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FusionGeneSummary

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FusionProtFeature

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FusionGeneSequence

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FusionGenePPI

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RelatedDiseases

Fusion gene ID: 24094

FusionGeneSummary for NF1_GFPT1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: NF1_GFPT1
Fusion gene ID: 24094
HgeneTgene
Gene symbol

NF1

GFPT1

Gene ID

4763

2673

Gene nameneurofibromin 1glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1
SynonymsNFNS|VRNF|WSSCMS12|CMSTA1|GFA|GFAT|GFAT 1|GFAT1|GFAT1m|GFPT|GFPT1L|MSLG
Cytomap

17q11.2

2p13.3

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionneurofibrominneurofibromatosis 1neurofibromatosis-related protein NF-1truncated neurofibromin 1glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1D-fructose-6-phosphate amidotransferase 1glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1glutamine:fructose-6-phosphate amidotransferase 1hexosephosphate aminotransferas
Modification date2018052720180523
UniProtAcc

P21359

Q06210

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000356175, ENST00000358273, 
ENST00000431387, ENST00000581113, 
ENST00000417592, ENST00000444181, 
ENST00000357308, ENST00000361060, 
ENST00000494201, 
Fusion gene scores* DoF score35 X 18 X 19=119703 X 2 X 3=18
# samples 463
** MAII scorelog2(46/11970*10)=-4.70164548088649
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(3/18*10)=0.736965594166206
effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs).
DoF>8 and MAII>0
Context

PubMed: NF1 [Title/Abstract] AND GFPT1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotationTumor suppressor gene involved fusion gene, in-frame but not retained their domain.
Tumor suppressor gene involved fusion gene, retained protein feature but frameshift.
DDR (DNA damage repair) gene involved fusion gene, in-frame but not retained their domain.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneNF1

GO:0043547

positive regulation of GTPase activity

2121371


check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVSTADTCGA-CG-4477-01ANF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000356175ENST00000357308NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
In-frameENST00000356175ENST00000361060NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
5CDS-intronENST00000356175ENST00000494201NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
In-frameENST00000358273ENST00000357308NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
In-frameENST00000358273ENST00000361060NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
5CDS-intronENST00000358273ENST00000494201NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-3CDSENST00000431387ENST00000357308NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-3CDSENST00000431387ENST00000361060NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-intronENST00000431387ENST00000494201NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-3CDSENST00000581113ENST00000357308NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-3CDSENST00000581113ENST00000361060NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-intronENST00000581113ENST00000494201NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-3CDSENST00000417592ENST00000357308NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-3CDSENST00000417592ENST00000361060NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-intronENST00000417592ENST00000494201NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-3CDSENST00000444181ENST00000357308NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-3CDSENST00000444181ENST00000361060NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-
intron-intronENST00000444181ENST00000494201NF1chr17

29664600

+GFPT1chr2

69556930

-

Top

FusionProtFeatures for NF1_GFPT1


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
NF1

P21359

GFPT1

Q06210

Stimulates the GTPase activity of Ras. NF1 shows greateraffinity for Ras GAP, but lower specific activity. May be aregulator of Ras activity. {ECO:0000269|PubMed:2121371,ECO:0000269|PubMed:8417346}. Controls the flux of glucose into the hexosaminepathway. Most likely involved in regulating the availability ofprecursors for N- and O-linked glycosylation of proteins.Regulates the circadian expression of clock genes ARNTL/BMAL1 andCRY1.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000356175+42571352_135521932819Compositional biasNote=Poly-Ser
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000358273+43581352_135522142840Compositional biasNote=Poly-Ser
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000356175+42571235_145121932819DomainRas-GAP
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000356175+42571580_173821932819DomainCRAL-TRIO
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000358273+43581235_145122142840DomainRas-GAP
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000358273+43581580_173822142840DomainCRAL-TRIO
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000356175+42571580_183721932819RegionNote=Lipid binding
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000358273+43581580_183722142840RegionNote=Lipid binding
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000357308-1420548_689494700DomainSIS 2
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000361060-1319548_689476682DomainSIS 2

