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RelatedDiseases

Fusion gene ID: 20455

FusionGeneSummary for LYRM4_EYS

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: LYRM4_EYS
Fusion gene ID: 20455
HgeneTgene
Gene symbol

LYRM4

EYS

Gene ID

57128

346007

Gene nameLYR motif containing 4eyes shut homolog (Drosophila)
SynonymsC6orf149|CGI-203|COXPD19|ISD11C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1
Cytomap

6p25.1

6q12

Type of geneprotein-codingprotein-coding
DescriptionLYR motif-containing protein 4homolog of yeast Isd11mitochondrial matrix Nfs1 interacting proteinprotein eyes shut homologEGF-like-domain, multiple 10EGF-like-domain, multiple 11epidermal growth factor-like protein 10epidermal growth factor-like protein 11protein spacemaker homolog
Modification date2018051920180519
UniProtAcc

Q9HD34

Q5T1H1

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000330636, ENST00000468929, 
ENST00000464010, ENST00000480566, 
ENST00000500576, ENST00000606472, 
ENST00000503581, ENST00000370621, 
ENST00000370616, ENST00000393380, 
ENST00000342421, ENST00000370618, 
ENST00000486069, 
Fusion gene scores* DoF score3 X 2 X 3=1826 X 15 X 12=4680
# samples 427
** MAII scorelog2(4/18*10)=1.15200309344505
effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs).
DoF>8 and MAII>0		log2(27/4680*10)=-4.11547721741994
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: LYRM4 [Title/Abstract] AND EYS [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID

check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVLIHCTCGA-CC-A8HV-01ALYRM4chr6

5260881

-EYSchr6

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-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000330636ENST00000503581LYRM4chr6

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-EYSchr6

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-
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-EYSchr6

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-
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-EYSchr6

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-
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-
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-
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-EYSchr6

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-
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-
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Frame-shiftENST00000500576ENST00000370618LYRM4chr6

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-EYSchr6

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-EYSchr6

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intron-intronENST00000606472ENST00000486069LYRM4chr6

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-

Top

FusionProtFeatures for LYRM4_EYS


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
LYRM4

Q9HD34

EYS

Q5T1H1

Required for nuclear and mitochondrial iron-sulfurprotein biosynthesis. {ECO:0000269|PubMed:17331979,ECO:0000269|PubMed:19454487}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
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FusionGeneSequence for LYRM4_EYS


