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Fusion gene ID: 8845

FusionGeneSummary for CTNND1_ARHGEF10L

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: CTNND1_ARHGEF10L
Fusion gene ID: 8845
HgeneTgene
Gene symbol

CTNND1

ARHGEF10L

Gene ID

1500

55160

Gene namecatenin delta 1Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like
SynonymsBCDS2|CAS|CTNND|P120CAS|P120CTN|p120|p120(CAS)|p120(CTN)GrinchGEF
Cytomap

11q12.1

1p36.13

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptioncatenin delta-1cadherin-associated Src substratecatenin (cadherin-associated protein), delta 1p120 cateninrho guanine nucleotide exchange factor 10-like proteinRho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 10-like
Modification date2018052320180523
UniProtAcc

O60716

Q9HCE6

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000524630, ENST00000529919, 
ENST00000399039, ENST00000360682, 
ENST00000361796, ENST00000361391, 
ENST00000530094, ENST00000428599, 
ENST00000361332, ENST00000527467, 
ENST00000415361, ENST00000532245, 
ENST00000532463, ENST00000528232, 
ENST00000529986, ENST00000531014, 
ENST00000358694, ENST00000526772, 
ENST00000532787, ENST00000533667, 
ENST00000529873, ENST00000525902, 
ENST00000529526, ENST00000532649, 
ENST00000426142, ENST00000532844, 
ENST00000528621, ENST00000399050, 
ENST00000526357, ENST00000530748, 
ENST00000534579, ENST00000526938, 
ENST00000434513, ENST00000361221, 
ENST00000452522, ENST00000375415, 
ENST00000375420, ENST00000469726, 
ENST00000375408, ENST00000167825, 
Fusion gene scores* DoF score17 X 11 X 12=22448 X 8 X 3=192
# samples 1910
** MAII scorelog2(19/2244*10)=-3.56200135227784
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(10/192*10)=-0.941106310946431
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: CTNND1 [Title/Abstract] AND ARHGEF10L [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID

check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChiTaRS3.1AI868281CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

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-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
intron-intronENST00000524630ENST00000434513CTNND1chr11

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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
intron-intronENST00000524630ENST00000452522CTNND1chr11

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-ARHGEF10Lchr1

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-
intron-intronENST00000524630ENST00000375415CTNND1chr11

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-ARHGEF10Lchr1

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-
intron-intronENST00000524630ENST00000375420CTNND1chr11

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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
intron-intronENST00000524630ENST00000375408CTNND1chr11

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-ARHGEF10Lchr1

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-
intron-intronENST00000524630ENST00000167825CTNND1chr11

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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-
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-
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-
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-
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-
intron-intronENST00000361796ENST00000469726CTNND1chr11

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-
intron-intronENST00000361796ENST00000375408CTNND1chr11

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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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18018627

-
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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-ARHGEF10Lchr1

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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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-
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-ARHGEF10Lchr1

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intron-intronENST00000415361ENST00000361221CTNND1chr11

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-ARHGEF10Lchr1

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intron-intronENST00000415361ENST00000452522CTNND1chr11

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-ARHGEF10Lchr1

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-
intron-intronENST00000415361ENST00000375415CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000415361ENST00000375420CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000415361ENST00000469726CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000415361ENST00000375408CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000415361ENST00000167825CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000532245ENST00000434513CTNND1chr11

57510433

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18018627

-
intron-intronENST00000426142ENST00000167825CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000532844ENST00000434513CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000532844ENST00000361221CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000532844ENST00000452522CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000532844ENST00000375415CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000532844ENST00000375420CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000532844ENST00000469726CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000532844ENST00000375408CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000532844ENST00000167825CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000528621ENST00000434513CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000528621ENST00000361221CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000528621ENST00000452522CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000528621ENST00000375415CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000528621ENST00000375420CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000528621ENST00000469726CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000528621ENST00000375408CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000528621ENST00000167825CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000399050ENST00000434513CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000399050ENST00000361221CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000399050ENST00000452522CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000399050ENST00000375415CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000399050ENST00000375420CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000399050ENST00000469726CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000399050ENST00000375408CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000399050ENST00000167825CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526357ENST00000434513CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526357ENST00000361221CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526357ENST00000452522CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526357ENST00000375415CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526357ENST00000375420CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526357ENST00000469726CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526357ENST00000375408CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526357ENST00000167825CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000530748ENST00000434513CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000530748ENST00000361221CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000530748ENST00000452522CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000530748ENST00000375415CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000530748ENST00000375420CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000530748ENST00000469726CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000530748ENST00000375408CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000530748ENST00000167825CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000534579ENST00000434513CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000534579ENST00000361221CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000534579ENST00000452522CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000534579ENST00000375415CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000534579ENST00000375420CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000534579ENST00000469726CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000534579ENST00000375408CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000534579ENST00000167825CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526938ENST00000434513CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526938ENST00000361221CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526938ENST00000452522CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526938ENST00000375415CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526938ENST00000375420CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526938ENST00000469726CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526938ENST00000375408CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-
intron-intronENST00000526938ENST00000167825CTNND1chr11

57510433

-ARHGEF10Lchr1

18018627

-

Top

FusionProtFeatures for CTNND1_ARHGEF10L


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
CTNND1

O60716

ARHGEF10L

Q9HCE6


check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note


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FusionGeneSequence for CTNND1_ARHGEF10L


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.

* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).

* Fusion transcript sequences (Full-length transcript).

Top

FusionGenePPI for CTNND1_ARHGEF10L


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for CTNND1_ARHGEF10L


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for CTNND1_ARHGEF10L


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource