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Fusion gene ID: 15427

FusionGeneSummary for GRIK2_EYS

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: GRIK2_EYS
Fusion gene ID: 15427
HgeneTgene
Gene symbol

GRIK2

EYS

Gene ID

2901

346007

Gene nameglutamate ionotropic receptor kainate type subunit 5eyes shut homolog (Drosophila)
SynonymsEAA2|GRIK2|GluK5|KA2C6orf178|C6orf179|C6orf180|EGFL10|EGFL11|RP25|SPAM|bA166P24.2|bA307F22.3|bA74E24.1|dJ1018A4.2|dJ22I17.2|dJ303F19.1
Cytomap

19q13.2

6q12

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionglutamate receptor ionotropic, kainate 5excitatory amino acid receptor 2glutamate receptor KA2protein eyes shut homologEGF-like-domain, multiple 10EGF-like-domain, multiple 11epidermal growth factor-like protein 10epidermal growth factor-like protein 11protein spacemaker homolog
Modification date2018052320180519
UniProtAcc

Q13002

Q5T1H1

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000413795, ENST00000369138, 
ENST00000421544, ENST00000358361, 
ENST00000318991, ENST00000369137, 
ENST00000369134, 		ENST00000503581, 
ENST00000370621, ENST00000370616, 
ENST00000393380, ENST00000342421, 
ENST00000370618, ENST00000486069, 
Fusion gene scores* DoF score7 X 3 X 4=8426 X 15 X 12=4680
# samples 627
** MAII scorelog2(6/84*10)=-0.485426827170242
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0		log2(27/4680*10)=-4.11547721741994
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: GRIK2 [Title/Abstract] AND EYS [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID

check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVLGGTCGA-TM-A7CF-01AGRIK2chr6

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+EYSchr6

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-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000413795ENST00000503581GRIK2chr6

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In-frameENST00000413795ENST00000370621GRIK2chr6

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In-frameENST00000413795ENST00000370616GRIK2chr6

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In-frameENST00000318991ENST00000370616GRIK2chr6

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5CDS-intronENST00000318991ENST00000393380GRIK2chr6

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5CDS-intronENST00000318991ENST00000342421GRIK2chr6

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5CDS-intronENST00000318991ENST00000370618GRIK2chr6

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-
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In-frameENST00000369137ENST00000370616GRIK2chr6

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5CDS-intronENST00000369137ENST00000393380GRIK2chr6

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5CDS-intronENST00000369137ENST00000342421GRIK2chr6

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5CDS-intronENST00000369137ENST00000486069GRIK2chr6

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intron-3CDSENST00000369134ENST00000370621GRIK2chr6

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intron-3CDSENST00000369134ENST00000370616GRIK2chr6

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intron-intronENST00000369134ENST00000342421GRIK2chr6

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intron-intronENST00000369134ENST00000370618GRIK2chr6

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Top

FusionProtFeatures for GRIK2_EYS


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
GRIK2

Q13002

EYS

Q5T1H1


check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneEYSchr6:101847268chr6:65767620ENST00000342421-091004_1040-111595DomainEGF-like 16%3B calcium-binding
TgeneEYSchr6:101847268chr6:65767620ENST00000342421-091042_1077-111595DomainEGF-like 17
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- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
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FusionGeneSequence for GRIK2_EYS


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
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* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
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GGAACCACACATGTATTAAGATTTGGTACGCAATGTGAAATTGATATAGATGAGTGTGCTTCACATCCCTGCAAAAATGGAGCCACCTGC
ATTGACCAACCTGGTAATTACTTCTGCCAGTGTGTGCCTCCATTTAAAGTGGTTGATGGCTTTTCCTGCTTATGCAATCCAGGCTATGTT
GGGATAAGATGTGAACAGGACATTGATGACTGCATCCTGAATGCCTGTGAGCACAATTCTACCTGCAAAGACCTGCATCTCAGCTACCAG
TGTGTGTGCCTATCTGATTGGGAAGGAAATTTTTGTGAACAAGAATCCAATGAGTGTAAAATGAATCCTTGCAAGAACAATTCCACCTGT
ACTGACCTTTACAAAAGCTATCGATGTGAGTGTACATCTGGATGGACTGGACAGAACTGTAGTGAAGAAATAAATGAATGCGACTCTGAT
CCATGCATGAATGGAGGTCTTTGTCATGAATCTACCATCCCTGGACAATTTGTATGTCTGTGCCCACCCCTTTATACTGGACAATTTTGC
CACCAACGCTATAACCTTTGTGACCTACTTCATAACCCTTGCAGAAACAACTCAACATGCTTAGCTTTGGTAGACGCAAATCAGCATTGT
ATTTGTAGAGAAGAATTTGAAGGTAAAAACTGTGAAATTGATGTGAAAGACTGCCTCTTCCTTTCCTGCCAGGATTATGGTGACTGTGAA
GATATGGTCAACAATTTCAGGTGTATTTGCAGACCTGGGTTTTCTGGATCTCTGTGTGAAATTGAAATTAATGAATGTTCCTCTGAACCT
TGCAAAAATAATGGAACATGTGTGGATCTGACAAACAGATTTTTTTGTAATTGTGAACCTGAGTACCATGGGCCCTTCTGTGAACTTGAT
GTAAATAAATGTAAAATCTCACCTTGTCTAGATGAAGAAAATTGTGTCTACAGGACTGATGGATACAACTGCCTCTGTGCCCCTGGTTAT
ACAGGCATCAACTGTGAAATAAATCTAGATGAATGCCTATCAGAGCCCTGTCTCCATGATGGAGTTTGTATCGATGGCATCAATCATTAT
ACCTGTGACTGCAAGAGTGGGTTTTTTGGAACACACTGTGAAACAAACGCCAATGATTGCCTTTCAAATCCTTGTCTACATGGAAGGTGC
ACAGAACTTATTAATGAATATCCATGTTCATGTGATGCAGATGGGACTAGCACACAATGTAAGATCAAAATTAATGACTGCACATCAATC
CCTTGTATGAATGAAGGCTTCTGTCAGAAGTCAGCACATGGATTTACTTGCATTTGCCCACGTGGATACACTGGTGCATACTGTGAAAAA
AGCATTGATAATTGTGCTGAGCCTGAACTTAATTCAGTCATCTGTCTTAATGGAGGGATCTGTGTTGATGGGCCTGGACATACTTTTGAC
TGCAGATGTCTTCCTGGATTTTCTGGTCAATTTTGTGAAATTAATATAAATGAATGCTCTTCATCACCATGTCTACATGGTGCAGACTGT
GAAGATCACATCAATGGATATGTTTGCAAATGCCAACCAGGATGGTCTGGACACCACTGTGAGAATGAGCTTGAGTGCATTCCCAACTCA
TGTGTTCATGAACTCTGCATGGAGAATGAACCTGGCTCGACATGTTTATGCACACCTGGATTTATGACCTGCTCCATTGGGCTTCTTTGT
GGTGATGAAATAAGGAGAATTACCTGTTTAACTCCCATCTTTCAAAGAACAGATCCCATTTCCACACAGACATATACAATTCCCCCTTCT
GAGACTTTGGTCAGCAGCTTTCCATCTATAAAGGCTACTAGAATACCAGCCATAATGGACACTTACCCAGTTGATCAAGGTCCAAAACAG
ACAGGCATTGTCAAGCACGACATTCTCCCAACCACTGGTTTGGCAACATTAAGAATTAGCACACCCTTGGAAAGCTACTTACTCCAAGAA
CTGATTGTCACTAGAGAGCTTTCAGCAAAACACAGTCTTCTTTCTTCCGCAGATGTTTCCTCTTCTCGATTCCTGAATTTTGGTATTCGT
GACCCAGCACAAATTGTCCAGGACAAAACATCGGTATCACATATGCCTATTCGAACTTCAGCAGCCACACTAGGTTTCTTTTTTCCTGAT
AGGAGAGCAAGGACCCCATTTATCATGTCTTCCTTAATGTCAGATTTTATTTTTCCTACACAATCTTTATTATTTGAGAACTGTCAGACT
GTTGCTTTATCTGCTACCCCAACGACTTCAGTAATTAGAAGCATTCCAGGGGCTGATATTGAGCTAAACAGGCAGTCATTACTCTCCCGT
GGATTCCTGCTTATAGCTGCCTCCATAAGTGCAACTCCAGTTGTCTCTAGGGGGGCTCAAGAGGATATTGAAGAATATTCAGCTGATTCT
TTAATTTCAAGAAGAGAGCACTGGAGATTGCTCAGCCCCTCGATGTCTCCCATTTTTCCTGCTAAGGTAATTATATCTAAACAGGTAACC
ATCTTAAACTCATCAGCTCTGCACCGGTTCAGTACAAAAGCCTTCAATCCCAGTGAATATCAGGCTATTACTGAGGCTTCAAGCAACCAG
AGACTCACAAACATCAAATCACAGGCTGCTGATTCTTTAAGAGAATTAAGCCAAACATGTGCAACATGTTCTATGACTGAAATAAAATCC
TCTCGTGAATTCTCAGATCAAGTTTTGCATAGCAAACAGTCCCACTTTTATGAGACATTCTGGATGAACTCAGCGATATTAGCCAGCTGG
TATGCACTAATGGGAGCTCAAACTATCACTTCTGGGCATTCATTTTCTTCTGCTACTGAAATAACACCATCAGTGGCATTCACAGAAGTG
CCATCTTTATTTCCTTCTAAAAAGAGTGCAAAAAGAACAATTTTATCCTCATCCTTGGAAGAATCCATTACCCTATCAAGTAATTTGGAT
GTTAATTTATGTTTGGATAAGACTTGTTTATCCATTGTCCCTTCACAAACTATCTCTTCAGACTTGATGAATTCTGATTTGACTTCAAAA
ATGACTACTGATGAACTGTCAGTATCAGAAAACATTTTAAAACTATTGAAAATAAGACAATATGGCATAACTATGGGACCCACTGAGGTA
CTAAATCAAGAGAGCTTATTGGACATGGAAAAAAGTAAAGGATCTCATACACTGTTCAAACTTCACCCAAGTGATAGTTCTCTGGATTTT
GAGTTAAACTTACAAATTTATCCGGATGTTACTTTAAAGACATATTCAGAAATTACACATGCAAATGACTTCAAAAATAATCTGCCACCA
TTGACAGGCTCAGTGCCTGATTTTTCAGAAGTCACCACCAATGTTGCATTTTATACAGTTTCAGCAACTCCAGCACTTTCAATACAGACG
TCTTCCTCCATGTCTGTAATTAGGCCAGATTGGCCATATTTTACAGATTATATGACCTCTCTTAAAAAAGAGGTCAAGACTTCTTCAGAA
TGGTCCAAATGGGAACTTCAGCCTAGTGTGCAATATCAGGAATTTCCCACTGCAAGCCGGCATCTTCCCTTCACTAGATCTCTTACTTTG
TCTTCACTGGAATCCATTCTGGCACCTCAACGGCTGATGATTTCTGATTTCAGTTGTGTTCGTTATTATGGAGATTCTTATCTAGAATTT
CAGAATGTGGCTTTAAATCCACAAAATAACATCTCCCTAGAATTTCAGACCTTCAGCTCCTATGGACTTCTGCTGTATGTCAAGCAAGAC
