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FusionGeneSummary

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FusionProtFeature

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FusionGeneSequence

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FusionGenePPI

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RelatedDiseases

Fusion gene ID: 23186

FusionGeneSummary for MYO6_NEGR1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: MYO6_NEGR1
Fusion gene ID: 23186
HgeneTgene
Gene symbol

MYO6

NEGR1

Gene ID

4646

257194

Gene namemyosin VIneuronal growth regulator 1
SynonymsDFNA22|DFNB37|Myo6-007|Myo6-008DMML2433|IGLON4|KILON|Ntra
Cytomap

6q14.1

1p31.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionunconventional myosin-VImyosin VI transcript variant 007myosin VI transcript variant 008unconventional myosin-6neuronal growth regulator 1IgLON family member 4a kindred of IgLONneurotractin
Modification date2018052720180522
UniProtAcc

Q9UM54

Q7Z3B1

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000369981, ENST00000369985, 
ENST00000369977, ENST00000369975, 
ENST00000462633, 
ENST00000357731, 
ENST00000306821, ENST00000434200, 
ENST00000467479, 
Fusion gene scores* DoF score9 X 8 X 8=5768 X 6 X 3=144
# samples 177
** MAII scorelog2(17/576*10)=-1.76053406530461
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(7/144*10)=-1.04064198449735
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: MYO6 [Title/Abstract] AND NEGR1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneMYO6

GO:0030330

DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator

16507995


check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVPRADTCGA-HC-8262-01AMYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000369981ENST00000357731MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
In-frameENST00000369981ENST00000306821MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
5CDS-intronENST00000369981ENST00000434200MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
5CDS-5UTRENST00000369981ENST00000467479MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
In-frameENST00000369985ENST00000357731MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
In-frameENST00000369985ENST00000306821MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
5CDS-intronENST00000369985ENST00000434200MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
5CDS-5UTRENST00000369985ENST00000467479MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
In-frameENST00000369977ENST00000357731MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
In-frameENST00000369977ENST00000306821MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
5CDS-intronENST00000369977ENST00000434200MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
5CDS-5UTRENST00000369977ENST00000467479MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
In-frameENST00000369975ENST00000357731MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
In-frameENST00000369975ENST00000306821MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
5CDS-intronENST00000369975ENST00000434200MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
5CDS-5UTRENST00000369975ENST00000467479MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
intron-3CDSENST00000462633ENST00000357731MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
intron-3CDSENST00000462633ENST00000306821MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
intron-intronENST00000462633ENST00000434200MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-
intron-5UTRENST00000462633ENST00000467479MYO6chr6

76558248

+NEGR1chr1

72163822

-

Top

FusionProtFeatures for MYO6_NEGR1


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
MYO6

Q9UM54

NEGR1

Q7Z3B1

Myosins are actin-based motor molecules with ATPaseactivity. Unconventional myosins serve in intracellular movements.Myosin 6 is a reverse-direction motor protein that moves towardsthe minus-end of actin filaments. Has slow rate of actin-activatedADP release due to weak ATP binding. Functions in a variety ofintracellular processes such as vesicular membrane trafficking andcell migration. Required for the structural integrity of the Golgiapparatus via the p53-dependent pro-survival pathway. Appears tobe involved in a very early step of clathrin-mediated endocytosisin polarized epithelial cells. May act as a regulator of F-actindynamics. May play a role in transporting DAB2 from the plasmamembrane to specific cellular targets. Required for structuralintegrity of inner ear hair cells (By similarity). {ECO:0000250,ECO:0000269|PubMed:10519557, ECO:0000269|PubMed:11447109,ECO:0000269|PubMed:16507995, ECO:0000269|PubMed:16949370}. May be involved in cell-adhesion. May function as atrans-neural growth-promoting factor in regenerative axonsprouting in the mammalian brain (By similarity). {ECO:0000250}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+11352_533591286DomainMyosin N-terminal SH3-like
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+11332_533591263DomainMyosin N-terminal SH3-like
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+1135151_1583591286Nucleotide bindingATP
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+1133151_1583591263Nucleotide bindingATP
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+1135273_3173591286RegionResponsible for slow ATPase activity
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+1133273_3173591263RegionResponsible for slow ATPase activity
TgeneNEGR1chr6:76558248chr1:72163822ENST00000357731-27225_313178355DomainNote=Ig-like C2-type 3

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>>>>>>>>>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+1135920_10273591286Compositional biasNote=Glu-rich
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+1133920_10273591263Compositional biasNote=Glu-rich
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+113557_7713591286DomainMyosin motor
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+1135814_8343591286DomainNote=IQ
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+113357_7713591263DomainMyosin motor
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+1133814_8343591263DomainNote=IQ
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+1135665_6723591286RegionActin-binding
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+1135782_8103591286RegionRequired for binding calmodulin
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+1135835_9163591286RegionNote=Three-helix bundle
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+1135917_9843591286RegionSAH
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+1133665_6723591263RegionActin-binding
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+1133782_8103591263RegionRequired for binding calmodulin
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+1133835_9163591263RegionNote=Three-helix bundle
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+1133917_9843591263RegionSAH
TgeneNEGR1chr6:76558248chr1:72163822ENST00000357731-27139_221178355DomainNote=Ig-like C2-type 2
TgeneNEGR1chr6:76558248chr1:72163822ENST00000357731-2738_134178355DomainNote=Ig-like C2-type 1


Top

FusionGeneSequence for MYO6_NEGR1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
>In-frame_MYO6_ENST00000369981_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000357731_chr1_72163822_-_536aa
MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYV
ANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSLGTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
RIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGKEERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDN
FRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEYLKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSA
KPFENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVKVVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQ

>In-frame_MYO6_ENST00000369981_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000306821_chr1_72163822_-_536aa
MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYV
ANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSLGTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
RIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGKEERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDN
FRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEYLKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSA
KPFENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVKVVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQ

>In-frame_MYO6_ENST00000369985_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000357731_chr1_72163822_-_536aa
MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYV
ANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSLGTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
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FRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEYLKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSA
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>In-frame_MYO6_ENST00000369985_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000306821_chr1_72163822_-_536aa
MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYV
ANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSLGTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
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>In-frame_MYO6_ENST00000369977_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000357731_chr1_72163822_-_536aa
MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYV
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FRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEYLKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSA
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>In-frame_MYO6_ENST00000369977_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000306821_chr1_72163822_-_536aa
MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYV
ANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSLGTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
RIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGKEERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDN
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>In-frame_MYO6_ENST00000369975_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000357731_chr1_72163822_-_536aa
MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYV
ANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSLGTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
RIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGKEERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDN
FRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEYLKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSA
KPFENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVKVVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQ

>In-frame_MYO6_ENST00000369975_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000306821_chr1_72163822_-_536aa
MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYV
ANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSLGTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
RIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGKEERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDN
FRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEYLKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSA
KPFENGQYLDIYGITRDQAGEYECSAENDVSFPDVRKVKVVVNFAPTIQEIKSGTVTPGRSGLIRCEGAGVPPPAFEWYKGEKKLFNGQQ


* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
>In-frame_MYO6_ENST00000369981_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000357731_chr1_72163822_-_1608nt
ATGGAGGATGGAAAGCCCGTTTGGGCGCCACACCCTACAGATGGATTTCAGATGGGCAATATTGTGGATATTGGCCCCGACAGCTTAACA
ATTGAACCCTTGAATCAGAAAGGCAAGACATTTTTGGCTCTCATAAACCAAGTGTTTCCTGCAGAAGAGGACAGTAAAAAAGATGTGGAA
GATAACTGTTCACTAATGTATTTAAATGAAGCCACACTGCTCCATAATATCAAAGTTCGATATAGTAAAGACAGAATTTATACATATGTC
GCCAACATTCTGATTGCAGTGAATCCATACTTTGACATACCTAAAATATATTCTTCAGAAGCAATAAAGTCATATCAAGGAAAATCTCTT
GGGACAAGACCACCTCATGTCTTTGCAATTGCTGATAAAGCTTTTCGAGACATGAAGGTGCTCAAGATGAGTCAGTCTATCATTGTATCT
GGAGAATCAGGAGCCGGCAAAACAGAAAATACAAAATTTGTTCTAAGATACCTGACTGAATCCTATGGAACAGGTCAAGATATTGATGAC
AGAATTGTTGAAGCTAACCCACTCCTAGAAGCCTTTGGAAATGCGAAGACTGTTCGCAACAATAATAGCAGTCGATTTGGGAAATTTGTA
GAAATACATTTTAATGAAAAGAGCTCAGTTGTTGGAGGATTTGTTTCACATTATCTCCTAGAGAAATCTAGGATCTGTGTTCAAGGCAAA
GAGGAAAGAAATTATCATATCTTTTATAGGTTGTGTGCTGGTGCTTCTGAAGATATTAGAGAAAAACTTCATTTGAGTTCACCAGATAAT
TTTCGGTATTTAAACCGAGGCTGCACTAGATACTTTGCTAACAAAGAAACTGACAAACAGATTTTACAGAACCGCAAAAGTCCTGAGTAC
CTTAAGGCAGGTTCTATGAAAGATCCTCTGCTAGATGACCATGGTGATTTTATTAGAATGTGCACGGCTATGAAAAAAATTGGTTTGGAT
GATGAAGAAAAGCTTGATCTCTTCCGGGTAGTAGCTGGCGTCCTGCACCTTGGAAATATTGATTTTGAGGAAGCTGGCAGCACTTCAGCA
AAACCATTTGAAAATGGACAATATTTGGACATTTATGGAATTACAAGGGACCAGGCTGGGGAATATGAATGCAGTGCGGAAAATGATGTG
TCATTCCCAGATGTGAGGAAAGTAAAAGTTGTTGTCAACTTTGCTCCTACTATTCAGGAAATTAAATCTGGCACCGTGACCCCCGGACGC
AGTGGCCTGATAAGATGTGAAGGTGCAGGTGTGCCGCCTCCAGCCTTTGAATGGTACAAAGGAGAGAAGAAGCTCTTCAATGGCCAACAA
GGAATTATTATTCAAAATTTTAGCACAAGATCCATTCTCACTGTTACCAACGTGACACAGGAGCACTTCGGCAATTATACCTGTGTGGCT
GCCAACAAGCTAGGCACAACCAATGCGAGCCTGCCTCTTAACCCTCCAAGTACAGCCCAGTATGGAATTACCGGGAGCGCTGATGTTCTT

