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FusionGeneSummary

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FusionProtFeature

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FusionGeneSequence

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FusionGenePPI

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RelatedDiseases

Fusion gene ID: 24226

FusionGeneSummary for NFIB_STRN

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: NFIB_STRN
Fusion gene ID: 24226
HgeneTgene
Gene symbol

NFIB

STRN

Gene ID

4781

6801

Gene namenuclear factor I Bstriatin
SynonymsCTF|HMGIC/NFIB|NF-I/B|NF1-B|NFI-B|NFI-RED|NFIB2|NFIB3PPP2R6A|SG2NA|STRN1
Cytomap

9p23-p22.3

2p22.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionnuclear factor 1 B-typeCCAAT-box-binding transcription factorTGGCA-binding proteinnuclear factor 1/Bstriatinprotein phosphatase 2 regulatory subunit B'''alphastriatin, calmodulin binding protein
Modification date2018052320180523
UniProtAcc

O00712

O43815

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000380934, ENST00000380959, 
ENST00000380953, ENST00000397575, 
ENST00000397581, ENST00000397579, 
ENST00000543693, ENST00000380924, 
ENST00000380921, 
ENST00000263918, 
ENST00000379213, 
Fusion gene scores* DoF score8 X 8 X 4=2562 X 1 X 1=2
# samples 82
** MAII scorelog2(8/256*10)=-1.67807190511264
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(2/2*10)=3.32192809488736
Context

PubMed: NFIB [Title/Abstract] AND STRN [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneNFIB

GO:0045944

positive regulation of transcription by RNA polymerase II

9099724|19540848


check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVBRCATCGA-A1-A0SB-01ANFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
intron-3CDSENST00000380934ENST00000263918NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
intron-3CDSENST00000380934ENST00000379213NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000380959ENST00000263918NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000380959ENST00000379213NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000380953ENST00000263918NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000380953ENST00000379213NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000397575ENST00000263918NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000397575ENST00000379213NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000397581ENST00000263918NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000397581ENST00000379213NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000397579ENST00000263918NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000397579ENST00000379213NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
intron-3CDSENST00000543693ENST00000263918NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
intron-3CDSENST00000543693ENST00000379213NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
intron-3CDSENST00000380924ENST00000263918NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
intron-3CDSENST00000380924ENST00000379213NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000380921ENST00000263918NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-
In-frameENST00000380921ENST00000379213NFIBchr9

14313481

-STRNchr2

37152351

-

Top

FusionProtFeatures for NFIB_STRN


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
NFIB

O00712

STRN

O43815

Calmodulin-binding protein which may function asscaffolding or signaling protein and may play a role in dendriticCa(2+) signaling.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note


Top

FusionGeneSequence for NFIB_STRN


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
>In-frame_NFIB_ENST00000380959_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000263918_chr2_37152351_-_713aa
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RQLLRQTLQEVGTTDTILDVKSKRVRALLGFSSDVTDREDDKNQDSVVNGTEAEVKETAMIAKSELTDSASVLDNFKFLESAAADFSDED
EDDDVDGREKSVIDTSTIVRKKALPDSGEDRDTKEALKEFDFLVTSEEGDNESRSAGDGTDWEKEDQCLMPEAWNVDQGVITKLKEQYKK
ERKGKKGVKRPNRSKLQDMLANLRDVDELPSLQPSVGSPSRPSSSRLPEHEINRADEVEALTFPPSSGKSFIMGADEALESELGLGELAG
LTVANEADSLTTDIANNKDALRKTWNPKFTLRSHFDGIRALAFHPIEPVLITASEDHTLKMWNLQKTAPAKKSTSLDVEPITTFRAHKGP
VLCVVMSSNGEQCYSGGTDGLIQGWNTTNPNIDPTDSTDPSVLRGPLLGHTDAVWGLATSAAHQRLLSCSADGTLRLWNTTEVAPALSVF
NDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNMETQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKL

>In-frame_NFIB_ENST00000380959_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000379213_chr2_37152351_-_676aa
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RQLLRQTLQEVGTTDTILDVKSKRVRALLGFSSDVTDREDDKNQDSVVNGTEAEVKETAMIAKSELTDSASVLDNFKFLESAAADFSDED
EDDDVDGREKSVIDTSTIVRKKALPDSGEDRDTKEALKEFDFLVTSEEGDNESRSAGDGTDWGPNRSKLQDMLANLRDVDELPSLQPSVG
SPSRPSSSRLPEHEINRADEVEALTFPPSSGKSFIMGADEALESELGLGELAGLTVANEADSLTTDIANNKDALRKTWNPKFTLRSHFDG
IRALAFHPIEPVLITASEDHTLKMWNLQKTAPAKKSTSLDVEPITTFRAHKGPVLCVVMSSNGEQCYSGGTDGLIQGWNTTNPNIDPTDS
TDPSVLRGPLLGHTDAVWGLATSAAHQRLLSCSADGTLRLWNTTEVAPALSVFNDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNME
TQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKLIHSMVAHLEAVTSLAVDPNGLYLMSGSHDCSIRLWNL

