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Center for Computational Systems Medicine
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FusionGeneSummary

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FusionProtFeature

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FusionGeneSequence

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FusionGenePPI

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RelatedDiseases

Fusion gene ID: 20584

FusionGeneSummary for MAGI2_VWC2

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: MAGI2_VWC2
Fusion gene ID: 20584
HgeneTgene
Gene symbol

MAGI2

VWC2

Gene ID

9863

375567

Gene namemembrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 2von Willebrand factor C domain containing 2
SynonymsACVRIP1|AIP-1|AIP1|ARIP1|MAGI-2|SSCAMPSST739|UNQ739
Cytomap

7q21.11

7p12.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionmembrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 2activin receptor interacting protein 1atrophin-1-interacting protein 1atrophin-1-interacting protein Amembrane-associated guanylate kinase inverted 2brorinbrain-specific chordin-like proteinvon Willebrand factor C domain-containing protein 2
Modification date2018052220180329
UniProtAcc

Q86UL8

Q2TAL6

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000419488, ENST00000354212, 
ENST00000522391, ENST00000536571, 
ENST00000535697, ENST00000517762, 
ENST00000340652, 
Fusion gene scores* DoF score3 X 3 X 2=185 X 2 X 4=40
# samples 35
** MAII scorelog2(3/18*10)=0.736965594166206
effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs).
DoF>8 and MAII>0
log2(5/40*10)=0.321928094887362
effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs).
DoF>8 and MAII>0
Context

PubMed: MAGI2 [Title/Abstract] AND VWC2 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneMAGI2

GO:0002092

positive regulation of receptor internalization

11526121

HgeneMAGI2

GO:0032516

positive regulation of phosphoprotein phosphatase activity

10760291

HgeneMAGI2

GO:0051898

negative regulation of protein kinase B signaling

10760291


check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVLGGTCGA-HT-7477-01BMAGI2chr7

79082336

-VWC2chr7

49842307

+
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000419488ENST00000340652MAGI2chr7

79082336

-VWC2chr7

49842307

+
In-frameENST00000354212ENST00000340652MAGI2chr7

79082336

-VWC2chr7

49842307

+
In-frameENST00000522391ENST00000340652MAGI2chr7

79082336

-VWC2chr7

49842307

+
intron-3CDSENST00000536571ENST00000340652MAGI2chr7

79082336

-VWC2chr7

49842307

+
intron-3CDSENST00000535697ENST00000340652MAGI2chr7

79082336

-VWC2chr7

49842307

+
intron-3CDSENST00000517762ENST00000340652MAGI2chr7

79082336

-VWC2chr7

49842307

+

Top

FusionProtFeatures for MAGI2_VWC2


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
MAGI2

Q86UL8

VWC2

Q2TAL6

BMP antagonist which may play a role in neuraldevelopment. Promotes cell adhesion (By similarity).{ECO:0000250}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-12217_1011001456DomainPDZ 1
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-12117_1011001442DomainPDZ 1

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-1221015_11181001456Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-1221340_14301001456Compositional biasNote=Ala-rich
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-1211015_11181001442Compositional biasNote=Pro-rich
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-1211340_14301001442Compositional biasNote=Ala-rich
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-122109_2831001456DomainGuanylate kinase-like
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-1221147_12291001456DomainPDZ 6
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-122302_3351001456DomainWW 1
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-122348_3811001456DomainWW 2
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-122426_5101001456DomainPDZ 2
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-122605_6831001456DomainPDZ 3
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-122778_8601001456DomainPDZ 4
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-122920_10101001456DomainPDZ 5
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-121109_2831001442DomainGuanylate kinase-like
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-1211147_12291001442DomainPDZ 6
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-121302_3351001442DomainWW 1
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-121348_3811001442DomainWW 2
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-121426_5101001442DomainPDZ 2
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-121605_6831001442DomainPDZ 3
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-121778_8601001442DomainPDZ 4
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-121920_10101001442DomainPDZ 5
TgeneVWC2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000340652+14120_127232326Compositional biasNote=Poly-Ala
TgeneVWC2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000340652+14153_212232326DomainVWFC 1
TgeneVWC2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000340652+14216_274232326DomainVWFC 2
TgeneVWC2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000340652+14114_116232326MotifMediates cell adhesion


