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Fusion gene ID: 3968

FusionGeneSummary for BCAS3_SYTL2

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: BCAS3_SYTL2
Fusion gene ID: 3968
HgeneTgene
Gene symbol

BCAS3

SYTL2

Gene ID

54828

54843

Gene nameBCAS3, microtubule associated cell migration factorsynaptotagmin like 2
SynonymsGAOB1|MAABCHR11SYT|EXO4|PPP1R151|SGA72M|SLP2|SLP2A
Cytomap

17q23.2

11q14.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionbreast carcinoma-amplified sequence 3BCAS4/BCAS3 fusionRudhirabreast carcinoma amplified sequence 4/3 fusion proteinmetastasis associated antigen of breast cancerprotein Maab1synaptotagmin-like protein 2breast cancer-associated antigen SGA-72Mchromosome 11 synaptotagminexophilin-4protein phosphatase 1, regulatory subunit 151
Modification date2018052320180523
UniProtAcc

Q9H6U6

Q9HCH5

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000589222, ENST00000407086, 
ENST00000390652, ENST00000408905, 
ENST00000588462, ENST00000585744, 
ENST00000588874, ENST00000585812, 
ENST00000389960, ENST00000316356, 
ENST00000528231, ENST00000527523, 
ENST00000524452, ENST00000359152, 
ENST00000354566, ENST00000525702, 
ENST00000525423, ENST00000529581, 
ENST00000389958, ENST00000533892, 
ENST00000528566, 
Fusion gene scores* DoF score40 X 23 X 15=138004 X 4 X 4=64
# samples 474
** MAII scorelog2(47/13800*10)=-4.87586369998789
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(4/64*10)=-0.678071905112638
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: BCAS3 [Title/Abstract] AND SYTL2 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotationOncogene involved fusion gene, in-frame and retained their domain.
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
HgeneBCAS3

GO:0043085

positive regulation of catalytic activity

17505058

HgeneBCAS3

GO:0045944

positive regulation of transcription by RNA polymerase II

17505058

HgeneBCAS3

GO:0071391

cellular response to estrogen stimulus

17505058

TgeneSYTL2

GO:0006887

exocytosis

18812475

TgeneSYTL2

GO:0006904

vesicle docking involved in exocytosis

18812475

TgeneSYTL2

GO:0010923

negative regulation of phosphatase activity

19389623


check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVSARCTCGA-DX-AB2Q-01ABCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000589222ENST00000389960BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000589222ENST00000316356BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000589222ENST00000528231BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000589222ENST00000527523BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000589222ENST00000524452BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000589222ENST00000359152BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000589222ENST00000354566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
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59161925

+SYTL2chr11

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-
5CDS-5UTRENST00000589222ENST00000525423BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
5CDS-5UTRENST00000589222ENST00000529581BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
5CDS-intronENST00000589222ENST00000389958BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
5CDS-5UTRENST00000589222ENST00000533892BCAS3chr17

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+SYTL2chr11

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-
5CDS-5UTRENST00000589222ENST00000528566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000407086ENST00000389960BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000407086ENST00000316356BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000407086ENST00000528231BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000407086ENST00000527523BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000407086ENST00000524452BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000407086ENST00000359152BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000407086ENST00000354566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
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+SYTL2chr11

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-
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+SYTL2chr11

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-
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+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-intronENST00000407086ENST00000389958BCAS3chr17

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-
5CDS-5UTRENST00000407086ENST00000533892BCAS3chr17

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+SYTL2chr11

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-
5CDS-5UTRENST00000407086ENST00000528566BCAS3chr17

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+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000390652ENST00000389960BCAS3chr17

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+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000390652ENST00000316356BCAS3chr17

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+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000390652ENST00000528231BCAS3chr17

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+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000390652ENST00000527523BCAS3chr17

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+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000390652ENST00000524452BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000390652ENST00000359152BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000390652ENST00000354566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000390652ENST00000525702BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000390652ENST00000525423BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000390652ENST00000529581BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-intronENST00000390652ENST00000389958BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000390652ENST00000533892BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000390652ENST00000528566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000408905ENST00000389960BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000408905ENST00000316356BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000408905ENST00000528231BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000408905ENST00000527523BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000408905ENST00000524452BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
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-
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+SYTL2chr11

