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Fusion gene ID: 3960 |
FusionGeneSummary for BCAS3_PRKAA2 |
 Fusion gene summary |
| Fusion gene information | Fusion gene name: BCAS3_PRKAA2 | Fusion gene ID: 3960 | Hgene | Tgene | Gene symbol | BCAS3 | PRKAA2 | Gene ID | 54828 | 5563 |
| Gene name | BCAS3, microtubule associated cell migration factor | protein kinase AMP-activated catalytic subunit alpha 2 | |
| Synonyms | GAOB1|MAAB | AMPK|AMPK2|AMPKa2|PRKAA | |
| Cytomap | 17q23.2 | 1p32.2 | |
| Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
| Description | breast carcinoma-amplified sequence 3BCAS4/BCAS3 fusionRudhirabreast carcinoma amplified sequence 4/3 fusion proteinmetastasis associated antigen of breast cancerprotein Maab1 | 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-25'-AMP-activated protein kinase, catalytic alpha-2 chainACACA kinaseAMP-activated protein kinase alpha-2 subunit variant 2AMP-activated protein kinase alpha-2 subunit variant 3AMPK alpha 2AMPK | |
| Modification date | 20180523 | 20180523 | |
| UniProtAcc | Q9H6U6 | P54646 | |
| Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000589222, ENST00000407086, ENST00000390652, ENST00000408905, ENST00000588462, ENST00000585744, ENST00000588874, ENST00000585812, | ENST00000371244, | |
| Fusion gene scores | * DoF score | 40 X 23 X 15=13800 | 2 X 3 X 2=12 |
| # samples | 47 | 2 | |
| ** MAII score | log2(47/13800*10)=-4.87586369998789 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | log2(2/12*10)=0.736965594166206 effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs). DoF>8 and MAII>0 | |
| Context | PubMed: BCAS3 [Title/Abstract] AND PRKAA2 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
| Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation | Oncogene involved fusion gene, in-frame and retained their domain. Tumor suppressor gene involved fusion gene, in-frame but not retained their domain. Tumor suppressor gene involved fusion gene, retained protein feature but frameshift. DDR (DNA damage repair) gene involved fusion gene, in-frame but not retained their domain. | ||
| * DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
| Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
| Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
| Hgene | BCAS3 | GO:0043085 | positive regulation of catalytic activity | 17505058 |
| Hgene | BCAS3 | GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | 17505058 |
| Hgene | BCAS3 | GO:0071391 | cellular response to estrogen stimulus | 17505058 |
| Fusion gene information from three resources (ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018)) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| Data type | Source | Cancer type | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| TCGA | RV | BRCA | TCGA-A8-A09G-01A | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57140054 | + |
| TCGA | LD | BRCA | TCGA-A8-A09G-01A | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57157067 | + |