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
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* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
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GTGCAAATGGATGCAGTTGTTTGAGTGAAGAAGACAGTCAGGAATATCGGTATCTATGTTTTCTCAGATGGGCTGGCAACATGTATCTGG
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GCCCACGTGGATACACTGGTGCATACTGTGAAAAAAGCATTGATAATTGTGCTGAGCCTGAACTTAATTCAGTCATCTGTCTTAATGGAG
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GCTCTTCATCACCATGTCTACATGGTGCAGACTGTGAAGATCACATCAATGGATATGTTTGCAAATGCCAACCAGGATGGTCTGGACACC
ACTGTGAGAATGAGCTTGAGTGCATTCCCAACTCATGTGTTCATGAACTCTGCATGGAGAATGAACCTGGCTCGACATGTTTATGCACAC
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CCATTTCCACACAGACATATACAATTCCCCCTTCTGAGACTTTGGTCAGCAGCTTTCCATCTATAAAGGCTACTAGAATACCAGCCATAA
TGGACACTTACCCAGTTGATCAAGGTCCAAAACAGACAGGCATTGTCAAGCACGACATTCTCCCAACCACTGGTTTGGCAACATTAAGAA
TTAGCACACCCTTGGAAAGCTACTTACTCCAAGAACTGATTGTCACTAGAGAGCTTTCAGCAAAACACAGTCTTCTTTCTTCCGCAGATG
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CTACACAATCTTTATTATTTGAGAACTGTCAGACTGTTGCTTTATCTGCTACCCCAACGACTTCAGTAATTAGAAGCATTCCAGGGGCTG
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CTCAAGAGGATATTGAAGAATATTCAGCTGATTCTTTAATTTCAAGAAGAGAGCACTGGAGATTGCTCAGCCCCTCGATGTCTCCCATTT
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CTTCAGACTTGATGAATTCTGATTTGACTTCAAAAATGACTACTGATGAACTGTCAGTATCAGAAAACATTTTAAAACTATTGAAAATAA
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CCATTTCCACACAGACATATACAATTCCCCCTTCTGAGACTTTGGTCAGCAGCTTTCCATCTATAAAGGCTACTAGAATACCAGCCATAA
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TTAGCACACCCTTGGAAAGCTACTTACTCCAAGAACTGATTGTCACTAGAGAGCTTTCAGCAAAACACAGTCTTCTTTCTTCCGCAGATG
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TTCCTGCTAAGGTAATTATATCTAAACAGGTAACCATCTTAAACTCATCAGCTCTGCACCGGTTCAGTACAAAAGCCTTCAATCCCAGTG
