGTCTAT TCTTCAGATGCTTCTTTCTTACCATGAGCATCTCAAGCCCTCAGATCGGGAATTGGTATGGCAGAGCGTGGACTTTCTCATGGAACAGGA ACAAAACTGCAACTGGCCACCTGAGCTCGGCGAGACCATCGAGAGAGAGAATGAGCTGGTGCACTGGTGCCATGGCGCTCCAGGAATTGC CTATCTGTTTGCCAAAGCTTATCTGGTTTCCAAGAAACCGCAGTACCTGGACACATGTATTCGGTGTGGGGAACTCACATGGCAGAAAGG CCTGCTAAAGAAGGGGCCTGGGATTTGCCATGGAGTAGCCGGCAGTGCCTATGTCTTCCTGCTGCTGTACCGGCTCACGGGAAACTCTAA ATACATCTACCGAGCTCAAAGGTTTGCTCAATTCTTATTTACCGAGGAATTCAAGGCCGGTTCTCGGGTCCTTGAAAGTATATACAGCTT GTATGAAGGCTTCTCTGGGACAGTGTGCTTTCTGATTGACCTGCTGCAGCCCAATCAGGCTGAATTCCCACTCTTCAGCGTCTTTGTTTA GAAGGCTCTATCTTCCACTGTGGCCCTGCAGAGATCCCCTGAGCCAAGCCGAGGCAGTTTCCACATAAGCCACATTCAATGGTATCGCAA CCATGAGCCTTAACATTGCCATCAGAAGGAAGGAATCAGGCAGGTGAAGGCAACATGATGCCAGATTTGAGAAAGGATCTGCAAAATAAA GATACCACAATTCATCTTAAAACTGCAGAGATTTAATGTGTCAGGGAATAGATGTGAAACAAGGGATCATAGGAAAAGGGGAAAGAGAAA TGATCTGTTTTTCAGTTATGACATAGAAAACCAAACTGCAAGTGTAGACTATGACAAAAAATACACTAATACCTTTGCAATCTGAATGAG AATTTGACCATTTGTGTGTGCCCTCTACCCTTAAATTCAGAAATAAAGACAATAAAAAATTAAAATAATTGCCCAGCTGAAAACTGCTAT GAGGAATGGATTGTCAGGTTGCTGAAGTATAAAAATAAACTCTTGGTTGTCCTGTGCTTATACTTATTGAAATTTATGGTTTTTACTGAG CAAAGATATTTGCATATGAATCTCTATTTTTTTCATTACCCTGGGCAATTTAAAGAAATCATATCATAGCGTAGTTCAGATACTAAAATT TGAAGTTTCCTTAGGCCCTAGAACATCTCTTTTCCTGGTTCCTTTTTTTTCCTCAAAGCTCAATTAGAATAGCAAAATTTATAAGCTAGT AAACTTATACTATAGCAAGTGTTGCTGTAAAGTGTTTTTCTCCATAGGAAGTGTGAACTGTGTATTGTCTATTGTTAGTAATTTTAAAAA TGCCTTTATGTACATAATCTTGATGGAGCTATTAGCTGAACTATAAAATATGCTCTTGGTAAATATCACTAATTTCAAAGATCAGGGGAA CCACTACAAAGACGTGTCATTTCTGCCTTTGTTTGGGACAGGCAGACAGGCTGAGGAAGTCACCAGTGATTGTGGAAATAATTTTGCTCC ATTTTATACTATTAAATGAAGAGATGAGTGAATTCTGTGGTTGGTTACCTTACCTTCCAAGATACAGGGTCCACTAGAAATTGGCTGTAA TACTCATTGAGCCAAGTTGTCATATCAAATTCAACCCTGCTGTAAACACATAGAAGTTGTGAAACTGCTTCAAGTAAATAGTGGTTTGCA GAACACTGTAGGAGCATCTGTCACTTCATTATGCAGAGCATAAGTTGATCCTTTTCCTAGAATTTTGTCAGTGGCAATTGCATATATCAG ATTGAGTAGGAAATTGTGTACTGTATAAGACTTATTTAAATAGTCATTAAATATTTGGATATATTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG TGTGTATGGTGTGTATTCCATATCTATTCCCATGTAAATCCAAATACTTATTCTTTATTTCAGTAATTCTTAACTTGAATCATAGACTTT GGAACGAGTTAGGGAATGCTCTGTTGCCTAAAAAGCAAACCTACAAGTATGTTGGTGTGTGTATGTGTATGGACCAGTTTGTTTGTGTGT |
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FusionGenePPI for CENPI_LANCL3 |
| Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in . |
| Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
| Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
| CENPI | CENPA, CENPH, CENPO, CENPP, APP, CENPM, CENPN, CENPU, ITGB3BP, CENPQ, RBM34, NIFK, DGCR8, ZNF71 | LANCL3 |
| - Retained PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
| - Lost PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
| - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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RelatedDrugs for CENPI_LANCL3 |
| Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02) |
| Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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RelatedDiseases for CENPI_LANCL3 |
| Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
| Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
Copyright 2018-Present -The University of Texas Health Science Center at Houston (UTHealth)
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