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Fusion gene ID: 8848

FusionGeneSummary for CTNND1_CTNND1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: CTNND1_CTNND1
Fusion gene ID: 8848
HgeneTgene
Gene symbol

CTNND1

CTNND1

Gene ID

1500

1500

Gene namecatenin delta 1catenin delta 1
SynonymsBCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN)BCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN)
Cytomap

11q12.1

11q12.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptioncatenin delta-1cadherin-associated Src substratecatenin (cadherin-associated protein), delta 1p120 catenincatenin delta-1cadherin-associated Src substratecatenin (cadherin-associated protein), delta 1p120 catenin
Modification date2018052320180523
UniProtAcc

O60716

O60716

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000524630, ENST00000529919, 
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ENST00000361796, ENST00000361391, 
ENST00000530094, ENST00000428599, 
ENST00000361332, ENST00000527467, 
ENST00000415361, ENST00000532245, 
ENST00000532463, ENST00000528232, 
ENST00000529986, ENST00000531014, 
ENST00000358694, ENST00000526772, 
ENST00000532787, ENST00000533667, 
ENST00000529873, ENST00000525902, 
ENST00000529526, ENST00000532649, 
ENST00000426142, ENST00000532844, 
ENST00000528621, ENST00000399050, 
ENST00000526357, ENST00000530748, 
ENST00000534579, ENST00000526938, 
ENST00000524630, ENST00000529919, 
ENST00000399039, ENST00000360682, 
ENST00000361796, ENST00000361391, 
ENST00000530094, ENST00000428599, 
ENST00000361332, ENST00000527467, 
ENST00000415361, ENST00000532245, 
ENST00000532463, ENST00000528232, 
ENST00000529986, ENST00000531014, 
ENST00000358694, ENST00000526772, 
ENST00000532787, ENST00000533667, 
ENST00000529873, ENST00000525902, 
ENST00000529526, ENST00000532649, 
ENST00000426142, ENST00000532844, 
ENST00000528621, ENST00000399050, 
ENST00000526357, ENST00000530748, 
ENST00000534579, ENST00000526938, 
Fusion gene scores* DoF score17 X 11 X 12=22448 X 7 X 5=280
# samples 199
** MAII scorelog2(19/2244*10)=-3.56200135227784
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(9/280*10)=-1.63742992061529
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: CTNND1 [Title/Abstract] AND CTNND1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID

check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChiTaRS3.1AW992887CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
intron-intronENST00000524630ENST00000524630CTNND1chr11

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+
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+
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+CTNND1chr11

57545005

+
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+CTNND1chr11

57545005

+
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+CTNND1chr11

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intron-intronENST00000534579ENST00000529873CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000525902CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000529526CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000532649CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000426142CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000532844CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000528621CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000399050CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000526357CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000530748CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000534579CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000534579ENST00000526938CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000524630CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000529919CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000399039CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000360682CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000361796CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000361391CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000530094CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000428599CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000361332CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000527467CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000415361CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000532245CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000532463CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000528232CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000529986CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000531014CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000358694CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000526772CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000532787CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000533667CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000529873CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000525902CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000529526CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000532649CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000426142CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000532844CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000528621CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000399050CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000526357CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000530748CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000534579CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+
intron-intronENST00000526938ENST00000526938CTNND1chr11

57550469

+CTNND1chr11

57545005

+

Top

FusionProtFeatures for CTNND1_CTNND1


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
CTNND1

O60716

CTNND1

O60716


check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note


Top

FusionGeneSequence for CTNND1_CTNND1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.

* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).

* Fusion transcript sequences (Full-length transcript).

Top

FusionGenePPI for CTNND1_CTNND1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


Top

RelatedDrugs for CTNND1_CTNND1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

Top

RelatedDiseases for CTNND1_CTNND1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource