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Center for Computational Systems Medicine
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FusionGeneSummary

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FusionProtFeature

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FusionGeneSequence

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FusionGenePPI

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RelatedDiseases

Fusion gene ID: 24227

FusionGeneSummary for NFIB_ZDHHC21

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: NFIB_ZDHHC21
Fusion gene ID: 24227
HgeneTgene
Gene symbol

NFIB

ZDHHC21

Gene ID

4781

340481

Gene namenuclear factor I Bzinc finger DHHC-type containing 21
SynonymsCTF|HMGIC/NFIB|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097
Cytomap

9p23-p22.3

9p22.3

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionnuclear factor 1 B-typeCCAAT-box-binding transcription factorTGGCA-binding proteinnuclear factor 1/Bpalmitoyltransferase ZDHHC21zinc finger, DHHC domain containing 21
Modification date2018052320180523
UniProtAcc

O00712

Q8IVQ6

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000380934, ENST00000380959, 
ENST00000380953, ENST00000397575, 
ENST00000397581, ENST00000397579, 
ENST00000543693, ENST00000380924, 
ENST00000380921, 
ENST00000380916, 
ENST00000497966, 
Fusion gene scores* DoF score8 X 8 X 4=2561 X 1 X 1=1
# samples 81
** MAII scorelog2(8/256*10)=-1.67807190511264
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(1/1*10)=3.32192809488736
Context

PubMed: NFIB [Title/Abstract] AND ZDHHC21 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneNFIB

GO:0045944

positive regulation of transcription by RNA polymerase II

9099724|19540848

TgeneZDHHC21

GO:0018345

protein palmitoylation

23034182


check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVLUADTCGA-75-6211-01ANFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000380934ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000380934ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000380959ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000380959ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000380953ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000380953ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000397575ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000397575ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000397581ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000397581ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000397579ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000397579ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
intron-3CDSENST00000543693ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
intron-intronENST00000543693ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
intron-3CDSENST00000380924ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
intron-intronENST00000380924ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
In-frameENST00000380921ENST00000380916NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-
5CDS-intronENST00000380921ENST00000497966NFIBchr9

14306988

-ZDHHC21chr9

14662324

-

Top

FusionProtFeatures for NFIB_ZDHHC21


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
NFIB

O00712

ZDHHC21

Q8IVQ6

Palmitoylates sex steroid hormone receptors, includingESR1, PGR and AR, thereby regulating their targeting to the plasmamembrane. This affects rapid intracellular signaling by sexhormones via ERK and AKT kinases and the generation of cAMP, butdoes not affect that mediated by their nuclear receptor (Bysimilarity). {ECO:0000250, ECO:0000269|PubMed:22031296}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST00000380916-41090_14084266DomainDHHC
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST00000380916-410134_15484266TransmembraneHelical
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST00000380916-410186_20684266TransmembraneHelical

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneNFIBchr9:14306988chr9:14662324ENST00000380953-2111_195187495DNA bindingCTF/NF-I
HgeneNFIBchr9:14306988chr9:14662324ENST00000380959-291_195187421DNA bindingCTF/NF-I
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST00000380916-41017_3784266TransmembraneHelical
TgeneZDHHC21chr9:14306988chr9:14662324ENST00000380916-41045_6584266TransmembraneHelical


Top

FusionGeneSequence for NFIB_ZDHHC21


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
>In-frame_NFIB_ENST00000380934_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_395aa
MERIPVSVDFWVVCCAVLKCNPGIPKRMSTLCFGFSDEFHPFIEALLPHVRAIATTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSE
KPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQETREDFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKS
PHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFLAYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFY
TELLTCYALMFSFCHTYTFLPLKKRNLDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQ

>In-frame_NFIB_ENST00000380959_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa
MMTSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIATTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQETRE
DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHTYTFLPLKKRN
LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV

>In-frame_NFIB_ENST00000380953_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa
MMTSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIATTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQETRE
DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHTYTFLPLKKRN
LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV

>In-frame_NFIB_ENST00000397575_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa
MMTSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIATTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQETRE
DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHTYTFLPLKKRN
LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV

>In-frame_NFIB_ENST00000397581_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa
MMTSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIATTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQETRE
DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHTYTFLPLKKRN
LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV

>In-frame_NFIB_ENST00000397579_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa
MMTSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIATTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQETRE
DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHTYTFLPLKKRN
LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV

>In-frame_NFIB_ENST00000380921_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa
MMTSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIATTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQETRE
DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHTYTFLPLKKRN
LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV


* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
>In-frame_NFIB_ENST00000380934_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1185nt
ATGGAAAGAATCCCAGTGTCTGTGGACTTCTGGGTTGTCTGCTGTGCAGTTCTGAAATGTAACCCTGGGATTCCTAAAAGAATGTCAACT
CTGTGCTTTGGATTTTCTGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACTTGGTTCAACCTG
CAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAGCTTCTCAGTGAA
AAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAGGACTTTGTGCTC
ACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGCCTGCGACAGGCA
GACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGGCTCATGAAATCC
CCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTGGCATACTACGTG
CAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGCCGCTGCGGCCAC
TGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAGTTGTGTTTCTAC
ACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAATTTGGACCTCTTT
GTTTTTAGACATGAATTGGCCATAATGAGACTAGCAGCCTTTATGGGCATTACTATGTTAGTTGGAATAACTGGACTCTTTTACACTCAA
CTAATTGGCATCATCACAGATACAACATCTATTGAAAAGATGTCAAACTGTTGTGAAGATATATCGAGGCCCCGAAAGCCATGGCAGCAG
ACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTTCCCTACCACTTT

>In-frame_NFIB_ENST00000380959_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1107nt
ATGATGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACT
TGGTTCAACCTGCAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAG
CTTCTCAGTGAAAAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAG
GACTTTGTGCTCACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGC
CTGCGACAGGCAGACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGG
CTCATGAAATCCCCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTG
GCATACTACGTGCAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGC
CGCTGCGGCCACTGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAG
TTGTGTTTCTACACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAAT
TTGGACCTCTTTGTTTTTAGACATGAATTGGCCATAATGAGACTAGCAGCCTTTATGGGCATTACTATGTTAGTTGGAATAACTGGACTC
TTTTACACTCAACTAATTGGCATCATCACAGATACAACATCTATTGAAAAGATGTCAAACTGTTGTGAAGATATATCGAGGCCCCGAAAG
CCATGGCAGCAGACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTT

>In-frame_NFIB_ENST00000380953_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1107nt
ATGATGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACT
TGGTTCAACCTGCAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAG
CTTCTCAGTGAAAAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAG
GACTTTGTGCTCACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGC
CTGCGACAGGCAGACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGG
CTCATGAAATCCCCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTG
GCATACTACGTGCAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGC
CGCTGCGGCCACTGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAG
TTGTGTTTCTACACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAAT
TTGGACCTCTTTGTTTTTAGACATGAATTGGCCATAATGAGACTAGCAGCCTTTATGGGCATTACTATGTTAGTTGGAATAACTGGACTC
TTTTACACTCAACTAATTGGCATCATCACAGATACAACATCTATTGAAAAGATGTCAAACTGTTGTGAAGATATATCGAGGCCCCGAAAG
CCATGGCAGCAGACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTT

>In-frame_NFIB_ENST00000397575_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1107nt
ATGATGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACT
TGGTTCAACCTGCAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAG
CTTCTCAGTGAAAAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAG
GACTTTGTGCTCACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGC
CTGCGACAGGCAGACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGG
CTCATGAAATCCCCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTG
GCATACTACGTGCAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGC
CGCTGCGGCCACTGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAG
TTGTGTTTCTACACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAAT
TTGGACCTCTTTGTTTTTAGACATGAATTGGCCATAATGAGACTAGCAGCCTTTATGGGCATTACTATGTTAGTTGGAATAACTGGACTC
TTTTACACTCAACTAATTGGCATCATCACAGATACAACATCTATTGAAAAGATGTCAAACTGTTGTGAAGATATATCGAGGCCCCGAAAG
CCATGGCAGCAGACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTT

>In-frame_NFIB_ENST00000397581_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1107nt
ATGATGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACT
TGGTTCAACCTGCAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAG
CTTCTCAGTGAAAAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAG
GACTTTGTGCTCACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGC
CTGCGACAGGCAGACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGG
CTCATGAAATCCCCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTG
GCATACTACGTGCAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGC
CGCTGCGGCCACTGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAG
TTGTGTTTCTACACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAAT
TTGGACCTCTTTGTTTTTAGACATGAATTGGCCATAATGAGACTAGCAGCCTTTATGGGCATTACTATGTTAGTTGGAATAACTGGACTC
TTTTACACTCAACTAATTGGCATCATCACAGATACAACATCTATTGAAAAGATGTCAAACTGTTGTGAAGATATATCGAGGCCCCGAAAG
CCATGGCAGCAGACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTT

>In-frame_NFIB_ENST00000397579_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1107nt
ATGATGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACT
TGGTTCAACCTGCAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAG
CTTCTCAGTGAAAAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAG
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CCATGGCAGCAGACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTT


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TTGAATGCCTTATATTGTATACATTCCTTTCAAATAAAGACCTTGAGAAAACAGCAGAGCCAAGTGAAGATCACCTAAAGAACTTTGTGG
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TTCCCATTATATTCTTGCTGTCAATCAATCACAAATTTATATCAGATTAGGATAAACTAAGCCATTTTATGTATTTTATTTTAAACCTTA
TTTTGGCAGAGTAATTCCTTAGAATTGGAAAAGCTGTTACTTTGAAATTACCAATTTATTACAAAACATAGAAATGTATTGTAGCTACAA
AGACAACCAAGCATTTTCTGTGTTTTAATGAATATCTAAAAAACTACATTTAGTTTATTTTACTCAGTTTTGAAATGATTTTTTTACTGG
CTCTATTGCCTTAAAATAACTAAGAGATTAATGATTCTTTGTATAATTTTCCTTTTCTTTGTTCTTTTTTTTACATTTCGCAGAGTTATA
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TTACATCAGTAAAGTCATTTGTCGACCTTCTGGAAATGAAAGGTTTTTACCTAGATACTGTAAGTTACACCTCCTTAACAATCATATTTG
TCATTGTTGTTTTCTGCAAACAAAAATGTTTATGGGCTTCATGTAGGCTTAAGATTGTAGGCAAAAATGGACTGAGTTCAGGACCCTTCA
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TTCAAGTCACTCCCATACAAGTAACTAGTGGGTGATATGTTTCACTCCAAAGGGTGTATTAATTCTGAATGCTAATCATGAAGACTTAAG
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GTTTTCACATGTATTGCTATAAAATCACAATGTACCAAGCTCTGGTTTAATATGCCATTAATACTAATTAATAGAGCTGCTAGTCTCTCT
CTGGACTTTTCTCTAGTCTCTGCTTCTCTTGCGCTTCCTGTATCAATAGATTACTTAGCTCAAGTTTACCAAGTTTAATAACCTATAGTT
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ACAGTATAAGAAAGTATTAGAACCAACTTGCTTGAACTATTTTGAACCAGTGTTGTAATTCTATATGTTAATCAGTATTTAGCATTTCTG
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AAATAAACAATATATAAGGGTGGCTTTCACTTTAACATTTGGGATATTTTGGAGTTCTTGATACCTCGAAGGTCTCCATTTCTATTGGTA
TTTTGAATATCTGTAACATGTAATGTCGTTCTTATAACAGTTCAACACTGATTTTTTTGGTATCGATAGCTTTATATATAAACAAAGATG
CGGACAAAATAGCTTAACAGAAGTTGTGGGCTTTTTTGTGGCTTTGCCTGCCTGTTTGACCAAATACAGGGTTTAATTGTTTGCAGGCTG
TTAACTAAAGGGAAAGCTTACCTGCGTATTGCAAGCTATATATTCTTGCCAGTATACATTGGATGATATTTTAACCTACTGGTGCCTGAA
GTTCGTGTTTTATAACCTCAACAACTATAAAACATCCTGGTGCTATTCACTTTAGCATTGAGTGACATTTTTAATTCCTGTACCAAAGAG
TTAATTTTCTTTTTGGTTGACTGAGTTTTCTTCTCACATCGTTGTGTATTTATAAAGTAGAATTTAATGTTACTAAGAACAGTTTGATTA
ACAGATCTTATTTTTTGCATGCTGCTCTGGCAATTTAATGGATTTTAAATGTTTCTCATTTGGATTTTTTTTTAGGTAGGCATGTATGGA
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AATTTAAAACACCTTTGAAATGTAATTGTCCAAATGTAATGCTGCTATGTATATTATTTGGGTTCCAGATTTTTCCCTTTAAAATTCTCA
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CATTTGAAAATATTTTGCATTATTGTTAGCTAAAATCAACCTCTCCTTGAATGTAGATACAATATATGGTTTTGCAGTCAATTCTGAATG
GAAAAAAAGAATCAAGTCTGAAATTTATGTGAAATGTGGCTTCAGATCATTTGAACGATATGTAGAAATCTAGATGAACATATCATTAGA
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GGTAAGATTAGGAGAATCGACTGCCTGCGACAGGCAGACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCC
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TACTGACAGTGTTACAGATTCTAATTTATGGTAAATTTCAGATGTTTATTTAAAATTTTCACTTTTAAACAGTAACCAAATCTAAATTTA
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TTAAAATTTTTTTCACAATAATTTTTTCAATTTTCACTATTACTGTTGTAATTATTGATTGTGATTAAAATATTTGCTCCCAGGAGAACT
CCTGACCAGTGGGCATGTATTCCTATTTTATCCTAAGATTTTAATGAGCAAAAAGGGGAGAGAATTTGCAATAACTTCACAATTACCTTT
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CTTTTGAAAAGAGTATACTTTTTACTTTTATTTATGTACTAGTAGATGTAAAATTTCACATTGAAGGTTTATATATATTGGCCAACTCAT
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GCTGGCTGTAATTTGCATTGAGAGACCTTTTACTAGTAGCTAGTGTTAGGAAGTGAACCTAAAATAAGAAAATATAATGATCTGTGTTTA
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GAAAAAAACTCAGCTTTTAGTTTTTTTCCATTAGAATACTGCAAAACCCATATATCTTTTTAAAAAATTTATGTACTCACAGTCTTTCCC
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GCAGTTATATTAGAATGCATATGTTTTTAAAATGCTAGTATAACTAGATAGTATATAATGTACAGTATAAAGAGGAATATTGTGCTTTTG
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FusionGenePPI for NFIB_ZDHHC21


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
NFIBRFX1, NFIC, NFIX, SOX2, ELAVL1, GRK5, EED, UNK, XRCC5, SASS6, NFIAZDHHC21ESR1, CREB3, SLC22A9, CD97, TSPAN5, DPEP1, SLC7A1, C3AR1


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for NFIB_ZDHHC21


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for NFIB_ZDHHC21


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneNFIBC0010606Adenoid Cystic Carcinoma1CTD_human