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Fusion gene ID: 13927 |
FusionGeneSummary for FRS2_AHCYL2 |
 Fusion gene summary |
| Fusion gene information | Fusion gene name: FRS2_AHCYL2 | Fusion gene ID: 13927 | Hgene | Tgene | Gene symbol | FRS2 | AHCYL2 | Gene ID | 10818 | 23382 |
| Gene name | fibroblast growth factor receptor substrate 2 | adenosylhomocysteinase like 2 | |
| Synonyms | FRS1A|FRS2A|FRS2alpha|SNT|SNT-1|SNT1 | ADOHCYASE3|IRBIT2 | |
| Cytomap | 12q15 | 7q32.1 | |
| Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
| Description | fibroblast growth factor receptor substrate 2FGFR signalling adaptorFGFR substrate 2FGFR-signaling adaptor SNTsuc1-associated neurotrophic factor target 1 | adenosylhomocysteinase 3IP(3)Rs binding protein released with IP(3) 2S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase 3S-adenosylhomocysteine hydrolase-like 2long-IRBITputative adenosylhomocysteinase 3 | |
| Modification date | 20180522 | 20180523 | |
| UniProtAcc | Q8WU20 | Q96HN2 | |
| Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000299293, ENST00000549921, ENST00000550389, ENST00000397997, | ENST00000325006, ENST00000446544, ENST00000531335, ENST00000474594, ENST00000446212, ENST00000490911, ENST00000472554, | |
| Fusion gene scores | * DoF score | 56 X 9 X 12=6048 | 7 X 5 X 5=175 |
| # samples | 47 | 7 | |
| ** MAII score | log2(47/6048*10)=-3.68572547765607 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | log2(7/175*10)=-1.32192809488736 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | |
| Context | PubMed: FRS2 [Title/Abstract] AND AHCYL2 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
| Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation | |||
| * DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
| Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
| Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
| Fusion gene information from three resources (ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018)) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| Data type | Source | Cancer type | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| TCGA | LD | SARC | TCGA-DX-A6BH-01A | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| * LD: Li Ding group's fusion gene list RV: Roel Verhaak group's fusion gene list ChiTaRs fusion database |
| Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| In-frame | ENST00000299293 | ENST00000325006 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000299293 | ENST00000446544 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000299293 | ENST00000531335 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000299293 | ENST00000474594 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000299293 | ENST00000446212 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000299293 | ENST00000490911 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000299293 | ENST00000472554 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000549921 | ENST00000325006 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000549921 | ENST00000446544 