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000431387+1151352_1355-111594Compositional biasNote=Poly-Ser
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000431387+1151235_1451-111594DomainRas-GAP
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000431387+1151580_1738-111594DomainCRAL-TRIO
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000356175+42572555_257121932819MotifNote=Bipartite nuclear localization signal
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000358273+43582555_257122142840MotifNote=Bipartite nuclear localization signal
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000431387+1152555_2571-111594MotifNote=Bipartite nuclear localization signal
HgeneNF1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000431387+1151580_1837-111594RegionNote=Lipid binding
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000357308-14202_305494700DomainGlutamine amidotransferase type-2
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000357308-1420377_516494700DomainSIS 1
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000361060-13192_305476682DomainGlutamine amidotransferase type-2
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000361060-1319377_516476682DomainSIS 1
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000357308-1420313_680494700RegionNote=Isomerase
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000357308-1420394_395494700RegionSubstrate-binding
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000357308-1420439_441494700RegionSubstrate-binding
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000361060-1319313_680476682RegionNote=Isomerase
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000361060-1319394_395476682RegionSubstrate-binding
TgeneGFPT1chr17:29664600chr2:69556930ENST00000361060-1319439_441476682RegionSubstrate-binding


Top

FusionGeneSequence for NF1_GFPT1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
>In-frame_NF1_ENST00000356175_chr17_29664600_+_GFPT1_ENST00000357308_chr2_69556930_-_2399aa
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IILLILCPEIIQDISKDVVDENNMNKKLFLDSLRKALAGHGGSRQLTESAAIACVKLCKASTYINWEDNSVIFLLVQSMVVDLKNLLFNP
SKPFSRGSQPADVDLMIDCLVSCFRISPHNNQHFKICLAQNSPSTFHYVLVNSLHRIITNSALDWWPKIDAVYCHSVELRNMFGETLHKA
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RPFNDFVKSNFDAARRFFLDIASDCPTSDAVNHSLSFISDGNVLALHRLLWNNQEKIGQYLSSNRDHKAVGRRPFDKMATLLAYLGPPEH
KPVADTHWSSLNLTSSKFEEFMTRHQVHEKEEFKALKTLSIFYQAGTSKAGNPIFYYVARRFKTGQINGDLLIYHVLLTLKPYYAKPYEI
VVDLTHTGPSNRFKTDFLSKWFVVFPGFAYDNVSAVYIYNCNSWVREYTKYHERLLTGLKGSKRLVFIDCPGKLAEHIEHEQQKLPAATL
ALEEDLKVFHNALKLAHKDTKVSIKVGSTAVQVTSAERTKVLGQSVFLNDIYYASEIEEICLVDENQFTLTIANQGTPLTFMHQECEAIV
QSIIHIRTRWELSQPDSIPQHTKIRPKDVPGTLLNIALLNLGSSDPSLRSAAYNLLCALTCTFNLKIEGQLLETSGLCIPANNTLFIVSI
SKTLAANEPHLTLEFLEECISGFSKSSIELKHLCLEYMTPWLSNLVRFCKHNDDAKRQRVTAILDKLITMTINEKQMYPSIQAKIWGSLG
QITDLLDVVLDSFIKTSATGGLGSIKAEVMADTAVALASGNVKLVSSKVIGRMCKIIDKTCLSPTPTLEQHLMWDDIAILARYMLMLSFN
NSLDVAAHLPYLFHVVTFLVATGPLSLRASTHGLVINIIHSLCTCSQLHFSEETKQVLRLSLTEFSLPKFYLLFGISKVKSAAVIAFRSS
YRDRSFSPGSYERETFALTSLETVTEALLEIMEAYTSQFVSLVMFALMMCDDRISMQERRKEIMLGLKRLPDLIKEVLSMDDEIQKLATE
LYHQKSVLIMGRGYHYATCLEGALKIKEITYMHSEGILAGELKHGPLALVDKLMPVIMIIMRDHTYAKCQNALQQVVARQGRPVVICDKE

>In-frame_NF1_ENST00000356175_chr17_29664600_+_GFPT1_ENST00000361060_chr2_69556930_-_2399aa
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YRDRSFSPGSYERETFALTSLETVTEALLEIMEAYTSQFVSLVMFALMMCDDRISMQERRKEIMLGLKRLPDLIKEVLSMDDEIQKLATE
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>In-frame_NF1_ENST00000358273_chr17_29664600_+_GFPT1_ENST00000357308_chr2_69556930_-_2420aa
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CGVDEVSVHNLLPNYNTFMEFASVSNMMSTGRAALQKRVMALLRRIEHPTAGNTEAWEDTHAKWEQATKLILNYPKAKMEDGQAAESLHK
TIVKRRMSHVSGGGSIDLSDTDSLQEWINMTGFLCALGGVCLQQRSNSGLATYSPPMGPVSERKGSMISVMSSEGNADTPVSKFMDRLLS
LMVCNHEKVGLQIRTNVKDLVGLELSPALYPMLFNKLKNTISKFFDSQGQVLLTDTNTQFVEQTIAIMKNLLDNHTEGSSEHLGQASIET
MMLNLVRYVRVLGNMVHAIQIKTKLCQLVEVMMARRDDLSFCQEMKFRNKMVEYLTDWVMGTSNQAADDDVKCLTRDLDQASMEAVVSLL
AGLPLQPEEGDGVELMEAKSQLFLKYFTLFMNLLNDCSEVEDESAQTGGRKRGMSRRLASLRHCTVLAMSNLLNANVDSGLMHSIGLGYH
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FSKEVELADSMQTLFRGNSLASKIMTFCFKVYGATYLQKLLDPLLRIVITSSDWQHVSFEVDPTRLEPSESLEENQRNLLQMTEKFFHAI
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CATACCAAAGTCAGTACTGAGCACAACAAGGAATGTCTAATCAATATTTCCAAATACAAGTTTTCTTTGGTTATAAGCGGCCTCACTACT
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GAAAAATGTCTTGCTGGGCAACCAAAGGACACAATGAGATTAGATGAAACGATGCTGGTCAAACAGTTGCTGCCAGAAATCTGCCATTTT
CTTCACACCTGTCGTGAAGGAAACCAGCATGCAGCTGAACTTCGGAATTCTGCCTCTGGGGTTTTATTTTCTCTCAGCTGCAACAACTTC
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AGTACTTACATCAATTGGGAAGATAACTCTGTCATTTTCCTACTTGTTCAGTCCATGGTGGTTGATCTTAAGAACCTGCTTTTTAATCCA
AGTAAGCCATTCTCAAGAGGCAGTCAGCCTGCAGATGTGGATCTAATGATTGACTGCCTTGTTTCTTGCTTTCGTATAAGCCCTCACAAC
AACCAACACTTTAAGATCTGCCTGGCTCAGAATTCACCTTCTACATTTCACTATGTGCTGGTAAATTCACTCCATCGAATCATCACCAAT
TCCGCATTGGATTGGTGGCCTAAGATTGATGCTGTGTATTGTCACTCGGTTGAACTTCGAAATATGTTTGGTGAAACACTTCATAAAGCA
GTGCAAGGTTGTGGAGCACACCCAGCAATACGAATGGCACCGAGTCTTACATTTAAAGAAAAAGTAACAAGCCTTAAATTTAAAGAAAAA
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TGGGAGATTAGCTCACAAATGCTTTTTTACATCTGCAAGAAATTAACTAGTCATCAAATGCTTAGTAGCACAGAAATTCTCAAGTGGTTG
CGGGAAATATTGATCTGCAGGAATAAATTTCTTCTTAAAAATAAGCAGGCAGATAGAAGTTCCTGTCACTTTCTCCTTTTTTACGGGGTA
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GGAAAAGGGAACTCCTCTATGGATAGTGCAGCAGGATGCAGCGGAACCCCCCCGATTTGCCGACAAGCCCAGACCAAACTAGAAGTGGCC
CTGTACATGTTTCTGTGGAACCCTGACACTGAAGCTGTTCTGGTTGCCATGTCCTGTTTCCGCCACCTCTGTGAGGAAGCAGATATCCGG
TGTGGGGTGGATGAAGTGTCAGTGCATAACCTCTTGCCCAACTATAACACATTCATGGAGTTTGCCTCTGTCAGCAATATGATGTCAACA
GGAAGAGCAGCACTTCAGAAAAGAGTGATGGCACTGCTGAGGCGCATTGAGCATCCCACTGCAGGAAACACTGAGGCTTGGGAAGATACA
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ACCATTGTTAAGAGGCGAATGTCCCATGTGAGTGGAGGAGGATCCATAGATTTGTCTGACACAGACTCCCTACAGGAATGGATCAACATG
ACTGGCTTCCTTTGTGCCCTTGGGGGAGTGTGCCTCCAGCAGAGAAGCAATTCTGGCCTGGCAACCTATAGCCCACCCATGGGTCCAGTC
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GTAGAACAAACCATAGCTATAATGAAGAACTTGCTAGATAATCATACTGAAGGCAGCTCTGAACATCTAGGGCAAGCTAGCATTGAAACA
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GCTGGTCTCCCTCTGCAGCCTGAAGAAGGAGATGGTGTGGAATTGATGGAAGCCAAATCACAGTTATTTCTTAAATACTTCACATTATTT
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GTTCCTTGTTCTCAGTGGGATGAACTAGCTCGAGTTCTGGTTACTCTGTTTGATTCTCGGCATTTACTCTACCAACTGCTCTGGAACATG
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GTATATGGTGCTACCTATCTACAAAAACTCCTGGATCCTTTATTACGAATTGTGATCACATCCTCTGATTGGCAACATGTTAGCTTTGAA
GTGGATCCTACCAGGTTAGAACCATCAGAGAGCCTTGAGGAAAACCAGCGGAACCTCCTTCAGATGACTGAAAAGTTCTTCCATGCCATC
ATCAGTTCCTCCTCAGAATTCCCCCCTCAACTTCGAAGTGTGTGCCACTGTTTATACCAGGTGGTTAGCCAGCGTTTCCCTCAGAACAGC
ATCGGTGCAGTAGGAAGTGCCATGTTCCTCAGATTTATCAATCCTGCCATTGTCTCACCGTATGAAGCAGGGATTTTAGATAAAAAGCCA
CCACCTAGAATCGAAAGGGGCTTGAAGTTAATGTCAAAGATACTTCAGAGTATTGCCAATCATGTTCTCTTCACAAAAGAAGAACATATG
CGGCCTTTCAATGATTTTGTGAAAAGCAACTTTGATGCAGCACGCAGGTTTTTCCTTGATATAGCATCTGATTGTCCTACAAGTGATGCA
GTAAATCATAGTCTTTCCTTCATAAGTGACGGCAATGTGCTTGCTTTACATCGTCTACTCTGGAACAATCAGGAGAAAATTGGGCAGTAT
CTTTCCAGCAACAGGGATCATAAAGCTGTTGGAAGACGACCTTTTGATAAGATGGCAACACTTCTTGCATACCTGGGTCCTCCAGAGCAC
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GAAGAATTCAAGGCTTTGAAAACGTTAAGTATTTTCTACCAAGCTGGGACTTCCAAAGCTGGGAATCCTATTTTTTATTATGTTGCACGG
AGGTTCAAAACTGGTCAAATCAATGGTGATTTGCTGATATACCATGTCTTACTGACTTTAAAGCCATATTATGCAAAGCCATATGAAATT
GTAGTGGACCTTACCCATACCGGGCCTAGCAATCGCTTTAAAACAGACTTTCTCTCTAAGTGGTTTGTTGTTTTTCCTGGCTTTGCTTAC
GACAACGTCTCCGCAGTCTATATCTATAACTGTAACTCCTGGGTCAGGGAGTACACCAAGTATCATGAGCGGCTGCTGACTGGCCTCAAA
GGTAGCAAAAGGCTTGTTTTCATAGACTGTCCTGGGAAACTGGCTGAGCACATAGAGCATGAACAACAGAAACTACCTGCTGCCACCTTG
GCTTTAGAAGAGGACCTGAAGGTATTCCACAATGCTCTCAAGCTAGCTCACAAAGACACCAAAGTTTCTATTAAAGTTGGTTCTACTGCT
GTCCAAGTAACTTCAGCAGAGCGAACAAAAGTCCTAGGGCAATCAGTCTTTCTAAATGACATTTATTATGCTTCGGAAATTGAAGAAATC
TGCCTAGTAGATGAGAACCAGTTCACCTTAACCATTGCAAACCAGGGCACGCCGCTCACCTTCATGCACCAGGAGTGTGAAGCCATTGTC
CAGTCTATCATTCATATCCGGACCCGCTGGGAACTGTCACAGCCCGACTCTATCCCCCAACACACCAAGATTCGGCCAAAAGATGTCCCT
GGGACACTGCTCAATATCGCATTACTTAATTTAGGCAGTTCTGACCCGAGTTTACGGTCAGCTGCCTATAATCTTCTGTGTGCCTTAACT
TGTACCTTTAATTTAAAAATCGAGGGCCAGTTACTAGAGACATCAGGTTTATGTATCCCTGCCAACAACACCCTCTTTATTGTCTCTATT
AGTAAGACACTGGCAGCCAATGAGCCACACCTCACGTTAGAATTTTTGGAAGAGTGTATTTCTGGATTTAGCAAATCTAGTATTGAATTG
AAACACCTTTGTTTGGAATACATGACTCCATGGCTGTCAAATCTAGTTCGTTTTTGCAAGCATAATGATGATGCCAAACGACAAAGAGTT
ACTGCTATTCTTGACAAGCTGATAACAATGACCATCAATGAAAAACAGATGTACCCATCTATTCAAGCAAAAATATGGGGAAGCCTTGGG
CAGATTACAGATCTGCTTGATGTTGTACTAGACAGTTTCATCAAAACCAGTGCAACAGGTGGCTTGGGATCAATAAAAGCTGAGGTGATG
GCAGATACTGCTGTAGCTTTGGCTTCTGGAAATGTGAAATTGGTTTCAAGCAAGGTTATTGGAAGGATGTGCAAAATAATTGACAAGACA
TGCTTATCTCCAACTCCTACTTTAGAACAACATCTTATGTGGGATGATATTGCTATTTTAGCACGCTACATGCTGATGCTGTCCTTCAAC
AATTCCCTTGATGTGGCAGCTCATCTTCCCTACCTCTTCCACGTTGTTACTTTCTTAGTAGCCACAGGTCCGCTCTCCCTTAGAGCTTCC
ACACATGGACTGGTCATTAATATCATTCACTCTCTGTGTACTTGTTCACAGCTTCATTTTAGTGAAGAGACCAAGCAAGTTTTGAGACTC
AGTCTGACAGAGTTCTCATTACCCAAATTTTACTTGCTGTTTGGCATTAGCAAAGTCAAGTCAGCTGCTGTCATTGCCTTCCGTTCCAGT
TACCGGGACAGGTCATTCTCTCCTGGCTCCTATGAGAGAGAGACTTTTGCTTTGACATCCTTGGAAACAGTCACAGAAGCTTTGTTGGAG
ATCATGGAGGCTTATACCAGCCAGTTTGTATCCCTTGTGATGTTTGCCCTTATGATGTGTGATGATCGGATCTCCATGCAAGAAAGACGC
AAAGAGATCATGCTTGGATTGAAACGGCTGCCTGATTTGATTAAGGAAGTACTGAGCATGGATGACGAAATTCAGAAACTAGCAACAGAA
CTTTATCATCAGAAGTCAGTTCTGATAATGGGACGAGGCTATCATTATGCTACTTGTCTTGAAGGGGCACTGAAAATCAAAGAAATTACT
TATATGCACTCTGAAGGCATCCTTGCTGGTGAATTGAAACATGGCCCTCTGGCTTTGGTGGATAAATTGATGCCTGTGATCATGATCATC
ATGAGAGATCACACTTATGCCAAGTGTCAGAATGCTCTTCAGCAAGTGGTTGCTCGGCAGGGGCGGCCTGTGGTAATTTGTGATAAGGAG
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ATGGCCGCGCACAGGCCGGTGGAATGGGTCCAGGCCGTGGTCAGCCGCTTCGACGAGCAGCTTCCAATAAAAACAGGACAGCAGAACACA
CATACCAAAGTCAGTACTGAGCACAACAAGGAATGTCTAATCAATATTTCCAAATACAAGTTTTCTTTGGTTATAAGCGGCCTCACTACT
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CTTCACACCTGTCGTGAAGGAAACCAGCATGCAGCTGAACTTCGGAATTCTGCCTCTGGGGTTTTATTTTCTCTCAGCTGCAACAACTTC
AATGCAGTCTTTAGTCGCATTTCTACCAGGTTACAGGAATTAACTGTTTGTTCAGAAGACAATGTTGATGTTCATGATATAGAATTGTTA
CAGTATATCAATGTGGATTGTGCAAAATTAAAACGACTCCTGAAGGAAACAGCATTTAAATTTAAAGCCCTAAAGAAGGTTGCGCAGTTA
GCAGTTATAAATAGCCTGGAAAAGGCATTTTGGAACTGGGTAGAAAATTATCCAGATGAATTTACAAAACTGTACCAGATCCCACAGACT
GATATGGCTGAATGTGCAGAAAAGCTATTTGACTTGGTGGATGGTTTTGCTGAAAGCACCAAACGTAAAGCAGCAGTTTGGCCACTACAA
ATCATTCTCCTTATCTTGTGTCCAGAAATAATCCAGGATATATCCAAAGACGTGGTTGATGAAAACAACATGAATAAGAAGTTATTTCTG
GACAGTCTACGAAAAGCTCTTGCTGGCCATGGAGGAAGTAGGCAGCTGACAGAAAGTGCTGCAATTGCCTGTGTCAAACTGTGTAAAGCA
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GGAAAAGGGAACTCCTCTATGGATAGTGCAGCAGGATGCAGCGGAACCCCCCCGATTTGCCGACAAGCCCAGACCAAACTAGAAGTGGCC
CTGTACATGTTTCTGTGGAACCCTGACACTGAAGCTGTTCTGGTTGCCATGTCCTGTTTCCGCCACCTCTGTGAGGAAGCAGATATCCGG
TGTGGGGTGGATGAAGTGTCAGTGCATAACCTCTTGCCCAACTATAACACATTCATGGAGTTTGCCTCTGTCAGCAATATGATGTCAACA
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GCTGGTCTCCCTCTGCAGCCTGAAGAAGGAGATGGTGTGGAATTGATGGAAGCCAAATCACAGTTATTTCTTAAATACTTCACATTATTT
ATGAACCTTTTGAATGACTGCAGTGAAGTTGAAGATGAAAGTGCGCAAACAGGTGGCAGGAAACGTGGCATGTCTCGGAGGCTGGCATCA
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GTTCCTTGTTCTCAGTGGGATGAACTAGCTCGAGTTCTGGTTACTCTGTTTGATTCTCGGCATTTACTCTACCAACTGCTCTGGAACATG
TTTTCTAAAGAAGTAGAATTGGCAGACTCCATGCAGACTCTCTTCCGAGGCAACAGCTTGGCCAGTAAAATAATGACATTCTGTTTCAAG
GTATATGGTGCTACCTATCTACAAAAACTCCTGGATCCTTTATTACGAATTGTGATCACATCCTCTGATTGGCAACATGTTAGCTTTGAA
GTGGATCCTACCAGGTTAGAACCATCAGAGAGCCTTGAGGAAAACCAGCGGAACCTCCTTCAGATGACTGAAAAGTTCTTCCATGCCATC
ATCAGTTCCTCCTCAGAATTCCCCCCTCAACTTCGAAGTGTGTGCCACTGTTTATACCAGGTGGTTAGCCAGCGTTTCCCTCAGAACAGC
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CGGCCTTTCAATGATTTTGTGAAAAGCAACTTTGATGCAGCACGCAGGTTTTTCCTTGATATAGCATCTGATTGTCCTACAAGTGATGCA
GTAAATCATAGTCTTTCCTTCATAAGTGACGGCAATGTGCTTGCTTTACATCGTCTACTCTGGAACAATCAGGAGAAAATTGGGCAGTAT
CTTTCCAGCAACAGGGATCATAAAGCTGTTGGAAGACGACCTTTTGATAAGATGGCAACACTTCTTGCATACCTGGGTCCTCCAGAGCAC
AAACCTGTGGCAGATACACACTGGTCCAGCCTTAACCTTACCAGTTCAAAGTTTGAGGAATTTATGACTAGGCATCAGGTACATGAAAAA
GAAGAATTCAAGGCTTTGAAAACGTTAAGTATTTTCTACCAAGCTGGGACTTCCAAAGCTGGGAATCCTATTTTTTATTATGTTGCACGG