Top

FusionGeneSequence for MAGI2_VWC2


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
>In-frame_MAGI2_ENST00000419488_chr7_79082336_-_VWC2_ENST00000340652_chr7_49842307_+_194aa
MSKSLKKKSHWTSKVHESVIGRNPEGQLGFELKGGAENGQFPYLGEVKPGKVAYESGSKLVSEELLLEVNETPVAGLTIRDVLAVIKHCK
DPLRLKCVKQGVSMREVSLXSQRXGAMHSVSVSPDGVCGPCVRAXSVLSHLQKWSKLLCRNRGDPCWQRSEDXRVHHMPLYLXGRHMENR

>In-frame_MAGI2_ENST00000354212_chr7_79082336_-_VWC2_ENST00000340652_chr7_49842307_+_194aa
MSKSLKKKSHWTSKVHESVIGRNPEGQLGFELKGGAENGQFPYLGEVKPGKVAYESGSKLVSEELLLEVNETPVAGLTIRDVLAVIKHCK
DPLRLKCVKQGVSMREVSLXSQRXGAMHSVSVSPDGVCGPCVRAXSVLSHLQKWSKLLCRNRGDPCWQRSEDXRVHHMPLYLXGRHMENR

>In-frame_MAGI2_ENST00000522391_chr7_79082336_-_VWC2_ENST00000340652_chr7_49842307_+_194aa
MSKSLKKKSHWTSKVHESVIGRNPEGQLGFELKGGAENGQFPYLGEVKPGKVAYESGSKLVSEELLLEVNETPVAGLTIRDVLAVIKHCK
DPLRLKCVKQGVSMREVSLXSQRXGAMHSVSVSPDGVCGPCVRAXSVLSHLQKWSKLLCRNRGDPCWQRSEDXRVHHMPLYLXGRHMENR


* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
>In-frame_MAGI2_ENST00000419488_chr7_79082336_-_VWC2_ENST00000340652_chr7_49842307_+_583nt
ATGTCCAAAAGCTTGAAAAAGAAAAGCCACTGGACTAGCAAAGTCCATGAGAGTGTCATTGGCAGGAACCCGGAGGGCCAGCTGGGCTTT
GAACTGAAGGGGGGCGCCGAGAATGGACAGTTCCCCTACCTGGGGGAGGTGAAGCCCGGCAAGGTGGCCTATGAGAGCGGCAGCAAATTG
GTGTCGGAGGAGCTGCTGCTGGAGGTGAACGAGACCCCCGTGGCGGGGCTCACCATCAGGGACGTGCTGGCCGTGATCAAACACTGCAAG
GACCCCCTCCGGCTCAAGTGTGTCAAGCAAGGTGTCTCCATGCGAGAGGTGTCGCTGTGAAGCCAACGGTGAGGTGCTATGCACAGTGTC
AGCGTGTCCCCAGACGGAGTGTGTGGACCCTGTGTACGAGCCTGATCAGTGCTGTCCCATCTGCAAAAATGGTCCAAACTGCTTTGCAGA
AACCGCGGTGATCCCTGCTGGCAGAGAAGTGAAGACTGACGAGTGCACCATATGCCACTGTACTTATGAGGAAGGCACATGGAGAATCGA