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000549921 | ENST00000531335 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000549921 | ENST00000474594 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000549921 | ENST00000446212 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000549921 | ENST00000490911 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000549921 | ENST00000472554 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000550389 | ENST00000325006 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000550389 | ENST00000446544 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000550389 | ENST00000531335 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000550389 | ENST00000474594 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000550389 | ENST00000446212 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000550389 | ENST00000490911 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000550389 | ENST00000472554 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000397997 | ENST00000325006 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000397997 | ENST00000446544 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000397997 | ENST00000531335 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000397997 | ENST00000474594 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000397997 | ENST00000446212 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| In-frame | ENST00000397997 | ENST00000490911 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000397997 | ENST00000472554 | FRS2 | chr12 | 69967865 | + | AHCYL2 | chr7 | 129019482 | + |
Top |
FusionProtFeatures for FRS2_AHCYL2 |
| Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
| Hgene | Tgene |
| FRS2 | AHCYL2 |
| Adapter protein that links activated FGR and NGFreceptors to downstream signaling pathways. Plays an importantrole in the activation of MAP kinases and in the phosphorylationof PIK3R1, the regulatory subunit of phosphatidylinositol 3-kinase, in response to ligand-mediated activation of FGFR1.Modulates signaling via SHC1 by competing for a common bindingsite on NTRK1. {ECO:0000269|PubMed:12974390,ECO:0000269|PubMed:21765395}. | May regulate the electrogenic sodium/bicarbonatecotransporter SLC4A4 activity and Mg(2+)-sensitivity. On thecontrary of its homolog AHCYL1, does not regulate ITPR1sensitivity to inositol 1,4,5-trisphosphate (PubMed:19220705).{ECO:0000250|UniProtKB:A6QLP2, ECO:0000269|PubMed:19220705}. |
| Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at . * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
| - In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000325006 | + | 0 | 17 | 336_338 | 121 | 612 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000325006 | + | 0 | 17 | 401_406 | 121 | 612 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000325006 | + | 0 | 17 | 478_479 | 121 | 612 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000446544 | + | 0 | 17 | 336_338 | 121 | 611 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000446544 | + | 0 | 17 | 401_406 | 