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-
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+SYTL2chr11

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-
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+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000408905ENST00000529581BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
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+SYTL2chr11

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-
5CDS-5UTRENST00000408905ENST00000533892BCAS3chr17

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+SYTL2chr11

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-
5CDS-5UTRENST00000408905ENST00000528566BCAS3chr17

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-
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-
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-
In-frameENST00000588462ENST00000528231BCAS3chr17

59161925

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-
In-frameENST00000588462ENST00000527523BCAS3chr17

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+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000588462ENST00000524452BCAS3chr17

59161925

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-
In-frameENST00000588462ENST00000359152BCAS3chr17

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-
In-frameENST00000588462ENST00000354566BCAS3chr17

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-
5CDS-5UTRENST00000588462ENST00000525702BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
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59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000588462ENST00000529581BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
5CDS-intronENST00000588462ENST00000389958BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000588462ENST00000533892BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000588462ENST00000528566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000585744ENST00000389960BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000585744ENST00000316356BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000585744ENST00000528231BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

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-
In-frameENST00000585744ENST00000527523BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
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59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000585744ENST00000359152BCAS3chr17

59161925

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85425550

-
In-frameENST00000585744ENST00000354566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000585744ENST00000525702BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000585744ENST00000525423BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000585744ENST00000529581BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-intronENST00000585744ENST00000389958BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000585744ENST00000533892BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000585744ENST00000528566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000588874ENST00000389960BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000588874ENST00000316356BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000588874ENST00000528231BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000588874ENST00000527523BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000588874ENST00000524452BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000588874ENST00000359152BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
In-frameENST00000588874ENST00000354566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000588874ENST00000525702BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000588874ENST00000525423BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000588874ENST00000529581BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-intronENST00000588874ENST00000389958BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000588874ENST00000533892BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
5CDS-5UTRENST00000588874ENST00000528566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-3CDSENST00000585812ENST00000389960BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-3CDSENST00000585812ENST00000316356BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-3CDSENST00000585812ENST00000528231BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-3CDSENST00000585812ENST00000527523BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-3CDSENST00000585812ENST00000524452BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-3CDSENST00000585812ENST00000359152BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-3CDSENST00000585812ENST00000354566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-5UTRENST00000585812ENST00000525702BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-5UTRENST00000585812ENST00000525423BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-5UTRENST00000585812ENST00000529581BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-intronENST00000585812ENST00000389958BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-5UTRENST00000585812ENST00000533892BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-
intron-5UTRENST00000585812ENST00000528566BCAS3chr17

59161925

+SYTL2chr11

85425550

-

Top

FusionProtFeatures for BCAS3_SYTL2


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
BCAS3

Q9H6U6

SYTL2

Q9HCH5


check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000316356-919579_619539936Compositional biasNote=Ser-rich
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000389958-09579_619-126366Compositional biasNote=Ser-rich
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000389960-1019579_619554911Compositional biasNote=Ser-rich
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000524452-918579_619554911Compositional biasNote=Ser-rich
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000525702-09579_619-230377Compositional biasNote=Ser-rich
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000527523-919579_619506903Compositional biasNote=Ser-rich
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TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000529581-212579_619-20377Compositional biasNote=Ser-rich
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TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000389960-1019778_880554911DomainC2 2
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000524452-918629_733554911DomainC2 1
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000524452-918778_880554911DomainC2 2
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000525702-091_57-230377DomainRabBD
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TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000533892-2111_57-20337DomainRabBD
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000533892-211629_733-20337DomainC2 1
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000533892-211778_880-20337DomainC2 2