| * LD: Li Ding group's fusion gene list RV: Roel Verhaak group's fusion gene list ChiTaRs fusion database |
| Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| Frame-shift | ENST00000589222 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57140054 | + |
| Frame-shift | ENST00000407086 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57140054 | + |
| Frame-shift | ENST00000390652 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57140054 | + |
| Frame-shift | ENST00000408905 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57140054 | + |
| Frame-shift | ENST00000588462 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57140054 | + |
| intron-3CDS | ENST00000585744 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57140054 | + |
| intron-3CDS | ENST00000588874 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57140054 | + |
| intron-3CDS | ENST00000585812 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57140054 | + |
| In-frame | ENST00000589222 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57157067 | + |
| In-frame | ENST00000407086 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57157067 | + |
| In-frame | ENST00000390652 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57157067 | + |
| In-frame | ENST00000408905 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57157067 | + |
| In-frame | ENST00000588462 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57157067 | + |
| intron-3CDS | ENST00000585744 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57157067 | + |
| intron-3CDS | ENST00000588874 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57157067 | + |
| intron-3CDS | ENST00000585812 | ENST00000371244 | BCAS3 | chr17 | 58885437 | + | PRKAA2 | chr1 | 57157067 | + |
Top |
FusionProtFeatures for BCAS3_PRKAA2 |
| Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
| Hgene | Tgene |
| BCAS3 | PRKAA2 |
| Catalytic subunit of AMP-activated protein kinase(AMPK), an energy sensor protein kinase that plays a key role inregulating cellular energy metabolism. In response to reduction ofintracellular ATP levels, AMPK activates energy-producing pathwaysand inhibits energy-consuming processes: inhibits protein,carbohydrate and lipid biosynthesis, as well as cell growth andproliferation. AMPK acts via direct phosphorylation of metabolicenzymes, and by longer-term effects via phosphorylation oftranscription regulators. Also acts as a regulator of cellularpolarity by remodeling the actin cytoskeleton; probably byindirectly activating myosin. Regulates lipid synthesis byphosphorylating and inactivating lipid metabolic enzymes such asACACA, ACACB, GYS1, HMGCR and LIPE; regulates fatty acid andcholesterol synthesis by phosphorylating acetyl-CoA carboxylase(ACACA and ACACB) and hormone-sensitive lipase (LIPE) enzymes,respectively. Regulates insulin-signaling and glycolysis byphosphorylating IRS1, PFKFB2 and PFKFB3. Involved