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AAAAGCATTAATACTACTGTTAGAGTGGACAACGGGCAAAAGTATACACTGCTTATCAGGCAAGAATTGGATCCATGTAACGCTGAGCTG
ACTATTTTAGGGAGGAATACACAAATATGCGAATCTATCAATCATGTACTCGGAAAACCCCTGCCAAAATCAGGATCTGTCTTCATTGGT
GGATTTCCAGACCTTCATGGGAAAATCCAGATGCCTGTACCAGTCAAGAATTTTACTGGCTGCATAGAAGTTATAGAAATAAATAACTGG
AGATCTTTCATTCCATCCAAGGCAGTGAAAAACTATCACATTAACAATTGCAGATCCCAGGGATTTATGCTGTCTCCAACAGCCTCCTTT
GTTGATGCTTCTGATGTGACACAAGGGGTTGATACCATGTGGACTTCTGTCAGCCCCTCTGTTGCAGCACCCTCTGTGTGCCAGCAGGAT
GTATGCCACAATGGAGGCACATGCCATGCCATCTTCCTCTCCAGTGGCATAGTGTCATTCCAATGTGACTGTCCACTACATTTCACTGGC
CGCTTCTGTGAAAAAGATGCAGGTTTATTCTTTCCATCTTTCAATGGGAATTCCTATTTAGAACTGCCCTTTTTGAAGTTTGTCCTGGAG
AAGGAACATAACAGAACTGTTACCATCTACTTGACTATAAAAACAAACAGTTTAAATGGAACTATTCTTTACAGTAATGGGAATAATTGT
GGAAAGCAGTTTCTTCATTTATTTCTTGTGGAAGGAAGGCCATCAGTTAAATATGGGTGTGGAAATTCTCAAAATATTTTGACTGTTTCT
GCTAATTACAGCATTAACACAAATGCATTCACCCCTATCACAATACGCTACACAACGCCTGTTGGCAGCCCTGGAGTTGTTTGTATGATT
GAAATGACTGCAGATGGAAAACCTCCAGTACAGAAGAAAGACACAGAGATTTCCCATGCCTCTCAGGCATATTTTGAATCAATGTTCCTT
GGCCATATTCCTGCAAATGTTCAAATTCATAAGAAAGCAGGTCCTGTTTATGGGTTCAGGGGCTGCATTCTAGACCTTCAAGTAAACAAC
AAAGAATTCTTCATCATCGATGAAGCACGACATGGAAAGAATATTGAGAACTGCCACGTCCCTTGGTGTGCTCATCATCTGTGCCGCAAC
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AACAACCCATGTGGAAATGGTGCCACCTGTGTTCCAAAATCCGGAACAGATATTGTCTGCCTCTGCCCATATGGGAGGTCTGGACCCCTC
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ATGAAGATTATTTTCCCGATTCTAAGTAATCCAGTCTTCAGGCGCACCGTTAAACTCCTGCTCTGTTTACTGTGGATTGGATATTCTCAA
GGAACCACACATGTATTAAGATTTGGTACGCAATGTGAAATTGATATAGATGAGTGTGCTTCACATCCCTGCAAAAATGGAGCCACCTGC
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ATGACTACTGATGAACTGTCAGTATCAGAAAACATTTTAAAACTATTGAAAATAAGACAATATGGCATAACTATGGGACCCACTGAGGTA
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CAGTGAATATCAGGCTATTACTGAGGCTTCAAGCAACCAGAGACTCACAAACATCAAATCACAGGCTGCTGATTCTTTAAGAGAATTAAG
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TGCTACTGAAATAACACCATCAGTGGCATTCACAGAAGTGCCATCTTTATTTCCTTCTAAAAAGAGTGCAAAAAGAACAATTTTATCCTC
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TTATACAGTTTCAGCAACTCCAGCACTTTCAATACAGACGTCTTCCTCCATGTCTGTAATTAGGCCAGATTGGCCATATTTTACAGATTA
TATGACCTCTCTTAAAAAAGAGGTCAAGACTTCTTCAGAATGGTCCAAATGGGAACTTCAGCCTAGTGTGCAATATCAGGAATTTCCCAC
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CAGTTGTGTTCGTTATTATGGAGATTCTTATCTAGAATTTCAGAATGTGGCTTTAAATCCACAAAATAACATCTCCCTAGAATTTCAGAC
CTTCAGCTCCTATGGACTTCTGCTGTATGTCAAGCAAGACTCAAATTTAGTAGATGGATTTTTTATTCAATTGTTTATTGAAAATGGTAC
TTTAAAGTACCACTTTTACTGTCCTGGTGAAGCAAAATTTAAAAGCATTAATACTACTGTTAGAGTGGACAACGGGCAAAAGTATACACT
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CAGCCCCTCTGTTGCAGCACCCTCTGTGTGCCAGCAGGATGTATGCCACAATGGAGGCACATGCCATGCCATCTTCCTCTCCAGTGGCAT
AGTGTCATTCCAATGTGACTGTCCACTACATTTCACTGGCCGCTTCTGTGAAAAAGATGCAGGTTTATTCTTTCCATCTTTCAATGGGAA
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TTGCTTATTCACTTTTTACCTATCCCTAATGCTTACATTTTAAAATCAACGTGTAAACACAATTTTAAAAATCAATGTGTAAGCTGAACT
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CACACAATGTAAGATCAAAATTAATGACTGCACATCAATCCCTTGTATGAATGAAGGCTTCTGTCAGAAGTCAGCACATGGATTTACTTG
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CACACCTGGATTTATGACCTGCTCCATTGGGCTTCTTTGTGGTGATGAAATAAGGAGAATTACCTGTTTAACTCCCATCTTTCAAAGAAC
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CAGCACTGCAAAATAACTTGATATTTTTTACTGGACAGAAAGGCCATGGGTTGAATGGCGATGACTTCCTGGCTGTGGGCCTGCTCAATG
GCAGTGTGGTTTATAGTTATAACCTGGGGTCTGGCATAGCAAGCATCAGGAGCGAGCCCCTCAATCTGAGCCTTGGAGTCCACACTGTTC
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GCAGAAATGGAGGTGAATGTACAGTAAATGGCACAACTTTTTCTTGCAGATGTTTGCCAGATTGGGCTGGAAATACATGTAACCAGTCTG
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TGGGAAGGTATTGTGAAAACAAAACTTCATTTTCAACTGCAAAATTTATGGGTAATTCTTACATTAAATACATTGATCCAAATTATAGAA
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AAGAAAATGATTTTCTGGCAATTGGTCTCCATAATCAGACCTTGAAAATAGCAGTTAACTTGGGAGAAAGAATCTCTGTGCCTATGAGCT
ATAACAATGGCACATTCTGTTGTAATAAATGGCACCATGTAGTTGTAATTCAAAATCAGACTCTTATCAAGGCCTACATAAATAACAGTC
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GAAAGGTAAATATCGTTACTCAAGAGATTTTTAAAACCAATTTTGTTGGCAAAATTAAAGATGTTGTATTTTTTCAGGAACCAAAAAACA