AGGTTCAAAACTGGTCAAATCAATGGTGATTTGCTGATATACCATGTCTTACTGACTTTAAAGCCATATTATGCAAAGCCATATGAAATT
GTAGTGGACCTTACCCATACCGGGCCTAGCAATCGCTTTAAAACAGACTTTCTCTCTAAGTGGTTTGTTGTTTTTCCTGGCTTTGCTTAC
GACAACGTCTCCGCAGTCTATATCTATAACTGTAACTCCTGGGTCAGGGAGTACACCAAGTATCATGAGCGGCTGCTGACTGGCCTCAAA
GGTAGCAAAAGGCTTGTTTTCATAGACTGTCCTGGGAAACTGGCTGAGCACATAGAGCATGAACAACAGAAACTACCTGCTGCCACCTTG
GCTTTAGAAGAGGACCTGAAGGTATTCCACAATGCTCTCAAGCTAGCTCACAAAGACACCAAAGTTTCTATTAAAGTTGGTTCTACTGCT
GTCCAAGTAACTTCAGCAGAGCGAACAAAAGTCCTAGGGCAATCAGTCTTTCTAAATGACATTTATTATGCTTCGGAAATTGAAGAAATC
TGCCTAGTAGATGAGAACCAGTTCACCTTAACCATTGCAAACCAGGGCACGCCGCTCACCTTCATGCACCAGGAGTGTGAAGCCATTGTC
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ATCATGGAGGCTTATACCAGCCAGTTTGTATCCCTTGTGATGTTTGCCCTTATGATGTGTGATGATCGGATCTCCATGCAAGAAAGACGC
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CACTCTCTGTGTACTTGTTCACAGCTTCATTTTAGTGAAGAGACCAAGCAAGTTTTGAGACTCAGTCTGACAGAGTTCTCATTACCCAAA
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GTATCCCTTGTGATGTTTGCCCTTATGATGTGTGATGATCGGATCTCCATGCAAGAAAGACGCAAAGAGATCATGCTTGGATTGAAACGG
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ATGGGACGAGGCTATCATTATGCTACTTGTCTTGAAGGGGCACTGAAAATCAAAGAAATTACTTATATGCACTCTGAAGGCATCCTTGCT
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* Fusion transcript sequences (Full-length transcript).
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GGCTGTGGGGAGACGGCGCTAGTGGGGAGAGCGACCAAGAGGCCCCCTCCCCTCCCCGGGTCCCCTTCCCCTATCCCCCTCCCCCCAGCC
TCCTTGCCAACGCCCCCTTTCCCTCTCCCCCTCCCGCTCGGCGCTGACCCCCCATCCCCACCCCCGTGGGAACACTGGGAGCCTGCACTC
CACAGACCCTCTCCTTGCCTCTTCCCTCACCTCAGCCTCCGCTCCCCGCCCTCTTCCCGGCCCAGGGCGCCGGCCCACCCTTCCCTCCGC
CGCCCCCCGGCCGCGGGGAGGACATGGCCGCGCACAGGCCGGTGGAATGGGTCCAGGCCGTGGTCAGCCGCTTCGACGAGCAGCTTCCAA
TAAAAACAGGACAGCAGAACACACATACCAAAGTCAGTACTGAGCACAACAAGGAATGTCTAATCAATATTTCCAAATACAAGTTTTCTT
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AGTTGATTATATTGGATACACTGGAAAAATGTCTTGCTGGGCAACCAAAGGACACAATGAGATTAGATGAAACGATGCTGGTCAAACAGT
TGCTGCCAGAAATCTGCCATTTTCTTCACACCTGTCGTGAAGGAAACCAGCATGCAGCTGAACTTCGGAATTCTGCCTCTGGGGTTTTAT
TTTCTCTCAGCTGCAACAACTTCAATGCAGTCTTTAGTCGCATTTCTACCAGGTTACAGGAATTAACTGTTTGTTCAGAAGACAATGTTG
ATGTTCATGATATAGAATTGTTACAGTATATCAATGTGGATTGTGCAAAATTAAAACGACTCCTGAAGGAAACAGCATTTAAATTTAAAG
CCCTAAAGAAGGTTGCGCAGTTAGCAGTTATAAATAGCCTGGAAAAGGCATTTTGGAACTGGGTAGAAAATTATCCAGATGAATTTACAA
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ACATGAATAAGAAGTTATTTCTGGACAGTCTACGAAAAGCTCTTGCTGGCCATGGAGGAAGTAGGCAGCTGACAGAAAGTGCTGCAATTG
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TTAAGAACCTGCTTTTTAATCCAAGTAAGCCATTCTCAAGAGGCAGTCAGCCTGCAGATGTGGATCTAATGATTGACTGCCTTGTTTCTT
GCTTTCGTATAAGCCCTCACAACAACCAACACTTTAAGATCTGCCTGGCTCAGAATTCACCTTCTACATTTCACTATGTGCTGGTAAATT
CACTCCATCGAATCATCACCAATTCCGCATTGGATTGGTGGCCTAAGATTGATGCTGTGTATTGTCACTCGGTTGAACTTCGAAATATGT
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ACTTTCTCCTTTTTTACGGGGTAGGATGTGATATTCCTTCTAGTGGAAATACCAGTCAAATGTCCATGGATCATGAAGAATTACTACGTA
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FusionGenePPI for NF1_GFPT1


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check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
NF1HRAS, SMARCA4, POLR2A, TIRAP, SIRT7, VCP, NSFL1C, CAV1, YWHAB, FAF2, NXF1, CCDC8, HLA-DPA1, EFNB2, CD274, TNFSF13B, CA14, SLAMF1, VSIG4, TGOLN2, HTR6, NOSIP, KRAS, CLK1, CDC5L, APP, YWHAH, PML, TRAF6, PTEN, SDC2, EGFR, CD79B, P4HA3, SCN3B, VSIG1, SIGLECL1, EPHA1, FAM174A, KCTD3, KIF13B, ZBTB21, KSR1, CGN, GIGYF1, LRFN1, RTKN, MAST3, DENND1A, SH3PXD2A, SRGAP2, DENND4C, PPM1H, EIF4E2, SIPA1L1, LIMA1, RALGPS2, MAGI1, CBY1, TESK2, CDC25C, DCLK1, GIGYF2, HDAC4, LPIN3, ZNF638, CAMSAP2, NADK, MAPKAP1, SRSF12, RASAL2, SYDE1, KIAA1804, TIAM1, AGAP1, CDC25B, CDK16, SH3RF3, PHLDB2, PLEKHA7, KIF1C, OSBPL6, FAM110B, USP21, NAV1, TANC2, PTPN13, FAM53C, ANKRD34A, STARD13, PTPN14, GAB2, DENND4A, INPP5E, TOP1, TOP2A, TOP3A, NRASGFPT1PRKAA2, PRKAB2, ELAVL1, SIRT7, MAPK8, CARS, GARS, HIST1H4A, KHSRP, OSBP, RBX1, SEC23A, TROVE2, TTC1, KPNA6, NCBP1, PRMT3, SF1, XPO7, DCP2, SIRT6, UNK, ASNS, CRK, ACADM, AHSA1, ARHGAP1, ATP5B, CAD, CCT6A, CCT8, DARS, DNAAF5, FASN, IARS, LDHB, MARS, NMD3, PFDN4, PFDN5, PPP2R1A, PSMC2, PSMC4, PSMD2, PSMD3, PSMD4, TARS, TTC27, UBA1, XPO1, SETD3, NTRK1, POC5, TCTN1, MCM2, RNF126, GFPT2, LRP1, G3BP1