in insulinreceptor/INSR internalization (PubMed:25687571). AMPK stimulatesglucose uptake in muscle by increasing the translocation of theglucose transporter SLC2A4/GLUT4 to the plasma membrane, possiblyby mediating phosphorylation of TBC1D4/AS160. Regulatestranscription and chromatin structure by phosphorylatingtranscription regulators involved in energy metabolism such asCRTC2/TORC2, FOXO3, histone H2B, HDAC5, MEF2C, MLXIPL/ChREBP,EP300, HNF4A, p53/TP53, SREBF1, SREBF2 and PPARGC1A. Acts as a keyregulator of glucose homeostasis in liver by phosphorylatingCRTC2/TORC2, leading to CRTC2/TORC2 sequestration in thecytoplasm. In response to stress, phosphorylates 'Ser-36' ofhistone H2B (H2BS36ph), leading to promote transcription. Acts asa key regulator of cell growth and proliferation byphosphorylating TSC2, RPTOR and ATG1/ULK1: in response to nutrientlimitation, negatively regulates the mTORC1 complex byphosphorylating RPTOR component of the mTORC1 complex and byphosphorylating and activating TSC2. In response to nutrientlimitation, promotes autophagy by phosphorylating and activatingATG1/ULK1. AMPK also acts as a regulator of circadian rhythm bymediating phosphorylation of CRY1, leading to destabilize it. Mayregulate the Wnt signaling pathway by phosphorylating CTNNB1,leading to stabilize it. Also phosphorylates CFTR, EEF2K, KLC1,NOS3 and SLC12A1. Plays an important role in the differentialregulation of pro-autophagy (composed of PIK3C3, BECN1, PIK3R4 andUVRAG or ATG14) and non-autophagy (composed of PIK3C3, BECN1 andPIK3R4) complexes, in response to glucose starvation. Can inhibitthe non-autophagy complex by phosphorylating PIK3C3 and canactivate the pro-autophagy complex by phosphorylating BECN1 (Bysimilarity). {ECO:0000250|UniProtKB:Q8BRK8,ECO:0000269|PubMed:11518699, ECO:0000269|PubMed:11554766,ECO:0000269|PubMed:12519745, ECO:0000269|PubMed:14651849,ECO:0000269|PubMed:15866171, ECO:0000269|PubMed:17486097,ECO:0000269|PubMed:17711846, ECO:0000269|PubMed:18184930,ECO:0000269|PubMed:20074060, ECO:0000269|PubMed:20160076,ECO:0000269|PubMed:21205641, ECO:0000269|PubMed:25687571,ECO:0000269|PubMed:7959015}. |
| Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at . * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
| - In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Tgene | >PRKAA2 | chr17:58885437 | chr1:57157067 | ENST00000371244 | + | 1 | 9 | 291_376 | 78 | 553 | Region | AIS |
| - In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Tgene | PRKAA2 | chr17:58885437 | chr1:57157067 | ENST00000371244 | + | 1 | 9 | 16_268 | 78 | 553 | Domain | Protein kinase |
| Tgene | PRKAA2 | chr17:58885437 | chr1:57157067 | ENST00000371244 | + | 1 | 9 | 22_30 | 78 | 553 | Nucleotide binding | ATP |
Top |
FusionGeneSequence for BCAS3_PRKAA2 |
| For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. (nt: nucleotides, aa: amino acids) |
| * Fusion amino acid sequences. |