>In-frame_MYO6_ENST00000369981_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000306821_chr1_72163822_-_1608nt
ATGGAGGATGGAAAGCCCGTTTGGGCGCCACACCCTACAGATGGATTTCAGATGGGCAATATTGTGGATATTGGCCCCGACAGCTTAACA
ATTGAACCCTTGAATCAGAAAGGCAAGACATTTTTGGCTCTCATAAACCAAGTGTTTCCTGCAGAAGAGGACAGTAAAAAAGATGTGGAA
GATAACTGTTCACTAATGTATTTAAATGAAGCCACACTGCTCCATAATATCAAAGTTCGATATAGTAAAGACAGAATTTATACATATGTC
GCCAACATTCTGATTGCAGTGAATCCATACTTTGACATACCTAAAATATATTCTTCAGAAGCAATAAAGTCATATCAAGGAAAATCTCTT
GGGACAAGACCACCTCATGTCTTTGCAATTGCTGATAAAGCTTTTCGAGACATGAAGGTGCTCAAGATGAGTCAGTCTATCATTGTATCT
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CTTAAGGCAGGTTCTATGAAAGATCCTCTGCTAGATGACCATGGTGATTTTATTAGAATGTGCACGGCTATGAAAAAAATTGGTTTGGAT
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AAACCATTTGAAAATGGACAATATTTGGACATTTATGGAATTACAAGGGACCAGGCTGGGGAATATGAATGCAGTGCGGAAAATGATGTG
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GAAATACATTTTAATGAAAAGAGCTCAGTTGTTGGAGGATTTGTTTCACATTATCTCCTAGAGAAATCTAGGATCTGTGTTCAAGGCAAA
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CTTAAGGCAGGTTCTATGAAAGATCCTCTGCTAGATGACCATGGTGATTTTATTAGAATGTGCACGGCTATGAAAAAAATTGGTTTGGAT
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AAACCATTTGAAAATGGACAATATTTGGACATTTATGGAATTACAAGGGACCAGGCTGGGGAATATGAATGCAGTGCGGAAAATGATGTG
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ATGGAGGATGGAAAGCCCGTTTGGGCGCCACACCCTACAGATGGATTTCAGATGGGCAATATTGTGGATATTGGCCCCGACAGCTTAACA
ATTGAACCCTTGAATCAGAAAGGCAAGACATTTTTGGCTCTCATAAACCAAGTGTTTCCTGCAGAAGAGGACAGTAAAAAAGATGTGGAA
GATAACTGTTCACTAATGTATTTAAATGAAGCCACACTGCTCCATAATATCAAAGTTCGATATAGTAAAGACAGAATTTATACATATGTC
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GGGACAAGACCACCTCATGTCTTTGCAATTGCTGATAAAGCTTTTCGAGACATGAAGGTGCTCAAGATGAGTCAGTCTATCATTGTATCT
GGAGAATCAGGAGCCGGCAAAACAGAAAATACAAAATTTGTTCTAAGATACCTGACTGAATCCTATGGAACAGGTCAAGATATTGATGAC
AGAATTGTTGAAGCTAACCCACTCCTAGAAGCCTTTGGAAATGCGAAGACTGTTCGCAACAATAATAGCAGTCGATTTGGGAAATTTGTA
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CTTAAGGCAGGTTCTATGAAAGATCCTCTGCTAGATGACCATGGTGATTTTATTAGAATGTGCACGGCTATGAAAAAAATTGGTTTGGAT
GATGAAGAAAAGCTTGATCTCTTCCGGGTAGTAGCTGGCGTCCTGCACCTTGGAAATATTGATTTTGAGGAAGCTGGCAGCACTTCAGCA
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GCCAACATTCTGATTGCAGTGAATCCATACTTTGACATACCTAAAATATATTCTTCAGAAGCAATAAAGTCATATCAAGGAAAATCTCTT
GGGACAAGACCACCTCATGTCTTTGCAATTGCTGATAAAGCTTTTCGAGACATGAAGGTGCTCAAGATGAGTCAGTCTATCATTGTATCT
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AGAATTGTTGAAGCTAACCCACTCCTAGAAGCCTTTGGAAATGCGAAGACTGTTCGCAACAATAATAGCAGTCGATTTGGGAAATTTGTA
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GATGAAGAAAAGCTTGATCTCTTCCGGGTAGTAGCTGGCGTCCTGCACCTTGGAAATATTGATTTTGAGGAAGCTGGCAGCACTTCAGCA
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ATTGAACCCTTGAATCAGAAAGGCAAGACATTTTTGGCTCTCATAAACCAAGTGTTTCCTGCAGAAGAGGACAGTAAAAAAGATGTGGAA
GATAACTGTTCACTAATGTATTTAAATGAAGCCACACTGCTCCATAATATCAAAGTTCGATATAGTAAAGACAGAATTTATACATATGTC
GCCAACATTCTGATTGCAGTGAATCCATACTTTGACATACCTAAAATATATTCTTCAGAAGCAATAAAGTCATATCAAGGAAAATCTCTT
GGGACAAGACCACCTCATGTCTTTGCAATTGCTGATAAAGCTTTTCGAGACATGAAGGTGCTCAAGATGAGTCAGTCTATCATTGTATCT
GGAGAATCAGGAGCCGGCAAAACAGAAAATACAAAATTTGTTCTAAGATACCTGACTGAATCCTATGGAACAGGTCAAGATATTGATGAC
AGAATTGTTGAAGCTAACCCACTCCTAGAAGCCTTTGGAAATGCGAAGACTGTTCGCAACAATAATAGCAGTCGATTTGGGAAATTTGTA
GAAATACATTTTAATGAAAAGAGCTCAGTTGTTGGAGGATTTGTTTCACATTATCTCCTAGAGAAATCTAGGATCTGTGTTCAAGGCAAA
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CTTAAGGCAGGTTCTATGAAAGATCCTCTGCTAGATGACCATGGTGATTTTATTAGAATGTGCACGGCTATGAAAAAAATTGGTTTGGAT
GATGAAGAAAAGCTTGATCTCTTCCGGGTAGTAGCTGGCGTCCTGCACCTTGGAAATATTGATTTTGAGGAAGCTGGCAGCACTTCAGCA
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AGTGGCCTGATAAGATGTGAAGGTGCAGGTGTGCCGCCTCCAGCCTTTGAATGGTACAAAGGAGAGAAGAAGCTCTTCAATGGCCAACAA
GGAATTATTATTCAAAATTTTAGCACAAGATCCATTCTCACTGTTACCAACGTGACACAGGAGCACTTCGGCAATTATACCTGTGTGGCT
GCCAACAAGCTAGGCACAACCAATGCGAGCCTGCCTCTTAACCCTCCAAGTACAGCCCAGTATGGAATTACCGGGAGCGCTGATGTTCTT