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TGTGTGTGCCTATCTGATTGGGAAGGAAATTTTTGTGAACAAGAATCCAATGAGTGTAAAATGAATCCTTGCAAGAACAATTCCACCTGT
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CCATGCATGAATGGAGGTCTTTGTCATGAATCTACCATCCCTGGACAATTTGTATGTCTGTGCCCACCCCTTTATACTGGACAATTTTGC
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ATTTGTAGAGAAGAATTTGAAGGTAAAAACTGTGAAATTGATGTGAAAGACTGCCTCTTCCTTTCCTGCCAGGATTATGGTGACTGTGAA
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TGCAAAAATAATGGAACATGTGTGGATCTGACAAACAGATTTTTTTGTAATTGTGAACCTGAGTACCATGGGCCCTTCTGTGAACTTGAT
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CCTTGTATGAATGAAGGCTTCTGTCAGAAGTCAGCACATGGATTTACTTGCATTTGCCCACGTGGATACACTGGTGCATACTGTGAAAAA
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AGGAGAGCAAGGACCCCATTTATCATGTCTTCCTTAATGTCAGATTTTATTTTTCCTACACAATCTTTATTATTTGAGAACTGTCAGACT
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GGATTCCTGCTTATAGCTGCCTCCATAAGTGCAACTCCAGTTGTCTCTAGGGGGGCTCAAGAGGATATTGAAGAATATTCAGCTGATTCT
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AGACTCACAAACATCAAATCACAGGCTGCTGATTCTTTAAGAGAATTAAGCCAAACATGTGCAACATGTTCTATGACTGAAATAAAATCC
TCTCGTGAATTCTCAGATCAAGTTTTGCATAGCAAACAGTCCCACTTTTATGAGACATTCTGGATGAACTCAGCGATATTAGCCAGCTGG
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GAAAAGGCCTCCACTAAAATGAGTTCTCTGGACACAAATACAGACTTCTATATTGGAGGAGTATCTTCTTTAAATCTTGTAAATCCCATG
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AAAGGTGGCTCAAATGTAGGTGACTGTGATGGGACAGCCTGTGGGTACAACACATGCAGAAATGGAGGTGAATGTACAGTAAATGGCACA
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AGCATTGATAATTGTGCTGAGCCTGAACTTAATTCAGTCATCTGTCTTAATGGAGGGATCTGTGTTGATGGGCCTGGACATACTTTTGAC
TGCAGATGTCTTCCTGGATTTTCTGGTCAATTTTGTGAAATTAATATAAATGAATGCTCTTCATCACCATGTCTACATGGTGCAGACTGT
GAAGATCACATCAATGGATATGTTTGCAAATGCCAACCAGGATGGTCTGGACACCACTGTGAGAATGAGCTTGAGTGCATTCCCAACTCA
TGTGTTCATGAACTCTGCATGGAGAATGAACCTGGCTCGACATGTTTATGCACACCTGGATTTATGACCTGCTCCATTGGGCTTCTTTGT
GGTGATGAAATAAGGAGAATTACCTGTTTAACTCCCATCTTTCAAAGAACAGATCCCATTTCCACACAGACATATACAATTCCCCCTTCT
GAGACTTTGGTCAGCAGCTTTCCATCTATAAAGGCTACTAGAATACCAGCCATAATGGACACTTACCCAGTTGATCAAGGTCCAAAACAG
ACAGGCATTGTCAAGCACGACATTCTCCCAACCACTGGTTTGGCAACATTAAGAATTAGCACACCCTTGGAAAGCTACTTACTCCAAGAA
CTGATTGTCACTAGAGAGCTTTCAGCAAAACACAGTCTTCTTTCTTCCGCAGATGTTTCCTCTTCTCGATTCCTGAATTTTGGTATTCGT
GACCCAGCACAAATTGTCCAGGACAAAACATCGGTATCACATATGCCTATTCGAACTTCAGCAGCCACACTAGGTTTCTTTTTTCCTGAT
AGGAGAGCAAGGACCCCATTTATCATGTCTTCCTTAATGTCAGATTTTATTTTTCCTACACAATCTTTATTATTTGAGAACTGTCAGACT
GTTGCTTTATCTGCTACCCCAACGACTTCAGTAATTAGAAGCATTCCAGGGGCTGATATTGAGCTAAACAGGCAGTCATTACTCTCCCGT
GGATTCCTGCTTATAGCTGCCTCCATAAGTGCAACTCCAGTTGTCTCTAGGGGGGCTCAAGAGGATATTGAAGAATATTCAGCTGATTCT
TTAATTTCAAGAAGAGAGCACTGGAGATTGCTCAGCCCCTCGATGTCTCCCATTTTTCCTGCTAAGGTAATTATATCTAAACAGGTAACC
ATCTTAAACTCATCAGCTCTGCACCGGTTCAGTACAAAAGCCTTCAATCCCAGTGAATATCAGGCTATTACTGAGGCTTCAAGCAACCAG
AGACTCACAAACATCAAATCACAGGCTGCTGATTCTTTAAGAGAATTAAGCCAAACATGTGCAACATGTTCTATGACTGAAATAAAATCC
TCTCGTGAATTCTCAGATCAAGTTTTGCATAGCAAACAGTCCCACTTTTATGAGACATTCTGGATGAACTCAGCGATATTAGCCAGCTGG
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CCATCTTTATTTCCTTCTAAAAAGAGTGCAAAAAGAACAATTTTATCCTCATCCTTGGAAGAATCCATTACCCTATCAAGTAATTTGGAT
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TGGTCCAAATGGGAACTTCAGCCTAGTGTGCAATATCAGGAATTTCCCACTGCAAGCCGGCATCTTCCCTTCACTAGATCTCTTACTTTG
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CAGAATGTGGCTTTAAATCCACAAAATAACATCTCCCTAGAATTTCAGACCTTCAGCTCCTATGGACTTCTGCTGTATGTCAAGCAAGAC
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TGCACTGATGCTATTAATATTACTCAGCCAAGGTTCAGTGGCACAGATGCCTTTGGATACACCTCATTCCTGGCTTATTCACGGATCTCA
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GATTTTTTATGCATCTCTTTAGTAAATAGTTCCGTTCAACTTCGCTACAACCTTGGCGACAGAACTATCATTCTAGAAACTCTCCAAAAA
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ACTGCAAAATTTATGGGTAATTCTTACATTAAATACATTGATCCAAATTATAGAATGAGAAACCTCCAGTTCACTACTATATCCTTAAAT
TTCAGTACCACTAAAACAGAAGGTCTAATTGTATGGATGGGAATAGCTCAAAATGAAGAAAATGATTTTCTGGCAATTGGTCTCCATAAT
CAGACCTTGAAAATAGCAGTTAACTTGGGAGAAAGAATCTCTGTGCCTATGAGCTATAACAATGGCACATTCTGTTGTAATAAATGGCAC
CATGTAGTTGTAATTCAAAATCAGACTCTTATCAAGGCCTACATAAATAACAGTCTAATTCTTTCCGAGGATATTGATCCACATAAAAAC
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ACCAATTTTGTTGGCAAAATTAAAGATGTTGTATTTTTTCAGGAACCAAAAAACATTGAACTAATTAAATTAGAAGGATACAATGTTTAT