| >In-frame_BCAS3_ENST00000589222_chr17_58885437_+_PRKAA2_ENST00000371244_chr1_57157067_+_633aa MNEAMATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRFENADLNDTSRNLEFHEIHSTGNEPP LLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILPAPQFGAQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGYQVISTPTDFFMVMEYVSGGE LFDYICKHGRVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLY AGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPED PSYDANVIDDEAVKEVCEKFECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPSGSFMDDSAMHIPPGLKPHPERM PPLIADSPKARCPLDALNTTKPKSLAVKKAKWHLGIRSQSKPYDIMAEVYRAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLV DNRSYLLDFKSIDDEVVEQRSGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTGSTLSSVSPRLGSHTMDFFEMCASLITTL >In-frame_BCAS3_ENST00000407086_chr17_58885437_+_PRKAA2_ENST00000371244_chr1_57157067_+_633aa MNEAMATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRFENADLNDTSRNLEFHEIHSTGNEPP LLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILPAPQFGAQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGYQVISTPTDFFMVMEYVSGGE LFDYICKHGRVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLY AGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPED PSYDANVIDDEAVKEVCEKFECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPSGSFMDDSAMHIPPGLKPHPERM PPLIADSPKARCPLDALNTTKPKSLAVKKAKWHLGIRSQSKPYDIMAEVYRAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLV DNRSYLLDFKSIDDEVVEQRSGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTGSTLSSVSPRLGSHTMDFFEMCASLITTL >In-frame_BCAS3_ENST00000390652_chr17_58885437_+_PRKAA2_ENST00000371244_chr1_57157067_+_633aa MNEAMATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRFENADLNDTSRNLEFHEIHSTGNEPP LLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILPAPQFGAQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGYQVISTPTDFFMVMEYVSGGE LFDYICKHGRVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLY AGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPED PSYDANVIDDEAVKEVCEKFECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPSGSFMDDSAMHIPPGLKPHPERM PPLIADSPKARCPLDALNTTKPKSLAVKKAKWHLGIRSQSKPYDIMAEVYRAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLV DNRSYLLDFKSIDDEVVEQRSGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTGSTLSSVSPRLGSHTMDFFEMCASLITTL >In-frame_BCAS3_ENST00000408905_chr17_58885437_+_PRKAA2_ENST00000371244_chr1_57157067_+_633aa MNEAMATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRFENADLNDTSRNLEFHEIHSTGNEPP LLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILPAPQFGAQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGYQVISTPTDFFMVMEYVSGGE LFDYICKHGRVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLY AGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPED PSYDANVIDDEAVKEVCEKFECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPSGSFMDDSAMHIPPGLKPHPERM PPLIADSPKARCPLDALNTTKPKSLAVKKAKWHLGIRSQSKPYDIMAEVYRAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLV DNRSYLLDFKSIDDEVVEQRSGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTGSTLSSVSPRLGSHTMDFFEMCASLITTL >In-frame_BCAS3_ENST00000588462_chr17_58885437_+_PRKAA2_ENST00000371244_chr1_57157067_+_633aa MNEAMATDSPRRPSRCTGGVVVRPQAVTEQSYMESVVTFLQDVVPQAYSGTPLTEEKEKIVWVRFENADLNDTSRNLEFHEIHSTGNEPP LLIMIGYSDGMQVWSIPISGEAQELFSVRHGPIRAARILPAPQFGAQKCDNFAEKRPLLGVCKSIGSSGYQVISTPTDFFMVMEYVSGGE LFDYICKHGRVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLRTSCGSPNYAAPEVISGRLY AGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPED PSYDANVIDDEAVKEVCEKFECTESEVMNSLYSGDPQDQLAVAYHLIIDNRRIMNQASEFYLASSPPSGSFMDDSAMHIPPGLKPHPERM PPLIADSPKARCPLDALNTTKPKSLAVKKAKWHLGIRSQSKPYDIMAEVYRAMKQLDFEWKVVNAYHLRVRRKNPVTGNYVKMSLQLYLV DNRSYLLDFKSIDDEVVEQRSGSSTPQRSCSAAGLHRPRSSFDSTTAESHSLSGSLTGSLTGSTLSSVSPRLGSHTMDFFEMCASLITTL |
| * Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region). |
| >In-frame_BCAS3_ENST00000589222_chr17_58885437_+_PRKAA2_ENST00000371244_chr1_57157067_+_1899nt ATGAATGAAGCTATGGCTACAGATTCCCCAAGAAGACCCAGTCGTTGTACTGGTGGAGTTGTGGTTCGCCCCCAGGCTGTCACAGAGCAG TCCTACATGGAAAGTGTTGTGACTTTTCTGCAGGATGTTGTGCCACAGGCTTACAGTGGAACACCTCTAACAGAAGAAAAGGAGAAAATA GTCTGGGTCAGATTTGAAAATGCAGATTTAAATGATACATCAAGAAATCTGGAATTTCATGAAATACATAGTACTGGGAATGAACCGCCT TTGTTGATTATGATTGGCTACAGTGATGGAATGCAGGTCTGGAGCATCCCTATCAGTGGTGAAGCACAAGAGCTCTTCTCTGTTCGACAT GGCCCAATTCGAGCGGCTAGAATCTTGCCTGCTCCACAGTTTGGTGCTCAAAAATGTGATAACTTTGCTGAAAAAAGACCCCTCCTTGGT GTTTGTAAGAGCATTGGATCTTCTGGATACCAGGTGATCAGCACTCCAACAGATTTTTTTATGGTAATGGAATATGTGTCTGGAGGTGAA TTATTTGACTACATCTGTAAGCATGGACGGGTTGAAGAGATGGAAGCCAGGCGGCTCTTTCAGCAGATTCTGTCTGCTGTGGATTACTGT CATAGGCATATGGTTGTTCATCGAGACCTGAAACCAGAGAATGTCCTGTTGGATGCACACATGAATGCCAAGATAGCCGATTTCGGATTA TCTAATATGATGTCAGATGGTGAATTTCTGAGAACTAGTTGCGGATCTCCAAATTATGCAGCACCTGAAGTCATCTCAGGCAGATTGTAT GCAGGTCCTGAAGTTGATATCTGGAGCTGTGGTGTTATCTTGTATGCTCTTCTTTGTGGCACCCTCCCATTTGATGATGAGCATGTACCT ACGTTATTTAAGAAGATCCGAGGGGGTGTCTTTTATATCCCAGAATATCTCAATCGTTCTGTCGCCACTCTCCTGATGCATATGCTGCAG GTTGACCCACTGAAACGAGCAACTATCAAAGACATAAGAGAGCATGAATGGTTTAAACAAGATTTGCCCAGTTACTTATTTCCTGAAGAC CCTTCCTATGATGCTAACGTCATTGATGATGAGGCTGTGAAAGAAGTGTGTGAAAAATTTGAATGTACAGAATCAGAAGTAATGAACAGT TTATATAGTGGTGACCCTCAAGACCAGCTTGCAGTGGCTTATCATCTTATCATTGACAATCGGAGAATAATGAACCAAGCCAGTGAGTTC TACCTCGCCTCTAGTCCTCCATCTGGTTCTTTTATGGATGATAGTGCCATGCATATTCCCCCAGGCCTGAAACCTCATCCAGAAAGGATG CCACCTCTTATAGCAGACAGCCCCAAAGCAAGATGTCCATTGGATGCACTGAATACGACTAAGCCCAAATCTTTAGCTGTGAAAAAAGCC AAGTGGCATCTTGGAATCCGAAGTCAGAGCAAACCGTATGACATTATGGCTGAAGTTTACCGAGCTATGAAGCAGCTGGATTTTGAATGG AAGGTAGTGAATGCATACCATCTTCGTGTAAGAAGAAAAAATCCAGTGACTGGCAATTACGTGAAAATGAGCTTACAACTTTACCTGGTT GATAACAGGAGCTATCTTTTGGACTTTAAAAGCATTGATGATGAAGTAGTGGAGCAGAGATCTGGTTCCTCAACACCTCAGCGTTCCTGT TCTGCTGCTGGCTTACACAGACCAAGATCAAGTTTTGATTCCACAACTGCAGAGAGCCATTCACTTTCTGGCTCTCTCACTGGCTCTTTG 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CCTCACTTTGGATTTATAAAATGTAAAAACCTGGAACATGCCTGCCACAGACACCACTTTGTCTATTCACCGGGTACTAATTTACATCCT ATTAATGGTTGTAAAAGCTGAGTGTCTAAATGCTAGACATGTTCACAATTTTGTCTGTTTTTGTTTATTTGTTTTTAAGACCCAAACCTT