>In-frame_MYO6_ENST00000369975_chr6_76558248_+_NEGR1_ENST00000357731_chr1_72163822_-_1608nt
ATGGAGGATGGAAAGCCCGTTTGGGCGCCACACCCTACAGATGGATTTCAGATGGGCAATATTGTGGATATTGGCCCCGACAGCTTAACA
ATTGAACCCTTGAATCAGAAAGGCAAGACATTTTTGGCTCTCATAAACCAAGTGTTTCCTGCAGAAGAGGACAGTAAAAAAGATGTGGAA
GATAACTGTTCACTAATGTATTTAAATGAAGCCACACTGCTCCATAATATCAAAGTTCGATATAGTAAAGACAGAATTTATACATATGTC
GCCAACATTCTGATTGCAGTGAATCCATACTTTGACATACCTAAAATATATTCTTCAGAAGCAATAAAGTCATATCAAGGAAAATCTCTT
GGGACAAGACCACCTCATGTCTTTGCAATTGCTGATAAAGCTTTTCGAGACATGAAGGTGCTCAAGATGAGTCAGTCTATCATTGTATCT
GGAGAATCAGGAGCCGGCAAAACAGAAAATACAAAATTTGTTCTAAGATACCTGACTGAATCCTATGGAACAGGTCAAGATATTGATGAC
AGAATTGTTGAAGCTAACCCACTCCTAGAAGCCTTTGGAAATGCGAAGACTGTTCGCAACAATAATAGCAGTCGATTTGGGAAATTTGTA
GAAATACATTTTAATGAAAAGAGCTCAGTTGTTGGAGGATTTGTTTCACATTATCTCCTAGAGAAATCTAGGATCTGTGTTCAAGGCAAA
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TTTCGGTATTTAAACCGAGGCTGCACTAGATACTTTGCTAACAAAGAAACTGACAAACAGATTTTACAGAACCGCAAAAGTCCTGAGTAC
CTTAAGGCAGGTTCTATGAAAGATCCTCTGCTAGATGACCATGGTGATTTTATTAGAATGTGCACGGCTATGAAAAAAATTGGTTTGGAT
GATGAAGAAAAGCTTGATCTCTTCCGGGTAGTAGCTGGCGTCCTGCACCTTGGAAATATTGATTTTGAGGAAGCTGGCAGCACTTCAGCA
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GCCAACAAGCTAGGCACAACCAATGCGAGCCTGCCTCTTAACCCTCCAAGTACAGCCCAGTATGGAATTACCGGGAGCGCTGATGTTCTT

