|
||||||
|
 | |
| |
| |
| |
| |
|
Fusion gene ID: 6181 |
FusionGeneSummary for CD44_CAPRIN1 |
 Fusion gene summary |
| Fusion gene information | Fusion gene name: CD44_CAPRIN1 | Fusion gene ID: 6181 | Hgene | Tgene | Gene symbol | CD44 | CAPRIN1 | Gene ID | 960 | 4076 |
| Gene name | CD44 molecule (Indian blood group) | cell cycle associated protein 1 | |
| Synonyms | CDW44|CSPG8|ECMR-III|HCELL|HUTCH-I|IN|LHR|MC56|MDU2|MDU3|MIC4|Pgp1 | GPIAP1|GPIP137|GRIP137|M11S1|RNG105|p137GPI | |
| Cytomap | 11p13 | 11p13 | |
| Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
| Description | CD44 antigenGP90 lymphocyte homing/adhesion receptorHermes antigencell surface glycoprotein CD44chondroitin sulfate proteoglycan 8epicanextracellular matrix receptor IIIhematopoietic cell E- and L-selectin ligandheparan sulfate proteoglycanhoming | caprin-1GPI-anchored membrane protein 1GPI-anchored protein p137GPI-p137RNA granule protein 105activation/proliferation-associated protein 1caprin 1cytoplasmic activation- and proliferation-associated protein 1cytoplasmic activation/proliferation- | |
| Modification date | 20180527 | 20180519 | |
| UniProtAcc | P16070 | Q14444 | |
| Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000263398, ENST00000526025, ENST00000449691, ENST00000360158, ENST00000415148, ENST00000437706, ENST00000433354, ENST00000428726, ENST00000526669, ENST00000433892, ENST00000278386, ENST00000434472, ENST00000352818, ENST00000528922, | ENST00000341394, ENST00000389645, ENST00000532820, ENST00000530820, ENST00000529307, ENST00000533657, | |
| Fusion gene scores | * DoF score | 11 X 10 X 7=770 | 6 X 5 X 4=120 |
| # samples | 14 | 8 | |
| ** MAII score | log2(14/770*10)=-2.4594316186373 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | log2(8/120*10)=-0.584962500721156 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | |
| Context | PubMed: CD44 [Title/Abstract] AND CAPRIN1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
| Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation | Tumor suppressor gene involved fusion gene, in-frame but not retained their domain. | ||
| * DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
| Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
| Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
| Hgene | CD44 | GO:0030214 | hyaluronan catabolic process | 17170110 |
| Hgene | CD44 | GO:0033138 | positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation | 17045821 |
| Hgene | CD44 | GO:0043518 | negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator | 17045821 |
| Hgene | CD44 | GO:0044344 | cellular response to fibroblast growth factor stimulus | 19577615 |
| Hgene | CD44 | GO:0050731 | positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation | 17045821 |
| Hgene | CD44 | GO:0070374 | positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade | 17045821 |
| Hgene | CD44 | GO:1902166 | negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator | 17045821 |
| Fusion gene information from three resources (ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018)) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| Data type | Source | Cancer type | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| TCGA | RV | UCS | TCGA-NG-A4VU-01A | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| TCGA | LD | UCS | TCGA-N5-A4RO-01A | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| * LD: Li Ding group's fusion gene list RV: Roel Verhaak group's fusion gene list ChiTaRs fusion database |
| Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| In-frame | ENST00000263398 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000263398 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000263398 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000263398 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000263398 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000263398 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526025 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526025 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526025 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526025 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526025 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000526025 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000449691 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000449691 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000449691 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000449691 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000449691 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000449691 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000360158 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000360158 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000360158 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000360158 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000360158 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000360158 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000415148 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000415148 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000415148 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000415148 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000415148 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000415148 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000437706 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000437706 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000437706 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000437706 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000437706 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000437706 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433354 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433354 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433354 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433354 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433354 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000433354 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000428726 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000428726 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000428726 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000428726 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000428726 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000428726 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526669 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526669 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526669 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526669 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000526669 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000526669 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433892 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433892 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433892 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433892 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000433892 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000433892 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000278386 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000278386 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000278386 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000278386 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000278386 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000278386 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000434472 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000434472 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000434472 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000434472 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000434472 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000434472 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000352818 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000352818 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000352818 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000352818 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| In-frame | ENST00000352818 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000352818 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| intron-3CDS | ENST00000528922 | ENST00000341394 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| intron-3CDS | ENST00000528922 | ENST00000389645 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| intron-3CDS | ENST00000528922 | ENST00000532820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| intron-3CDS | ENST00000528922 | ENST00000530820 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| intron-3CDS | ENST00000528922 | ENST00000529307 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
| intron-intron | ENST00000528922 | ENST00000533657 | CD44 | chr11 | 35160917 | + | CAPRIN1 | chr11 | 34110942 | + |
Top |
FusionProtFeatures for CD44_CAPRIN1 |
| Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
| Hgene | Tgene |
| CD44 | CAPRIN1 |
| May regulate the transport and translation of mRNAs ofproteins involved in synaptic plasticity in neurons and cellproliferation and migration in multiple cell types. Binds directlyand selectively to MYC and CCND2 RNAs. In neuronal cells, directlybinds to several mRNAs associated with RNA granules, includingBDNF, CAMK2A, CREB1, MAP2, NTRK2 mRNAs, as well as to GRIN1 andKPNB1 mRNAs, but not to rRNAs. {ECO:0000269|PubMed:17210633}. |
| Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at . * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