>In-frame_MAGI2_ENST00000354212_chr7_79082336_-_VWC2_ENST00000340652_chr7_49842307_+_583nt
ATGTCCAAAAGCTTGAAAAAGAAAAGCCACTGGACTAGCAAAGTCCATGAGAGTGTCATTGGCAGGAACCCGGAGGGCCAGCTGGGCTTT
GAACTGAAGGGGGGCGCCGAGAATGGACAGTTCCCCTACCTGGGGGAGGTGAAGCCCGGCAAGGTGGCCTATGAGAGCGGCAGCAAATTG
GTGTCGGAGGAGCTGCTGCTGGAGGTGAACGAGACCCCCGTGGCGGGGCTCACCATCAGGGACGTGCTGGCCGTGATCAAACACTGCAAG
GACCCCCTCCGGCTCAAGTGTGTCAAGCAAGGTGTCTCCATGCGAGAGGTGTCGCTGTGAAGCCAACGGTGAGGTGCTATGCACAGTGTC
AGCGTGTCCCCAGACGGAGTGTGTGGACCCTGTGTACGAGCCTGATCAGTGCTGTCCCATCTGCAAAAATGGTCCAAACTGCTTTGCAGA
AACCGCGGTGATCCCTGCTGGCAGAGAAGTGAAGACTGACGAGTGCACCATATGCCACTGTACTTATGAGGAAGGCACATGGAGAATCGA

>In-frame_MAGI2_ENST00000522391_chr7_79082336_-_VWC2_ENST00000340652_chr7_49842307_+_583nt
ATGTCCAAAAGCTTGAAAAAGAAAAGCCACTGGACTAGCAAAGTCCATGAGAGTGTCATTGGCAGGAACCCGGAGGGCCAGCTGGGCTTT
GAACTGAAGGGGGGCGCCGAGAATGGACAGTTCCCCTACCTGGGGGAGGTGAAGCCCGGCAAGGTGGCCTATGAGAGCGGCAGCAAATTG
GTGTCGGAGGAGCTGCTGCTGGAGGTGAACGAGACCCCCGTGGCGGGGCTCACCATCAGGGACGTGCTGGCCGTGATCAAACACTGCAAG
GACCCCCTCCGGCTCAAGTGTGTCAAGCAAGGTGTCTCCATGCGAGAGGTGTCGCTGTGAAGCCAACGGTGAGGTGCTATGCACAGTGTC
AGCGTGTCCCCAGACGGAGTGTGTGGACCCTGTGTACGAGCCTGATCAGTGCTGTCCCATCTGCAAAAATGGTCCAAACTGCTTTGCAGA
AACCGCGGTGATCCCTGCTGGCAGAGAAGTGAAGACTGACGAGTGCACCATATGCCACTGTACTTATGAGGAAGGCACATGGAGAATCGA