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ATGGAGGATGGAAAGCCCGTTTGGGCGCCACACCCTACAGATGGATTTCAGATGGGCAATATTGTGGATATTGGCCCCGACAGCTTAACA
ATTGAACCCTTGAATCAGAAAGGCAAGACATTTTTGGCTCTCATAAACCAAGTGTTTCCTGCAGAAGAGGACAGTAAAAAAGATGTGGAA
GATAACTGTTCACTAATGTATTTAAATGAAGCCACACTGCTCCATAATATCAAAGTTCGATATAGTAAAGACAGAATTTATACATATGTC
GCCAACATTCTGATTGCAGTGAATCCATACTTTGACATACCTAAAATATATTCTTCAGAAGCAATAAAGTCATATCAAGGAAAATCTCTT
GGGACAAGACCACCTCATGTCTTTGCAATTGCTGATAAAGCTTTTCGAGACATGAAGGTGCTCAAGATGAGTCAGTCTATCATTGTATCT
GGAGAATCAGGAGCCGGCAAAACAGAAAATACAAAATTTGTTCTAAGATACCTGACTGAATCCTATGGAACAGGTCAAGATATTGATGAC
AGAATTGTTGAAGCTAACCCACTCCTAGAAGCCTTTGGAAATGCGAAGACTGTTCGCAACAATAATAGCAGTCGATTTGGGAAATTTGTA
GAAATACATTTTAATGAAAAGAGCTCAGTTGTTGGAGGATTTGTTTCACATTATCTCCTAGAGAAATCTAGGATCTGTGTTCAAGGCAAA
GAGGAAAGAAATTATCATATCTTTTATAGGTTGTGTGCTGGTGCTTCTGAAGATATTAGAGAAAAACTTCATTTGAGTTCACCAGATAAT
TTTCGGTATTTAAACCGAGGCTGCACTAGATACTTTGCTAACAAAGAAACTGACAAACAGATTTTACAGAACCGCAAAAGTCCTGAGTAC
CTTAAGGCAGGTTCTATGAAAGATCCTCTGCTAGATGACCATGGTGATTTTATTAGAATGTGCACGGCTATGAAAAAAATTGGTTTGGAT
GATGAAGAAAAGCTTGATCTCTTCCGGGTAGTAGCTGGCGTCCTGCACCTTGGAAATATTGATTTTGAGGAAGCTGGCAGCACTTCAGCA
AAACCATTTGAAAATGGACAATATTTGGACATTTATGGAATTACAAGGGACCAGGCTGGGGAATATGAATGCAGTGCGGAAAATGATGTG
TCATTCCCAGATGTGAGGAAAGTAAAAGTTGTTGTCAACTTTGCTCCTACTATTCAGGAAATTAAATCTGGCACCGTGACCCCCGGACGC
AGTGGCCTGATAAGATGTGAAGGTGCAGGTGTGCCGCCTCCAGCCTTTGAATGGTACAAAGGAGAGAAGAAGCTCTTCAATGGCCAACAA
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GCCAACAAGCTAGGCACAACCAATGCGAGCCTGCCTCTTAACCCTCCAAGTACAGCCCAGTATGGAATTACCGGGAGCGCTGATGTTCTT