121 | 611 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000446544 | + | 0 | 17 | 478_479 | 121 | 611 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000474594 | + | 0 | 17 | 336_338 | 19 | 509 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000474594 | + | 0 | 17 | 401_406 | 19 | 509 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000474594 | + | 0 | 17 | 478_479 | 19 | 509 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000490911 | + | 0 | 17 | 336_338 | 19 | 509 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000490911 | + | 0 | 17 | 401_406 | 19 | 509 | Nucleotide binding | NAD |
| Tgene | >AHCYL2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000490911 | + | 0 | 17 | 478_479 | 19 | 509 | Nucleotide binding | NAD |
| - In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Hgene | >FRS2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000299293 | + | 1 | 10 | 13_115 | -170 | 509 | Domain | IRS-type PTB |
| Hgene | >FRS2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000397997 | + | 1 | 8 | 13_115 | -101 | 509 | Domain | IRS-type PTB |
| Hgene | >FRS2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000549921 | + | 1 | 9 | 13_115 | -139 | 509 | Domain | IRS-type PTB |
| Hgene | >FRS2 | chr12:69967865 | chr7:129019482 | ENST00000550389 | + | 1 | 7 | 13_115 | -82 | 509 | Domain | IRS-type PTB |
Top |
FusionGeneSequence for FRS2_AHCYL2 |
| For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. (nt: nucleotides, aa: amino acids) |
| * Fusion amino acid sequences. |
| >In-frame_FRS2_ENST00000299293_chr12_69967865_+_AHCYL2_ENST00000325006_chr7_129019482_+_2608aa MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYLCLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFK CARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVVERNNHQTELEVPRTPRTPTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVGE ESTHPLLVAEEQVHTYVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDPQILLEPEGVKFVLGPTPVQKQLMEKEKLEQ LGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPSVNKLVYENINGLSIPSASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWE ARKLSRDEDDNLGPKTPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVFNFDIRRPSLEHRQLNYIQVDLEGGSDSDNP QTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTAAMSNLQKALPRDDGTSRKTRHNSTDLPMXAWKALCCLHLCEVFKNEDASASFSFLNTNSF YRLIKFFSEYFMCIFNXRELMXSRYSLKNTNFIIYYSLYSSIPVFTVPIXNESXSKXHAGXFLSIFWTXRIPFMSKSWLAFKTFYKASXQ CTLLTGNYRLXKXCSXIQCSQYVASSMXHEESFISLINGFLTXAKTYVKETEVPHLLLHQSAPLPSVLLESGLCPXVCFAVGALKGRKET RFSIYSSHDVIXRACPDILKLXXAQESVSGHFTQKHLKIXTTISXKFFSYRLLTTHCFLEAFVPLGFHLSSVFFFGVWDVLFCCLMSFSI XNVXVCIXFXNWIMCSLLFSLHFCQIMVLKVHLELTVSLXQGCPCPVFIYKLFTFQVDKNILQFXICLCPXVISLANXEKKEATFNMQSS LKVYRVVSVGTLPQHFSSNSPSYTLQLYSAHSSVPQLCCPFTCSWIFDYPSISMKYXYCCQHSRYSGSLVAVRLYHNLGFKMNXSLYKLK SLHMSNSWKIKDVPISXTLENTREGRVEKVRXPCKIFYYFLXIXGSLRLXSGSTRYNXGXFSMKKFXSYWHPTYSVTESXDNDGLGEQXS GIIIKKINYXRCLYRFSAIFSVFTINQYQCILSFYVHSRIFFSPFCSPVNLVLIKVLTVLLKESSGIGVQFPXCRFHFXYIVPLILSSEX IANCAKFMXXFLXCGIRIMMEPLHIFFXNSQSRQNINLQMQGLIYLFILEVGYFILSFRHPFHCFPRILISFYFFXITPIXSLQFMLXIL