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Fusion gene ID: 25728 |
FusionGeneSummary for PACRG_QKI |
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Fusion gene information | Fusion gene name: PACRG_QKI | Fusion gene ID: 25728 | Hgene | Tgene | Gene symbol | PACRG | QKI | Gene ID | 135138 | 9444 |
Gene name | parkin coregulated | QKI, KH domain containing RNA binding | |
Synonyms | GLUP|HAK005771|PARK2CRG | Hqk|QK|QK1|QK3|hqkI | |
Cytomap | 6q26 | 6q26 | |
Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
Description | parkin coregulated gene proteinPARK2 co-regulatedPARK2 coregulatedmolecular chaperone/chaperonin-binding proteinparkin co-regulated gene protein | protein quakingQKI/LOC100132735 fusionRNA binding protein HQKhomolog of mouse quaking QKI (KH domain RNA binding protein)quaking homolog, KH domain RNA binding | |
Modification date | 20180523 | 20180522 | |
UniProtAcc | Q96M98 | Q96PU8 | |
Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000337019, ENST00000366889, ENST00000366888, ENST00000542669, | ENST00000275262, ENST00000392127, ENST00000453779, ENST00000361752, ENST00000361195, ENST00000424802, | |
Fusion gene scores | * DoF score | 1 X 1 X 1=1 | 13 X 14 X 6=1092 |
# samples | 2 | 18 | |
** MAII score | log2(2/1*10)=4.32192809488736 | log2(18/1092*10)=-2.60090404459018 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | |
Context | PubMed: PACRG [Title/Abstract] AND QKI [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation | Oncogene involved fusion gene, in-frame and retained their domain. Tumor suppressor gene involved fusion gene, in-frame but not retained their domain. Tumor suppressor gene involved fusion gene, retained protein feature but frameshift. DDR (DNA damage repair) gene involved fusion gene, in-frame but not retained their domain. |
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
![]() |
Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
![]() (ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018)) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
Data type | Source | Cancer type | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
TCGA | LD | LGG | TCGA-DU-6404-01A | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
TCGA | LD | LGG | TCGA-HT-8114-01A | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
* LD: Li Ding group's fusion gene list RV: Roel Verhaak group's fusion gene list ChiTaRs fusion database |
![]() * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000275262 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000392127 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000453779 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000361752 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000361195 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000424802 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000275262 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000392127 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000453779 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000361752 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000361195 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000424802 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000275262 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000392127 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000453779 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000361752 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000361195 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000424802 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000275262 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000392127 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000453779 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000361752 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000361195 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000424802 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163983014 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000275262 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000392127 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000453779 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000361752 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000361195 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000337019 | ENST00000424802 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000275262 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000392127 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000453779 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000361752 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000361195 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366889 | ENST00000424802 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000275262 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000392127 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000453779 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000361752 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000361195 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
In-frame | ENST00000366888 | ENST00000424802 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000275262 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000392127 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000453779 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000361752 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000361195 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
3UTR-3CDS | ENST00000542669 | ENST00000424802 | PACRG | chr6 | 163235313 | + | QKI | chr6 | 163899812 | + |
Top |
FusionProtFeatures for PACRG_QKI |
![]() |
Hgene | Tgene |
PACRG | QKI |
Suppresses cell death induced by accumulation ofunfolded Pael receptor (Pael-R, a substrate of Parkin).Facilitates the formation of inclusions consisting of Pael-R,molecular chaperones, protein degradation molecules and itselfwhen proteasome is inhibited. May play an important role in theformation of Lewy bodies and protection of dopaminergic neuronsagainst Parkinson disease. {ECO:0000269|PubMed:14532270}. |
![]() * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000275262 | + | 1 | 7 | 276_279 | 95 | 326 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000275262 | + | 1 | 7 | 324_330 | 95 | 326 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000361195 | + | 1 | 8 | 276_279 | 95 | 334 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000361195 | + | 1 | 8 | 324_330 | 95 | 334 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000361752 | + | 1 | 8 | 276_279 | 95 | 342 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000361752 | + | 1 | 8 | 324_330 | 95 | 342 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000392127 | + | 1 | 6 | 276_279 | 95 | 320 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000392127 | + | 1 | 6 | 324_330 | 95 | 320 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000424802 | + | 1 | 7 | 276_279 | 95 | 318 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000424802 | + | 1 | 7 | 324_330 | 95 | 318 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000453779 | + | 1 | 7 | 276_279 | 95 | 320 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000453779 | + | 1 | 7 | 324_330 | 95 | 320 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000275262 | + | 3 | 7 | 276_279 | 182 | 326 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000275262 | + | 3 | 7 | 324_330 | 182 | 326 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000361195 | + | 3 | 8 | 276_279 | 182 | 334 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000361195 | + | 3 | 8 | 324_330 | 182 | 334 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000361752 | + | 3 | 8 | 276_279 | 182 | 342 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000361752 | + | 3 | 8 | 324_330 | 182 | 342 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000392127 | + | 3 | 6 | 276_279 | 182 | 320 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000392127 | + | 3 | 6 | 324_330 | 182 | 320 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000424802 | + | 3 | 7 | 276_279 | 182 | 318 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000424802 | + | 3 | 7 | 324_330 | 182 | 318 