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FusionGeneSummary

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FusionProtFeature

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FusionGeneSequence

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FusionGenePPI

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RelatedDiseases

Fusion gene ID: 30710

FusionGeneSummary for RBM17_PRKACB

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: RBM17_PRKACB
Fusion gene ID: 30710
HgeneTgene
Gene symbol

RBM17

PRKACB

Gene ID

84991

5567

Gene nameRNA binding motif protein 17protein kinase cAMP-activated catalytic subunit beta
SynonymsSPF45PKA C-beta|PKACB
Cytomap

10p15.1

1p31.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionsplicing factor 4545 kDa-splicing factorsplicing factor 45kDacAMP-dependent protein kinase catalytic subunit betacAMP-dependent protein kinase catalytic beta subunit isoform 4abprotein kinase A catalytic subunit betaprotein kinase, cAMP-dependent, beta catalytic subunitprotein kinase, cAMP-dependent, catalytic,
Modification date2018052320180519
UniProtAcc

Q96I25

P22694

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000379888, ENST00000446108, 
ENST00000476706, 
ENST00000370689, 
ENST00000370685, ENST00000394838, 
ENST00000370682, ENST00000394839, 
ENST00000370688, ENST00000470673, 
ENST00000370680, 
Fusion gene scores* DoF score4 X 3 X 4=486 X 5 X 5=150
# samples 46
** MAII scorelog2(4/48*10)=-0.263034405833794
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(6/150*10)=-1.32192809488736
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: RBM17 [Title/Abstract] AND PRKACB [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotationKinase involved fusion gene, inframe and retained kinase domain.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgenePRKACB

GO:0006468

protein phosphorylation

12420224|21880142


check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVHNSCTCGA-MT-A67F-01ARBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000379888ENST00000370689RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000379888ENST00000370685RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000379888ENST00000394838RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000379888ENST00000370682RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000379888ENST00000394839RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000379888ENST00000370688RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
5CDS-3UTRENST00000379888ENST00000470673RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
5CDS-3UTRENST00000379888ENST00000370680RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000446108ENST00000370689RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000446108ENST00000370685RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000446108ENST00000394838RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000446108ENST00000370682RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000446108ENST00000394839RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
In-frameENST00000446108ENST00000370688RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
5CDS-3UTRENST00000446108ENST00000470673RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
5CDS-3UTRENST00000446108ENST00000370680RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
intron-3CDSENST00000476706ENST00000370689RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
intron-3CDSENST00000476706ENST00000370685RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
intron-3CDSENST00000476706ENST00000394838RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
intron-3CDSENST00000476706ENST00000370682RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
intron-3CDSENST00000476706ENST00000394839RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
intron-3CDSENST00000476706ENST00000370688RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
intron-3UTRENST00000476706ENST00000470673RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+
intron-3UTRENST00000476706ENST00000370680RBM17chr10

6148201

+PRKACBchr1

84644860

+

Top

FusionProtFeatures for RBM17_PRKACB


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
RBM17

Q96I25

PRKACB

P22694

Splice factor that binds to the single-stranded 3'AG atthe exon/intron border and promotes its utilization in the secondcatalytic step. Involved in the regulation of alternative splicingand the utilization of cryptic splice sites. Promotes theutilization of a cryptic splice site created by the beta-110mutation in the HBB gene. The resulting frameshift leads to sicklecell anemia. {ECO:0000269|PubMed:12015979,ECO:0000269|PubMed:17589525}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>>>>>>>>>>>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370682+212299_35119356DomainNote=AGC-kinase C-terminal
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370682+21244_29819356DomainProtein kinase
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370685+010299_35162399DomainNote=AGC-kinase C-terminal
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370688+09299_35115258DomainNote=AGC-kinase C-terminal
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370688+0944_29815258DomainProtein kinase
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370689+010299_35115352DomainNote=AGC-kinase C-terminal
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370689+01044_29815352DomainProtein kinase
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000394838+313299_35122359DomainNote=AGC-kinase C-terminal
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000394838+31344_29822359DomainProtein kinase
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000394839+211299_35118322DomainNote=AGC-kinase C-terminal
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000394839+21144_29818322DomainProtein kinase
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370682+21250_5819356Nucleotide bindingATP
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370688+0950_5815258Nucleotide bindingATP
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370689+01050_5815352Nucleotide bindingATP
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000394838+31350_5822359Nucleotide bindingATP
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000394839+21150_5818322Nucleotide bindingATP

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneRBM17chr10:6148201chr1:84644860ENST00000379888+512235_283168402DomainG-patch
HgeneRBM17chr10:6148201chr1:84644860ENST00000379888+512306_385168402DomainNote=RRM
HgeneRBM17chr10:6148201chr1:84644860ENST00000446108+512235_283168402DomainG-patch
HgeneRBM17chr10:6148201chr1:84644860ENST00000446108+512306_385168402DomainNote=RRM
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370685+01044_29862399DomainProtein kinase
TgenePRKACBchr10:6148201chr1:84644860ENST00000370685+01050_5862399Nucleotide bindingATP


Top

FusionGeneSequence for RBM17_PRKACB


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
>In-frame_RBM17_ENST00000379888_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000370689_chr1_84644860_+_505aa
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>In-frame_RBM17_ENST00000379888_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000370685_chr1_84644860_+_505aa
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>In-frame_RBM17_ENST00000379888_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000394838_chr1_84644860_+_505aa
MSLYDDLGVETSDSKTEGWSKNFKLLQSQLQVKKAALTQAKSQRTKQSTVLAPVIDLKRGGSSDDRQIVDTPPHVAAGLKDPVPSGFSAG
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>In-frame_RBM17_ENST00000379888_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000370682_chr1_84644860_+_505aa
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PEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKW

>In-frame_RBM17_ENST00000379888_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000394839_chr1_84644860_+_472aa
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IVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFF
ADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFRGSGDTSNFDD

>In-frame_RBM17_ENST00000379888_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000370688_chr1_84644860_+_411aa
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PEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKW

>In-frame_RBM17_ENST00000446108_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000370685_chr1_84644860_+_505aa
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PEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKW

>In-frame_RBM17_ENST00000446108_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000394838_chr1_84644860_+_505aa
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EVLIPLADEYDPMFPNDYEKVVKRQREERQRQRELERQKEIEEREKRRKDRHEASGFARRPDPDSDEDEDYERERRKRMKEFLAKAKEDF
LKKWENPTQNNAGLEDFERKKTLGTGSFGRVMLVKHKATEQYYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVRLEYAFKDNSNL
YMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLA
PEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKW

>In-frame_RBM17_ENST00000446108_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000394839_chr1_84644860_+_472aa
MSLYDDLGVETSDSKTEGWSKNFKLLQSQLQVKKAALTQAKSQRTKQSTVLAPVIDLKRGGSSDDRQIVDTPPHVAAGLKDPVPSGFSAG
EVLIPLADEYDPMFPNDYEKVVKRQREERQRQRELERQKEIEEREKRRKDRHEASGFARRPDPDSDEDEDYERERRKRMKEFLAKAKEDF
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ATGTCCCTGTACGATGACCTAGGAGTGGAGACCAGTGACTCAAAAACAGAAGGCTGGTCCAAAAACTTCAAACTTCTGCAGTCTCAGCTT
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GAAGTTCTGATTCCCTTAGCTGACGAATATGACCCTATGTTTCCTAATGATTATGAGAAAGTAGTGAAGCGCCAAAGAGAGGAACGACAG
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ATGTCCCTGTACGATGACCTAGGAGTGGAGACCAGTGACTCAAAAACAGAAGGCTGGTCCAAAAACTTCAAACTTCTGCAGTCTCAGCTT
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ATGTCCCTGTACGATGACCTAGGAGTGGAGACCAGTGACTCAAAAACAGAAGGCTGGTCCAAAAACTTCAAACTTCTGCAGTCTCAGCTT
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CCATTCTTTGCAGACCAACCAATTCAGATTTATGAAAAGATTGTTTCTGGAAAGGTCCGATTCCCATCCCACTTCAGTTCAGATCTCAAG
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ATGTCCCTGTACGATGACCTAGGAGTGGAGACCAGTGACTCAAAAACAGAAGGCTGGTCCAAAAACTTCAAACTTCTGCAGTCTCAGCTT
CAGGTGAAGAAGGCAGCTCTCACTCAGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAACAAAGTACAGTCCTCGCCCCAGTCATTGACCTGAAGCGAGGT
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CGGAACCTGCTGCAGGTGGATTTGACCAAGAGATTTGGAAATCTAAAGAATGGTGTCAGTGATATAAAAACTCACAAGTGGTTTGCCACG
ACAGATTGGATTGCTATTTACCAGAGGAAGGTTGAAGCTCCATTCATACCAAAGTTTAGAGGCTCTGGAGATACCAGCAACTTTGATGAC