>In-frame_NFIB_ENST00000380953_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000263918_chr2_37152351_-_713aa
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EDDDVDGREKSVIDTSTIVRKKALPDSGEDRDTKEALKEFDFLVTSEEGDNESRSAGDGTDWEKEDQCLMPEAWNVDQGVITKLKEQYKK
ERKGKKGVKRPNRSKLQDMLANLRDVDELPSLQPSVGSPSRPSSSRLPEHEINRADEVEALTFPPSSGKSFIMGADEALESELGLGELAG
LTVANEADSLTTDIANNKDALRKTWNPKFTLRSHFDGIRALAFHPIEPVLITASEDHTLKMWNLQKTAPAKKSTSLDVEPITTFRAHKGP
VLCVVMSSNGEQCYSGGTDGLIQGWNTTNPNIDPTDSTDPSVLRGPLLGHTDAVWGLATSAAHQRLLSCSADGTLRLWNTTEVAPALSVF
NDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNMETQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKL

>In-frame_NFIB_ENST00000380953_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000379213_chr2_37152351_-_676aa
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EDDDVDGREKSVIDTSTIVRKKALPDSGEDRDTKEALKEFDFLVTSEEGDNESRSAGDGTDWGPNRSKLQDMLANLRDVDELPSLQPSVG
SPSRPSSSRLPEHEINRADEVEALTFPPSSGKSFIMGADEALESELGLGELAGLTVANEADSLTTDIANNKDALRKTWNPKFTLRSHFDG
IRALAFHPIEPVLITASEDHTLKMWNLQKTAPAKKSTSLDVEPITTFRAHKGPVLCVVMSSNGEQCYSGGTDGLIQGWNTTNPNIDPTDS
TDPSVLRGPLLGHTDAVWGLATSAAHQRLLSCSADGTLRLWNTTEVAPALSVFNDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNME
TQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKLIHSMVAHLEAVTSLAVDPNGLYLMSGSHDCSIRLWNL

>In-frame_NFIB_ENST00000397575_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000263918_chr2_37152351_-_713aa
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EDDDVDGREKSVIDTSTIVRKKALPDSGEDRDTKEALKEFDFLVTSEEGDNESRSAGDGTDWEKEDQCLMPEAWNVDQGVITKLKEQYKK
ERKGKKGVKRPNRSKLQDMLANLRDVDELPSLQPSVGSPSRPSSSRLPEHEINRADEVEALTFPPSSGKSFIMGADEALESELGLGELAG
LTVANEADSLTTDIANNKDALRKTWNPKFTLRSHFDGIRALAFHPIEPVLITASEDHTLKMWNLQKTAPAKKSTSLDVEPITTFRAHKGP
VLCVVMSSNGEQCYSGGTDGLIQGWNTTNPNIDPTDSTDPSVLRGPLLGHTDAVWGLATSAAHQRLLSCSADGTLRLWNTTEVAPALSVF
NDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNMETQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKL

>In-frame_NFIB_ENST00000397575_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000379213_chr2_37152351_-_676aa
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EDDDVDGREKSVIDTSTIVRKKALPDSGEDRDTKEALKEFDFLVTSEEGDNESRSAGDGTDWGPNRSKLQDMLANLRDVDELPSLQPSVG
SPSRPSSSRLPEHEINRADEVEALTFPPSSGKSFIMGADEALESELGLGELAGLTVANEADSLTTDIANNKDALRKTWNPKFTLRSHFDG
IRALAFHPIEPVLITASEDHTLKMWNLQKTAPAKKSTSLDVEPITTFRAHKGPVLCVVMSSNGEQCYSGGTDGLIQGWNTTNPNIDPTDS
TDPSVLRGPLLGHTDAVWGLATSAAHQRLLSCSADGTLRLWNTTEVAPALSVFNDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNME
TQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKLIHSMVAHLEAVTSLAVDPNGLYLMSGSHDCSIRLWNL

>In-frame_NFIB_ENST00000397581_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000263918_chr2_37152351_-_713aa
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NDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNMETQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKL

>In-frame_NFIB_ENST00000397581_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000379213_chr2_37152351_-_676aa
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SPSRPSSSRLPEHEINRADEVEALTFPPSSGKSFIMGADEALESELGLGELAGLTVANEADSLTTDIANNKDALRKTWNPKFTLRSHFDG
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TDPSVLRGPLLGHTDAVWGLATSAAHQRLLSCSADGTLRLWNTTEVAPALSVFNDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNME
TQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKLIHSMVAHLEAVTSLAVDPNGLYLMSGSHDCSIRLWNL

>In-frame_NFIB_ENST00000397579_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000263918_chr2_37152351_-_713aa
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NDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNMETQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKL

>In-frame_NFIB_ENST00000397579_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000379213_chr2_37152351_-_676aa
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TDPSVLRGPLLGHTDAVWGLATSAAHQRLLSCSADGTLRLWNTTEVAPALSVFNDTKELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSKGTTSIFNME
TQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKLIHSMVAHLEAVTSLAVDPNGLYLMSGSHDCSIRLWNL

>In-frame_NFIB_ENST00000380921_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000263918_chr2_37152351_-_713aa
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>In-frame_NFIB_ENST00000380921_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000379213_chr2_37152351_-_676aa
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TQQRILTLESNVDTTANSSCQINRVISHPTLPISITAHEDRHIKFTDNNTGKLIHSMVAHLEAVTSLAVDPNGLYLMSGSHDCSIRLWNL


* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
>In-frame_NFIB_ENST00000380959_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000263918_chr2_37152351_-_2139nt
ATGATGTATTCTCCCATCTGTCTCACTCAGGCCCAGATTGCCTTCCTGCAGGGAGAAAGGAAGGGCCAAGAAAATTTGAAGAAGGATCTT
GTGAGGAGGATCAAAATGTTGGAGTATGCTCTTAAACAGGAAAGAGCCAAATACCACAAGTTGAAATACGGGACAGAATTGAATCAGGGA
GATATGAAGCCTCCAAGCTATGATTCTGATGAAGGTAATGAAACAGAAGTGCAGCCACAACAAAACAGCCAGTTAATGTGGAAACAAGGT
CGACAACTACTCAGACAGTATCTACAGGAGGTGGGTTATACAGATACTATTCTAGATGTGAAATCTAAACGAGTGCGAGCTTTGTTGGGC
TTTTCAAGTGATGTCACGGACAGGGAAGATGACAAAAATCAGGACTCAGTTGTAAATGGCACAGAGGCTGAAGTTAAAGAGACAGCAATG
ATTGCAAAATCTGAGTTAACAGATTCTGCCTCCGTGCTGGATAATTTCAAATTCCTTGAAAGTGCAGCTGCAGATTTCAGTGATGAAGAT
GAAGATGATGATGTTGATGGAAGAGAGAAAAGCGTCATTGATACTTCAACAATTGTTAGGAAAAAAGCATTGCCTGACAGCGGTGAAGAT
CGAGATACAAAAGAAGCTCTAAAGGAGTTTGACTTCTTGGTTACATCAGAGGAAGGAGACAATGAATCTAGAAGTGCAGGCGATGGAACA
GACTGGGAAAAGGAAGACCAGTGTCTCATGCCTGAAGCCTGGAATGTGGACCAGGGAGTAATTACCAAACTCAAGGAACAATACAAAAAG
GAGAGAAAGGGGAAAAAGGGGGTGAAGAGGCCCAATAGGTCAAAACTACAAGATATGCTTGCTAATTTGAGAGATGTTGATGAACTTCCT
TCATTGCAGCCATCTGTGGGTTCACCTTCCAGACCCAGCAGCTCCAGGCTTCCTGAACATGAAATTAATAGGGCAGATGAAGTGGAAGCA
TTGACATTTCCTCCTTCTTCTGGAAAGTCATTCATCATGGGAGCAGATGAAGCCCTTGAAAGTGAACTGGGACTTGGAGAACTAGCAGGC
CTTACGGTGGCCAATGAAGCAGACTCACTAACTTATGATATAGCAAACAATAAAGATGCATTGAGGAAGACATGGAACCCTAAGTTTACA
TTGAGAAGTCACTTTGATGGCATCCGAGCCCTTGCTTTCCATCCCATTGAGCCTGTTTTGATAACAGCATCAGAGGATCACACATTAAAA
ATGTGGAATTTACAGAAAACAGCCCCAGCCAAAAAGAGCACTTCTCTTGATGTAGAACCTATCTATACATTCAGAGCCCATAAAGGTCCA
GTGCTTTGTGTGGTAATGAGCAGCAATGGTGAGCAGTGTTACAGTGGTGGTACTGATGGACTGATCCAGGGCTGGAATACCACTAATCCC
AACATCGACCCCTATGATTCTTATGATCCTTCTGTTTTACGAGGCCCTCTGCTAGGCCACACGGATGCAGTCTGGGGTTTGGCTTATAGT
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GCTCTTTCTTCTTTGTCACGTTCAAGTTATCTGACATCTACCAAGAACAGTTCATAATTATTAATAGCCCAAAGAGTATGGTTAACTTCA
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ATGGATAAGCTAATTAAGATATCCATCTTTGGTGGCTCTAAGTGTATTATTTGTTTTTAAATAAAGTGTACAAATATAGATAACATGCTA
TAGGTGTCTCATGAATTGGAATATTTGTCAGATTTGGGATCTAGCTGTGGCTTTACAGTAATCAGTTAAATTAACATAGTCTGATTTGGG