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GCCGGCATCTTCCCTTCACTAGATCTCTTACTTTGTCTTCACTGGAATCCATTCTGGCACCTCAACGGCTGATGATTTCTGATTTCAGTT
GTGTTCGTTATTATGGAGATTCTTATCTAGAATTTCAGAATGTGGCTTTAAATCCACAAAATAACATCTCCCTAGAATTTCAGACCTTCA
GCTCCTATGGACTTCTGCTGTATGTCAAGCAAGACTCAAATTTAGTAGATGGATTTTTTATTCAATTGTTTATTGAAAATGGTACTTTAA
AGTACCACTTTTACTGTCCTGGTGAAGCAAAATTTAAAAGCATTAATACTACTGTTAGAGTGGACAACGGGCAAAAGTATACACTGCTTA
TCAGGCAAGAATTGGATCCATGTAACGCTGAGCTGACTATTTTAGGGAGGAATACACAAATATGCGAATCTATCAATCATGTACTCGGAA
AACCCCTGCCAAAATCAGGATCTGTCTTCATTGGTGGATTTCCAGACCTTCATGGGAAAATCCAGATGCCTGTACCAGTCAAGAATTTTA
CTGGCTGCATAGAAGTTATAGAAATAAATAACTGGAGATCTTTCATTCCATCCAAGGCAGTGAAAAACTATCACATTAACAATTGCAGAT
CCCAGGGATTTATGCTGTCTCCAACAGCCTCCTTTGTTGATGCTTCTGATGTGACACAAGGGGTTGATACCATGTGGACTTCTGTCAGCC
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CATTCCAATGTGACTGTCCACTACATTTCACTGGCCGCTTCTGTGAAAAAGATGCAGGTTTATTCTTTCCATCTTTCAATGGGAATTCCT
ATTTAGAACTGCCCTTTTTGAAGTTTGTCCTGGAGAAGGAACATAACAGAACTGTTACCATCTACTTGACTATAAAAACAAACAGTTTAA
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GGTGTGGAAATTCTCAAAATATTTTGACTGTTTCTGCTAATTACAGCATTAACACAAATGCATTCACCCCTATCACAATACGCTACACAA
CGCCTGTTGGCAGCCCTGGAGTTGTTTGTATGATTGAAATGACTGCAGATGGAAAACCTCCAGTACAGAAGAAAGACACAGAGATTTCCC
ATGCCTCTCAGGCATATTTTGAATCAATGTTCCTTGGCCATATTCCTGCAAATGTTCAAATTCATAAGAAAGCAGGTCCTGTTTATGGGT
TCAGGGGCTGCATTCTAGACCTTCAAGTAAACAACAAAGAATTCTTCATCATCGATGAAGCACGACATGGAAAGAATATTGAGAACTGCC
ACGTCCCTTGGTGTGCTCATCATCTGTGCCGCAACAATGGCACCTGCATCAGTGATAATGAAAATCTGTTTTGTGAGTGTCCAAGGCTGT
ATTCAGGCAAGCTGTGCCAGTTTGCAAGTTGTGAAAACAACCCATGTGGAAATGGTGCCACCTGTGTTCCAAAATCCGGAACAGATATTG
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CAGCACTGCAAAATAACTTGATATTTTTTACTGGACAGAAAGGCCATGGGTTGAATGGCGATGACTTCCTGGCTGTGGGCCTGCTCAATG
GCAGTGTGGTTTATAGTTATAACCTGGGGTCTGGCATAGCAAGCATCAGGAGCGAGCCCCTCAATCTGAGCCTTGGAGTCCACACTGTTC