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000354566-313579_6198761273Compositional biasNote=Ser-rich
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000525423-212579_6198601257Compositional biasNote=Ser-rich
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000316356-9191_57539936DomainRabBD
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000354566-3131_578761273DomainRabBD
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000354566-313629_7338761273DomainC2 1
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000354566-313778_8808761273DomainC2 2
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000389960-10191_57554911DomainRabBD
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000524452-9181_57554911DomainRabBD
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000525423-2121_578601257DomainRabBD
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000525423-212629_7338601257DomainC2 1
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000525423-212778_8808601257DomainC2 2
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000527523-9191_57506903DomainRabBD
TgeneSYTL2chr17:59161925chr11:85425550ENST00000528231-8181_57538935DomainRabBD


Top

FusionGeneSequence for BCAS3_SYTL2


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
>In-frame_BCAS3_ENST00000589222_chr17_59161925_+_SYTL2_ENST00000389960_chr11_85425550_-_1165aa
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>In-frame_BCAS3_ENST00000589222_chr17_59161925_+_SYTL2_ENST00000316356_chr11_85425550_-_1205aa
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>In-frame_BCAS3_ENST00000589222_chr17_59161925_+_SYTL2_ENST00000528231_chr11_85425550_-_1205aa
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>In-frame_BCAS3_ENST00000589222_chr17_59161925_+_SYTL2_ENST00000527523_chr11_85425550_-_1205aa
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* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
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TCCTACATGGAAAGTGTTGTGACTTTTCTGCAGGATGTTGTGCCACAGGCTTACAGTGGAACACCTCTAACAGAAGAAAAGGAGAAAATA
GTCTGGGTCAGATTTGAAAATGCAGATTTAAATGATACATCAAGAAATCTGGAATTTCATGAAATACATAGTACTGGGAATGAACCGCCT
TTGTTGATTATGATTGGCTACAGTGATGGAATGCAGGTCTGGAGCATCCCTATCAGTGGTGAAGCACAAGAGCTCTTCTCTGTTCGACAT
GGCCCAATTCGAGCGGCTAGAATCTTGCCTGCTCCACAGTTTGGTGCTCAAAAATGTGATAACTTTGCTGAAAAAAGACCCCTCCTTGGT
GTTTGTAAGAGCATTGGATCTTCTGGCACAAGCCCACCGTACTGTTGTGTGGATCTGTATTCACTTCGTACTGGGGAGATGGTCAAGTCC
ATTCAATTTAAGACACCTATTTATGATCTCCATTGCAATAAACGGATCCTTGTCGTAGTCTTGCAGGAGAAAATTGCTGCCTTTGATAGC
TGTACTTTCACGAAGAAATTCTTTGTTACAAGCTGCTATCCATGTCCAGGGCCAAACATGAATCCTATTGCTCTTGGGAGCCGCTGGCTT