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FusionGenePPI for GRIK2_EYS


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
GRIK2SDCBP, PICK1, DLG4, GRIP1, GRID2, DLG1, DLG3, GRIK5, GRIA1, GRIA2, CALCOCO1, TRIM25, PARK2EYSEGFR


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for GRIK2_EYS


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status
HgeneGRIK2Q13002DB00849MethylphenobarbitalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved
HgeneGRIK2Q13002DB01354HeptabarbitalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved
HgeneGRIK2Q13002DB01355HexobarbitalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved
HgeneGRIK2Q13002DB00306TalbutalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|illicit
HgeneGRIK2Q13002DB01351AmobarbitalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|illicit
HgeneGRIK2Q13002DB01352AprobarbitalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|illicit
HgeneGRIK2Q13002DB01353ButethalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|illicit
HgeneGRIK2Q13002DB01174PhenobarbitalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|investigational
HgeneGRIK2Q13002DB00312PentobarbitalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|investigational|vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00142Glutamic AcidGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|nutraceutical
HgeneGRIK2Q13002DB00418SecobarbitalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00599ThiopentalGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|vet_approved
HgeneGRIK2Q13002DB00794PrimidoneGlutamate receptor ionotropic, kainate 2small moleculeapproved|vet_approved

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RelatedDiseases for GRIK2_EYS


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneGRIK2C0005586Bipolar Disorder3CTD_human;PSYGENET
HgeneGRIK2C0004352Autistic Disorder2CTD_human
HgeneGRIK2C0033953Psychosexual Disorders1CTD_human
HgeneGRIK2C0036341Schizophrenia1CTD_human
HgeneGRIK2C0236969Substance-Related Disorders1CTD_human
HgeneGRIK2C0525045Mood Disorders1PSYGENET
TgeneEYSC1864446Retinitis Pigmentosa 252CTD_human;UNIPROT
TgeneEYSC0035334Retinitis Pigmentosa1CTD_human;ORPHANET