* Fusion transcript sequences (Full-length transcript).
>In-frame_MAGI2_ENST00000419488_chr7_79082336_-_VWC2_ENST00000340652_chr7_49842307_+_10583nt
GGGACAGCACAACCTCATCCAAGCTCTCCTACCTCTGCCCAGCCGTCCCTCTCATCCTCCCCATTCCTCGTCCACACTCCATCCAAAGAA
GAGGGAAAGCACCGAATAGAGGGGGGCGAAGGCAAAGTCTGCTGTTCTTCCCCCTGGGCCCCCTTGCTCCTCCATCCTCATTCTCTCACC
ACCAGCCCCCCTAACCCCAAGGAGCCCAGGAACTGAGGCGACTCGCCCCACTGCCATGTCCAAAAGCTTGAAAAAGAAAAGCCACTGGAC
TAGCAAAGTCCATGAGAGTGTCATTGGCAGGAACCCGGAGGGCCAGCTGGGCTTTGAACTGAAGGGGGGCGCCGAGAATGGACAGTTCCC
CTACCTGGGGGAGGTGAAGCCCGGCAAGGTGGCCTATGAGAGCGGCAGCAAATTGGTGTCGGAGGAGCTGCTGCTGGAGGTGAACGAGAC
CCCCGTGGCGGGGCTCACCATCAGGGACGTGCTGGCCGTGATCAAACACTGCAAGGACCCCCTCCGGCTCAAGTGTGTCAAGCAAGGTGT
CTCCATGCGAGAGGTGTCGCTGTGAAGCCAACGGTGAGGTGCTATGCACAGTGTCAGCGTGTCCCCAGACGGAGTGTGTGGACCCTGTGT
ACGAGCCTGATCAGTGCTGTCCCATCTGCAAAAATGGTCCAAACTGCTTTGCAGAAACCGCGGTGATCCCTGCTGGCAGAGAAGTGAAGA
CTGACGAGTGCACCATATGCCACTGTACTTATGAGGAAGGCACATGGAGAATCGAGCGGCAGGCCATGTGCACGAGACATGAATGCAGGC
AAATGTAGACGCTTCCCAGAACACAAACTCTGACTTTTTCTAGAACATTTTACTGATGTGAACATTCTAGATGACTCTGGGAACTATCAG
TCAAAGAAGACTTTTGATGAGGAATAATGGAAAATTGTTGGTACTTTTCCTTTTCTTGATAACAGTTACTACAACAGAAGGAAATGGATA
TATTTCAAAACATCAACAAGAACTTTGGGCATAAAATCCTTCTCTAAATAAATGTGCTATTTTCACAGTAAGTACACAAAAGTACACTAT
TATATATCAAATGTATTTCTATAATCCCTCCATTAGAGAGCTTATATAAGTGTTTTCTATAGATGCAGATTAAAAATGCTGTGTTGTCAA
CCGTCCTCACCGTGTACCTGCATATCTTTTTCAGTTCTGATTCCATCACCCAGGAATGTTCCCCCTGCACATTTTCACAGGGCAGAGTCA
CGCATGAATGGATCATAAGATATTAGGACCAATTTCCACTGAAACCCTGTTTAAATTCTATTTAATTACAGACATATCTCTAATGTTGAT
GTCTACTTCACATAAATATATTTCCTTTTTATAATAATATATGGCTTTTATCTGCTTCATTCTCAGTCACTTGTGAAATGCAGGTGTAAA
GATCACTAACTCACACTTTCTCAGTTCTTTCCCCTAAGCTCCTGTATTGTACACCATAGGTAAGCACATACATATATTTCATTCTTATTT
ACATTATTTTCTCTTCTAAGGATAACTTTAATTCATTCCCTAAACTGAGGAATAAAGTAGGCTGGAAAATTTGCATTACTGTTCCATCAA
GCTGAAGCAGACAACAAAATAGGGGAGGAGTCCTTCGATTCTCCTAGGATAGTTAAGGAAAATCAAACTCCTAAACAAGTTTATATACCT
GAAATCTAAATGTGCTACAGATAACTCAGCTGTCAGTTCAGTGGAATCATATTTGTCATCAGACTTGAGTCATCTATCCTCCATAAACTA
CACAGTAAAATCTTGACTGATAACCTTGAATTAGCCACCCTTCACAAGCAGAGTGAGGAAGCAGTTATTTTGTTAAAACAAAGCTGAAGA
CCAAGTGCACTCCACAACTTTCCTATAGTTATAATTCCAAACCAACTTCTTTTCTCTTCATTTGAACAGAGAACATAAAAAGCCACTGCA
AAGTCCTGCTAATCTAATTAATGCATAATAGAAAATAGTTCTACCTTTATCAATCATATCAGCATGCGGTGTGTTGATGAAAGAGGTAAT