ATCTGGGCAAGTTCTTCCAAGAGGGCTGGCTGAAGGTAGATGATCATAAAAATAAATCCATTATCGCCCCAGGAAGACTGGTTGGTCTCA
ATGTCTTCAGTCAGTTTTATGTAGGTGGCTACAGTGAATACACTCCAGATCTCTTACCAAATGGAGCAGATTTTAAAAATGGTTTTCAAG
GCTGTATTTTCACTCTTCAAGTTCGCACTGAGAAGGATGGCCATTTCAGAGGACTGGGAAATCCTGAGGGCCACCCAAATGCTGGACGCA
GTGTTGGCCAGTGTCATGCTTCTCCCTGCAGTTTAATGAAATGTGGCAATGGTGGGACATGCATAGAGAGTGGAACTAGTGTTTACTGCA
ATTGTACCACTGGGTGGAAAGGATCATTCTGCACAGAGACAGTTTCTACCTGTGATCCTGAACATGACCCTCCACACCACTGTAGCAGAG
GAGCAACCTGCATTTCATTACCTCATGGATACACCTGTTTCTGTCCTCTAGGAACCACTGGAATCTACTGTGAACAAGCACTTATCCTCA
TTGTGATCTTGGAAAAGCCAAAACCAGCAGAACGGAAAGTGAAGAAGGAGGCTTTATCCATAAGTGATCCATCTTTCAGAAGCAATGAGT
TATCCTGGATGTCTTTTGCTTCCTTTCATGTTCGAAAAAAGACACATATTCAATTGCAGTTTCAGCCTCTCGCTGCAGATGGTATCCTAT
TTTATGCTGCACAACACTTAAAAGCCCAATCAGGTGATTTTTTATGCATCTCTTTAGTAAATAGTTCCGTTCAACTTCGCTACAACCTTG
GCGACAGAACTATCATTCTAGAAACTCTCCAAAAAGTAACTATAAACGGAAGTACTTGGCATATAATAAAAGCAGGAAGAGTTGGTGCAG
AAGGCTACCTGGATCTAGATGGGATAAATGTAACAGAAAAGGCCTCCACTAAAATGAGTTCTCTGGACACAAATACAGACTTCTATATTG
GAGGAGTATCTTCTTTAAATCTTGTAAATCCCATGGCAATAGAAAATGAACCTGTAGGTTTTCAAGGCTGTATCCGACAAGTTATCATAA
ATAATCAAGAATTACAATTAACTGAATTTGGAGCAAAAGGTGGCTCAAATGTAGGTGACTGTGATGGGACAGCCTGTGGGTACAACACAT
GCAGAAATGGAGGTGAATGTACAGTAAATGGCACAACTTTTTCTTGCAGATGTTTGCCAGATTGGGCTGGAAATACATGTAACCAGTCTG
TGTCCTGTTTGAATAATCTTTGCCTCCACCAATCTTTATGTATACCTGACCAATCATTTTCTTACAGTTGCCTGTGTACTTTGGGTTGGG
TGGGAAGGTATTGTGAAAACAAAACTTCATTTTCAACTGCAAAATTTATGGGTAATTCTTACATTAAATACATTGATCCAAATTATAGAA
TGAGAAACCTCCAGTTCACTACTATATCCTTAAATTTCAGTACCACTAAAACAGAAGGTCTAATTGTATGGATGGGAATAGCTCAAAATG
AAGAAAATGATTTTCTGGCAATTGGTCTCCATAATCAGACCTTGAAAATAGCAGTTAACTTGGGAGAAAGAATCTCTGTGCCTATGAGCT
ATAACAATGGCACATTCTGTTGTAATAAATGGCACCATGTAGTTGTAATTCAAAATCAGACTCTTATCAAGGCCTACATAAATAACAGTC
TAATTCTTTCCGAGGATATTGATCCACATAAAAACTTTGTGGCTCTAAACTATGATGGCATTTGTTATCTAGGGGGCTTTGAATATGGTA
GAAAGGTAAATATCGTTACTCAAGAGATTTTTAAAACCAATTTTGTTGGCAAAATTAAAGATGTTGTATTTTTTCAGGAACCAAAAAACA