TTCAATCTTGCATTTATTTACTTGGTTCTCCTGTGTCACCCTGTGGCTTTTTAAATAGGGAATGTAATTTATTTTAATAGTAGTTCTCAA AGACTCTATTAAAAACTCTGGACGAGGGATATGTGCAATCTGTTGGTAAGTCACATCCTATGTTTGGCCTCATTTTTATAACTCCTAAAA TGAGAAAGGTAGATTTTAACACTTCTAAGGTACCTTTGAGCTTTAAAGTTCTTTTCTGCTTTTCCATATGATTTGTGTTAGTGTTCACTT TTTATATATTTAGAGTTTTTATATGAGTGTGAATGTTTCTGTTTTGATTTGGTGAGGCATGTCAGAGGTATATACTTGAATATTTTTCTA AATACAGCTGCTGGAGGAATGCAAATGGCAAAAATCATCCAGAAAACCAAACACGGTGAAACATCACATCCATTTGGCATGAAGCAAAGC ATTACAAATTTGGAGTGATGAAAGTGTTCCATATATTTTTTATAGTGATTTTTCGATCTAGAGACCCTTCATATTGTTTACTTACTATTA CGATAACTTTGAGAGGTAACCAGAGAAAGCATTTTTGCCATTTCCAGATGAGGAAGCAGGACCAGAAAGCTCTTCATAAAGCTTTAACAC CATACAAGTATCCAGCAGTGATCAATTGCTCTTTATAGGAAACCACCTTTCCTCTGGGGAAGAACAGTCTGAATTAATAAAACATCAGAG TGGTTGAGTAGTAAAAATAAACACAGATGTATTGCTTTCAAGTCTTAGAGTGACATAAAGTAGTCTTAAATAAATAGTTCTTAGTTTATT TTAAGCAGTTGATTGTACTAACGAGATGTAATTATCTGAAGTATTTATGATTAGCATATTGGTTTTTATAAGTATTTCTGAGTTATTGAG GGTGCTTAAAAATGCTGAAGAAACTTTAAAACATGATTCTTCTTATAATTTTATGTGATTCTTATAGCACAATCATTTTTGAAAAAGGAA AACTAGGCTGGGTGTAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACCCGAGTTCAGGAGTTCGAGAC CAGTCTGGCCAACATGGTGAAACCTCGTCTCTACTAAAAATACCAAAATTATCCGGTGTGGTGACAGGCTGCTTGTAATCCCAGCTACTC GGGAGGCTGAGGCACGGGAATCTCTTGAACCTGGGAGGCAGAGATTGCAATAAGCCAAGATCATGCCACTGCATGCCAGCCTGGGTGACA GCACAAGACTGTCTCAAAAAAAAACAAAAAAAGGAAAAAGAAAACTAGCCCCAGTCCCTGTCTAAATTGTTATAGTTTTTGACTATTATC TGAATTAGTCTTATCCAAATTTCATATGCAGATTGATTTTTCATTTTGTATGTATATTACATGATATAACTATTTTCATAGAATATATTT CTAATTTACAAACACTGAATTATTAGCTTGATAGAGTTTCTCCCAAACCTTATAAAACTTTGAAATGTACTTATGTTTGAGCTTTAAAAA TTATAAAAACTTCATTTAAACAAGTTGCTGGCATCATTACTAGCCTTTCCACCTATAATTATGATGCATTTGATGCCACTGAACAGTAAT AGCACAAAGAACAGGTCACACAGTCTAGACTGGATTGAGTTTTAATTAAACTTCTTCATCCATAGCCTGATAAGAATCAGGCTGGGTCTA GAAGAGTTATCAGACTGTAGGCCTGTATTAATTTTGCAAGCTAATGTTAATGTTTACTGCCAGCCTTGCATAGCAATGCCAGTTTGCAGT TGTGACTATGATGTGACTTTTGGTAAAAATGGTTTATATCTAAAGTAGTTTAGATTTTATGGAAGTGGCTCTTGATTGTTTGGACAAGCA GGGTAGGTAAATTTCAATTACGTTTGAAGTGTAATTAAATCCTAGAATAGAGCACTCTCCAGAAAAAAAAATGAAAAAAGAATTTGGAGA ATATCCTGGCATGAAAACTTTTTTGAATAATACGTAGAATTTTGACAAGGTTCATACAGTGCATACAGTGTGACCTTTTCTGAGGTGGGC AGGGAGGGTTGCTACGTTGTGTTGATTTAAAATTTCAAGGAGGAACAAAAACATTCTAGCCAAGGAGAATTGCATTGTTATTTTTTTTTC TACTAATTTAAACGTGCATTTTTCACAGTTACACATTTAAGTTTTGCTACCAAAAATGGCCATTTTTCTAGACAGATAACATTTTCCTAA AGTGGAAGAGAGATCCACTGTTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTAAATTGTGCCTTCTCCCTTAAATTATAAGAAGAGTAATAGT AAAAACTTGTTTAAACTATATTTTCTTTTTTTCTAATCCCTCTCAGTTCTCCTTAGATCTGCCTCCTACAAATGATCATGTTGTTTGCAT CTGCCTGATTGAGTTCCCTTGGTCAAACCTCTCCCTATCACTATCAGAAGTTGTTCACTAAATGTATTTTCCTATTTCTTTCATGTTGAT TGACTTTATAAGTCACCTTGGTAAACATAACATTTGGCTACCTTCTCATGCTTTATAAATGAATTTGATGAATGGCAGTTTTTATATTTT AACCCTTTAAAAAGTTTGTCAAGGAAACAACTCAGAGCTAAGAACAAAATCTAACTTGGAATCAGTTTCTTCCTTTGGCTGCTGAAGCAG CAGCAAGTCACGTAACCTCATTTAGTTTTTTGATTTACAAAATGTGGATAATAACCTACCTCACAGATGTGTGTGAGCAACTGTTTGAAA GCCCTTGTTTAAATACAGGGTTTATATCCCCACATTCAATGTAAATTCCTTTTTTTAAAAAAAATAAGTATCTTTGATACTGATAGGATG