GCTTATGCAGAAAACAAGTTGATTCGATGTCATCAGTCCCGTGGTGGAGCCTGTGGAGACAACATTCAGTCTTATACTGCCACAGTCATT
AGTGCTGCTAAAACATTGAAAAGTGGCCTGACAATGGTAGGGAAAGTGGTGACTCAGCTGACAGGCACACTGCCTTCAGGTGTGACAGAA
GATGATGTTGCCATCCACAGTAATTCACGGCGGAGTCCTTTGGTCCCAGGCATCATCACAGTTATTGACACCGAAACCGTTGGAGAGGGC
CAGGTGCTTGTGAGTGAGGATTCTGACAGTGATGGCATTGTGGCCCACTTCCCTGCCCATGAGAAGCCAGTGTGCTGCATGGCTTTTAAT
ACAAGTGGAATGCTTCTAGTCACAACAGACACCCTTGGCCATGACTTTCATGTCTTCCAAATTCTGACTCATCCTTGGTCCTCATCACAA
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GTGGTCAGTACTCTCCGGGGTACTTCCCACGTTTTCCCCATCAACCCTTATGGTGGCCAGCCTTGTGTTCGTACACATATGTCACCACGA
GTAGTGAATCGCATGAGCCGTTTCCAGAAAAGTGCTGGACTGGAAGAGATTGAACAAGAACTGACGTCTAAGCAAGGAGGTCGCTGTAGC
CCTGTTCCAGGTCTATCAAGCAGCCCTTCTGGGTCACCCTTGCATGGGAAACTGAACAGCCAAGACTCCTATAACAATTTTACCAACAAC
AACCCTGGCAACCCTCGGCTCTCTCCTCTTCCCAGCTTGATGGTAGTGATGCCTCTTGCACAAATCAAGCAGCCAATGACATTGGGGACC
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GGAACATCCAGGTCATGGTTTGCAAATAATGCAGGTCTGAAAAGAGAAAAAGATCAGTCCAAACAAGTTGTAGTTGAGTCCCTGTACATT
ATCAGTTGCTATGGCACCTTAGTGGAACACATGATGGAGCCGCGACCCCTCAGCACTGCACCCAAGATTAGTGACGACACACCACTGGAA
ATGATGACATCGCCTCGAGCCAGCTGGACTCTGGTTAGAACCCCTCAATGGAATGAATTGCAGCCACCGTTTAATGCAAACCACCCTCTG
CTCCTCGCTGCAGATGCAGTACAGTATTATCAGTTCCTGCTTGCTGGCCTGGTTCCCCCTGGAAGTCCTGGGCCCATTACTCGACATGGG
TCTTACGACAGTTTAGCTTCTGACCATAGTGGACAGGAAGATGAAGAATGGCTTTCCCAGGTTGAAATTGTAACACACACTGGACCCCAT
AGACGTCTGTGGATGGGTCCACAGTTCCAGTTCAAAACCATCCATCCCTCAGGCCAAACCACAGTTATCTCATCCAGTTCATCTGTGTTG
CAGTCTCATGGTCCGAGTGACACGCCACAGCCTCTTTTGGATTTTGATACAGATGATCTTGATCTCAACAGTCTCAGGATCCAGCCAGTC
CGCTCTGACCCCGTCAGCATGCCAGGGTCATCCCGTCCAGTCTCTGATCGAAGGGGAGTTTCCACAGTGATTGATGCTGCCTCAGTTTCC
ACAGTGCCTACACAACCTGATAATCCATTTTCTCACCCTGACAAACTCAAAAGGATGAGCAAGTCTGTTCCAGCATTTCTCCAAGATGAG
GTGAGTGGCAGTGTGATGAGTGTTTATAGTGGAGACTTTGGCAATCTGGAAGTTAAAGGAAATATTCAGTTTGCAATTGAATATGTGGAG
TCACTGAAGGAGTTGCATGTTTTTGTGGCCCAGTGTAAGGACTTAGCAGCAGCGGATGTAAAAAAACAGCGTTCAGACCCATATGTAAAG
GCCTATTTGCTACCAGACAAAGGCAAAATGGGCAAGAAGAAAACACTCGTAGTGAAGAAAACCTTGAATCCTGTGTATAACGAAATACTG
CGGTATAAAATTGAAAAACAAATCTTAAAGACACAGAAATTGAACCTGTCCATTTGGCATCGGGATACATTTAAGCGCAATAGTTTCCTA
GGGGAGGTGGAACTTGATTTGGAAACATGGGACTGGGATAACAAACAGAATAAACAATTGAGATGGTACCCTCTGAAGCGGAAGACAGCA
CCAGTTGCCCTTGAAGCAGAAAACAGAGGTGAAATGAAACTAGCTCTCCAGTATGTCCCAGAGCCAGTCCCTGGTAAAAAGCTTCCTACA
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CTTCCAGATACAAGTAGGAAAAGTCGCCAGAAGACAAGAGCTGTAGGGAAAACCACCAACCCTATCTTCAACCACACTATGGTGTATGAT
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CGTATTGGCTTTGGAACAGGTAAAAGTTATGGGACTGAAGTGGACTGGATGGACTCTACTTCAGAGGAAGTTGCTCTCTGGGAGAAGATG

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ATGAATGAAGCTATGGCTACAGATTCCCCAAGAAGACCCAGTCGTTGTACTGGTGGAGTTGTGGTTCGCCCCCAGGCTGTCACAGAGCAG
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TTGTTGATTATGATTGGCTACAGTGATGGAATGCAGGTCTGGAGCATCCCTATCAGTGGTGAAGCACAAGAGCTCTTCTCTGTTCGACAT
GGCCCAATTCGAGCGGCTAGAATCTTGCCTGCTCCACAGTTTGGTGCTCAAAAATGTGATAACTTTGCTGAAAAAAGACCCCTCCTTGGT
GTTTGTAAGAGCATTGGATCTTCTGGCACAAGCCCACCGTACTGTTGTGTGGATCTGTATTCACTTCGTACTGGGGAGATGGTCAAGTCC
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TGTACTTTCACGAAGAAATTCTTTGTTACAAGCTGCTATCCATGTCCAGGGCCAAACATGAATCCTATTGCTCTTGGGAGCCGCTGGCTT
GCTTATGCAGAAAACAAGTTGATTCGATGTCATCAGTCCCGTGGTGGAGCCTGTGGAGACAACATTCAGTCTTATACTGCCACAGTCATT
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GATGATGTTGCCATCCACAGTAATTCACGGCGGAGTCCTTTGGTCCCAGGCATCATCACAGTTATTGACACCGAAACCGTTGGAGAGGGC
CAGGTGCTTGTGAGTGAGGATTCTGACAGTGATGGCATTGTGGCCCACTTCCCTGCCCATGAGAAGCCAGTGTGCTGCATGGCTTTTAAT
ACAAGTGGAATGCTTCTAGTCACAACAGACACCCTTGGCCATGACTTTCATGTCTTCCAAATTCTGACTCATCCTTGGTCCTCATCACAA
TGTGCTGTCCACCATCTGTATACTCTTCACAGGGGAGAAACTGAAGCCAAAGTACAGGACATCTGCTTCAGCCATGACTGTCGCTGGGTT
GTGGTCAGTACTCTCCGGGGTACTTCCCACGTTTTCCCCATCAACCCTTATGGTGGCCAGCCTTGTGTTCGTACACATATGTCACCACGA
GTAGTGAATCGCATGAGCCGTTTCCAGAAAAGTGCTGGACTGGAAGAGATTGAACAAGAACTGACGTCTAAGCAAGGAGGTCGCTGTAGC
CCTGTTCCAGGTCTATCAAGCAGCCCTTCTGGGTCACCCTTGCATGGGAAACTGAACAGCCAAGACTCCTATAACAATTTTACCAACAAC
AACCCTGGCAACCCTCGGCTCTCTCCTCTTCCCAGCTTGATGGTAGTGATGCCTCTTGCACAAATCAAGCAGCCAATGACATTGGGGACC
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GGAACATCCAGGTCATGGTTTGCAAATAATGCAGGTCTGAAAAGAGAAAAAGATCAGTCCAAACAAGTTGTAGTTGAGTCCCTGTACATT
ATCAGTTGCTATGGCACCTTAGTGGAACACATGATGGAGCCGCGACCCCTCAGCACTGCACCCAAGATTAGTGACGACACACCACTGGAA
ATGATGACATCGCCTCGAGCCAGCTGGACTCTGGTTAGAACCCCTCAATGGAATGAATTGCAGCCACCGTTTAATGCAAACCACCCTCTG
CTCCTCGCTGCAGATGCAGTACAGTATTATCAGTTCCTGCTTGCTGGCCTGGTTCCCCCTGGAAGTCCTGGGCCCATTACTCGACATGGG
TCTTACGACAGTTTAGCTTCTGACCATAGTGGACAGGAAGATGAAGAATGGCTTTCCCAGGTTGAAATTGTAACACACACTGGACCCCAT
AGACGTCTGTGGATGGGTCCACAGTTCCAGTTCAAAACCATCCATCCCTCAGGCCAAACCACAGTTATCTCATCCAGTTCATCTGTGTTG
CAGTCTCATGGTCCGAGTGACACGCCACAGCCTCTTTTGGATTTTGATACAGATGATCTTGATCTCAACAGTCTCAGGATCCAGCCAGTC
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AGATGGTACCCTCTGAAGCGGAAGACAGCACCAGTTGCCCTTGAAGCAGAAAACAGAGGTGAAATGAAACTAGCTCTCCAGTATGTCCCA
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CATCTAAATTCTTTTGTTAAATGTACCATCCTTCCAGATACAAGTAGGAAAAGTCGCCAGAAGACAAGAGCTGTAGGGAAAACCACCAAC
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CTCCTCGCTGCAGATGCAGTACAGTATTATCAGTTCCTGCTTGCTGGCCTGGTTCCCCCTGGAAGTCCTGGGCCCATTACTCGACATGGG
TCTTACGACAGTTTAGCTTCTGACCATAGTGGACAGGAAGATGAAGAATGGCTTTCCCAGGTTGAAATTGTAACACACACTGGACCCCAT
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AATATTCAGTTTGCAATTGAATATGTGGAGTCACTGAAGGAGTTGCATGTTTTTGTGGCCCAGTGTAAGGACTTAGCAGCAGCGGATGTA
AAAAAACAGCGTTCAGACCCATATGTAAAGGCCTATTTGCTACCAGACAAAGGCAAAATGGGCAAGAAGAAAACACTCGTAGTGAAGAAA
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CATCTAAATTCTTTTGTTAAATGTACCATCCTTCCAGATACAAGTAGGAAAAGTCGCCAGAAGACAAGAGCTGTAGGGAAAACCACCAAC
CCTATCTTCAACCACACTATGGTGTATGATGGGTTCAGGCCTGAAGATCTGATGGAAGCCTGTGTAGAGCTTACTGTCTGGGACCATTAC
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TCAGAGGAAGTTGCTCTCTGGGAGAAGATGGTAAACTCCCCCAATACTTGGATTGAAGCAACACTGCCTCTCAGAATGCTTTTGATTGCC

