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Fusion gene ID: 39817

FusionGeneSummary for TSPAN14_TSPAN14

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: TSPAN14_TSPAN14
Fusion gene ID: 39817
HgeneTgene
Gene symbol

TSPAN14

TSPAN14

Gene ID

81619

81619

Gene nametetraspanin 14tetraspanin 14
SynonymsDC-TM4F2|TM4SF14DC-TM4F2|TM4SF14
Cytomap

10q23.1

10q23.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptiontetraspanin-14tetraspanin similar to TM4SF9transmembrane 4 superfamily member 14tspan-14tetraspanin-14tetraspanin similar to TM4SF9transmembrane 4 superfamily member 14tspan-14
Modification date2018052320180523
UniProtAcc

Q8NG11

Q8NG11

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000429989, ENST00000481124, 
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ENST00000341863, ENST00000372156, 
ENST00000265450, 
ENST00000429989, 
ENST00000481124, ENST00000372164, 
ENST00000372158, ENST00000341863, 
ENST00000372156, ENST00000265450, 
Fusion gene scores* DoF score8 X 6 X 5=2407 X 8 X 2=112
# samples 98
** MAII scorelog2(9/240*10)=-1.41503749927884
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(8/112*10)=-0.485426827170242
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: TSPAN14 [Title/Abstract] AND TSPAN14 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID

check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChiTaRS3.1AA343945TSPAN14chr10

82278647

+TSPAN14chr10

82278428

+
ChiTaRS3.1BF754904TSPAN14chr10

82280276

-TSPAN14chr10

82280987

-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
3UTR-3UTRENST00000429989ENST00000429989TSPAN14chr10

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+
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+
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+
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FusionProtFeatures for TSPAN14_TSPAN14


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
TSPAN14

Q8NG11

TSPAN14

Q8NG11