* Fusion transcript sequences (Full-length transcript).
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TCACCCGTACAGGTAGCCCCGCCGCCGCGCACCTGCCTTCGCTCCCGCACCGGTGACAGTGGATAGTGGAAACAGGAGATCGTGGATCCT
CCTTCAAAAATGGAGGATGGAAAGCCCGTTTGGGCGCCACACCCTACAGATGGATTTCAGATGGGCAATATTGTGGATATTGGCCCCGAC
AGCTTAACAATTGAACCCTTGAATCAGAAAGGCAAGACATTTTTGGCTCTCATAAACCAAGTGTTTCCTGCAGAAGAGGACAGTAAAAAA
GATGTGGAAGATAACTGTTCACTAATGTATTTAAATGAAGCCACACTGCTCCATAATATCAAAGTTCGATATAGTAAAGACAGAATTTAT
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CAAGGCAAAGAGGAAAGAAATTATCATATCTTTTATAGGTTGTGTGCTGGTGCTTCTGAAGATATTAGAGAAAAACTTCATTTGAGTTCA
CCAGATAATTTTCGGTATTTAAACCGAGGCTGCACTAGATACTTTGCTAACAAAGAAACTGACAAACAGATTTTACAGAACCGCAAAAGT
CCTGAGTACCTTAAGGCAGGTTCTATGAAAGATCCTCTGCTAGATGACCATGGTGATTTTATTAGAATGTGCACGGCTATGAAAAAAATT
GGTTTGGATGATGAAGAAAAGCTTGATCTCTTCCGGGTAGTAGCTGGCGTCCTGCACCTTGGAAATATTGATTTTGAGGAAGCTGGCAGC
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CCCGGACGCAGTGGCCTGATAAGATGTGAAGGTGCAGGTGTGCCGCCTCCAGCCTTTGAATGGTACAAAGGAGAGAAGAAGCTCTTCAAT
GGCCAACAAGGAATTATTATTCAAAATTTTAGCACAAGATCCATTCTCACTGTTACCAACGTGACACAGGAGCACTTCGGCAATTATACC
TGTGTGGCTGCCAACAAGCTAGGCACAACCAATGCGAGCCTGCCTCTTAACCCTCCAAGTACAGCCCAGTATGGAATTACCGGGAGCGCT
GATGTTCTTTTCTCCTGCTGGTACCTTGTGTTGACACTGTCCTCTTTCACCAGCATATTCTACCTGAAGAATGCCATTCTACAATAAATT
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ATTACCTTGTGAAGCAGTACACATTGTCCTTTTTTTAAGACGTGAAAGCTCTGAAATTACTTTTAGAGGATATTAATTGTGATTTCATGT
TTGTAATCTACAACTTTTCAAAAGCATTCAGTCATGGTCTGCTAGGTTGCAGGCTGTAGTTTACAAAAACGAATATTGCAGTGAATATGT
GATTCTTTAAGGCTGCAATACAAGCATTCAGTTCCCTGTTTCAATAAGAGTCAATCCACATTTACAAAGATGCATTTTTTTCTTTTTTGA
TAAAAAAGCAAATAATATTGCCTTCAGATTATTTCTTCAAAATATAACACATATCTAGATTTTTCTGCTCGCATGATATTCAGGTTTCAG
GAATGAGCCTTGTAATATAACTGGCTGTGCAGCTCTGCTTCTCTTTCCTGTAAGTTCAGCATGGGTGTGCCTTCATACAATAATATTTTT
CTCTTTGTCTCCAACTAATATAAAATGTTTTGCTAAATCTTACAATTTGAAAGTAAAAATAAACCAGAGTGATCAAGTTAAACCATACAC
TATCTCTAAGTAACGAAGGAGCTATTGGACTGTAAAAATCTCTTCCTGCACTGACAATGGGGTTTGAGAATTTTGCCCCACACTAACTCA
GTTCTTGTGATGAGAGACAATTTAATAACAGTATAGTAAATATACCATATGATTTCTTTAGTTGTAGCTAAATGTTAGATCCACCGTGGG
AAATCATTCCCTTTAAAATGACAGCACAGTCCACTCAAAGGATTGCCTAGCAATACAGCATCTTTTCCTTTCACTAGTCCAAGCCAAAAA
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GGAATGCATGTTATATATTTTAAAACTTCCAAAATATATTATAACAAACATTCTATATCGGTATGTAGCAGACCAATCTCTAAAATAGCT
AATTCTTCAATAAAATCTTTCTATATAGCCATTTCAGTGCAAACAAGTAAAATCAAAAAAGACCATCCTTTATTTTTCCTTACATGATAT
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CCTTTTACAAGTTGTAACAACAAAGACCCTATAATAAAATTAGATACAAGAAATTTTGCAGTGGTTATACATATTTGAGATATCTAGTAT
GTTGCCCTAGCAGGGATGGCTTAAAAACTGTGATTTTTTTTCTTCAAGTAAAACTTAGTCCCAAAGTACATCATAAATCAATTTTAATTA
GAAAAATGAATCTTAAATGAGGGGACATAAGTATACTCTTTCCACAAAATGGCAATAATAAGGCATAAAGCTAGTAAATCTACTAACTGT