AGTATCTTGATTTTTAGGTAAGATCACAGTTTCACAAATTGTGGTGTTGTTAGGTGACATTTAATATTTCTTGAGACCTCAAGTATTCAA ATATCAAACTTGTCCTGTGTTGTAACAAATATTCAGAATCTCTTAAAATGTTGGCTGAAGCTGCCTTAATGTACCAAAATACAGCTCTCA AGACTGTTCACAAATATCTGTGGTTGTACAATGTTTTGAACATTTAATGTAAAGTTGTTGTAGAACTGTGAACTCTAAGGATAGTATCTT TATTGTTTTAGGAAGAATGGTTGTGTTCTTTGTCATGTATGCTTAAATATACAGTGGATTTTGAATGCAACAAATAAAACTGAAAACAGC CATTTGGTTGTGTCATGACAATCATAATATAGGATATAATATTTACTTTTTTTCAAAAACATCCTGCATTCATTCATTCTTAGCATACCT TTGAAAAAGAAAAAAAAATCCATAGGTTGATACATTGACCCATTGAAGTACTTCATTACGTATTTATTGAAAATTTTTTTTAATTGTTGA AATTGGGACCACTTTTTATAATTGGTTTCAAGAAAAAAAAATGAACAGACTTCCAGTGCTTTTCTGTTCAAATAAACTCCGATTCAAATT TCAGTTTTGTTTGTTATATACTTTTTGTGAGTGTTAAATGATATGGGAAGGATTTGTCTTTCATTAACCATATGGAAAAGATGTCTTCCT GAATTACATAGCATTTCATAGTTACAGATTCTTCCTAATTAATGTTTGCACCATATGAAACTCATAGGTAACAAACACAAAGGAGAAAAG |
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FusionGenePPI for BCAS3_PRKAA2 |
| Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in . |
| Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
| Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
| BCAS3 | CTBP1, CTBP2, CDC23, C16orf70, ZDHHC17, ESR1, PELP1, HIST1H3A, KAT2B, WIPI2, ATM, BAG4, CCND1, FBXW7, KRAS, PALB2, PHB, PTPN1, SMAD4, STK11, TGFB1, TSG101, XRCC3, OFD1, CEP128, FBF1, NPHP1, SCLT1, XPO1, CD14, HDAC1, IRF3, MAGEE1, IL17RA, DOCK5, VWA5A, RAB2B | PRKAA2 | PRKAG1, CAMKK2, PRKAB2, MLF2, PRKAA1, STIM2, SH3PXD2A, STIM1, GYS1, PRKAG2, CEP170B, MAST3, MAP3K5, MAP3K6, BAIAP2L1, GYG1, PIK3CG, FLCN, AMOT, RB1CC1, ULK1, GFPT1, AGL, PARS2, FNIP1, DFFA, SMC1A, ACACA, DNAJB1, PRKAB1, EPM2A, NRAP, TMOD1, UBE2I, PBXIP1, SNW1, TRIP6, MYOZ1, C19orf47, PSMD11, RPTOR, WWP1, HSP90AA1, PPARG, AES, FOS, GLI1, KIFC3, KRT31, NONO, VPS52, TCF4, AIMP2, ABI2, APPBP2, RBPMS, NECAB2, HOMEZ, CCNB1IP1, HMBOX1, TSC22D4, USHBP1, ZNF397, L3MBTL3, RFX6, NUTM1, KCTD1, KIF24, KRTAP10-3, NOTCH2NL, ZBTB8A, BRCA1, INSR, PPM1E, PPM1F, DCLRE1C, NIPSNAP1, STK11, TFAP2A, USP10, G3BP1, PRKAG3, CTNNA3, DNMT1, RBBP7, HAT1 |
| - Retained PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
| - Lost PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
| - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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RelatedDrugs for BCAS3_PRKAA2 |
| Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02) |
| Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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RelatedDiseases for BCAS3_PRKAA2 |
| Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
| Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
| Tgene | PRKAA2 | C0018800 | Cardiomegaly | 1 | CTD_human |
| Tgene | PRKAA2 | C0021655 | Insulin Resistance | 1 | CTD_human |
| Tgene | PRKAA2 | C0038454 | Cerebrovascular accident | 1 | CTD_human |
| Tgene | PRKAA2 | C0271650 | Impaired glucose tolerance | 1 | CTD_human |
| Tgene | PRKAA2 | C0878544 | Cardiomyopathies | 1 | CTD_human |
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