TGGAGTCTTAATAGGTGTAGGATAAAAAAAGCAAAACTATAATCACTATTAATGTCTTTAAAGGATTAAAATATATATAATCATTATTTG
AAGCCTCTAAAGGTATTTTTCATATTTTTGTTTATTCTGAAATTTTGCATTAAGAACCTATTAAGTACAAAGCATTGACAACAAGGGAAT
AAGGCTTGATTTCTTGCCTTCTTGGACTTTCGGTCTCTGGCATAAGAAGTATATGAAATCATAATGTATTGTATTAGGAGCCAAACTAGA
GACCAGCAAATGGAGATTAGAAAGCCTTCCTAATGAGAAGATGGAGAACATGAAAAAATCATTATATAAAAAATAATTCAATCATTAAAG
ACTGAATAACATTCAAGAAAAATGGATACATCTATCATAATTGAAAAATTAAACTATTGTGAACCTTAGTAAGTATAAAGATGCCACTGA
CTGAGTCATCAAAACACTACATATAGTCATTTAATTTTTGTCTTGTTCATAAAGAACACCTTGAGCCAAAGGAACTACCAGTACATAGAT
TTCATGAAAATACTCAGGGGAATTATTAGCTAATTGTTCTCAGGTGTAATCAGCTTTCCAAAATTTAACCTTTGTATTAAAGACTGGTAG
ACATTGGCCATCCCTCCTTTATTCAAGGATGGATTGTTTGAGACACAGTTATTTAAAGTTGTCGTTTTGCTAATAAATGGCCCTAGCCCC
CATGGGTAGGTGGGCCATTAGTAACCTCTTCTCTCTCCATCAGGCATGATGCAGTTAGAGACTCAGTCCATGCAGCTCAAAGTCTTCCTG
TTTCCCTTAATAATAATTCCTACCAGAATGGATGATGAGCTCTGAAATAATTGCAATGGTGTTTTCAATGCTGTGAGAATTTCAGAAAAC
CTAGTATTTTGTTGCATATAGAGAGAATGAACCCAGTATCATCTTGGGAAGTTAACTGACTCACTTGCTCTAAACTTAGTTTGACCTGCA
GGGTCACCAGCACACACTCCTAAGAGCTAAAGCTCAATGGCTGTTATTACACCAAAGTAACTCCCCTCCCCATCTCTGATTTCAACCCCC
TCATTCCTCTCTCCTCATAGAAATAATGCATAAACCAAACACATGGAAGAACTTGGATTTTTGACACTGTATATACTCATTAATAATAAT
GGCATTATTTGCATTTTTGTCCAAGATCAACTTCTTCTTGCAGTTAGACTTTCACAAATACATAGCTATCTCAGATTGACATTCTATTTT
CCTCCCCTCTGTTGTCAGAGAACTCTTTGCTGAGATTGTCAACAACAAACTGTTCTATTCAATAAATAACCTGAATAACTGCCCAATAAA
AAAGGAAAGTATAAGTTACTCAATTTCAAAATAATATGGTTTGGAGATAGCACAGAAAAGGGGGCCTCAGAATTCAAGTATAGAAGTTCT
GGAAAAGCCATAATCACTAAAATTCAAATAGGCCTGCTCTATAAGTACCTAATAATTGTTAAATGATTTGTTCAAGTTAATAAACTAAAT
CGTGCTTACAAATGTATTAATGAATTTATTTCAAATTTTCAACCCATATTTAGATCTGAAAGTATAAAGCTACTTATGTAAGCAATAGAA
TGGTTCTGGAAATTATCTGATGTCTTAGAGGTTTTCAAGTTAAATTCATTCTTTCAGTGATAGGATATTTACTTGTTGGGTGGATTAACA
ATACTTTTTATTGACATTTCCCAGAAGTCTTGAGAAAAGTCATTTCAAAAACTTGTATTTCATCCCTGCATGCAAGAAGTATTAGATGCA
CTCCAGTCCAGGCAAGTCCTGCTATAATGTTGCAGCTAGTGCAGATGGAGAGGCACAGTGTCCTTGACATCAAGGGGTCTGTAAGCCTTG
AAACTAATTTAGGTTTGATTATAATACTTTTAATCTTTTGATACTTAGAATTTCATCACCTGCTTTGTGCAGTAAAACATGCTAAGAAGA
ATTATCATGCAGTTTTAAGTTCATAACATCAATAATATGTTTAATAAACTTTCTTCCCTCGTTCTCCAACATAAATGTTGCATTTATATA
AGGTTAAAAGTCCTAAAAAATCATAAAATTCAGATGTTTAATTTTTGTTTTTAAGCAGTGAAATGGGTTTTTAAATGTATACATTATCTG
AAACTTACAAAATATACACTGTTTCAAACAAGCATTGTTGGAAACTAAATCCATTATTTTAAATGTGGACTATTTAAACATGTAGAAAAC