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000453779 | + | 3 | 7 | 276_279 | 182 | 320 | Motif | Note=SH3-binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000453779 | + | 3 | 7 | 324_330 | 182 | 320 | Motif | Nuclear localization signal |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000275262 | + | 1 | 7 | 182_213 | 95 | 326 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000361195 | + | 1 | 8 | 182_213 | 95 | 334 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000361752 | + | 1 | 8 | 182_213 | 95 | 342 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000392127 | + | 1 | 6 | 182_213 | 95 | 320 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000424802 | + | 1 | 7 | 182_213 | 95 | 318 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000453779 | + | 1 | 7 | 182_213 | 95 | 320 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000275262 | + | 3 | 7 | 182_213 | 182 | 326 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000361195 | + | 3 | 8 | 182_213 | 182 | 334 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000361752 | + | 3 | 8 | 182_213 | 182 | 342 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000392127 | + | 3 | 6 | 182_213 | 182 | 320 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000424802 | + | 3 | 7 | 182_213 | 182 | 318 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
Tgene | >QKI | chr6:163235313 | chr6:163983014 | ENST00000453779 | + | 3 | 7 | 182_213 | 182 | 320 | Region | Qua2 domain%3B involved in RNA binding |
- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
Tgene | QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000275262 | + | 1 | 7 | 87_153 | 95 | 326 | Domain | Note=KH |
Tgene | QKI | chr6:163235313 | chr6:163899812 | ENST00000361195 | + | 1 | 8 | 87_153 | 95 | 334 | Domain | Note=KH |
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AGACACCACATTGTGGGAAGATCTCAGCTTCCAGGGTAAAAGTTAATTTATAACTTAAAAGTGCTATTAAGTTTTTATTACCAAATATAT CTTTTATGGTTTATATTGTAGTGGTATGTATGAAACATTTAAAATTTTACTGTGGAAATTGTGTATATATATATATATAGTCGAAATAGG TGTTCACAGGTCACATGTGAACGGAGAACTGCATGACCGTACATGAAATGCAATAAACCAACTGGAAAAAGTGCATGTGCTTCATCCTCT CAAGCCAACTGCAGCTGGAAAGTGCTGCTTATCCTCCACCCCCAGAAAATGCATGTATCAATATGAGAATAAAGAACGCACACTTTCAAT TTTATTGAGGCTTTCAACACTATTTAAAAGAAAATGTAAGAATTTGACATTCTGGAGTTATTATAACATTAGAAAATGAGCATAACATTC ACTCTGATTTTAGCCATTAAGGGAGATTAGTAAACAGACTGCTACAGTGTTCCATAGTTGGACTGTGCATCCAAAACATTTTTTTATCTT TAATAAATGGTACAGTTTTTATGTAGTTTTCGAATGTAAGAAGAAAGGAATGCTGACCAAAACTTGATTTCATCAGCTTCATGAAAAGGA CTAGTGTCATTAACCTGTTGAACAGAATTGGTTTATTAAAAAAATCATTTCCAGTAGTGTGAAACCTTTACGAGTCTTTAACATCTAAAT GTTATGACTCCTTGTACCTTAAGTTTTCCAGTCTTTCTTATTTATATCATCTCCAAGTACCTCTGGCTCCTTTCCTCTTGCTCACCGGAA CCTTAGTTTTCCTCAACAGAATGCTTTGTTAAAGTAGCCCACAGTTGCAGGATCCATAGCACCGTCGTGCAGACTAGCAGCCCAAAGGTG TGTTTGGTTTGGCTTATACGGTGTTTTGCTTTTTAAACTACTTGCCATAATTTAAAAGTGGCAACACTAGACTTAAAAAAAAAAAAGTCT GATTGCCCATATTAGATTTTTTTTTTAATTCTTCACAAAATCTGCTCTTCCTGAAAGATCAAAGTGTCTAGAAAGCCCAAACATGTATTC TTAACATAGTAGGCACCAGCTGAAACTGAGTAATTAAACGGTCCCCTGAAGCCAAGTATTCCCTGGTTAGTCGCCACCCCACCACTCCTT CCTGTCTCTAGTGTCACACTTGGGCTGTTGATTTTCTTACTCTTCTCTTGCTTTAATCCTTCCCCCCGGCTCTCTGGCTCCTGTGGATAT CTGTGCTTGTTTCCTGGTCCAGGATGGTGATCTGACTTTCAAACCAGCTTCTCAAAAGGGGTGACATAAAATCAGTTTTGATGTTTTTCC TCCTGAAAAATCAGATGAATATTTTAGTCACTGTTACTCATGCACATTGTGTTCTTATGTTTACAGAAGTGCTTAAGTGAATGGAAGCAC TAGACATTTGGATTTCCTTCCTAACGTAATTTTTAATGATTACCCCTTTTATACAGTAATTTGTGGTCTTTAGAAAGCAGTTAAACTAAT TGACCATCTAATAGTTGTACTATACATATGTCTAAAATAATAGTCATGGTAAGTTTGGCATCATATCTTCCCCAAAAAATGTTTATTAAA ATTAGATTATTCCAGTTTAATGCTATTTTGTGAACTGTATACCCTCTGAAAGCGCTTATTTTTACATGCTACACAACAGTTCCAATTTTA AGGAGTGTCTCCTAAAATTGGGATGAAAATCTACTGTAGTCTGTTTTAAAGTATGCTATACTATGTTCATTGGTTACTTAACTGGATATT AATATAAAGGTTATTACAAGAAAAATGATGAAGAGCAAAAGGAGAAGAAAATATTTGCAAGTGAATCCACAATTCTTGCAGAACTATTTG AGTTGATACTAAAGATTTTATGTTCACTCCTTTACCTTAGAACTGTCAAGCTTGGGAATGAGGAAAGTGCCTTGGCTGTGCTTGAAACCT GAATTTTAGTGCTTCCCTTATTACATTCATTGTTTTCAATGATTGATTTATAAAATTAAGACATACTGGTAGTACAAGTTGAAAGTTGGT TTGAATACATTTTAATTAAATGATAATATGTTAATATGCTTTTGTTCATTGCTTTCTCACTGAGGTAAAACAGCATTAAAAAGTTGTCCA >In-frame_PACRG_ENST00000366888_chr6_163235313_+_QKI_ENST00000361195_chr6_163899812_+_1320nt