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ATGGCAGCCTCCAGTCGCGCACAAGTGTTATCTCTGTACCGGGCGATGCTGAGAGAGAGCAAGCGTTTCAGCGCCTACAATTACAGATTT
GTGCAAATGGATGCAGTTGTTTGAGTGAAGAAGACAGTCAGGAATATCGGTATCTATGTTTTCTCAGATGGGCTGGCAACATGTATCTGG
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GTTACATTGGCAGATTGTGTGTTGTCAATGTTGACTATTGCTTAGGGAACCACAGTATATCAGTGCATGGCCTCTGCCTGGCCCTTTCGC
ACAATTGTAACTGTAGCGGTCTGCAAAGATATGAAAGGAACATCTGTGAGATAGATACTGAAGACTGCAAATCTGCGTCCTGCAAAAATG
GAACAACTAGTACACATTTAAGGGGATATTTCTTCCGCAAGTGTGTCCCAGGATTTAAAGGTACGCAATGTGAAATTGATATAGATGAGT
GTGCTTCACATCCCTGCAAAAATGGAGCCACCTGCATTGACCAACCTGGTAATTACTTCTGCCAGTGTGTGCCTCCATTTAAAGTGGTTG
ATGGCTTTTCCTGCTTATGCAATCCAGGCTATGTTGGGATAAGATGTGAACAGGACATTGATGACTGCATCCTGAATGCCTGTGAGCACA
ATTCTACCTGCAAAGACCTGCATCTCAGCTACCAGTGTGTGTGCCTATCTGATTGGGAAGGAAATTTTTGTGAACAAGAATCCAATGAGT
GTAAAATGAATCCTTGCAAGAACAATTCCACCTGTACTGACCTTTACAAAAGCTATCGATGTGAGTGTACATCTGGATGGACTGGACAGA
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GTGCAAATGGATGCAGTTGTTTGAGTGAAGAAGACAGTCAGGAATATCGGTATCTATGTTTTCTCAGATGGGCTGGCAACATGTATCTGG
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GTTACATTGGCAGATTGTGTGTTGTCAATGTTGACTATTGCTTAGGGAACCACAGTATATCAGTGCATGGCCTCTGCCTGGCCCTTTCGC
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GTGCTTCACATCCCTGCAAAAATGGAGCCACCTGCATTGACCAACCTGGTAATTACTTCTGCCAGTGTGTGCCTCCATTTAAAGTGGTTG
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ATTCTACCTGCAAAGACCTGCATCTCAGCTACCAGTGTGTGTGCCTATCTGATTGGGAAGGAAATTTTTGTGAACAAGAATCCAATGAGT
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TCTTCCTTTCCTGCCAGGATTATGGTGACTGTGAAGATATGGTCAACAATTTCAGGTGTATTTGCAGACCTGGGTTTTCTGGATCTCTGT
GTGAAATTGAAATTAATGAATGTTCCTCTGAACCTTGCAAAAATAATGGAACATGTGTGGATCTGACAAACAGATTTTTTTGTAATTGTG
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CTGGATTTATGACCTGCTCCATTGGGCTTCTTTGTGGTGATGAAATAAGGAGAATTACCTGTTTAACTCCCATCTTTCAAAGAACAGATC
CCATTTCCACACAGACATATACAATTCCCCCTTCTGAGACTTTGGTCAGCAGCTTTCCATCTATAAAGGCTACTAGAATACCAGCCATAA
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CTACACAATCTTTATTATTTGAGAACTGTCAGACTGTTGCTTTATCTGCTACCCCAACGACTTCAGTAATTAGAAGCATTCCAGGGGCTG
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GCGCCCGCCCCCGAAGCGGCGCGGGACGCCTGGCGCCGTCCGCGATCCGCAGGGCTGCCCGCTTAGGCTTAGGCCCGGCCCGCTGGCAAA
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GCTCAGCCCCTCGATGTCTCCCATTTTTCCTGCTAAGGTAATTATATCTAAACAGGTAACCATCTTAAACTCATCAGCTCTGCACCGGTT
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CATCTCCCTAGAATTTCAGACCTTCAGCTCCTATGGACTTCTGCTGTATGTCAAGCAAGACTCAAATTTAGTAGATGGATTTTTTATTCA
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TGATACCATGTGGACTTCTGTCAGCCCCTCTGTTGCAGCACCCTCTGTGTGCCAGCAGGATGTATGCCACAATGGAGGCACATGCCATGC
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GAAGTTTCAGCTGGCAAACAACCACTCAGCACTGCAAAATAACTTGATATTTTTTACTGGACAGAAAGGCCATGGGTTGAATGGCGATGA
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CGCCCCAGGAAGACTGGTTGGTCTCAATGTCTTCAGTCAGTTTTATGTAGGTGGCTACAGTGAATACACTCCAGATCTCTTACCAAATGG
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CTGTGAAATTGATGTGAAAGACTGCCTCTTCCTTTCCTGCCAGGATTATGGTGACTGTGAAGATATGGTCAACAATTTCAGGTGTATTTG