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ACTAGAAATAGTGGTGCTACCACAAAAAATGTTAACCATCAGTACCATTGTTTGGGAGAAAGAAACAGATCAAGAATGCATATTATTCAG
TGACCGCTTTCCTAGAGTTAAAATACCTCCTCTTTGTAAGGTTTGTAGGTAAATTGAGGTATAAACTATGGATGAACCAAATAATTAGTT
CAAAGTGTTGTCATGATTCCAAATTTGTGGAGTCTGGTGTTTTTACCATAGAATGTGACAGAAGTACAGTCATAGCTCAGTAGCTATATG
TATTTGCCTTTATGTTAGAAGAGACTTTCTTGAGTGACATTTTTAAATAGAGGAGGTATTCACTATGTTTTTCTGTATCACAGCAGCATT
CCTAGTCCTTAGGCCCTCGGACAGAGTGAAATCATGAGTATTTATGAGTTCAATATTGTCAAATAAGGCTACAGTATTTGCTTTTTTGTG
TGAATGTATTGCATATAATGTTCAAGTAGATGATTTTACATTTATGGACATATAAAATGTCTGATTACCCCATTTTATCAGTCCTGACTG
TACAAGATTGTTGCAATTTCAGAATAGCAGTTTTATAAATTGATTTATCTTTTAATCTATAACAATTTGTGTTAGCTGTTCATTTCAGGA
TTATATTTTCTACAAGTTCCACTTGTGGGACTCCTTTTGTTGCCCCTATTTTTTTTTAAAGAAGGAAGAAAGAAAAATAAGTAGCAGTTT
AAAAATGAGAATGGAGAGAAAAGAAAAAGAATGAAAAGGAAAGGCAGTAAAGAGGGAAAAAAAGGAAGGATGGAAGGAATGAAGGAAGGA
AGGGAGGAAGGGGAGAAGGTAGGAAGAAAGAAAGGATGAGAGGGAAGGAAGAATCAGAGTATTAGGGTAGTTAACTTACACATTTGCATT
CTTAGTTTAACTGCAAGTGGTGTAACTACGTTTTTCAATGATCGCATTTGAAACATAAGTCCTATTATACCATTAAGTTCCTATTATGCA
GCAATTATATAATAAAAAGTACTGCCCAAGTTATAGTAATGTGGGTGTTTTTGAGACACTAAAAGATTTGAGAGGGAGAATTTCAAACTT
AAAGCCACTTTTGGGGGGTTTATAACTTAACTGAAAAATTAATGCTTCATCATAACATTTAAGCTATATCTAGAAAGTAGACTGGAGAAC
TGAGAAAATTACCCAGGTAATTCAGGGAAAAAAAAAAATATATATATATATAAATACCCCTACATTTGAAGTCAGAAAACTCTGAAAAAC
TGAATTATCAAAGTCAATCATCTATAATGATCAAATTTACTGAACAATTGTTAATTTATCCATTGTGCTTAGCTTTGTGACACAGCCAAA
AGTTACCTATTTAATCTTTTCAATAAAAATTGTTTTTTGAAATCCAGAAATGATTTAAAAAGAGGTCAGGTTTTTAACTATTTATTGAAG
TATGTGGATGTACAGTATTTCAATAGATATGAATATGAATAAATGGTATGCCTTAAGATTCTTTGAATATGTATTTACTTTAAAGACTGG
AAAAAGCTCTTCCTGTCTTTTAGTAAAACATCCATATTTCATAACCTGATGTAAAATATGTTGTACTGTTTCCAATAGGTGAATATAAAC
TCAGTTTATCAATTAAAATATGTATTTGACTCATTTTAAAACTCTATTAGCTTAAGAGAAAGAAGGAAGAAATAATAATTTGAAGATATT
TCTGCTATTCTCTTTATTTCCTGTATTACACTCATCTTTCTGCTTACTCTAAAGCAGTACAGGGTAAAAATTCTAGATGCTACAGTTTCA
AATGACTCCACACTATATTCTTTCTTGCTGTTGCTGATTCCTAAAAGGTTTGATGAGCTGAACTACATCTAAACTAAAAATAAATTTTCT
GGAAACATTTTATTATTAATTATTTAGAACCTTTACCTGGTAAAATACAGCAGAGTTAGCAACAGAGACTAAATATCCTGTTGATAAAAT
CCTGATGATCTTACAGGCTAAACAACTGAAAACTCAAACGCTTGTAAGAGCCAGGCAGAGTGTAATTTCTTAACAGCTGGGTATAAAACA
ACGGGCACCTGAAGGTATTCAGATACAATTTCCTTAAAAATACCTTGGTTTCCAAGCAAAACACGTTATTTGGCTGAGAACCTTTAGTTT
GTAAATACCAAACCATAATATACAAATGAGATCTCAAGCCAAATGAATTTTTTAAGCCCTCTTTCCCATATCTGTTCATCTATGATAGTC
AACTGAATAAATGAGAACAATGTGATAGATAAAACAACAAAGCATAAAAAAGATTCATGCTTGGTTTTATAAGCTATTTTGAAATATAAG
TATCATTGCTATTCTGAGAAATCTATATACACCAAAGCCCTCCCTCCACAAAAAAACTGGAAATGTTCTAATAAATGTCTGATTTCCCCC
ACAGCTTCATTATTTCTTCCCTTTTCAACATCTATCTTATCTATCTTGCATAAATTACATCACAGAAACAGAAACATCAAGTATCAGACA
TGGAAAACCAGCACATGAAACAGAGCTAGTTTCCCTCTCAAAAGAATAGGGCAAAACATAGATGCTTCAAAATCATATCTTGGTATACAG
AAAATAATTATTCACTTTAACCTGACAGTCAGAAATGTAAGTAAGAATTTGTAGAGATAATTTTCCAAGGTAATTCATTCAAGTTAGTGG
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FusionGenePPI for MYO6_NEGR1