CALKRKMGPICLLRIXFXVLXEYXENIYNWCXFLDIFXKSLVFLFNKRXFRILLVLCSSLVMGIKLCPRRMYLLLGAFXNEILIFYXHII VAIYLRFSEADLILDNSVGRPCDPSFWFWKYNHCXCFPSKXNTVLSIQIITASIPCXGWKLILVLLVFFLSVFYFPVSSSSKNENMVPSL PPGRLANISFYLLLLWSDEICTLLFKIQQKAFHFSVYPEYIISGTXENLPSNLCFYRYXCXPSPAFNVINRTSQASVYLLPLPKTVAQHI KMYLNNVLLKMGQGPYVFIISQQCAAIFLPQGKGFNRXKSTSQFPRAIPNLXCPNVLCNVXCVCINTYILEIDIPSETSFTSNXCIGISF IFLMCEVYGTNYLFLDVCQIXIKALVRNYRMXRKCFWLEKLTYFMTYHSILCPNQHPIYLSCSLHPCSPSLLPHFWYNTVLLXHHYNCSS MAIGQLXHGNRLVXVVQXSPVCHICISNAKYTFYKGQTLCYVLFSLHCIILXDYCMSXFALXMFFSYVKAXIXQLCIKVAYXIFNFFFYK KLSNSGTTIAKLYMKYEFYPHGXFLLXTFHISLIKRHKXYCTMHTLYLNAVSDQHFKFWFAFLILAKRNHCXLKXNLVVYVTTXFSLYPF PPFVLYFSLSVPTSYILXHGNKIXLLHXGRVWLFGGSGDGTIALXLSFAYDCFLPYKPCHQAXKVFSYMMXTCFXGQVXMCFLSLIFVMT TNFFYLWRSQSSLQSNVYXLEYLEXASNXIXFKGXATHFXILIYCRVLVYCPTNYVKYGLILDDFGFCNALLLSFXHKYPXXGTQVDTGS XADHTLTXSIHEKLLYXIKSDWSSFHAHFPLIAESRLQXNPNKTFGRQIQFADQKQEFNKRPTKIGRRSLSRSISQSSTDSYSSAASYTD SSDDETSPRDKQQKNSKGSSDFCVKNIKQAEFGRREIEIAEQEMPALMALRKRAQGEKPLAGAKIVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCR WAACNIYSTLNEVAAALAESGFPVFAWKGESEDDFWWCIDRCVNVEGWQPNMILDDGGDLTHWIYKKYPNMFKKIKGIVEESVTGVHRLY QLSKAGKLCVPAMNVNDSVTKQKFDNLYCCRESILDGLKRTTDMMFGGKQVVVCGYGEVGKGCCAALKAMGSIVYVTEIDPICALQACMD GFRLVKLNEVIRQVDIVITCTGNKNVVTREHLDRMKNSCIVCNMGHSNTEIDVASLRTPELTWERVRSQVDHVIWPDGKRIVLLAEGRLL >In-frame_FRS2_ENST00000299293_chr12_69967865_+_AHCYL2_ENST00000446544_chr7_129019482_+_2607aa MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYLCLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFK 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| * Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region). |
| >In-frame_FRS2_ENST00000299293_chr12_69967865_+_AHCYL2_ENST00000325006_chr7_129019482_+_7824nt ATGGGTAGCTGTTGTAGCTGTCCAGATAAAGACACTGTCCCAGATAACCATCGGAACAAGTTTAAGGTCATTAATGTGGATGATGATGGG AATGAGTTAGGTTCTGGCATAATGGAACTTACAGACACAGAACTGATTTTATACACCCGCAAACGTGACTCAGTAAAATGGCACTACCTC TGCCTGCGACGCTATGGCTATGACTCGAATCTCTTTTCTTTTGAAAGTGGTCGAAGGTGTCAAACTGGACAAGGAATCTTTGCCTTTAAG TGTGCCCGTGCAGAAGAATTATTTAACATGTTGCAAGAGATTATGCAAAATAATAGTATAAATGTGGTGGAAGAGCCAGTTGTAGAAAGA AATAATCATCAGACAGAATTGGAAGTCCCTAGAACACCTCGAACACCTACAACTCCAGGATTTGCTGCTCAGAACTTACCTAATGGATAT CCCCGATATCCCTCATTTGGAGATGCTTCATCCCATCCGTCAAGCAGACATCCTTCTGTGGGAAGTGCTCGCCTGCCTTCAGTAGGGGAA GAATCTACACATCCTTTGCTTGTGGCTGAGGAACAAGTACATACCTATGTCAACACTACAGGTGTGCAAGAAGAGCGGAAAAACCGCACA AGTGTGCATGTTCCATTGGAGGCGAGGGTTTCTAACGCTGAAAGCAGCACACCAAAAGAAGAACCAAGTAGTATTGAGGACAGGGATCCT CAGATTCTTCTTGAACCTGAAGGAGTCAAATTTGTTTTAGGGCCAACCCCTGTTCAAAAGCAGTTAATGGAAAAAGAGAAACTGGAGCAA 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GGCGAGTCTGCGGACACCAGAACTGACCTGGGAGCGAGTGAGATCTCAAGTTGACCATGTGATATGGCCTGATGGCAAGAGGATAGTACT GCTGGCAGAGGGCCGCCTGCTGAACCTTAGCTGCTCCACAGTGCCTACATTTGTGCTCTCAATCACTGCTACTACTCAGGCTCTTGCCTT GATAGAGCTTTACAATGCTCCTGAGGGTCGCTATAAGCAGGATGTCTACCTGTTGCCCAAGAAGATGGATGAGTATGTGGCCAGCCTACA CCTGCCTACCTTTGATGCCCACTTGACAGAGCTGACAGATGAACAGGCCAAGTATCTGGGACTCAACAAGAATGGGCCCTTCAAGCCTAA TTACTACAGGTATTAAGTTCCTGTAACTCAAACCAGAATTTTTAAGGAATAGAACTCCAAGCCTTTTCTCCACTACTATACAAGAAAGAA