CAGACCTGGGTTTTCTGGATCTCTGTGTGAAATTGAAATTAATGAATGTTCCTCTGAACCTTGCAAAAATAATGGAACATGTGTGGATCT
GACAAACAGATTTTTTTGTAATTGTGAACCTGAGTACCATGGGCCCTTCTGTGAACTTGATGTAAATAAATGTAAAATCTCACCTTGTCT
AGATGAAGAAAATTGTGTCTACAGGACTGATGGATACAACTGCCTCTGTGCCCCTGGTTATACAGGCATCAACTGTGAAATAAATCTAGA
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ATGCCAACCAGGATGGTCTGGACACCACTGTGAGAATGAGCTTGAGTGCATTCCCAACTCATGTGTTCATGAACTCTGCATGGAGAATGA
ACCTGGCTCGACATGTTTATGCACACCTGGATTTATGACCTGCTCCATTGGGCTTCTTTGTGGTGATGAAATAAGGAGAATTACCTGTTT
AACTCCCATCTTTCAAAGAACAGATCCCATTTCCACACAGACATATACAATTCCCCCTTCTGAGACTTTGGTCAGCAGCTTTCCATCTAT
AAAGGCTACTAGAATACCAGCCATAATGGACACTTACCCAGTTGATCAAGGTCCAAAACAGACAGGCATTGTCAAGCACGACATTCTCCC
AACCACTGGTTTGGCAACATTAAGAATTAGCACACCCTTGGAAAGCTACTTACTCCAAGAACTGATTGTCACTAGAGAGCTTTCAGCAAA
ACACAGTCTTCTTTCTTCCGCAGATGTTTCCTCTTCTCGATTCCTGAATTTTGGTATTCGTGACCCAGCACAAATTGTCCAGGACAAAAC
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TGCAACTCCAGTTGTCTCTAGGGGGGCTCAAGAGGATATTGAAGAATATTCAGCTGATTCTTTAATTTCAAGAAGAGAGCACTGGAGATT
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TAGCAAACAGTCCCACTTTTATGAGACATTCTGGATGAACTCAGCGATATTAGCCAGCTGGTATGCACTAATGGGAGCTCAAACTATCAC
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AAAAAGAACAATTTTATCCTCATCCTTGGAAGAATCCATTACCCTATCAAGTAATTTGGATGTTAATTTATGTTTGGATAAGACTTGTTT
ATCCATTGTCCCTTCACAAACTATCTCTTCAGACTTGATGAATTCTGATTTGACTTCAAAAATGACTACTGATGAACTGTCAGTATCAGA
AAACATTTTAAAACTATTGAAAATAAGACAATATGGCATAACTATGGGACCCACTGAGGTACTAAATCAAGAGAGCTTATTGGACATGGA
AAAAAGTAAAGGATCTCATACACTGTTCAAACTTCACCCAAGTGATAGTTCTCTGGATTTTGAGTTAAACTTACAAATTTATCCGGATGT
TACTTTAAAGACATATTCAGAAATTACACATGCAAATGACTTCAAAAATAATCTGCCACCATTGACAGGCTCAGTGCCTGATTTTTCAGA
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TTGGCCATATTTTACAGATTATATGACCTCTCTTAAAAAAGAGGTCAAGACTTCTTCAGAATGGTCCAAATGGGAACTTCAGCCTAGTGT
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CATCTCCCTAGAATTTCAGACCTTCAGCTCCTATGGACTTCTGCTGTATGTCAAGCAAGACTCAAATTTAGTAGATGGATTTTTTATTCA
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CCCTTTCGCACAATTGTAACTGTAGCGGTCTGCAAAGATATGAAAGGAACATCTGTGAGATAGATACTGAAGACTGCAAATCTGCGTCCT
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GATCTCTGTGTGAAATTGAAATTAATGAATGTTCCTCTGAACCTTGCAAAAATAATGGAACATGTGTGGATCTGACAAACAGATTTTTTT
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AAGGCTACCTGGATCTAGATGGGATAAATGTAACAGAAAAGGCCTCCACTAAAATGAGTTCTCTGGACACAAATACAGACTTCTATATTG
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ATAATCAAGAATTACAATTAACTGAATTTGGAGCAAAAGGTGGCTCAAATGTAGGTGACTGTGATGGGACAGCCTGTGGGTACAACACAT
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TGTCCTGTTTGAATAATCTTTGCCTCCACCAATCTTTATGTATACCTGACCAATCATTTTCTTACAGTTGCCTGTGTACTTTGGGTTGGG
TGGGAAGGTATTGTGAAAACAAAACTTCATTTTCAACTGCAAAATTTATGGGTAATTCTTACATTAAATACATTGATCCAAATTATAGAA
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AAGAAAATGATTTTCTGGCAATTGGTCTCCATAATCAGACCTTGAAAATAGCAGTTAACTTGGGAGAAAGAATCTCTGTGCCTATGAGCT
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TTACATTTTAAAATCAACGTGTAAACACAATTTTAAAAATCAATGTGTAAGCTGAACTTTAAAATGTTTAAAATTCAGTTGGGAATGAAT