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ACACCGAACCTTCGCGCACCCCCTACACCCCAACAACAACAACAACTGCAAAATAGAAAACAAATCCCCAAACCCAGGCGAAAAGCAGCC
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GTAGCTTTCCACCCATCCAAATGCTATATAGCCAGTGCTGGAGCTGACGCACTGGCTAAAGTCTTTGTATGACGCAATGCATCATCTTCA
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CCCAACAACAACAACAACTGCAAAATAGAAAACAAATCCCCAAACCCAGGCGAAAAGCAGCCAACACCGGCGGCGGCGGCGGCCTCGGCA
AGCACGGCCAGCGCGCTCGGACTGCAAGAGGGTTAAAAGTGTAGATTGGATTTCACCCCTGGAAATCTAGCACGCCGAGTGAACTTGAAT
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GATGACTGTAAAATGAATAGATGAAATTCTTGCTTCTCGAAGATTTTCTTGGGCATCTCCCGGAAAGTGCGTTTTAAGGCGAAGTCATGA
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CAAAATCTGAGTTAACAGATTCTGCCTCCGTGCTGGATAATTTCAAATTCCTTGAAAGTGCAGCTGCAGATTTCAGTGATGAAGATGAAG
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GCTGTTTATAAGTAATCAACTGCACACAAGAGATACAGAAGACGAGGGCAAGAATCATCTCGTCCTGCCCTTTTGTTCTGCTGAAGGAGC
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TACAAGTTTAGCTTGTCCCTGTTGAGTAAGTAGGGCATGCTACAATGGATAATTTAAAAGCTTGATAGCTGGGACTGAATAGAAGAAAAC
GGGAAACTTAGACCAAGTTCTCCCCTGAGAAATCTTGTTAAAACACATTAAGTAGTCAAAATAGTAATCTTTATCATATCTGCCATATTA
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GGCTAAAAAGTTCTGTCTTTCTCTCTCCCTATTCCTCCCCCATTGTTTAATTGAGATATACATGTTTTAATGGGCAGTGGATCAGTATTG
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GAAGACCCTGCTATCTAGACCTAGTCTCCTGTCATAAAGACATTATTTCTATAGTGGTTTATGTCTCTCTTACTCTTTGTCCCAAATGAC
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AAATCTATAGATATTTTAACCAATTAAAACAATTTCTACATATTCCATTCCCCACATTTTCCATCGTCATAACAATGATGCTTCTCATGA
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TAGAATTCTGCATTATACAGGCAAATTTTCTTTAAAGCTAGAGACTTGTGCTAAATTTGCCTGATTTTCATACAGATATGCTGTAGTAAT
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TGCATGATCTCAGCCTAGAAATGAGCCAAAGCTGTCTTCCAACCAGAGTAGCATATACATGTGTCTGACTTTTCCCCTAGCCTGTTGAAC
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TCTGAAAATGTCTCAGAGAATGGTATTTTAATTGACTTGTAGAGAGCTGCTAAATTTGTTATTATCAGCAATCAGAAAGTCTTTGGTCTA
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CAGATTTGGGATCTAGCTGTGGCTTTACAGTAATCAGTTAAATTAACATAGTCTGATTTGGGGCTTTTGGGGGAGGAGTTGTAGAGGGGT