AAAATTATAGACATAAACTATGATTTTAAAAATATTAACAATTTGCTAAATTTGCTTCAATGGGCAAGAGATCAATCCTACTTTTCATTG
TTATTTTTAATATCATATTTTTCCCCAACATAATGTTATTATGAAGAGTATCAGATGTACAAATAAGCATCATTGGTAAAAACATACATG
CTTCTTTGGCCAACATAATTTGTAACTGTCTTACTGAACCTACTTACCTACTATATTTTTTTTCCTCACTAGTAGCATCTGATGGTTGAT
ACAGTCAGTAACTATTCTGAAGAATCAGATTAAGAGAGAACAATTTACTTATTCAGGAATAAGTGCATTTTTACAGTACATATTTTTCAC
ATTTCAGCTGCAACTTCCAAAGATCAGGTTCTCATTGCTCCGTAGCACAGATTAAACAGCCTACTTATGTCATATCCTCACTTCACACCA
ACTTCTTCAGTCTATTATTTTAGTTTTCTAAATGTAGATCTAGTTTTCAACTGAATTCTTTGAGGATCGCAATCACACACAAAATAACAT
CCAAACTCCTCAACATGGAAGACTGGTGTCTTCACAATTAGATCATGGACAACACCATGACCCAGGCCCCTGTGGCTGGTGAGACTTCTG
GGCCCTGGGTACCACAGACTATACTCTAAACATGGTCTTTACTATCTCAGATCCTGCCCTGAGTGTCCTTTGCAGCATGTTGAGTATTAG
CCATTTTCAATGTCCAGTTCAAGTGCCATTGCTGGTAAGGCTTCTGTAGTTCTTATTGGAAGAATTGTCACTCTATGTCCCAGTAATAGT
ACTAATTTGGTTTCTTATTTTAACATATCATTTAGGAATCATACCATAGTTTGCATAATGGTTAATTTTATGCCTGCTTCTTCTATTATT
TACAAATCCCTTTAGTTTGGGCTGTGAAATATTCAATTCCCAAAACATCACCCAATATCTATATGTTAAAGGCTTGTTGAATTGTATTCC
ATCTATTAGTTCAGAGTTATTTGCTATTCTTGTTTAAGGACAATGTATGTATTAAAGAGCAACTAAAAACTCCCATTACTGTTTGCCAAC
CCAGTTGTCTTTTGATTTCTCTGTCAACTTACAAGTATCAAATATCTAAGTCACAGAACCCAGAGACACATCAAATACCCCAAATACCCC
ATGGTAGTTTTCGGATGAACTCTGACAGCTATTGGCCATTTCTGGTGCAAGTCAGAAAAAAATTGCTTTTAGTGTGAAATTTTTGATGCT
GAAGAAAGTTGATTGTATTGAAGAGACACTGGCCCTTTATGATAAAGGAAGTCAAGTTTACAGTTTTGATATTTGTTTACTTTCTTATTT
CTAATTTTTGGAAAACAATTTTCTTAGACTTTCATTTGTGATATTGATCATTTCTGTGTGTTTTAATCTTTCTACATAACATAATTAAAC
ACCTCAGTAGGTATCTAGTGAACTGATACAATAATGAGCTGAGTCATTTGTACAGAAATATAGTAGCTTCCATAATCTGAATGATAACCA
TTTAAAAGTGATGGTTGTTGAAATTTTACTGTAGTGTCAAATTTCACTTTAAATTTTGCAAAGCACCTGCTATTCTAGCCTTAACACAAA
GATTTGGCTAATTTTTAAATGAACAAATCCCATTGAATATTAAGTGACACTGACAATCACCCTGAAAAGTATTCAGCCAAAGTTTCAATA
GAATTAGGAAACTTAAATGAAAATGTGCTCTCAGTGCTTGGCCCATGAGCAGTTTATGATTTAAGACGTGCATACTGTTTAACTCTTTCC
TTTAAAGTTCAGAAAAGTACATAAAACCTCTGGCTGACCTATTATATAGGCACAGAATTATCAAAAGCAATCAAAGTATGTACCTAAAGT
CAATTTAGTATATTATGAATACAGCCTGATGACTAAACACAATTGCAAATATTGCGACTTTAGTTTTTAATTCAATTTTCAGCAAGTAGA
AATATTTCTCAATTTTATTTGGTATCTAATTATATTAAGACCAACATATACATTAAAGTGTATTTAGATGATTAATATTTAATGATCATT
ATTTTATTTAATGATTAATATTTTCTATTATTTGAATTTCTGTAATTTATGTTTTAGAAAGAACTGTTTCCAAACACATTTTATGGAAAG
ATTTCATTTTTCCATTCCCTTTACTTTTATATTTACATTGTCAAATAAATACAATTCTATTTTCATTTCTATTAGTTTTCAGGGTTTATT