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GTTACATTGGCAGATTGTGTGTTGTCAATGTTGACTATTGCTTAGGGAACCACAGTATATCAGTGCATGGCCTCTGCCTGGCCCTTTCGC
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GTGCTTCACATCCCTGCAAAAATGGAGCCACCTGCATTGACCAACCTGGTAATTACTTCTGCCAGTGTGTGCCTCCATTTAAAGTGGTTG
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CTGGACGCAGTGTTGGCCAGTGTCATGCTTCTCCCTGCAGTTTAATGAAATGTGGCAATGGTGGGACATGCATAGAGAGTGGAACTAGTG
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GTAGCAGAGGAGCAACCTGCATTTCATTACCTCATGGATACACCTGTTTCTGTCCTCTAGGAACCACTGGAATCTACTGTGAACAAGCAC
TTATCCTCATTGTGATCTTGGAAAAGCCAAAACCAGCAGAACGGAAAGTGAAGAAGGAGGCTTTATCCATAAGTGATCCATCTTTCAGAA
GCAATGAGTTATCCTGGATGTCTTTTGCTTCCTTTCATGTTCGAAAAAAGACACATATTCAATTGCAGTTTCAGCCTCTCGCTGCAGATG
GTATCCTATTTTATGCTGCACAACACTTAAAAGCCCAATCAGGTGATTTTTTATGCATCTCTTTAGTAAATAGTTCCGTTCAACTTCGCT
ACAACCTTGGCGACAGAACTATCATTCTAGAAACTCTCCAAAAAGTAACTATAAACGGAAGTACTTGGCATATAATAAAAGCAGGAAGAG
TTGGTGCAGAAGGCTACCTGGATCTAGATGGGATAAATGTAACAGAAAAGGCCTCCACTAAAATGAGTTCTCTGGACACAAATACAGACT
TCTATATTGGAGGAGTATCTTCTTTAAATCTTGTAAATCCCATGGCAATAGAAAATGAACCTGTAGGTTTTCAAGGCTGTATCCGACAAG
TTATCATAAATAATCAAGAATTACAATTAACTGAATTTGGAGCAAAAGGTGGCTCAAATGTAGGTGACTGTGATGGGACAGCCTGTGGGT
ACAACACATGCAGAAATGGAGGTGAATGTACAGTAAATGGCACAACTTTTTCTTGCAGATGTTTGCCAGATTGGGCTGGAAATACATGTA
ACCAGTCTGTGTCCTGTTTGAATAATCTTTGCCTCCACCAATCTTTATGTATACCTGACCAATCATTTTCTTACAGTTGCCTGTGTACTT
TGGGTTGGGTGGGAAGGTATTGTGAAAACAAAACTTCATTTTCAACTGCAAAATTTATGGGTAATTCTTACATTAAATACATTGATCCAA
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CTCAAAATGAAGAAAATGATTTTCTGGCAATTGGTCTCCATAATCAGACCTTGAAAATAGCAGTTAACTTGGGAGAAAGAATCTCTGTGC
CTATGAGCTATAACAATGGCACATTCTGTTGTAATAAATGGCACCATGTAGTTGTAATTCAAAATCAGACTCTTATCAAGGCCTACATAA
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AATATGGTAGAAAGGTAAATATCGTTACTCAAGAGATTTTTAAAACCAATTTTGTTGGCAAAATTAAAGATGTTGTATTTTTTCAGGAAC

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TACAGATTTGTGCAAATGGATGCAGTTGTTTGAGTGAAGAAGACAGTCAGGAATATCGGTATCTATGTTTTCTCAGATGGGCTGGCAACA
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GATTTAGTGGCTTAAAATCAATTAATGTAATTTAATGTATCAATAGAATAAATAAAGAAGAAAATGCATGATAATGTAGATGGAGAAAAA
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FusionGenePPI for LYRM4_EYS


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
LYRM4PVRL2, ZWINT, HLA-DPB1, NDUFAB1, CDNF, NFS1, ISCU, LYRM4, FXN, IDE, NRD1, CHCHD2, PMPCA, PMPCB, HOGA1, DDAH1, ECH1, BCKDHA, C1QBP, KLHL22, GPX7EYSEGFR


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for LYRM4_EYS


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for LYRM4_EYS


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneLYRM4C0036341Schizophrenia1PSYGENET
HgeneLYRM4C3810055COMBINED OXIDATIVE PHOSPHORYLATION DEFICIENCY 191UNIPROT
TgeneEYSC1864446Retinitis Pigmentosa 252CTD_human;UNIPROT
TgeneEYSC0035334Retinitis Pigmentosa1CTD_human;ORPHANET