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HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
MYO6DAB2, GIPC1, CALM2, DAB1, CYLD, USP11, USP25, CDC42, APC, UBC, SP1, TAX1BP1, CALCOCO2, FBXO25, OPTN, LMTK2, AP2A1, CLTC, PAK1, CAPZA1, POLR2A, ESR1, RNF11, TOM1, TOM1L2, MYO6, PARK2, PAN2, FBXO6, TP53, ENO1, MOV10, NXF1, ALK, ABCE1, CDH1, NTRK1, DPP9, DNAJC2, G6PD, PAK2, RAD23A, RAD23B, NHLRC2, CAPZA2, CDK2, CLTB, DBN1, FLNA, GAK, MYH9, PPP1CB, PICALM, ACTR2, SYNPO, GTSE1, ANLN, MYO5C, MYO19, MYO18A, CFTR, RNF126, UBXN1, SEC16A, AP2B1, AP2A2, AP2M1, CLINT1, PIK3C2A, EPS15, REPS2, COPB2, DDB1, EPRS, VPRBP, DCTN1, GTPBP4, ARHGEF12, YTHDC2, DCTN2, DOCK7, POTEI, FBXO34, PPP1R9A, CUEDC1, FBXO30, TMOD2, ACTBL2, GSN, REPS1, WBP2, COX15, DLST, HSD17B10, PDHA1, G3BP1NEGR1NTM, LSAMP, NEGR1


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369977+11351116_11183591286OPTN
HgeneMYO6chr6:76558248chr1:72163822ENST00000369985+11331116_11183591263OPTN


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for MYO6_NEGR1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for MYO6_NEGR1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneMYO6C2931767Deafness, autosomal dominant nonsyndromic sensorineural 222CTD_human;ORPHANET;UNIPROT
HgeneMYO6C0236969Substance-Related Disorders1CTD_human
HgeneMYO6C1843028Deafness, Autosomal Recessive 371CTD_human;UNIPROT
TgeneNEGR1C0028754Obesity1CTD_human