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Fusion gene ID: 24227 |
FusionGeneSummary for NFIB_ZDHHC21 |
 Fusion gene summary |
| Fusion gene information | Fusion gene name: NFIB_ZDHHC21 | Fusion gene ID: 24227 | Hgene | Tgene | Gene symbol | NFIB | ZDHHC21 | Gene ID | 4781 | 340481 |
| Gene name | nuclear factor I B | zinc finger DHHC-type containing 21 | |
| Synonyms | CTF|HMGIC/NFIB|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3 | DHHC-21|DHHC21|DNZ1|HSPC097 | |
| Cytomap | 9p23-p22.3 | 9p22.3 | |
| Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
| Description | nuclear factor 1 B-typeCCAAT-box-binding transcription factorTGGCA-binding proteinnuclear factor 1/B | palmitoyltransferase ZDHHC21zinc finger, DHHC domain containing 21 | |
| Modification date | 20180523 | 20180523 | |
| UniProtAcc | O00712 | Q8IVQ6 | |
| Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000380934, ENST00000380959, ENST00000380953, ENST00000397575, ENST00000397581, ENST00000397579, ENST00000543693, ENST00000380924, ENST00000380921, | ENST00000380916, ENST00000497966, | |
| Fusion gene scores | * DoF score | 8 X 8 X 4=256 | 1 X 1 X 1=1 |
| # samples | 8 | 1 | |
| ** MAII score | log2(8/256*10)=-1.67807190511264 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | log2(1/1*10)=3.32192809488736 | |
| Context | PubMed: NFIB [Title/Abstract] AND ZDHHC21 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
| Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation | |||
| * DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
| Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
| Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
| Hgene | NFIB | GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | 9099724|19540848 |
| Tgene | ZDHHC21 | GO:0018345 | protein palmitoylation | 23034182 |
| Fusion gene information from three resources (ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018)) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| Data type | Source | Cancer type | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| TCGA | RV | LUAD | TCGA-75-6211-01A | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| * LD: Li Ding group's fusion gene list RV: Roel Verhaak group's fusion gene list ChiTaRs fusion database |
| Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| In-frame | ENST00000380934 | ENST00000380916 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| 5CDS-intron | ENST00000380934 | ENST00000497966 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| In-frame | ENST00000380959 | ENST00000380916 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| 5CDS-intron | ENST00000380959 | ENST00000497966 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| In-frame | ENST00000380953 | ENST00000380916 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| 5CDS-intron | ENST00000380953 | ENST00000497966 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| In-frame | ENST00000397575 | ENST00000380916 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| 5CDS-intron | ENST00000397575 | ENST00000497966 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| In-frame | ENST00000397581 | ENST00000380916 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| 5CDS-intron | ENST00000397581 | ENST00000497966 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| In-frame | ENST00000397579 | ENST00000380916 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| 5CDS-intron | ENST00000397579 | ENST00000497966 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| intron-3CDS | ENST00000543693 | ENST00000380916 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| intron-intron | ENST00000543693 | ENST00000497966 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| intron-3CDS | ENST00000380924 | ENST00000380916 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| intron-intron | ENST00000380924 | ENST00000497966 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| In-frame | ENST00000380921 | ENST00000380916 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
| 5CDS-intron | ENST00000380921 | ENST00000497966 | NFIB | chr9 | 14306988 | - | ZDHHC21 | chr9 | 14662324 | - |
Top |
FusionProtFeatures for NFIB_ZDHHC21 |
| Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
| Hgene | Tgene |
| NFIB | ZDHHC21 |
| Palmitoylates sex steroid hormone receptors, includingESR1, PGR and AR, thereby regulating their targeting to the plasmamembrane. This affects rapid intracellular signaling by sexhormones via ERK and AKT kinases and the generation of cAMP, butdoes not affect that mediated by their nuclear receptor (Bysimilarity). {ECO:0000250, ECO:0000269|PubMed:22031296}. |
| Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at . * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
| - In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Tgene | >ZDHHC21 | chr9:14306988 | chr9:14662324 | ENST00000380916 | - | 4 | 10 | 90_140 | 84 | 266 | Domain | DHHC |
| Tgene | >ZDHHC21 | chr9:14306988 | chr9:14662324 | ENST00000380916 | - | 4 | 10 | 134_154 | 84 | 266 | Transmembrane | Helical |
| Tgene | >ZDHHC21 | chr9:14306988 | chr9:14662324 | ENST00000380916 | - | 4 | 10 | 186_206 | 84 | 266 | Transmembrane | Helical |
| - In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Hgene | >NFIB | chr9:14306988 | chr9:14662324 | ENST00000380953 | - | 2 | 11 | 1_195 | 187 | 495 | DNA binding | CTF/NF-I |
| Hgene | >NFIB | chr9:14306988 | chr9:14662324 | ENST00000380959 | - | 2 | 9 | 1_195 | 187 | 421 | DNA binding | CTF/NF-I |
| Tgene | ZDHHC21 | chr9:14306988 | chr9:14662324 | ENST00000380916 | - | 4 | 10 | 17_37 | 84 | 266 | Transmembrane | Helical |
| Tgene | ZDHHC21 | chr9:14306988 | chr9:14662324 | ENST00000380916 | - | 4 | 10 | 45_65 | 84 | 266 | Transmembrane | Helical |
Top |
FusionGeneSequence for NFIB_ZDHHC21 |
| For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. (nt: nucleotides, aa: amino acids) |
| * Fusion amino acid sequences. |
| >In-frame_NFIB_ENST00000380934_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_395aa MERIPVSVDFWVVCCAVLKCNPGIPKRMSTLCFGFSDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSE KPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYREDFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKS PHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFLAYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFY TELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRNLDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQ >In-frame_NFIB_ENST00000380959_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYRE DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRN LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV >In-frame_NFIB_ENST00000380953_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYRE DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRN LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV >In-frame_NFIB_ENST00000397575_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYRE DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRN LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV >In-frame_NFIB_ENST00000397581_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYRE DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRN LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV >In-frame_NFIB_ENST00000397579_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYRE DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRN LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV >In-frame_NFIB_ENST00000380921_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_369aa MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYRE DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL AYYVQEQEREFWELCNKCNLMRPKRSHHCSRCGHCVRRMDHHCPWINNCVGEDNHWLFLQLCFYTELLTCYALMFSFCHYYYFLPLKKRN LDLFVFRHELAIMRLAAFMGITMLVGITGLFYTQLIGIITDTTSIEKMSNCCEDISRPRKPWQQTFSEVFGTRWKILWFIPFRQRQPLRV |
| * Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region). |
| >In-frame_NFIB_ENST00000380934_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1185nt ATGGAAAGAATCCCAGTGTCTGTGGACTTCTGGGTTGTCTGCTGTGCAGTTCTGAAATGTAACCCTGGGATTCCTAAAAGAATGTCAACT CTGTGCTTTGGATTTTCTGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACTTGGTTCAACCTG CAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAGCTTCTCAGTGAA AAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAGGACTTTGTGCTC ACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGCCTGCGACAGGCA GACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGGCTCATGAAATCC CCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTGGCATACTACGTG CAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGCCGCTGCGGCCAC TGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAGTTGTGTTTCTAC ACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAATTTGGACCTCTTT GTTTTTAGACATGAATTGGCCATAATGAGACTAGCAGCCTTTATGGGCATTACTATGTTAGTTGGAATAACTGGACTCTTTTACACTCAA CTAATTGGCATCATCACAGATACAACATCTATTGAAAAGATGTCAAACTGTTGTGAAGATATATCGAGGCCCCGAAAGCCATGGCAGCAG ACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTTCCCTACCACTTT >In-frame_NFIB_ENST00000380959_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1107nt ATGATGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACT TGGTTCAACCTGCAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAG CTTCTCAGTGAAAAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAG GACTTTGTGCTCACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGC CTGCGACAGGCAGACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGG CTCATGAAATCCCCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTG GCATACTACGTGCAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGC CGCTGCGGCCACTGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAG TTGTGTTTCTACACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAAT TTGGACCTCTTTGTTTTTAGACATGAATTGGCCATAATGAGACTAGCAGCCTTTATGGGCATTACTATGTTAGTTGGAATAACTGGACTC TTTTACACTCAACTAATTGGCATCATCACAGATACAACATCTATTGAAAAGATGTCAAACTGTTGTGAAGATATATCGAGGCCCCGAAAG CCATGGCAGCAGACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTT >In-frame_NFIB_ENST00000380953_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1107nt ATGATGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACT TGGTTCAACCTGCAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAG CTTCTCAGTGAAAAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAG GACTTTGTGCTCACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGC CTGCGACAGGCAGACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGG CTCATGAAATCCCCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTG GCATACTACGTGCAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGC CGCTGCGGCCACTGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAG TTGTGTTTCTACACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAAT TTGGACCTCTTTGTTTTTAGACATGAATTGGCCATAATGAGACTAGCAGCCTTTATGGGCATTACTATGTTAGTTGGAATAACTGGACTC TTTTACACTCAACTAATTGGCATCATCACAGATACAACATCTATTGAAAAGATGTCAAACTGTTGTGAAGATATATCGAGGCCCCGAAAG CCATGGCAGCAGACCTTCTCAGAAGTTTTTGGCACTCGTTGGAAGATCCTGTGGTTCATTCCTTTCAGGCAGAGGCAACCACTGCGAGTT >In-frame_NFIB_ENST00000397575_chr9_14306988_-_ZDHHC21_ENST00000380916_chr9_14662324_-_1107nt ATGATGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGATGAATTTCACCCATTCATCGAGGCACTTCTTCCACATGTCCGTGCAATTGCCTATACT TGGTTCAACCTGCAGGCTCGAAAACGCAAGTACTTTAAAAAGCATGAGAAGCGAATGTCAAAGGATGAAGAAAGAGCAGTCAAAGATGAG CTTCTCAGTGAAAAGCCTGAAATCAAACAGAAGTGGGCATCCAGGCTCCTTGCCAAACTGCGCAAAGATATTCGCCAGGAGTATCGAGAG GACTTTGTGCTCACCGTGACTGGCAAGAAGCACCCGTGCTGTGTCTTATCCAATCCCGACCAGAAGGGTAAGATTAGGAGAATCGACTGC CTGCGACAGGCAGACAAAGTCTGGCGTCTGGATCTAGTCATGGTGATCCTGTTCAAAGGCATCCCCTTGGAAAGTACCGATGGAGAGCGG CTCATGAAATCCCCACATTGCACAAACCCAGCACTTTGTGTCCAGCCACATCATATCACAGTATCAGTTAAGGAGCTTGATTTGTTTTTG GCATACTACGTGCAGGAGCAAGAAAGGGAGTTCTGGGAATTATGTAACAAGTGTAATTTGATGAGACCAAAGCGTTCCCATCACTGTAGC CGCTGCGGCCACTGTGTGAGGAGAATGGATCATCACTGTCCATGGATTAACAATTGTGTTGGTGAAGATAATCATTGGCTCTTTCTGCAG TTGTGTTTCTACACTGAACTTCTTACTTGCTACGCACTGATGTTTTCTTTCTGCCACTATTACTATTTTCTTCCACTAAAAAAGCGTAAT 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TAAAGCAACTAAATGATACAAAAGTAAAAACTTCCACCAGAATCAGAGATATTCCGACAAGTGAATTGTGAGTCTAACACGGGAGGACAA AGCTAGGCTCTTGCAAGGACAGAGCACACGTGGATCATGCTGTATGAGCTCACTTTGTGTCCCTGGAATTAGTGTTTTTTTGTGTGTGAT CTAACTGGCAAGTTTAATGAATAGCCAAAATCTATGTTATTCTTGAGGCTCCTAAAATTATGTGTGAACCCCAAGTTCTGTCTAGTATTA TATCCCTAAAATGCTTTTAATAGTGGTATGTTACAAGTGGCATAAGAAGATCCTGTTTTTAAATTTGTCAGGCATTTTATTATTCAGTAC ATAATATGTATAGATCTGAGTGCTGTTTTCCTTGCATTGTCTATTATTTTTACCTTGTCTTTCCCCTAAGAGAATTTGAAGAAAATCTTC ACCAATATTTCTAGTGTTGATGGTAATTAGGAAAATAGTAGTTGAGAGATGTAAGAATAGTTTGAGAAGAGTGAGTAAAATGGGTGAAAT GACAAGTGGGAACCATGTAGCTGAGATGTATTTGTTTAGATGAAAAGTCTACACTGGTTCTTAATGTGAAAATCAAACCATGTATCTACC TTAAGAACAATGTTGTTGTTTTTAATTTATTGTAGCGATTTAGTTTTTTTCACGTAATATTTCTATTTTCTTTGCAGATTGTTTTTAATT |
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FusionGenePPI for NFIB_ZDHHC21 |
| Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in . |
| Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
| Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
| NFIB | RFX1, NFIC, NFIX, SOX2, ELAVL1, GRK5, EED, UNK, XRCC5, SASS6, NFIA | ZDHHC21 | ESR1, CREB3, SLC22A9, CD97, TSPAN5, DPEP1, SLC7A1, C3AR1 |
| - Retained PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
| - Lost PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
| - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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RelatedDrugs for NFIB_ZDHHC21 |
| Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02) |
| Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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RelatedDiseases for NFIB_ZDHHC21 |
| Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
| Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
| Hgene | NFIB | C0010606 | Adenoid Cystic Carcinoma | 1 | CTD_human |
Copyright 2018-Present -The University of Texas Health Science Center at Houston (UTHealth)
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