TTCAGCAAGCTGCTTCTCCAATCAAAGCTGCCTGCCGTGCTCACCCTGTGTGTTAGGTTATTTATTTATTAAAATCAAGAATCCTGTGCC TGTAGTGTTGGCCCAGAGTGTGGTTACTGCCCTGAGGGCCATGAAAGCCACAGAGGATGGGCTGAGGAAGGAAAGAAATGGGGTTACTGC TCCCAGTGCATCATTTGCATCATTCCCCATTGACTGAATCCTCAGCAGTGGCCGTTTTTCCTCTTGTCCAGGCTCACGAGTTAGTCCAGG GATTCCATACTCCCTATTCCCTGGAGTTTTCTGGAATAAATTTTCAGCACCTGCTTTTCTCAGCTTGGCCCTTCCCCGGGTGAGGCCGTT TGGAATTAACATGGCCAGTGTTTCACACAAGATTGGGTTCCCAATCTTGACCATCACTATCACTGCCTTCTTTATATAAAGGCTAATAAG GAAGGAGTGTTATTTATGGCTTTGCCAAGCTACATCAAGAACTCAGCTGTGCTGTGCCTACCAGGGGTCTCCTTTCTTACCCAGGACTCC 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TCTCTTCTTCTACCTCTACCCTCTCCAACTTCTCCTGGTCTTCACATATACTCTCAAAGCTAGTCTGAAAGTGACCTTACTTTCGGAAGT AGGGAAGTGGAACTTTGGTAAATGACTGTTTGCCTCATTTAATAGTATACAGGCTCAGCCCATAGACTACAGTTCTTCAGAGGCCATATG TCTCAGCAAGTACTGGTTATATTCTTTTTTTGTAAGGAAGATCATAAATGCTAAAAATTCCACTAAGCCATTCAGTTCTTCCTTTTGCCT ACCTAGTCCTGATTTTTGTATTAATTGGTTCCCTTTAGCAAGGGATTCAGATCTTTGTACCTTATCTTATATCCAGAGCAGATTCCATTT GGCAGATAGATGGTCTCTAGCCTATTGTATTCTTAGACCAAAAATCATAACCTGCTGTTTCTCAGCAAAGCCTTGCTCTCTGGAGCTTAC TATGTGCTGGTACTTAAAGAGTACATTCTGCCTTGCTGTAGTGAAGAGACCCACTCCAAATAAAAAAGGGGCCACACGGGGCTTCTAAGT TAGGTTGCCAGTGTTGCTGCCCATGATGAGTTATTTGCCTCTGAGTTTCAGATGACCTCTCTGTAGGGACACTGTGTTATCAACCATTAA GAAGAAAGAACCACAAGCCTCCCAAGTATTTGGGTTCTATCTTAGGGTTGAAATCTGGTCATTATTCCCTCTACCCTTGGAATCAGAGCA ATGTGTCTTCTTTCCTCCAACCTCTTACCTTAGATGCATCCTGGTTATCTGGAAGCATGGGAAAGAAGGCTACTTATCTCTTTGTATGTG GCTCCAGTCTGTGAGGATACATAACATTTTCTCTACAATGAATCTGTGCTAATATTTTGCCTTCTTTCTTTCTTTTCTTTTCACCCTTAG AGACAGGGTTTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGAACCA CAGGTGTGTGCTACCGTGCCTGGCACTTTTTTGCCTTCTTAATGGAGATATTCAGTTTTCTTTTTTTCATTTAAACAAAGAAAAAAAATG TATCTACTCTACCTTCCCTCTGCTCTCCTCCCTCCCTATCCTACTTGCCCATATGAGCACGGCTCCCCATGGCCACATACTCCTGCAAAG CTTTTATGCTGCTTCGCTTTTCTCTAAACAGATCTGATATTGCTGCTCCTGTGGTTTTCTCAAAATTAACTTTGCCGTGGTTTTTAAAAA GGAATCAAAATGCATTGTTGCATTAAGCTTTTTCAATAAAGGAAAATTACGGAAGGAAAATAGGCAACACCAGCAAATTATATGTGGACA GGTTCTAAACTCTATATATACATATATATATATATATCTATATATCTATATACGTAATCATCTAGTTCTGTCATCTTACTGAAAGGAATA ACACTTCTAAAGATCACCATTTCTGAGAAGTTCTTGGAAATCTTTATGTCTAAGTGATTGTATTAGATCAGCAATAATGACTATGTAATC >In-frame_FRS2_ENST00000397997_chr12_69967865_+_AHCYL2_ENST00000490911_chr7_129019482_+_8423nt CGCCCCCTCAACCTTCGCGGGGCGCGGGCCGCAGCTTTTCGGTTCACAGCGGGCAGGGAAAGCCGCGGGAAGGGTACTCCAGGCGAGAGG CGGACGCGAGTCGTCGTGGCAGGAAAAGTGACTAGCTCCCCTTCGTTGTCAGCCAGGGACGAGAACACAGCCACGCTCCCACCCGGCTGC CAACGATCCCTCGGCGGCGATGTCGGCCGCCGGTGCCCGAGGCCTGCGGGCCACCTACCACCGGCTCCTCGATAAAGTGGAGCTGATGCT GCCCGAGAAATTGAGGCCGTTGTACAACCATCCAGCAGGAACAAAATTGTATCTGTTTTTCTCAGAAGAGAATTCCACAAGGTTAAATCA GCAAACAAAGAAAACATGGTATTTTGAAATATGATTAAACTCCTGATGCTGCAGCAGAGGCTAAGAATATTAATGGCCAGATCTAGTGCA CACATGGTCTTCTGAAGAAGCCATGGGTAGCTGTTGTAGCTGTCCAGATAAAGACACTGTCCCAGATAACCATCGGAACAAGTTTAAGGT CATTAATGTGGATGATGATGGGAATGAGTTAGGTTCTGGCATAATGGAACTTACAGACACAGAACTGATTTTATACACCCGCAAACGTGA CTCAGTAAAATGGCACTACCTCTGCCTGCGACGCTATGGCTATGACTCGAATCTCTTTTCTTTTGAAAGTGGTCGAAGGTGTCAAACTGG ACAAGGAATCTTTGCCTTTAAGTGTGCCCGTGCAGAAGAATTATTTAACATGTTGCAAGAGATTATGCAAAATAATAGTATAAATGTGGT GGAAGAGCCAGTTGTAGAAAGAAATAATCATCAGACAGAATTGGAAGTCCCTAGAACACCTCGAACACCTACAACTCCAGGATTTGCTGC