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CAGGTGAAGAAGGCAGCTCTCACTCAGGCAAAGAGCCAAAGGACGAAACAAAGTACAGTCCTCGCCCCAGTCATTGACCTGAAGCGAGGT
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CCAGAAATAATTCTCAGCAAGGGCTACAATAAGGCAGTGGATTGGTGGGCATTAGGAGTGCTAATCTATGAAATGGCAGCTGGCTATCCC


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CAGGCGCAGGCGCAGGCGGGGCGCAGGCGCGGGCGCGCTCTCCCGGCAGCCCGCGCTCCCTGACCCCGCGCCGCCGAGCGCCCTGAGGAC
TCAGCGAAGGGTGGGCGCCGCCGAGGCCTCCTGCCGCTGGCGGGTTTCCGCGGAGTGCCGCCCGGCTCCGCTCTGCCGCCGGCGCGGCTC
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GCAGCTGGGCTGAAGGATCCTGTTCCCAGTGGGTTTTCTGCAGGGGAAGTTCTGATTCCCTTAGCTGACGAATATGACCCTATGTTTCCT
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GCTCCATTCATACCAAAGTTTAGAGGCTCTGGAGATACCAGCAACTTTGATGACTATGAAGAAGAAGATATCCGTGTCTCTATAACAGAA
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CACTCTGCATCCACCTATGTAACAAGGCACCGCTAAGCAAGCATTGTCTGTGCCATAACACAGTACTAGACCACTTTCTTACTTCTCTTT
GGGTTGTCTTTCTCCTCTCCTATATCCATTTCTTCCTTTTCCAATTTCATTGGTTTTCTCTAAACAGTGCTCCATTTTATTTTGTTGGTG
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CTGCTGCAACTTCTGCTTTCATCCCATGCCTCATCAATGAGGAAAGGGAACAAAGTGTATAAAACTGCCACAATTGTATTTTAATTTTGA
GGTATGATATTTTCAGATATTTCATAATTTCTAACCTCTGTTCTCTCAGTAAACAGAATGTCTGATCGATCATGCAGATACAATGTTGGT
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CTGAAAAAAAAAATCTTTCCCACTGTTTTTTCTGCTTGTTGTAAGAATCAAATGAAATAATGTATGTGAAAGCACCTTGTAAACTGTAAC
CTATCAATGTAAAATGTTAAGGTGTGTTGTTATTTCATTAATTACTTCTTTGTTTAGAATGGAATTTCCTATGCACTACTGTAGCTAGGA

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CAGGCGCAGGCGCAGGCGGGGCGCAGGCGCGGGCGCGCTCTCCCGGCAGCCCGCGCTCCCTGACCCCGCGCCGCCGAGCGCCCTGAGGAC
TCAGCGAAGGGTGGGCGCCGCCGAGGCCTCCTGCCGCTGGCGGGTTTCCGCGGAGTGCCGCCCGGCTCCGCTCTGCCGCCGGCGCGGCTC
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ACAGAAGGCTGGTCCAAAAACTTCAAACTTCTGCAGTCTCAGCTTCAGGTGAAGAAGGCAGCTCTCACTCAGGCAAAGAGCCAAAGGACG
AAACAAAGTACAGTCCTCGCCCCAGTCATTGACCTGAAGCGAGGTGGCTCCTCAGATGACCGGCAAATTGTGGACACTCCACCGCATGTA
GCAGCTGGGCTGAAGGATCCTGTTCCCAGTGGGTTTTCTGCAGGGGAAGTTCTGATTCCCTTAGCTGACGAATATGACCCTATGTTTCCT
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GCTCCATTCATACCAAAGTTTAGAGGCTCTGGAGATACCAGCAACTTTGATGACTATGAAGAAGAAGATATCCGTGTCTCTATAACAGAA
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TAGAGCTGAGACCGTCCTTGTTGAAGCAGTTACCTAGTTCCTTCATTCCAACGACTGAGTGAGGTCTTTATTGCCATCATCCCGTGTGCG
CACTCTGCATCCACCTATGTAACAAGGCACCGCTAAGCAAGCATTGTCTGTGCCATAACACAGTACTAGACCACTTTCTTACTTCTCTTT
GGGTTGTCTTTCTCCTCTCCTATATCCATTTCTTCCTTTTCCAATTTCATTGGTTTTCTCTAAACAGTGCTCCATTTTATTTTGTTGGTG
TTTCAGATGGGCAGTGTTATGGCTACGTGATATTTGAAGGGAAGGATAAGTGTTGCTTTCAGTAGTTATTGCCAATATTGTTGTTGGTCA
ATGGCTTGAAGATAAACTTTCTAATAATTATTATTTCTTTGAGTAGCTCAGACTTGGTTTTGCCAAAACTCTTGGTAATTTTTGAAGATA
GACTGTCTTATCACCAAGGAAATTTATACAAATTAAGACTAACTTTCTTGGAATTCACTATTCTGGCAATAAATTTTGGTAGACTAATAC
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CAGGCGCAGGCGCAGGCGGGGCGCAGGCGCGGGCGCGCTCTCCCGGCAGCCCGCGCTCCCTGACCCCGCGCCGCCGAGCGCCCTGAGGAC
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CACTCTGCATCCACCTATGTAACAAGGCACCGCTAAGCAAGCATTGTCTGTGCCATAACACAGTACTAGACCACTTTCTTACTTCTCTTT
GGGTTGTCTTTCTCCTCTCCTATATCCATTTCTTCCTTTTCCAATTTCATTGGTTTTCTCTAAACAGTGCTCCATTTTATTTTGTTGGTG
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GACTGTCTTATCACCAAGGAAATTTATACAAATTAAGACTAACTTTCTTGGAATTCACTATTCTGGCAATAAATTTTGGTAGACTAATAC
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TTATTTTTAATCAAGCTGATCTTAATGTATATAATCATTCTATTTGCTTTATTATCGGTGCAGGTAGGTCATTAACACCACTTCTTTTCA
TCTGTACCACACCCTGGTGAAACCTTTGAAGACATAAAAAAAACCTGTCTGAGATGTTCTTTCTACCAATCTATATGTCTTTCGGTTATC
AAGTGTTTCTGCATGGTAATGTCATGTAAATGCTGATATTGATTTCACTGGTCCATCTATATTTAAAACGTGCAAGAAAAAAATAAAATA
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ATTATTTTAATAAGTCATGGGGATGACAATTTGATTATTACAATTTAGTTTTCAGTAATCAAAAAGATTTCTATGAATTCTAAAAAATAT
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CATTCCATTTTACTCTCTATTTAAAGGCCGTGAGCAAGCTTGTCATGAGCAAATATGTCAAGGGAGTCAATTTCTGACCAATCAAGTACA
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TAGCATAAATCAGTATTTAACCTAAAATTACATATTTGAAACAGAAGATATTATGTTATGCTCAGTAAATAATTAAGAGATGGCATTGTG
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CAGGCGCAGGCGCAGGCGGGGCGCAGGCGCGGGCGCGCTCTCCCGGCAGCCCGCGCTCCCTGACCCCGCGCCGCCGAGCGCCCTGAGGAC
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ATGGGCAGAGTCGGCCGGGCGGGCCGGCATTAAACTGAAGAAAAGATGTCCCTGTACGATGACCTAGGAGTGGAGACCAGTGACTCAAAA
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AAACAAAGTACAGTCCTCGCCCCAGTCATTGACCTGAAGCGAGGTGGCTCCTCAGATGACCGGCAAATTGTGGACACTCCACCGCATGTA
GCAGCTGGGCTGAAGGATCCTGTTCCCAGTGGGTTTTCTGCAGGGGAAGTTCTGATTCCCTTAGCTGACGAATATGACCCTATGTTTCCT
AATGATTATGAGAAAGTAGTGAAGCGCCAAAGAGAGGAACGACAGAGACAGCGGGAGCTGGAAAGACAAAAGGAAATAGAAGAAAGGGAA
AAAAGGCGTAAAGACAGACATGAAGCAAGTGGGTTTGCAAGGAGACCAGATCCAGATTCTGATGAAGATGAAGATTATGAGCGAGAGAGG
AGGAAAAGAATGAAAGAGTTTCTAGCCAAAGCCAAAGAAGACTTTTTGAAAAAATGGGAGAATCCAACTCAGAATAATGCCGGACTTGAA
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AAGATCTTAGATAAGCAGAAGGTTGTTAAACTGAAGCAAATAGAGCATACTTTGAATGAGAAAAGAATATTACAGGCAGTGAATTTTCCT
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TCTGGAAAGGTCCGATTCCCATCCCACTTCAGTTCAGATCTCAAGGACCTTCTACGGAACCTGCTGCAGGTGGATTTGACCAAGAGATTT
GGAAATCTAAAGAATGGTGTCAGTGATATAAAAACTCACAAGTGGTTTGCCACGACAGATTGGATTGCTATTTACCAGAGGAAGGTTGAA
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>In-frame_RBM17_ENST00000446108_chr10_6148201_+_PRKACB_ENST00000370688_chr1_84644860_+_2826nt
AGTCCCCGCGGCGGGCGCTGGTCTCTCCACGCGGCTGCGGCCCGGTACCCTCCGCCCGCCGCCGCCTCTGGTGACCCTGGCCCTGACCTT
CTCCCTCTTCCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCATGTCTGCCTCGGGCTGTTTGGTGCTGAAGAGCGTTTCTTCTCCGTCTCGTGCACCGCAT
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TCTTAATTGACCATCAAGGCTATATCCAGGTCACAGACTTTGGGTTTGCCAAAAGAGTTAAAGGCAGAACTTGGACATTATGTGGAACTC
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TTGGCCTCGATTTGCCAATCATTCTCTATTGGTTAAATTTTATATTCAGCTGTTTATGAATATATATTCATTTTATATCAAACTTTAAAA
TTTTGTATCTAATAATCAGCATATATTCTAAAATCATAACAGTCTAAATCCTGGGCACCTTAGAAGAATGACACCAGAAAACCTTATTAT
ATCACAATATTCTGTTTTCCCCTTCATTTATTTAGAAATATGACAGGATATTTGGTGTACTTTTGTTTTTTAACTAAAAGTACCAGATTA
TCTCTCCCCATGTGGGATATAAAATTATCCCCATCTCTTACTCCCTTTACTCATCTAAAGTAGAAGTCATGAAAGTGGAATTTTTGCCAT
TAAAAGGCTCTGTATTATGTGAAGTTAGATTGTATTAACCATTTCCCAATAAATCATCTGTTTCAAAACTCAAATTCAAACTAGAATGTG
TCTCTATTCACATTGCAAAAATATTATTGTCTCTCTGGTTAGTGGCTAAAAGCCAAATTGGAAACTAACTAGTTTTTTAAATTTTTTAAA