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for NF1_GFPT1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for NF1_GFPT1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneNF1C0027831Neurofibromatosis 134CTD_human;ORPHANET;UNIPROT
HgeneNF1C2931482Neurofibromatosis-Noonan syndrome5CTD_human;ORPHANET;UNIPROT
HgeneNF1C0349639Juvenile Myelomonocytic Leukemia3CTD_human;HPO;ORPHANET
HgeneNF1C0004114Astrocytoma2CTD_human;HPO
HgeneNF1C0023467Leukemia, Myelocytic, Acute2CTD_human
HgeneNF1C0025202melanoma2CTD_human
HgeneNF1C0206727Nerve Sheath Tumors2CTD_human
HgeneNF1C0001430Adenoma1CTD_human
HgeneNF1C0004352Autistic Disorder1CTD_human
HgeneNF1C0016057Fibrosarcoma1CTD_human
HgeneNF1C0017636Glioblastoma1CTD_human
HgeneNF1C0017638Glioma1CTD_human
HgeneNF1C0023186Learning Disorders1CTD_human
HgeneNF1C0023827liposarcoma1CTD_human
HgeneNF1C0027809Neurilemmoma1CTD_human
HgeneNF1C0027830neurofibroma1CTD_human
HgeneNF1C0027962Melanocytic nevus1CTD_human
HgeneNF1C0031511Pheochromocytoma1CTD_human
HgeneNF1C0162678Neurofibromatoses1CTD_human;HPO
HgeneNF1C1261473Sarcoma1CTD_human
HgeneNF1C1834235NEUROFIBROMATOSIS, FAMILIAL SPINAL1CTD_human;UNIPROT
HgeneNF1C3714756Intellectual Disability1CTD_human;HPO
TgeneGFPT1C0028754Obesity1CTD_human
TgeneGFPT1C3552335MYASTHENIC SYNDROME, CONGENITAL, 121UNIPROT