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ATGAATGAAGCTATGGCTACAGATTCCCCAAGAAGACCCAGTCGTTGTACTGGTGGAGTTGTGGTTCGCCCCCAGGCTGTCACAGAGCAG
TCCTACATGGAAAGTGTTGTGACTTTTCTGCAGGATGTTGTGCCACAGGCTTACAGTGGAACACCTCTAACAGAAGAAAAGGAGAAAATA
GTCTGGGTCAGATTTGAAAATGCAGATTTAAATGATACATCAAGAAATCTGGAATTTCATGAAATACATAGTACTGGGAATGAACCGCCT
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GGGTTCAGGCCTGAAGATCTGATGGAAGCCTGTGTAGAGCTTACTGTCTGGGACCATTACAAATTAACCAACCAATTTTTGGGAGGTCTT
CGTATTGGCTTTGGAACAGGTAAAAGTTATGGGACTGAAGTGGACTGGATGGACTCTACTTCAGAGGAAGTTGCTCTCTGGGAGAAGATG

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GGGTTCAGGCCTGAAGATCTGATGGAAGCCTGTGTAGAGCTTACTGTCTGGGACCATTACAAATTAACCAACCAATTTTTGGGAGGTCTT
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>In-frame_BCAS3_ENST00000408905_chr17_59161925_+_SYTL2_ENST00000316356_chr11_85425550_-_3615nt
ATGAATGAAGCTATGGCTACAGATTCCCCAAGAAGACCCAGTCGTTGTACTGGTGGAGTTGTGGTTCGCCCCCAGGCTGTCACAGAGCAG
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GATACAGATGATCTTGATCTCAACAGTCTCAGGATCCAGCCAGTCCGCTCTGACCCCGTCAGCATGCCAGGGTCATCCCGTCCAGTCTCT
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CTTGATTTGGAAACATGGGACTGGGATAACAAACAGAATAAACAATTGAGATGGTACCCTCTGAAGCGGAAGACAGCACCAGTTGCCCTT
GAAGCAGAAAACAGAGGTGAAATGAAACTAGCTCTCCAGTATGTCCCAGAGCCAGTCCCTGGTAAAAAGCTTCCTACAACTGGAGAAGTG
CACATCTGGGTGAAGGAATGCCTTGATCTACCACTGCTAAGGGGAAGTCATCTAAATTCTTTTGTTAAATGTACCATCCTTCCAGATACA
AGTAGGAAAAGTCGCCAGAAGACAAGAGCTGTAGGGAAAACCACCAACCCTATCTTCAACCACACTATGGTGTATGATGGGTTCAGGCCT
GAAGATCTGATGGAAGCCTGTGTAGAGCTTACTGTCTGGGACCATTACAAATTAACCAACCAATTTTTGGGAGGTCTTCGTATTGGCTTT
GGAACAGGTAAAAGTTATGGGACTGAAGTGGACTGGATGGACTCTACTTCAGAGGAAGTTGCTCTCTGGGAGAAGATGGTAAACTCCCCC