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FusionGenePPI for RBM17_PRKACB


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
RBM17SAT1, SF3A2, ELAVL1, CUL3, CDK2, HINFP, BARD1, MDC1, SMURF1, SF3B1, DHX15, U2SURP, SF1, SUGP1, CWC15, SAP30BP, CSNK2A1, APBB1, GOLGA2, CCHCR1, PPP1R12C, QRICH1, CEP55, KIAA1683, FAM9B, OBSL1, WDFY2, ZRSR2, SON, LNX2, XPO1, HIST1H3E, MYO1C, PPP3CB, XRCC3, EMC2, MMGT1, SNW1, CDC5L, DPPA4, NANOG, POU5F1, CHERP, ZRSR1, SFSWAP, RBM5, GPATCH11, SF3A3, SF3A1, SF3B2, ACTA2, ACTBL2, RBM10, CYLD, FOXA1PRKACBNGFR, RYR2, TNP1, TNP2, SPP1, PRKAR2A, PRKACA, HSP90AA1, CSNK2A1, ARFGAP1, RPS6, RPL27A, ACVR1B, KIAA1279, ACTR2, ACTR3, ARPC1B, ARPC2, ARPC4, PFDN1, SUMO1, TP53RK, TPRKB, VAPB, HSP90AB1, PRKAR1A, AKAP5, PRKAR1B, PRKAR2B, DCAF7, DYNLL1, TRAP1, DYRK1A, MAPRE1, PDE4DIP, AKAP1, CDK5RAP2, AKAP9, VAPA, AKAP7, AKAP11, APPBP2, MLF1, NAPG, PER1, TALDO1, RABGGTB, C11orf49, AP2M1, DCLRE1C, CCNL2, AKAP14, ARF1, RPE, NTRK1, XPO1, FGFR1OP, CEP170P1, GPR161, PRKACG, HSP90AB4P, FKBP5, PKIG, BMP1, MRPS15, ETFB, NPAS1, DFFB, RAPGEF5, KLHL28, DNA2, TRIM25


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for RBM17_PRKACB


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for RBM17_PRKACB


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneRBM17C0087012Ataxia, Spinocerebellar1CTD_human
TgenePRKACBC0005426Biliary Tract Neoplasm1CTD_human
TgenePRKACBC0033578Prostatic Neoplasms1CTD_human
TgenePRKACBC0206698Cholangiocarcinoma1CTD_human