| - In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| - In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000263398 | + | 1 | 9 | 150_158 | 22 | 362 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000278386 | + | 1 | 4 | 150_158 | 22 | 140 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000352818 | + | 1 | 8 | 150_158 | 22 | 341 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000360158 | + | 1 | 10 | 150_158 | 22 | 397 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000415148 | + | 1 | 17 | 150_158 | 22 | 700 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000428726 | + | 1 | 18 | 150_158 | 22 | 743 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000433892 | + | 1 | 12 | 150_158 | 22 | 494 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000434472 | + | 1 | 10 | 150_158 | 22 | 430 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000437706 | + | 1 | 17 | 150_158 | 22 | 675 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000449691 | + | 1 | 17 | 150_158 | 22 | 700 | Compositional bias | Note=Arg/Lys-rich (basic) |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000263398 | + | 1 | 9 | 32_120 | 22 | 362 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000278386 | + | 1 | 4 | 32_120 | 22 | 140 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000352818 | + | 1 | 8 | 32_120 | 22 | 341 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000360158 | + | 1 | 10 | 32_120 | 22 | 397 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000415148 | + | 1 | 17 | 32_120 | 22 | 700 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000428726 | + | 1 | 18 | 32_120 | 22 | 743 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000433892 | + | 1 | 12 | 32_120 | 22 | 494 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000434472 | + | 1 | 10 | 32_120 | 22 | 430 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000437706 | + | 1 | 17 | 32_120 | 22 | 675 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000449691 | + | 1 | 17 | 32_120 | 22 | 700 | Domain | Link |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000263398 | + | 1 | 9 | 224_649 | 22 | 362 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000278386 | + | 1 | 4 | 224_649 | 22 | 140 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000352818 | + | 1 | 8 | 224_649 | 22 | 341 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000360158 | + | 1 | 10 | 224_649 | 22 | 397 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000415148 | + | 1 | 17 | 224_649 | 22 | 700 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000428726 | + | 1 | 18 | 224_649 | 22 | 743 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000433892 | + | 1 | 12 | 224_649 | 22 | 494 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000434472 | + | 1 | 10 | 224_649 | 22 | 430 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000437706 | + | 1 | 17 | 224_649 | 22 | 675 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000449691 | + | 1 | 17 | 224_649 | 22 | 700 | Region | Note=Stem |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000263398 | + | 1 | 9 | 21_649 | 22 | 362 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000263398 | + | 1 | 9 | 671_742 | 22 | 362 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000278386 | + | 1 | 4 | 21_649 | 22 | 140 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000278386 | + | 1 | 4 | 671_742 | 22 | 140 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000352818 | + | 1 | 8 | 21_649 | 22 | 341 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000352818 | + | 1 | 8 | 671_742 | 22 | 341 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000360158 | + | 1 | 10 | 21_649 | 22 | 397 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000360158 | + | 1 | 10 | 671_742 | 22 | 397 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000415148 | + | 1 | 17 | 21_649 | 22 | 700 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000415148 | + | 1 | 17 | 671_742 | 22 | 700 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000428726 | + | 1 | 18 | 21_649 | 22 | 743 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000428726 | + | 1 | 18 | 671_742 | 22 | 743 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000433892 | + | 1 | 12 | 21_649 | 22 | 494 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000433892 | + | 1 | 12 | 671_742 | 22 | 494 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000434472 | + | 1 | 10 | 21_649 | 22 | 430 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000434472 | + | 1 | 10 | 671_742 | 22 | 430 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000437706 | + | 1 | 17 | 21_649 | 22 | 675 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000437706 | + | 1 | 17 | 671_742 | 22 | 675 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000449691 | + | 1 | 17 | 21_649 | 22 | 700 | Topological domain | Extracellular |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000449691 | + | 1 | 17 | 671_742 | 22 | 700 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000263398 | + | 1 | 9 | 650_670 | 22 | 362 | Transmembrane | Helical |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000278386 | + | 1 | 4 | 650_670 | 22 | 140 | Transmembrane | Helical |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000352818 | + | 1 | 8 | 650_670 | 22 | 341 | Transmembrane | Helical |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000360158 | + | 1 | 10 | 650_670 | 22 | 397 | Transmembrane | Helical |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000415148 | + | 1 | 17 | 650_670 | 22 | 700 | Transmembrane | Helical |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000428726 | + | 1 | 18 | 650_670 | 22 | 743 | Transmembrane | Helical |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000433892 | + | 1 | 12 | 650_670 | 22 | 494 | Transmembrane | Helical |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000434472 | + | 1 | 10 | 650_670 | 22 | 430 | Transmembrane | Helical |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000437706 | + | 1 | 17 | 650_670 | 22 | 675 | Transmembrane | Helical |
| Hgene | >CD44 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000449691 | + | 1 | 17 | 650_670 | 22 | 700 | Transmembrane | Helical |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000341394 | + | 10 | 19 | 125_153 | 410 | 710 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000341394 | + | 10 | 19 | 60_94 | 410 | 710 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000389645 | + | 10 | 18 | 125_153 | 410 | 695 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000389645 | + | 10 | 18 | 60_94 | 410 | 695 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000530820 | + | 9 | 17 | 125_153 | 410 | 695 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000530820 | + | 9 | 17 | 60_94 | 410 | 695 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000532820 | + | 9 | 18 | 125_153 | 410 | 710 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000532820 | + | 9 | 18 | 60_94 | 410 | 710 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000341394 | + | 10 | 19 | 360_381 | 410 | 710 | Region | Note=G3BP1-binding |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000389645 | + | 10 | 18 | 360_381 | 410 | 695 | Region | Note=G3BP1-binding |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000530820 | + | 9 | 17 | 360_381 | 410 | 695 | Region | Note=G3BP1-binding |
| Tgene | CAPRIN1 | chr11:35160917 | chr11:34110942 | ENST00000532820 | + | 9 | 18 | 360_381 | 410 | 710 | Region | Note=G3BP1-binding |
Top |
FusionGeneSequence for CD44_CAPRIN1 |
| For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. (nt: nucleotides, aa: amino acids) |
| * Fusion amino acid sequences. |
| >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_307aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_322aa MDKFWWHAAWGLCLVPLSLAQIVHSESRLAQPNQVPVQPEATQVPLVSSTSEGYTASQPLYQPSHATEQRPQKEPIDQIQATISLNTDQT TASSSLPAASQPQVFQAGTSKPLHSSGINVNAAPFQSMQTVFNMNAPVPPVNEPETLKQQNQYQASYNQSFSSQPHQVEQTELQQEQLQT VVGTYHGSPDQSHQVTGNHQQPPQQNTGFPRSNQPYYNSRGVSRGGSRGARGLMNGYRGPANGFRGGYDGYRPSFSNTPNSGYTQSQFSA |
| * Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region). |
| >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_921nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_966nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA |
| * Fusion transcript sequences (Full-length transcript). |
| >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_3189nt GAGAAGAAAGCCAGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACG TCCCTGGCAGCCCCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACC TCTGCGGGCTGCTTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCG AATAAAAACTGCAGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCC TCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGT GGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTC CTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATG CTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCC TTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCC AATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCA GTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACC ATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCT ATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAG GAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTG GCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCC CAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACT GGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCC CATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCAT CTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTA TTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGAC AAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATT GGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTT CATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAG GCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATA CCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTG TCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTC ACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTT GAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAA ATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAAACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACA AATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTCTCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCT CCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTCCTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTG ACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTGTGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCA TTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCTTTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAG CATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTGCTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTT GCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAGGCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAGTTTTGTAGGGTGGTGGGAAATGGGGGATCTTCAA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2628nt GAGAAGAAAGCCAGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACG TCCCTGGCAGCCCCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACC TCTGCGGGCTGCTTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCG AATAAAAACTGCAGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCC TCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGT GGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTC CTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATG CTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCC TTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCC AATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCA GTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACC ATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCT ATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAG GAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTG GCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGT GGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAG ACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTG TTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAA CCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTC CTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACC ATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACA AAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACT ACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAG GGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAA TACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAG GATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTT TAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAA GGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTA AGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGCTTGATGATGGTGCCTGGCACATAGTAGGCACTCA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2497nt GAGAAGAAAGCCAGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACG TCCCTGGCAGCCCCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACC TCTGCGGGCTGCTTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCG AATAAAAACTGCAGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCC TCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGT GGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTC CTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATG CTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCC TTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCC AATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCA GTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACC ATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCT ATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAG GAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTG GCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCC CAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACT GGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCC CATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCAT CTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTA TTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGAC AAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATT GGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTT CATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAG GCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATA CCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTG TCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTC ACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTT >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2632nt GAGAAGAAAGCCAGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACG TCCCTGGCAGCCCCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACC TCTGCGGGCTGCTTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCG AATAAAAACTGCAGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCC TCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGT GGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTC CTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATG CTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCC TTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCC AATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCA GTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACC ATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCT ATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAG GAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTG GCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGT GGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAG ACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTG TTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAA CCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTC CTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACC ATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACA AAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACT ACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAG GGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAA TACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAG GATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTT TAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAA GGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTA AGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGCTTGATGATGGTGCCTGGCACATAGTAGGCACTCA >In-frame_CD44_ENST00000263398_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1547nt GAGAAGAAAGCCAGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACG TCCCTGGCAGCCCCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACC TCTGCGGGCTGCTTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCG AATAAAAACTGCAGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCC TCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGT GGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTC CTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATG CTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCC TTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCC AATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCA GTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACC ATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCT ATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAG GAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTG GCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCC CAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACT GGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCC >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_3177nt AGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACGTCCCTGGCAGCC CCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACCTCTGCGGGCTGC TTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCGAATAAAAACTGC AGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCC TGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCT GGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAG AAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAAC GACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGT CTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAA CGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGA GCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAG ACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTC GTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATG GTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGG ATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACA GAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACC ATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGG ACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGC ACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCT TGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTAT TTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAAC GTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAA CAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGC ACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACA CTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTT GGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCC TTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAG TATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTA TAAAAGTTGTATCTTGAAACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTT TATCTCCAGCAACATTTCTCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATT TATATTCAGTGATAATTCCTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTAT GTACTCTGTTGGAATTTGTGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCAT GGAGAATTAATCCCACCTTTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAG GAATTCTTCCAGTAGGTGCTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTA ACCTACCAAAATGGATAGGCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAGTTTTGTAGGGTGGTGGGAAATGGGGGATCTTCAATGTTTATTTTAA >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2616nt AGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACGTCCCTGGCAGCC CCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACCTCTGCGGGCTGC TTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCGAATAAAAACTGC AGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCC TGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCT GGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAG AAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAAC GACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGT CTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAA CGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGA GCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAG ACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTC GTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATG GTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGG ATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGC TCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAG GGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAA CTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGT TTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTT TTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGA TAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAAT TCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTT GGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACA TCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAA CTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATG TGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTA AAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCA TTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGA GCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGCTTGATGATGGTGCCTGGCACATAGTAGGCACTCAATAAATATTTGT >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2485nt AGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACGTCCCTGGCAGCC CCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACCTCTGCGGGCTGC TTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCGAATAAAAACTGC AGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCC TGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCT GGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAG AAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAAC GACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGT CTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAA CGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGA GCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAG ACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTC GTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATG GTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGG ATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACA GAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACC ATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGG ACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGC ACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCT TGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTAT TTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAAC GTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAA CAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGC ACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACA CTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTT GGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCC TTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAG >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2620nt AGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACGTCCCTGGCAGCC CCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACCTCTGCGGGCTGC TTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCGAATAAAAACTGC AGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCC TGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCT GGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAG AAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAAC GACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGT CTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAA CGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGA GCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAG ACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTC GTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATG GTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGG ATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGC TCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAG GGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAA CTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGT TTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTT TTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGA TAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAAT TCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTT GGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACA TCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAA CTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATG TGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTA AAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCA TTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGA GCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGCTTGATGATGGTGCCTGGCACATAGTAGGCACTCAATAAATATTTGT >In-frame_CD44_ENST00000526025_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1535nt AGTGCGTCTCTGGGCGCAGGGGCCAGTGGGGCTCGGAGGCACAGGCACCCCGCGACACTCCAGGTTCCCCGACCCACGTCCCTGGCAGCC CCGATTATTTACAGCCTCAGCAGAGCACGGGGCGGGGGCAGAGGGGCCCGCCCGGGAGGGCTGCTACTTCTTAAAACCTCTGCGGGCTGC TTAGTCACAGCCCCCCTTGCTTGGGTGTGTCCTTCGCTCGCTCCCTCCCTCCGTCTTAGGTCACTGTTTTCAACCTCGAATAAAAACTGC AGCCAACTTCCGAGGCAGCCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCC TGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCT GGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAG AAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAAC GACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGT CTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAA CGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGA GCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAG ACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTC GTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATG GTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGG ATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACA GAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACC ATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGG >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2889nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT TTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAA ACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTC TCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTC CTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTG TGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCT TTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTG CTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAG GCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAGTTTTGTAGGGTGGTGGGAAATGGGGGATCTTCAATGTTTATTTTAAAATAAAATAAAATAAGTT >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2328nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2197nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2332nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000449691_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1247nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2889nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT TTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAA ACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTC TCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTC CTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTG TGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCT TTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTG CTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAG GCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAGTTTTGTAGGGTGGTGGGAAATGGGGGATCTTCAATGTTTATTTTAAAATAAAATAAAATAAGTT >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2328nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2197nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2332nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000360158_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1247nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2889nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT TTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAA ACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTC TCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTC CTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTG TGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCT TTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTG CTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAG GCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAGTTTTGTAGGGTGGTGGGAAATGGGGGATCTTCAATGTTTATTTTAAAATAAAATAAAATAAGTT >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2328nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2197nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2332nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000415148_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1247nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2889nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT TTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAA ACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTC TCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTC CTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTG TGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCT TTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTG CTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAG GCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAGTTTTGTAGGGTGGTGGGAAATGGGGGATCTTCAATGTTTATTTTAAAATAAAATAAAATAAGTT >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2328nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2197nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2332nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000437706_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1247nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2889nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT TTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAA ACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTC TCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTC CTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTG TGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCT TTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTG CTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAG GCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAGTTTTGTAGGGTGGTGGGAAATGGGGGATCTTCAATGTTTATTTTAAAATAAAATAAAATAAGTT >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2328nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2197nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG AGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTT CTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCC TCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGA CTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGAT GAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAA TTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACA CATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGC AACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAG ACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTC ACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTT TTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGAT >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2332nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTG TTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTC TGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAA CATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACT GAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTA TATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTG CAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTA TACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTAT TTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTA TTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTA CATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTC TTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGT TAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAA TTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTC >In-frame_CD44_ENST00000433354_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1247nt CCTCATTGCCCAGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGAT CCTCCAGCTCCTTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGC CGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTT TGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAA TTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTC AGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATG CCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTC ACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGA CTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAG GCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCT CTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATT TCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGA ACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAG >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2878nt AGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCC TTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTG GCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCC ACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATT CAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACA AGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCT CCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAA CAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCAC CAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGT GCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCA AACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGC TCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAA GTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCT ATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGG ATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCT TAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACA TTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGG AGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGG TCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATG CTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGG GATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTT TGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGG TACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGA AAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTC AGGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAAACACTGGTGTT CAACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTCTCTAGTACTTG CACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTCCTTCCCTTAGA TGCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTGTGCTAGCAGTT TGAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCTTTAAGCAAAGG CTACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTGCTCAGCTATTT AAAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAGGCTGTTGAACA >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2317nt AGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCC TTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTG GCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCC ACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATT CAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACA AGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCT CCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAA CAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCAC CAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGT GCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCA AACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGC TCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTG GAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAA CTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTT CTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTT GTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGC CAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTT GGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAA AATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAG AGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAAC ATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAA AAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTT GTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATT ATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTA TGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGT >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2186nt AGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCC TTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTG GCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCC ACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATT CAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACA AGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCT CCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAA CAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCAC CAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGT GCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCA AACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGC TCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAA GTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCT ATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGG ATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCT TAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACA TTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGG AGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGG TCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATG CTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGG GATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTT TGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGG TACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGA AAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTC >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2321nt AGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCC TTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTG GCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCC ACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATT CAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACA AGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCT CCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAA CAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCAC CAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGT GCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCA AACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGC TCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTG GAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAA CTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTT CTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTT GTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGC CAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTT GGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAA AATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAG AGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAAC ATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAA AAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTT GTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATT ATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTA TGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGT >In-frame_CD44_ENST00000428726_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1236nt AGCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCC TTTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTG GCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCC ACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATT CAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACA AGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCT CCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAA CAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCAC CAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGT GCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCA AACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGC TCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAA GTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCT >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2877nt GCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCT TTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGG CGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCA CAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTC AGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAA GCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTC CTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAAC AAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACC AGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTG CTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAA ACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCT CTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAG TGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTA TTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGA TATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTT AGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACAT TGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGA GTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGT CCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGC TTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGG ATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTT GTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGT ACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAA AAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCA GGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAAACACTGGTGTTC AACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTCTCTAGTACTTGC ACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTCCTTCCCTTAGAT GCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTGTGCTAGCAGTTT GAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCTTTAAGCAAAGGC TACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTGCTCAGCTATTTA AAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAGGCTGTTGAACAT >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2316nt GCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCT TTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGG CGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCA CAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTC AGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAA GCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTC CTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAAC AAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACC AGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTG CTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAA ACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCT CTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGG AAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAAC TTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTC TCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTG TAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCC AGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTG GACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAA ATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGA GCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACA TGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAA AATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTG TAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTA TACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTAT GATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2185nt GCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCT TTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGG CGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCA CAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTC AGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAA GCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTC CTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAAC AAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACC AGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTG CTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAA ACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCT CTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAG TGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTA TTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGA TATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTT AGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACAT TGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGA GTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGT CCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGC TTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGG ATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTT GTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGT ACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAA AAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2320nt GCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCT TTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGG CGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCA CAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTC AGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAA GCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTC CTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAAC AAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACC AGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTG CTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAA ACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCT CTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGG AAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAAC TTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTC TCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTG TAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCC AGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTG GACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAA ATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGA GCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACA TGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAA AATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTG TAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTA TACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTAT GATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTA >In-frame_CD44_ENST00000526669_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1235nt GCGGACCCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCT TTCGCCCGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGG CGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCA CAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTC AGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAA GCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTC CTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAAC AAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACC AGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTG CTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAA ACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCT CTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAG TGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2871nt CCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCC CGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGA TCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTG AGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAA CAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAAC CTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTA ATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAG AGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGC CTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAG GCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTG GTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGC AGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATT AATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTT CTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGA AGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGT AAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATA AAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGG TTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAAT CACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTA ACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAA TCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGG ATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGT ACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATA CCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCAGGGAAA TCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAAACACTGGTGTTCAACAGC TAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTCTCTAGTACTTGCACTTAT TATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTCCTTCCCTTAGATGCATAG GGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTGTGCTAGCAGTTTGAGCAC TAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCTTTAAGCAAAGGCTACTAA GTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTGCTCAGCTATTTAAAAACA AAACTATTCTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAGGCTGTTGAACATTCCACA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2310nt CCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCC CGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGA TCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTG AGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAA CAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAAC CTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTA ATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAG AGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGC CTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAG GCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTG GTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGC AGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGC TGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATC TTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAA AAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGAC ATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACAC CCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTC TATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACA GGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGC ATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATA AAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAA TGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCAT ATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGT TTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTT ACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATT >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2179nt CCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCC CGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGA TCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTG AGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAA CAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAAC CTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTA ATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAG AGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGC CTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAG GCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTG GTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGC AGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATT AATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTT CTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGA AGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGT AAAACAATATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATA AAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGG TTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAAT CACACATATAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTA ACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAA TCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGG ATTGGTACTATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGT ACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATA CCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCAGGGAAA >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2314nt CCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCC CGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGA TCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTG AGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAA CAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAAC CTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTA ATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAG AGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGC CTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAG GCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTG GTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGC AGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGC TGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATC TTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAA AAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGAC ATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACAC CCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTC TATTAGTGATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACA GGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGC ATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATA AAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAA TGGATCACTTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCAT ATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGT TTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTT ACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATT >In-frame_CD44_ENST00000433892_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1229nt CCCAGCCTCTGCCAGGTTCGGTCCGCCATCCTCGTCCCGTCCTCCGCCGGCCCCTGCCCCGCGCCCAGGGATCCTCCAGCTCCTTTCGCC CGCGCCCTCCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGA TCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTG AGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAA CAATCTCTTTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAAC CTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTA ATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAG AGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGC CTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAG GCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTG GTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGC AGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATT AATCTGATTCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTT >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2773nt CCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCAT TCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTAC ACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCT TTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACAT AGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCA GAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAG CAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAG CAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATG AATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACA CAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGA CCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGAT TCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTT CAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACT ATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAAT ATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTAC AAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAG AACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATA TAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGA TACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATG GCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTAC TATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGA AAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGC CTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGAC AGTAGTTTCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAAACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCT TATGTGATTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTCTCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTT GTCTAATTTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTCCTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTC TCTAAATTTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTGTGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTG TGTGCCTAGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCTTTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGG TATTTTCTGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTGCTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATT CTCAAACATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAGGCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAG >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2212nt CCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCAT TCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTAC ACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCT TTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACAT AGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCA GAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAG CAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAG CAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATG AATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACA CAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGA CCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATA GTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCC AAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTT TTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGG AATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAAT GGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTG ATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGA GAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATG TAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGT GTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCAC TTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATG AAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATG TTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTA CTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGC >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2081nt CCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCAT TCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTAC ACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCT TTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACAT AGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCA GAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAG CAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAG CAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATG AATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACA CAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGA CCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGAT TCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTT CAGGAAACTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACT ATTTTTACTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAAT ATACTTTACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTAC AAATCAGCCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAG AACAACTGCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATA TAAGGCTGGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGA TACTGTATAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATG GCCGCTTCTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTAC TATCTATCATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGA AAATCTCTAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGC CTGCTGCTACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGAC >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2216nt CCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCAT TCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTAC ACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCT TTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACAT AGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCA GAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAG CAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAG CAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATG AATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACA CAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGA CCACGGGGAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATA GTCTGCATGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCC AAATTTTAATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTT TTTCCAACTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGG AATGAGATTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAAT GGCCGGATAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTG ATATAAATATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGA GAGTTTTTTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATG TAGTCTGAAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGT GTTAAGGAGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCAC TTGGGAATTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATG AAAGTTGAGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATG TTATGTAGTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTA CTGAAATGTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGC >In-frame_CD44_ENST00000278386_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1131nt CCGTTCGCTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCAT TCTGAATCTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTAC ACAGCATCTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCT TTAAATACAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACAT AGCAGTGGAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCA GAAACTTTAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAG CAAGAACAGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAG CAGAACACTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATG AATGGATACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACA CAGTCTCAGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGA CCACGGGGAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGAT TCACAGGATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTT >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2766nt CTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAAT CTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCAT CTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATA CAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTG GAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTT TAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAAC AGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACA CTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGAT ACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTC AGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGG GAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGG ATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAA CTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTA CTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTT ACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAG CCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACT GCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCT GGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTA TAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTT CTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTAT CATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTC TAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGC TACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTT TCAGTTCTGATGGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAAACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCTTATGTGA TTCACCCCATGCCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTCTCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTTGTCTAAT TTAACCTTAACTGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTCCTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTCTCTAAAT TTGATGGAAATGGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTGTGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTGTGTGCCT AGGAAGTTAATGCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCTTTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGGTATTTTC TGTGCAGAAATTAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTGCTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATTCTCAAAC ATTCATCATTAGACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAGGCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAGTTTTGTA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2205nt CTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAAT CTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCAT CTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATA CAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTG GAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTT TAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAAC AGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACA CTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGAT ACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTC AGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGG GAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCA TGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTT AATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAA CTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGA TTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGA TAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAA TATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTT TTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTG AAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGG AGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAA TTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTG AGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTA GTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAAT GTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGCTTGATGA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2074nt CTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAAT CTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCAT CTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATA CAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTG GAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTT TAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAAC AGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACA CTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGAT ACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTC AGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGG GAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGG ATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAA CTTATTGTAAAGGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTA CTCTGCATGTTCTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTT ACAGGGTGATAATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAG CCCTCGAGTTATTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACT GCATTTCACAGCTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCT GGCTACCAGCTTTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTA TAAGACAAAGCCAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTT CTGTACTTAATGTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTAT CATTCCTTATGACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTC TAGTGGATAATCATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGC TACCACCCTTTTCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTT >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2209nt CTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAAT CTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCAT CTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATA CAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTG GAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTT TAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAAC AGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACA CTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGAT ACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTC AGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGG GAGCCCCACGAGGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCA TGTTAGGAATACATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTT AATTTTTGAATGATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAA CTGAAAATTATTTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGA TTGAACATTTATATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGA TAAGCCATAGTTAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAA TATCAAGTTATTTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTT TTGTTTTTCTTTTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTG AAATTCTAAATGGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGG AGGAATTACAACGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAA TTACTGACTTGACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTG AGTTAACTGATAGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTA GTTTCTTTTTAACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAAT GTAAGCTAGAGTGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGCTTGATGA >In-frame_CD44_ENST00000434472_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1124nt CTCCGGACACCATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAAT CTAGACTTGCTCAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCAT CTCAACCCTTGTACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATA CAGACCAGACTACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTG GAATCAATGTAAATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTT TAAAACAGCAAAATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAAC AGCTTCAAACAGTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACA CTGGATTTCCACGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGAT ACCGGGGCCCTGCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTC AGTTCAGTGCTCCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGG GAGCCCCACGAGGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGG ATTATGTTTAATCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000341394_chr11_34110942_+_2755nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA GGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAA TCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAA GGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTT CTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATA ATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTA TTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAG CTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCT TTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGC CAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAAT GTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATG ACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAAT CATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTT TCAATTGCTATCTTTTGAAAGGCACCAGTATGTGTTTTAGATTGATTTCCCTGTTTCAGGGAAATCACGGACAGTAGTTTCAGTTCTGAT GGTATAAGCAAAACAAATAAAACGTTTATAAAAGTTGTATCTTGAAACACTGGTGTTCAACAGCTAGCAGCTTATGTGATTCACCCCATG CCACGTTAGTGTCACAAATTTTATGGTTTATCTCCAGCAACATTTCTCTAGTACTTGCACTTATTATCTTTTGTCTAATTTAACCTTAAC TGAATTCTCCGTTTCTCCTGGAGGCATTTATATTCAGTGATAATTCCTTCCCTTAGATGCATAGGGAGAGTCTCTAAATTTGATGGAAAT GGACACTTGAGTAGTGACTTAGCCTTATGTACTCTGTTGGAATTTGTGCTAGCAGTTTGAGCACTAGTTCTGTGTGCCTAGGAAGTTAAT GCTGCTTATTGTCTCATTCTGACTTCATGGAGAATTAATCCCACCTTTAAGCAAAGGCTACTAAGTTAATGGTATTTTCTGTGCAGAAAT TAAATTTTATTTTCAGCATTTAGCCCAGGAATTCTTCCAGTAGGTGCTCAGCTATTTAAAAACAAAACTATTCTCAAACATTCATCATTA GACAACTGGAGTTTTTGCTGGTTTTGTAACCTACCAAAATGGATAGGCTGTTGAACATTCCACATTCAAAAGTTTTGTAGGGTGGTGGGA >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000389645_chr11_34110942_+_2194nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA GGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATA CATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAAT GATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTAT TTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTA TATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGT TAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTAT TTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTT TTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAAT GGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAA CGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTG ACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGAT AGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTA ACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAG TGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGCTTGATGATGGTGCCTGGC >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000532820_chr11_34110942_+_2063nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA GGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAA TCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAA GGGACTGTTTTCATCCCATAAAGACAGGACTACAATTGTCAGCTTTCTATTACCTGGATATGGAAGGAAACTATTTTTACTCTGCATGTT CTGTCCTAAGCGTCATCTTGAGCCTTGCACATGATACTCAGATTCCTCACCCTTGCTTAGGAGTAAAACAATATACTTTACAGGGTGATA ATAATCTCCATAGTTATTTGAAGTGGCTTGAAAAAGGCAAGATTGACTTTTATGACATTGGATAAAATCTACAAATCAGCCCTCGAGTTA TTCAATGATAACTGACAAACTAAATTATTTCCCTAGAAAGGAAGATGAAAGGAGTGGAGTGTGGTTTGGCAGAACAACTGCATTTCACAG CTTTTCCAGTTAAATTGGAGCACTGAACGTTCAGATGCATACCAAATTATGCATGGGTCCTAATCACACATATAAGGCTGGCTACCAGCT TTGACACAGCACTGTTCATCTGGCCAAACAACTGTGGTTAAAAACACATGTAAAATGCTTTTTAACAGCTGATACTGTATAAGACAAAGC CAAGATGCAAAATTAGGCTTTGATTGGCACTTTTTGAAAAATATGCAACAAATATGGGATGTAATCCGGATGGCCGCTTCTGTACTTAAT GTGAAATATTTAGATACCTTTTTGAACACTTAACAGTTTCTTTGAGACAATGACTTTTGTAAGGATTGGTACTATCTATCATTCCTTATG ACATGTACATTGTCTGTCACTAATCCTTGGATTTTGCTGTATTGTCACCTAAATTGGTACAGGTACTGATGAAAATCTCTAGTGGATAAT CATAACACTCTCGGTCACATGTTTTTCCTTCAGCTTGAAAGCTTTTTTTTAAAAGGAAAAGATACCAAATGCCTGCTGCTACCACCCTTT >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000530820_chr11_34110942_+_2198nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA GGTAATATTTTGTGGTGGTGATCCTAGCTCCTAAGTGGAGCTTCTGTTCTGGCCTTGGAAGAGCTGTTAATAGTCTGCATGTTAGGAATA CATTTATCCTTTCCAGACTTGTTGCTAGGGATTAAATGAAATGCTCTGTTTCTAAAACTTAATCTTGGACCCAAATTTTAATTTTTGAAT GATTTAATTTTCCCTGTTACTATATAAACTGTCTTGAAAACTAGAACATATTCTCTTCTCAGAAAAAGTGTTTTTCCAACTGAAAATTAT TTTTCAGGTCCTAAAACCTGCTAAATGTTTTTAGGAAGTACTTACTGAAACATTTTTGTAAGACATTTTTGGAATGAGATTGAACATTTA TATAAATTTATTATTCCTCTTTCATTTTTTTGAAACATGCCTATTATATTTTAGGGCCAGACACCCTTTAATGGCCGGATAAGCCATAGT TAACATTTAGAGAACCATTTAGAAGTGATAGAACTAATGGAATTTGCAATGCCTTTTGGACCTCTATTAGTGATATAAATATCAAGTTAT TTCTGACTTTTAAACAAAACTCCCAAATTCCTAACTTATTGAGCTATACTTAAAAAAAATTACAGGTTTAGAGAGTTTTTTGTTTTTCTT TTACTGTTGGAAAACTACTTCCCATTTTGGCAGGAAGTTAACCTATTTAACAATTAGAGCTAGCATTTCATGTAGTCTGAAATTCTAAAT GGTTCTCTGATTTGAGGGAGGTTAAACATCAAACAGGTTTCCTCTATTGGCCATAACATGTATAAAATGTGTGTTAAGGAGGAATTACAA CGTACTTTGATTTGAATACTAGTAGAAACTGGCCAGGAAAAAGGTACATTTTTCTAAAAATTAATGGATCACTTGGGAATTACTGACTTG ACTAGAAGTATCAAAGGATGTTTGCATGTGAATGTGGGTTATGTTCTTTCCCACCTTGTAGCATATTCGATGAAAGTTGAGTTAACTGAT AGCTAAAAATCTGTTTTAACAGCATGTAAAAAGTTATTTTATCTGTTAAAAGTCATTATACAGTTTTGAATGTTATGTAGTTTCTTTTTA ACAGTTTAGGTAATAAGGTCTGTTTTCATTCTGGTGCTTTTATTAATTTTGATAGTATGATGTTACTTACTACTGAAATGTAAGCTAGAG TGTACACTAGAATGTAAGCTCCATGAGAGCAGGTACCTTGTCTGTCTTCTCTGCTGTATCTATTCCCAACGCTTGATGATGGTGCCTGGC >In-frame_CD44_ENST00000352818_chr11_35160917_+_CAPRIN1_ENST00000529307_chr11_34110942_+_1113nt ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGTTCATTCTGAATCTAGACTTGCT CAGCCTAATCAAGTTCCTGTACAACCAGAAGCGACACAGGTTCCTTTGGTATCATCCACAAGTGAGGGGTACACAGCATCTCAACCCTTG TACCAGCCTTCTCATGCTACAGAGCAACGACCACAGAAGGAACCAATTGATCAGATTCAGGCAACAATCTCTTTAAATACAGACCAGACT ACAGCATCATCATCCCTTCCTGCTGCGTCTCAGCCTCAAGTATTTCAGGCTGGGACAAGCAAACCTTTACATAGCAGTGGAATCAATGTA AATGCAGCTCCATTCCAATCCATGCAAACGGTGTTCAATATGAATGCCCCAGTTCCTCCTGTTAATGAACCAGAAACTTTAAAACAGCAA AATCAGTACCAGGCCAGTTATAACCAGAGCTTTTCTAGTCAGCCTCACCAAGTAGAACAAACAGAGCTTCAGCAAGAACAGCTTCAAACA GTGGTTGGCACTTACCATGGTTCCCCAGACCAGTCCCATCAAGTGACTGGTAACCACCAGCAGCCTCCTCAGCAGAACACTGGATTTCCA CGTAGCAATCAGCCCTATTACAATAGTCGTGGTGTGTCTCGTGGAGGCTCCCGTGGTGCTAGAGGCTTGATGAATGGATACCGGGGCCCT GCCAATGGATTCAGAGGAGGATATGATGGTTACCGCCCTTCATTCTCTAACACTCCAAACAGTGGTTATACACAGTCTCAGTTCAGTGCT CCCCGGGATTACTCTGGCTATCAACGGGATGGATATCAGCAGAATTTCAAGCGAGGCTCTGGGCAGAGTGGACCACGGGGAGCCCCACGA GGTCGTGGAGGGCCCCCAAGACCCAACAGAGGGATGCCGCAAATGAACACTCAGCAAGTGAATTAATCTGATTCACAGGATTATGTTTAA TCGCCAAAAACACACTGGCCAGTGTACCATAATATGTTACCAGAAGAGTTATTATCTATTTGTTCTCCCTTTCAGGAAACTTATTGTAAA |
Top |
FusionGenePPI for CD44_CAPRIN1 |
| Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in . |
| Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
| Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
| CD44 | ARHGEF1, COL14A1, LCK, IGFBP3, MMP7, ERBB4, TIAM1, TGFBR1, VAV2, FN1, EGFR, ERBB2, HBEGF, EZR, VCAN, SRC, PTPRC, FYN, MSN, NF2, ELAVL1, PRKCZ, ITGB1, FLOT2, CAV1, EP300, STAT3, SLC3A2, IQGAP1, FMNL1, ATF2, ANK1, VHL, BAG1, DPP8, ABCE1, AIM1, DBN1, FLNA, MYH9, DYNLL1, SYNPO, LIMA1, MYO19, SQSTM1, CHERP, PHRF1, CDC73, CD44, FGFR1, CTDSPL, GMEB2, FGF2, GMEB1, DHRS2, METTL8, FAM115C, SLC39A9, AMPD2, SNX33, CAMKV, ATG9A, PRDM10, C17orf80, SNX18, FGFR2, FGFRL1, VANGL1, PARP2, TEFM, LAMA3, MTCH2, HADHB, CLCN7, XAB2, GTF3C2, CDC40, GTF3C3, AQR, GTF3C1, GTF3C6, HADHA, TMEM160, OSBPL8, CDC5L, TNPO2, PRKCI, LEMD3, LGALS1, RBM22, VANGL2, MBOAT7, ISY1, GBAS, TRIM25, CD74 | CAPRIN1 | PINX1, PRMT1, G3BP1, GIGYF2, SIRT7, TSG101, CUL3, CUL1, COPS5, CAND1, APP, CIRBP, ESR1, IGSF8, FBXO6, TARDBP, WBP4, PIN1, RPA3, RPA2, RPA1, FXR1, FXR2, STAU1, RNF2, BMI1, SIRT6, CDK2, ILK, RPS6KB2, HNRNPA1, NTRK1, RPL7, YBX1, NF2, EGFR, CYLD, DNM1L, BRCA1, RPS6, G3BP2 |
| - Retained PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
| - Lost PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
| - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
Top |
RelatedDrugs for CD44_CAPRIN1 |
| Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02) |
| Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
| Hgene | CD44 | P16070 | DB08818 | Hyaluronic acid | CD44 antigen | small molecule | approved|vet_approved |
Top |
RelatedDiseases for CD44_CAPRIN1 |
| Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
| Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
| Hgene | CD44 | C0023487 | Acute Promyelocytic Leukemia | 2 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0011616 | Contact Dermatitis | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0017661 | IGA Glomerulonephritis | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0023467 | Leukemia, Myelocytic, Acute | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0024668 | Mammary Neoplasms, Experimental | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0027627 | Neoplasm Metastasis | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0027746 | Nerve Degeneration | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0030297 | Pancreatic Neoplasm | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0037274 | Dermatologic disorders | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0038356 | Stomach Neoplasms | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0042900 | Vitiligo | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C0311375 | Arsenic Poisoning | 1 | CTD_human |
| Hgene | CD44 | C2609414 | Acute kidney injury | 1 | CTD_human |
Copyright 2018-Present -The University of Texas Health Science Center at Houston (UTHealth)
|