>In-frame_NFIB_ENST00000380921_chr9_14313481_-_STRN_ENST00000379213_chr2_37152351_-_3601nt
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GGAGGATCAAAATGTTGGAGTATGCTCTTAAACAGGAAAGAGCCAAATACCACAAGTTGAAATACGGGACAGAATTGAATCAGGGAGATA
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GGGGGCCCAATAGGTCAAAACTACAAGATATGCTTGCTAATTTGAGAGATGTTGATGAACTTCCTTCATTGCAGCCATCTGTGGGTTCAC
CTTCCAGACCCAGCAGCTCCAGGCTTCCTGAACATGAAATTAATAGGGCAGATGAAGTGGAAGCATTGACATTTCCTCCTTCTTCTGGAA
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CAGCCAAAAAGAGCACTTCTCTTGATGTAGAACCTATCTATACATTCAGAGCCCATAAAGGTCCAGTGCTTTGTGTGGTAATGAGCAGCA
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ATCCTTCTGTTTTACGAGGCCCTCTGCTAGGCCACACGGATGCAGTCTGGGGTTTGGCTTATAGTGCAGCACATCAGCGTTTGTTGTCCT
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CTGCCTCTGTGGATCTAGTGAGCAGTGACCCGAGCCATATGGTAGCATCATTCAGCAAGGGATATACAAGCATTTTTAACATGGAAACAC
AACAACGCATTCTCACTTTAGAATCCAATGTAGATACAACAGCCAACTCTTCCTGCCAAATAAATAGAGTCATCAGTCATCCTACTCTTC
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TAGCCAGTGCTGGAGCTGACGCACTGGCTAAAGTCTTTGTATGACGCAATGCATCATCTTCACCTTCTAGCTGTTTATAAGTAATCAACT
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ATAGTTTTGCAATTCATATACTGTTTTCTAAAACTAAGGTTTGTTCAGGTTGCTGCAAGCTCAGCTGAATCTGTGAGCCTGAGGTCTGTT
TCAAATTTCTCCCCAATAGGCGCCTTTATTTCTGAGGTGGTTCTAATTCGCTAGGCAGGCCTGAGCGAATACAAGTTTAGCTTGTCCCTG
TTGAGTAAGTAGGGCATGCTACAATGGATAATTTAAAAGCTTGATAGCTGGGACTGAATAGAAGAAAACGGGAAACTTAGACCAAGTTCT
CCCCTGAGAAATCTTGTTAAAACACATTAAGTAGTCAAAATAGTAATCTTTATCATATCTGCCATATTAACCCCTTTGTGTATAATGACC
AGGCAGTGTTAAACTGAGTTTTTAATTTGACTCTCCTTTCAGCTGTTCACATAAAGCACCTGGCAAAGCATTTTACCTGTTAGGGGGAGA
AAAATGCAATAATATGTTAAATATATTATTATTCAGAAATGCTAGACAAATAGTTTGCAAGCAGATTTCTATATTGTATTACAGTTTTGA
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AACTTATTCAGGTTTGAAATTCTGTTTATTTTTAAGGGTAAACAGGGCATATCTCTTTAATAATTTCTATTTTAAAATTCACTTTATTCA
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CATTTATCAACACCCACCTAATCATGCTTCAGATGATCTGTGCTCTTTCTTCTTTGTCACGTTCAAGTTATCTGACATCTACCAAGAACA
GTTCATAATTATTAATAGCCCAAAGAGTATGGTTAACTTCACGCAGCTGCTTTTGCAGAAGCACTAATAAAAACAAATATTTTGTACCCT


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FusionGenePPI for NFIB_STRN


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ChiPPI page

.

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HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
NFIBRFX1, NFIC, NFIX, SOX2, ELAVL1, GRK5, EED, UNK, XRCC5, SASS6, NFIASTRNSTK24, MCC, CTTNBP2, CTTNBP2NL, STRIP1, MOB4, PDCD10, PPP2CA, PPP2R1A, STK26, SIKE1, STK25, STRN3, PPP2R1B, STRN4, STRIP2, SLMAP, CCT2, CCT8, CCT3, TCP1, CCT5, FGFR1OP2, CCT6A, CCT7, CCT4, CCT6B, TRAF3IP3, PPP2CB, ZRANB1, ELAVL1, LNX1, APC, TJP1, DDX1, DYNC1H1, CPSF6, EIF2S1, SF3B5, BRCA1, ECT2, PAXIP1, STK3, STK4, TFIP11, RINT1, PCOLCE2, LYPD3, NR1H3, PPP2R2C, RASSF3, PGAM5, NTRK1, HSPB1, DYNLL1, MAP4K4, EEF1E1, BAG2, SLC43A3, AHNAK, PRDM14, TNFRSF1A, NHSL2, PSMC5, PLP1, ZNF550, SNX24, LRRCC1, ZNF331, PRPF19, SPINK2, EXOC1, PKN3, NCKAP5L, TFPT, CCHCR1, YEATS4, TUFT1, RABGAP1L, GOLGA5


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PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


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PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for NFIB_STRN


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for NFIB_STRN


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneNFIBC0010606Adenoid Cystic Carcinoma1CTD_human