TCAGAACTTACCTAATGGATATCCCCGATATCCCTCATTTGGAGATGCTTCATCCCATCCGTCAAGCAGACATCCTTCTGTGGGAAGTGC TCGCCTGCCTTCAGTAGGGGAAGAATCTACACATCCTTTGCTTGTGGCTGAGGAACAAGTACATACCTATGTCAACACTACAGGTGTGCA AGAAGAGCGGAAAAACCGCACAAGTGTGCATGTTCCATTGGAGGCGAGGGTTTCTAACGCTGAAAGCAGCACACCAAAAGAAGAACCAAG TAGTATTGAGGACAGGGATCCTCAGATTCTTCTTGAACCTGAAGGAGTCAAATTTGTTTTAGGGCCAACCCCTGTTCAAAAGCAGTTAAT GGAAAAAGAGAAACTGGAGCAACTTGGAAGAGATCAAGTTAGTGGAAGTGGAGCAAATAACACAGAATGGGACACTGGCTATGACAGTGA TGAACGAAGAGATGCACCCTCTGTTAACAAACTGGTGTATGAAAATATAAATGGGCTATCTATCCCTAGTGCCTCAGGGGTCAGGAGAGG TCGTCTGACATCCACCAGTACCTCAGATACCCAGAATATCAACAACTCAGCTCAGAGAAGAACTGCATTATTAAACTATGAAAATCTACC ATCTTTGCCTCCTGTTTGGGAAGCCCGCAAGCTAAGTAGGGATGAAGATGACAATTTAGGACCAAAGACCCCATCTCTAAATGGCTACCA TAATAATCTAGATCCAATGCATAACTATGTAAATACAGAGAATGTAACAGTGCCAGCAAGTGCTCACAAAATAGAATATTCAAGGCGTCG GGACTGTACACCAACAGTCTTTAACTTTGATATCAGACGCCCAAGTTTAGAACACAGGCAGCTTAATTACATACAGGTTGACTTGGAAGG TGGCAGTGACTCTGACAACCCTCAGACTCCAAAAACGCCTACAACTCCCCTTCCACAAACCCCTACCAGGCGCACAGAGCTGTATGCCGT GATAGACATCGAGAGAACTGCTGCTATGTCAAATTTGCAGAAAGCACTGCCACGAGATGATGGTACATCTAGGAAAACTAGACACAATAG TACTGATCTGCCCATGTGAGCCTGGAAAGCATTGTGTTGTTTGCACCTTTGTGAAGTTTTTAAAAATGAAGATGCAAGTGCTTCATTTTC ATTTCTAAACACTAACTCCTTTTATAGACTGATAAAATTTTTTTCTGAATATTTCATGTGCATCTTTAACTAAAGGGAATTAATGTAGAG CAGGTACTCCTTAAAGAACACTAATTTCATTATATACTACTCGTTGTACAGCAGCATTCCCGTTTTCACAGTGCCTATTTAAAATGAGAG TTGAAGTAAATGACATGCTGGTTGATTTTTATCAATATTCTGGACTTAACGCATACCTTTCATGTCTAAGTCATGGTTGGCTTTTAAAAC TTTTTATAAAGCCTCTTGACAATGTACATTGCTAACAGGTAACTATAGGCTTTGAAAGTAATGCTCGTAGATTCAGTGTTCACAGTATGT GGCCTCCAGCATGTAACATGAGGAATCCTTTATTTCATTAATTAATGGCTTTTTGACTTGAGCCAAAACATATGTAAAGGAAACAGAAGT ACCGCACCTCCTCTTACACCAGTCAGCTCCTTTGCCTTCAGTGTTACTAGAAAGCGGCCTGTGTCCATGAGTGTGCTTTGCTGTTGGTGC ACTGAAAGGCAGGAAGGAGACAAGATTTTCTATTTACTCATCTCATGATGTCATTTGAAGGGCATGTCCAGATATCTTAAAATTATAATA GGCTCAAGAATCAGTCTCAGGTCACTTTACCCAAAAACATTTGAAAATCTGAACCACAATCTCCTGAAAGTTTTTCTCCTATAGATTGTT GACAACACATTGTTTTCTGGAGGCATTTGTGCCATTAGGTTTCCATTTATCTTCAGTTTTTTTCTTTGGTGTTTGGGATGTCTTATTTTG TTGCCTTATGTCCTTTTCAATTTAAAATGTTTGAGTTTGTATATAGTTTTGAAATTGGATTATGTGTTCATTGTTGTTTAGTTTGCATTT TTGTCAAATTATGGTTTTGAAGGTTCATTTGGAACTTACTGTTAGTCTGTAACAGGGTTGCCCTTGTCCAGTATTTATTTATAAGCTGTT TACTTTTCAAGTTGATAAAAACATTCTCCAATTCTAAATTTGCTTGTGTCCATAGGTGATCTCTTTAGCAAACTGAGAAAAAAAGGAAGC TACTTTTAACATGCAAAGTTCCCTCAAGGTGTACCGTGTTGTCTCTGTGGGCACTCTTCCCCAGCACTTTAGCAGTAATTCCCCCAGCTA CACGCTGCAGTTGTACTCTGCCCACTCTAGTGTTCCTCAGCTCTGCTGTCCTTTTACTTGTAGCTGGATCTTTGATTATCCTTCGATTTC CATGAAATATTAATATTGTTGCCAGCATAGCAGGTACAGTGGAAGTCTTGTAGCAGTGAGATTGTATCATAATTTAGGATTTAAAATGAA TTAAAGTTTATATAAACTGAAGAGTCTCCATATGTCAAACTCTTGGAAAATCAAAGATGTTCCAATTTCCTAAACACTAGAGAATACGAG AGAAGGTAGAGTGGAAAAGGTTAGGTAACCTTGCAAAATATTTTACTATTTTCTCTAAATATGAGGAAGTTTGAGATTATGATCTGGATC TACCAGATATAACTAAGGTTAATTTAGCATGAAAAAGTTTTAGTCATATTGGCATCCAACCTATTCAGTAACCGAATCATAGGACAATGA TGGATTAGGAGAACAATAGAGTGGGATCATTATAAAGAAAATAAATTATTAAAGGTGTCTTTATCGTTTTAGTGCCATTTTTAGTGTCTT TACTATAAATCAATATCAGTGTATTTTATCATTCTATGTGCATAGCAGAATTTTCTTTTCTCCCTTTTGTTCCCCTGTGAACTTGGTGCT TATTAAAGTGCTCACTGTTCTCTTAAAAGAGAGCAGTGGTATAGGTGTGCAGTTTCCATGATGCAGGTTCCATTTTTAATATATTGTTCC