GTGTTGACCAGTCGCTTAGCAACCGGGAGGCTTACCTTTGGAAGCTTGTTGCAGCTCTAGCCAAGGTCCTGCCCTCTTCCCGCCCCGCCC CTAGGGTCCAGCTCCCTTCACCTAGGAGCTGCCAAACATCTGGATCAACCTGGGCACTACGAGGGGTTGAATTTCTACCATTATCGCGCC TTTTGATATTTTTTTCCAGACCTCCTGCTCACATCCGTAAAGCCCACTGATTCTTTTACTACACTTTTTATGAGAACAAGACATTTTCTA GGAAGATGGTGGCAGAAAAAGAGACCCTGAGCTTAAACAAATGCCCAGACAAGATGCCGAAGAGGACCAAGCTGCTGGCACAACAGCCGC TCCCGGTGCACCAGCCTCACTCTCTGGTTTCTGAGGGTTTCACAGTCAAAGCCATGATGAAAAACTCAGTCGTGAGAGGCCCTCCAGCTG CAGGGGCATTTAAAGAAAGACCAACCAAGCCCACAGCATTTCGAAAATTCTATGAGCGAGGTGACTTCCCAATTGCCCTTGAGCATGATT CGAAAGGAAACAAAATCGCCTGGAAGTTTAATTTTGTTGGGAGAATCCTTGGACCTAGAGGACTTACAGCCAAACAACTTGAAGCAGAAA CCGGATGTAAAATCATGGTCCGAGGCAAAGGCTCAATGAGGGATAAAAAAAAGGAGGAGCAAAATAGAGGCAAGCCCAATTGGGAGCATC TAAATGAAGATTTACATGTACTAATCACTGTGGAAGATGCTCAGAACAGAGCAGAAATCAAATTGAAGAGAGCAGTTGAAGAAGTGAAGA AATTATTGGTACCTGCAGCAGAAGGAGAAGACAGCCTGAAGAAGATGCAGCTGATGGAGCTTGCGATTCTGAATGGCACCTACAGAGATG CCAACATTAAATCACCAACAGCCCAGGCTGCTCCAAGGATCATTACTGGGCCTGCGCCGGTTCTCCCACCAGCTGCCCTGCGTACTCCTA CGCCAGCTGGCCCTACCATAATGCCTTTGATCAGACAAATACAGACCGCTGTCATGCCAAACGGAACTCCTCACCCAACTGCTGCAATAG TTCCTCCAGGGCCCGAAGCTGGTTTAATCTATACACCCTATGAGTACCCCTACACATTGGCACCAGCTACATCAATCCTTGAGTATCCTA TTGAACCTAGTGGTGTATTAGGTGCGGTGGCTACTAAAGTTCGAAGGCACGATATGCGTGTCCATCCTTACCAAAGGATTGTGACCGCAG >In-frame_PACRG_ENST00000366888_chr6_163235313_+_QKI_ENST00000424802_chr6_163899812_+_1235nt GTGTTGACCAGTCGCTTAGCAACCGGGAGGCTTACCTTTGGAAGCTTGTTGCAGCTCTAGCCAAGGTCCTGCCCTCTTCCCGCCCCGCCC CTAGGGTCCAGCTCCCTTCACCTAGGAGCTGCCAAACATCTGGATCAACCTGGGCACTACGAGGGGTTGAATTTCTACCATTATCGCGCC TTTTGATATTTTTTTCCAGACCTCCTGCTCACATCCGTAAAGCCCACTGATTCTTTTACTACACTTTTTATGAGAACAAGACATTTTCTA GGAAGATGGTGGCAGAAAAAGAGACCCTGAGCTTAAACAAATGCCCAGACAAGATGCCGAAGAGGACCAAGCTGCTGGCACAACAGCCGC TCCCGGTGCACCAGCCTCACTCTCTGGTTTCTGAGGGTTTCACAGTCAAAGCCATGATGAAAAACTCAGTCGTGAGAGGCCCTCCAGCTG CAGGGGCATTTAAAGAAAGACCAACCAAGCCCACAGCATTTCGAAAATTCTATGAGCGAGGTGACTTCCCAATTGCCCTTGAGCATGATT CGAAAGGAAACAAAATCGCCTGGAAGTTTAATTTTGTTGGGAGAATCCTTGGACCTAGAGGACTTACAGCCAAACAACTTGAAGCAGAAA CCGGATGTAAAATCATGGTCCGAGGCAAAGGCTCAATGAGGGATAAAAAAAAGGAGGAGCAAAATAGAGGCAAGCCCAATTGGGAGCATC TAAATGAAGATTTACATGTACTAATCACTGTGGAAGATGCTCAGAACAGAGCAGAAATCAAATTGAAGAGAGCAGTTGAAGAAGTGAAGA AATTATTGGTACCTGCAGCAGAAGGAGAAGACAGCCTGAAGAAGATGCAGCTGATGGAGCTTGCGATTCTGAATGGCACCTACAGAGATG CCAACATTAAATCACCAACAGCCCAGGCTGCTCCAAGGATCATTACTGGGCCTGCGCCGGTTCTCCCACCAGCTGCCCTGCGTACTCCTA CGCCAGCTGGCCCTACCATAATGCCTTTGATCAGACAAATACAGACCGCTGTCATGCCAAACGGAACTCCTCACCCAACTGCTGCAATAG TTCCTCCAGGGCCCGAAGCTGGTTTAATCTATACACCCTATGAGTACCCCTACACATTGGCACCAGCTACATCAATCCTTGAGTATCCTA |
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FusionGenePPI for PACRG_QKI |
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Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
PACRG | HSP90AA1, CCT3, CCT4, CCT5, TCP1, CCT6A, CCT7, CCT2, TUBA1A, TUBB, HSPA4, PARK2, STUB1, DNAJA1, VCP, GPR37, APP, KLHL36, TP53, STIP1, CCDC40 | QKI | HNRNPK, USP30, MED12, MED13, MED25, MED16, MED17, MED1, MED24, MED23, MED4, MED29, MED31, MED15, MED14, MED26, MED10, POLR2A, MED27, ELAVL1, PSMF1, C10orf10, FUBP3, HCLS1, PCBP2, PTBP1, PTBP2, RBM14, RBFOX2, RBPMS, RNF138, SERF2, THAP1, USH1C, RBFOX1, PCBP1, PCBP4, APP, NDUFA7, CDV3, ATXN1, FN1, U2AF2, RBM23, RALY, WDR77, HNRNPH2, QKI, DAZ1, IL7R, CARM1, SNRPA, RBM11, NABP1, HNRNPLL, OIP5, RBMX, ZACN, CYP1A1, NTRK1, EWSR1, HYPK, DUSP22, DUSP4, ATE1, RBM42, FBXW11, SLC39A12, VAC14, TRIM11, SYNCRIP, SNRNP27 |
![]() |
Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
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Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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RelatedDrugs for PACRG_QKI |
![]() (DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02) |
Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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RelatedDiseases for PACRG_QKI |
![]() (DisGeNet 4.0) |
Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
Tgene | QKI | C0036341 | Schizophrenia | 5 | PSYGENET |
Tgene | QKI | C0017638 | Glioma | 1 | CTD_human |
Tgene | QKI | C0041696 | Unipolar Depression | 1 | PSYGENET |
Tgene | QKI | C1269683 | Major Depressive Disorder | 1 | PSYGENET |