CTTTTCCTAAGCATATAATTCTTATAATGGAAAAAAGTGAAAAGTATCCAGTAAGTAATATACACCTATGAAACTATTAATGTTCTTTAT
ACTACCAAGTAGTTTCATAGTTTTAAAAAGCCATTCTTAAGCAGTCGGTGAATGTATATCATCGGCCAAAAGTTATGCTAGGTTTCCTTC
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CCAACCCAGTTGTCTTTTGATTTCTCTGTCAACTTACAAGTATCAAATATCTAAGTCACAGAACCCAGAGACACATCAAATACCCCAAAT
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AGCCTCCCTAGTCTAAATGCTTATGCTATATTTTGTTTCCTAAATCTAGAGATCTCTTTTTAAAAATAGTATTGAAGCATCAGGTTGTTC
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TAGGTGATGATTATAGGGCAAACACTACAATTTCAAATTTCATATTCTTTTATCTGATTTATTCATTTTATCAACTCTGCTATATTGATG
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TGGTGGCACATGCCTGTAATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTAAACCGAGGGGGTGGAGGTTGCTTGAGCCGAGATCGCG
TCACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGAGCAAGACTCTGTTTAAAAAAAAAAAAAAAATCAGTGATGGAACTGAGGCCAAATCTGTCTGGT
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TCTTACTGAATCGATTTATTCATTGCATTCTATGTGTCAACTGCAATTTAGACCTGGGTGATAGAGTCATATATGGTCTTTGGACCCATG
AAGCTCTGAGTCAAGGATACCAGCAGATATCCTTAAACTAATAAAAAAAGCGATGGCATCACATGCCATTTTGAACTTTTGCATTAAAGT
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ATTAAATAAAAAATCCTCACAAACCCCAATTTAATTTAATATAGATTAATTATAAAAATAATCTACCCATGTTACATAATGTTAAATCTG
TAGTTTCAAGGTGTATGCTATTTCTTAAAACAAAAACAAAGATTGTCCCCACTCCAAACAATAACAGCAATGGTGAAGGTTGTGGGTGGA
CAGAGGTAGTCCCACTCATCCCCAGGGGGCTCAGCTGCCACCGGCCAGGTCTATCTATTGCTCCCACCTGCTCTGACTGTTTTCTCTCAA
GAAAAAGATTTTCATTTTAAGATAGGCATCAGTGCAATAAAGGAGCTTGATACAAAAATCATTATGTTCTATATATGTTTTTGTAGGTTT
TAGATTAATTATGGCCAACTGATACCTTAAAATATTTGTTACAAATAACACTGAAGTGAGATTCAAAATTGTGCCTTCTATTGAAGCCAA
GAAAGTAAATGTCTTTAAAATAAACATAATGGTGTTTTTTTTTGGTACAATAAACAGCATACCTACATTTCAGAGGACAAATCATGTTAT
TATAATAACCAGGAGAGAAAATAAAAGGAGACATTAATTTGGATATGGAAGCAAAATGGAACAGAGCAATATAGAGCAAAACAGAGGTTT
GTCTGAAACATTTAAAATATTAAGAAGTATGACTAAAAAACTCAAACATTTTAATACACGATGAATCCTTTTCTTAAGGAAAAAATGAAA
ATAATAAAAGTGGTATTTGGATGAGATAATTTTCCTTTAAATTTATTCCTCAGAATGATGTAAATTTTCCAGCTGGAAGGTCATCTTTCT
ATACATGCATGCATCTATACAAATGGTTAAACAGTTACTCTCTCAATTTGCTGTGATAGGAAAGGTGGATATAAATATAAGCAAGGGTCT
GATTAAAACAAAACAAAACAAACAAAAGACAAGAGAAGCACTGCATTGTTGGCAAGAAATTCCTTTTAAGTCAGACTTAAGTCCACGGAA
AGCTGGACCTAAGCAGTGAAGGATGTAAGGGAACAGAGAGAGACTCTGCTTGGCCGAGTTTGCTATTCTCATTTGTCTATGTCAATACGG
CTACATAAAGTTCACAACTATTTGCACATAGCTATAAATATAGCATGAATAAAACACATATGTATTTAATTGTGTTATTTACTATTTATA
ATTTGAATTGTTTAAAATAATTTTAAATACTTATTCCATAAACTCAGTATTTGAAAACTTAAAAAAAAAGTCATTTTAAATAACATCATT
TACCAAGTCTGTGTGATGCTTTACAAGGTACCTGATGAATGTAAAATTATAGCTTTTTGTCTTCATTTCTAATAGACTGTTATAGGGGAA
ATGTACTAAAATGTTGTACTTATTACATTTATGAATTTCTGACAGTTTCTATAGACTGAGAATAATGATATGCTTTTATAAATTATTTGG
TGAAAGTTTTCCAGTAAGTGTTCATGTCCTGTACAAATTTATTAAACAACATCAATTTTACCTAACAACTGTAACCACTAATAAATCATC
AGTCACCACCTTTCCTGCATATCTGACAGATGGAGAACACTGTGCTTAGTGTTGAAGATACCAAAGGGAATTCAAGTGAGGGGAAAAGAG
GAGAGCAAACTGATCAAAAGGGAATGCCCATGATGCTTTCAGGAAACCAGGGTGAGAACATGCTGGCTGGAGGATGGGTCTGGTTTCCAG
CAGAGATGATAGGAGTTAAAAGGCATAGGTGAGTTGTTCCCATCCCTGGCCTGAGCCTTACTCCATAGCTATAGAGACATAGTCTCTAGA
AACAAAGGCCAGAGCATCCTTTTAACATTTATATCATAAGTATTCTCAATAAACGTTTGCAATTTATTTGCTTTAATGTAACTTGGCAGT
AAAGACTTTGGCCTTTGGAGGTCTGATTCTAATCCCAGTTCTACCACTTACTGGTTATTTATCAGGTACACGTTACCTACCTCTCTGTAA
CTCAGATTGCTCATCAGTAACATGGGGAGAGTGGTATCAACCACTAAGAGGATTAAATGAGTGAATATTTGTAAAACACGTAGCCTAGAA
TAGATATTTATAAAGCACAAGATCTATGTAAAGTGTTTATAACATAATACATTGGAATATGAGACTTGAACATTTTGAAGATTCTAATAA
ATGAATAATTTAATTTAGTGCTCATTTGAAAAATATTTTATCCTCATGTTTACATTTAACACATATAATTTATATCTTAGTTTTTATCCC
ATTTATATATATATTTACCAGAAAAATGTTTTGTAATACCTTAATTTTATGTGGAGTTGAATTTAAATAATTAGGCCGAATTTGTATGTA


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FusionGenePPI for MAGI2_VWC2


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
MAGI2ATN1, ACVR2A, DSCAML1, PLXNB3, ADRB1, CTNNB1, ARRDC3, BAI1, TTBK1, RHBDL1VWC2


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000354212-122302_3811001456DDN
HgeneMAGI2chr7:79082336chr7:49842307ENST00000419488-121302_3811001442DDN


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for MAGI2_VWC2


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for MAGI2_VWC2


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneMAGI2C0036341Schizophrenia3CTD_human;PSYGENET
HgeneMAGI2C0003469Anxiety Disorders1CTD_human
HgeneMAGI2C0005586Bipolar Disorder1PSYGENET
HgeneMAGI2C0010606Adenoid Cystic Carcinoma1CTD_human
HgeneMAGI2C0025261Memory Disorders1CTD_human
HgeneMAGI2C0525041Neurobehavioral Manifestations1CTD_human
HgeneMAGI2C1839839MAJOR AFFECTIVE DISORDER 21PSYGENET