ACTTATCCTTTCTTCTGAGTAAATTGCTAATTGTGCCAAATTTATGTAATAGTTTTTGTAATGTGGAATAAGAATTATGATGGAACCATT GCACATTTTTTTCTGAAACAGCCAGTCAAGGCAGAACATTAATCTCCAAATGCAAGGGCTGATCTATTTATTCATTTTGGAGGTTGGGTA CTTTATTCTTTCTTTCCGTCATCCTTTTCATTGTTTCCCCCGGATTCTAATTAGTTTTTATTTTTTTTAGATAACTCCAATATAATCATT ACAGTTTATGCTTTAAATACTATGTGCTTTAAAAAGGAAAATGGGACCAATTTGTCTGCTAAGAATTTGATTTTAGGTACTATAAGAGTA TTAGGAAAATATATACAACTGGTGTTAATTTCTAGATATTTTCTAGAAATCACTTGTGTTCCTATTTAATAAAAGGTAATTTAGAATACT ACTTGTCCTTTGCAGTAGTTTAGTAATGGGCATTAAGCTGTGTCCTCGAAGGATGTACCTATTACTAGGTGCATTTTAGAATGAAATATT GATATTTTATTAGCATATAATTGTGGCCATATATCTCAGATTTTCTGAGGCAGATCTAATTTTAGATAATTCTGTTGGTAGACCATGTGA TCCTTCTTTTTGGTTTTGGAAATATAATCATTGTTAATGTTTTCCCTCCAAATAGAATACTGTTTTATCCATACAAATCATAACAGCATC TATCCCATGCTAGGGTTGGAAACTGATATTGGTATTACTTGTGTTTTTTCTTAGTGTGTTTTATTTCCCAGTTTCATCTTCTTCTAAAAA TGAAAATATGGTGCCTTCCCTCCCTCCAGGAAGACTGGCAAATATTTCCTTTTATTTACTGCTGCTGTGGAGTGATGAGATATGCACTTT ACTCTTTAAGATTCAGCAAAAAGCTTTTCACTTCTCAGTATATCCAGAATACATCATATCTGGGACTTAGGAAAATTTGCCAAGCAATCT TTGTTTTTATAGATACTAATGTTGACCCTCTCCAGCGTTCAATGTTATAAATAGAACAAGTCAAGCTAGTGTTTATCTCCTCCCCCTCCC CAAAACTGTGGCACAGCATATAAAAATGTACCTCAATAATGTTCTATTAAAAATGGGACAGGGGCCTTATGTTTTCATAATTTCCCAACA ATGTGCCGCCATATTTTTGCCTCAAGGTAAAGGTTTTAACAGATGAAAAAGTACTTCCCAATTCCCCCGTGCTATTCCTAACCTATAATG CCCAAATGTTTTGTGCAATGTGTAGTGTGTGTGTATAAATACATATATTCTTGAAATAGACATACCATCAGAGACATCATTCACAAGTAA CTGATGTATTGGCATCTCATTCATATTTCTGATGTGTGAGGTATATGGTACTAATTACCTTTTCCTTGATGTTTGCCAAATTTGAATAAA GGCATTGGTACGAAATTACAGAATGTAAAGAAAATGTTTTTGGCTTGAAAAATTAACATATTTTATGACGTACCACAGTATACTCTGCCC AAACCAGCACCCTATCTATCTTTCCTGTTCTTTACATCCCTGTTCCCCATCCCTACTTCCTCATTTTTGGTATAACACAGTTCTTTTGTA GCATCATTATAATTGCAGTTCTATGGCAATTGGACAGTTATAGCATGGAAACAGACTGGTATAAGTAGTACAGTAGTCACCAGTGTGCCA CATTTGCATTAGTAATGCAAAATATACATTTTATAAAGGACAAACTTTGTGTTATGTTTTATTTTCATTACATTGTATAATATTGTAAGA CTATTGTATGTCCTAATTTGCATTATAAATGTTTTTTTCCTACGTAAAGGCATAAATATAGCAACTTTGTATAAAGGTAGCTTATTAGAT TTTTAATTTTTTCTTTTATAAAAAATTGTCCAACAGTGGGACTACCATTGCCAAATTGTATATGAAATATGAATTTTACCCCCATGGTTA ATTTCTTTTATAAACATTCCATATTTCTCTAATAAAAAGACATAAGTGATACTGTACTATGCATACATTGTATCTTAATGCTGTTTCAGA TCAGCATTTTAAATTTTGGTTTGCATTTTTAATATTGGCAAAACGTAACCACTGTTAATTAAAATAAAACCTTGTTGTATATGTAACAAC ATAATTTTCCCTCTATCCCTTCCCACCCTTTGTTCTCTATTTCTCCCTATCAGTGCCAACTTCATACATTTTGTAGCATGGCAATAAAAT ATAACTTTTACACTGAGGCCGAGTGTGGCTTTTTGGAGGAAGTGGGGATGGGACGATTGCCCTCTAGTTGTCCTTTGCATATGACTGTTT TTTGCCATATAAGCCATGTCATCAGGCATGAAAAGTTTTCTCATATATGATGTAAACTTGCTTTTAAGGACAAGTGTGAATGTGCTTTTT AAGCTTAATTTTTGTCATGACAACTAATTTTTTTTATCTTTGGAGAAGTCAGAGTTCTTTACAATCAAACGTTTATTAACTGGAGTACTT AGAATAAGCTAGTAATTGAATTTAGTTCAAGGGCTAAGCAACACATTTTTAAATCCTTATTTATTGTAGAGTATTAGTATACTGTCCTAC AAATTATGTAAAATATGGTTTAATATTAGATGACTTTGGATTTTGCAATGCCTTACTGTTGTCATTCTAGCATAAATATCCATAATGAGG TACTCAAGTTGATACTGGAAGCTGAGCTGATCATACACTGACCTGAAGCATTCATGAAAAGCTGCTTTATTGAATAAAGTCTGATTGGAG TTCTTTTCATGCTCACTTTCCCCTTATTGCTGAAAGTAGATTGCAATAAAACCCCAATAAAACGTTTGGTCGGATCCAGTTTGCTGACCA GAAGCAAGAATTCAACAAACGTCCCACCAAAATTGGACGTCGCTCTTTGTCTCGTTCCATTTCTCAGTCATCTACTGACAGCTACAGCTC AGCGGCTTCATATACAGATAGCTCTGATGATGAGACATCGCCCAGGGACAAGCAGCAAAAGAACTCTAAGGGAAGCAGTGACTTCTGTGT TAAGAACATCAAACAGGCAGAGTTTGGACGAAGAGAAATTGAAATTGCTGAACAAGAAATGCCTGCATTGATGGCTTTGAGGAAGAGAGC TCAAGGAGAAAAGCCTTTGGCTGGAGCCAAAATCGTGGGTTGCACACACATCACTGCTCAGACTGCTGTGCTTATGGAAACTCTGGGTGC TCTGGGGGCCCAGTGCCGATGGGCTGCCTGCAACATCTATTCCACTCTCAATGAAGTGGCTGCTGCTCTAGCAGAAAGTGGATTTCCTGT TTTTGCCTGGAAGGGAGAGTCAGAAGATGACTTTTGGTGGTGTATCGATAGATGTGTGAATGTGGAGGGCTGGCAGCCAAACATGATCTT GGATGATGGAGGGGATCTTACCCACTGGATTTATAAAAAGTATCCCAACATGTTTAAGAAAATCAAGGGCATAGTAGAGGAGAGTGTTAC TGGAGTTCACAGGCTGTACCAACTGTCCAAAGCTGGGAAGCTGTGTGTTCCAGCCATGAATGTCAATGACTCAGTCACCAAACAGAAATT TGACAACCTCTACTGTTGCCGTGAATCAATTCTTGATGGACTTAAAAGGACAACAGACATGATGTTTGGTGGAAAGCAAGTGGTAGTCTG TGGCTATGGAGAGGTGGGGAAAGGGTGCTGTGCTGCCCTGAAAGCCATGGGCTCCATTGTGTATGTAACTGAAATTGACCCCATCTGTGC CCTGCAAGCCTGTATGGATGGATTTCGACTGGTGAAATTAAATGAGGTCATCCGACAAGTGGACATTGTTATTACCTGTACAGGTAACAA GAATGTGGTAACCAGAGAGCACTTGGACCGTATGAAGAATAGCTGCATCGTTTGTAACATGGGACATTCCAACACAGAGATTGACGTGGC GAGTCTGCGGACACCAGAACTGACCTGGGAGCGAGTGAGATCTCAAGTTGACCATGTGATATGGCCTGATGGCAAGAGGATAGTACTGCT GGCAGAGGGCCGCCTGCTGAACCTTAGCTGCTCCACAGTGCCTACATTTGTGCTCTCAATCACTGCTACTACTCAGGCTCTTGCCTTGAT AGAGCTTTACAATGCTCCTGAGGGTCGCTATAAGCAGGATGTCTACCTGTTGCCCAAGAAGATGGATGAGTATGTGGCCAGCCTACACCT GCCTACCTTTGATGCCCACTTGACAGAGCTGACAGATGAACAGGCCAAGTATCTGGGACTCAACAAGAATGGGCCCTTCAAGCCTAATTA CTACAGGTATTAAGTTCCTGTAACTCAAACCAGAATTTTTAAGGAATAGAACTCCAAGCCTTTTCTCCACTACTATACAAGAAAGAATTC |
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FusionGenePPI for FRS2_AHCYL2 |
| Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in . |
| Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
| Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
| FRS2 | PTPN11, INSR, SOS1, GRB2, CBL, FGFR1, CRK, NTRK1, NTRK2, NTRK3, RET, PRKCI, FGFR2, FLOT1, SORBS1, SPRY2, LYN, BECN1, RPS6, TMEM17, GAB1, GAB2, CDH1, TRIM25 | AHCYL2 | BAP1, JOSD2, WDR48, CLK4, CSNK1E, HOXC9, DHX8, UNKL, ZC3H3, DOK4, PITX2, MSL1, VSX2, GRN, RBM23, SYT6, ZNF444, FAM13C, ZBTB44, ANP32B, ANP32E, RPL17, PSMD4, RPS8, XPO1, AHCYL1, PIP4K2A, CAMKV, ZIC2, FOXK2, HEXIM2, ABCF2, ZNF263, RASL10B, NFKBIL1, PIP4K2C, FOXK1, DUSP11, TGIF2LY, CEP72, HOXB6, FAM19A3, BANP, PIP4K2B, KIF18B, FBXW11, FOXD4, HOXB9, PLCD3, ARRB2, NUAK2, ZNHIT6, EEF1D, CAB39, SNX20, PIP5K1A, ZNF414, C4orf26, CLK3, WDR33, PDCD2L, ARSI, JUN, SOST, PTPN21 |
| - Retained PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
| - Lost PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
| - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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RelatedDrugs for FRS2_AHCYL2 |
| Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02) |
| Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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RelatedDiseases for FRS2_AHCYL2 |
| Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
| Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
| Tgene | AHCYL2 | C0033578 | Prostatic Neoplasms | 1 | CTD_human |
Copyright 2018-Present -The University of Texas Health Science Center at Houston (UTHealth)
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