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ATGAATCCTATTGCTCTTGGGAGCCGCTGGCTTGCTTATGCAGAAAACAAGTTGATTCGATGTCATCAGTCCCGTGGTGGAGCCTGTGGA
GACAACATTCAGTCTTATACTGCCACAGTCATTAGTGCTGCTAAAACATTGAAAAGTGGCCTGACAATGGTAGGGAAAGTGGTGACTCAG
CTGACAGGCACACTGCCTTCAGGTGTGACAGAAGATGATGTTGCCATCCACAGTAATTCACGGCGGAGTCCTTTGGTCCCAGGCATCATC
ACAGTTATTGACACCGAAACCGTTGGAGAGGGCCAGGTGCTTGTGAGTGAGGATTCTGACAGTGATGGCATTGTGGCCCACTTCCCTGCC
CATGAGAAGCCAGTGTGCTGCATGGCTTTTAATACAAGTGGAATGCTTCTAGTCACAACAGACACCCTTGGCCATGACTTTCATGTCTTC
CAAATTCTGACTCATCCTTGGTCCTCATCACAATGTGCTGTCCACCATCTGTATACTCTTCACAGGGGAGAAACTGAAGCCAAAGTACAG
GACATCTGCTTCAGCCATGACTGTCGCTGGGTTGTGGTCAGTACTCTCCGGGGTACTTCCCACGTTTTCCCCATCAACCCTTATGGTGGC
CAGCCTTGTGTTCGTACACATATGTCACCACGAGTAGTGAATCGCATGAGCCGTTTCCAGAAAAGTGCTGGACTGGAAGAGATTGAACAA
GAACTGACGTCTAAGCAAGGAGGTCGCTGTAGCCCTGTTCCAGGTCTATCAAGCAGCCCTTCTGGGTCACCCTTGCATGGGAAACTGAAC
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GCACAAATCAAGCAGCCAATGACATTGGGGACCATCACCAAACGAACCGGGCCTTATCTCTTTGGAGCGGGGTGTTTTTCCATAAAAGCC
CCATGCAAAGTTAAACCTCCTCCACAAATTTCACCCAGCAAATCGATGGGCGGAGAATTTTGTGTGGCTGCTATCTTCGGAACATCCAGG
TCATGGTTTGCAAATAATGCAGGTCTGAAAAGAGAAAAAGATCAGTCCAAACAAGTTGTAGTTGAGTCCCTGTACATTATCAGTTGCTAT
GGCACCTTAGTGGAACACATGATGGAGCCGCGACCCCTCAGCACTGCACCCAAGATTAGTGACGACACACCACTGGAAATGATGACATCG
CCTCGAGCCAGCTGGACTCTGGTTAGAACCCCTCAATGGAATGAATTGCAGCCACCGTTTAATGCAAACCACCCTCTGCTCCTCGCTGCA
GATGCAGTACAGTATTATCAGTTCCTGCTTGCTGGCCTGGTTCCCCCTGGAAGTCCTGGGCCCATTACTCGACATGGGTCTTACGACAGT
TTAGCTTCTGACCATAGTGGACAGGAAGATGAAGAATGGCTTTCCCAGGTTGAAATTGTAACACACACTGGACCCCATAGACGTCTGTGG
ATGGGTCCACAGTTCCAGTTCAAAACCATCCATCCCTCAGGCCAAACCACAGTTATCTCATCCAGTTCATCTGTGTTGCAGTCTCATGGT
CCGAGTGACACGCCACAGCCTCTTTTGGATTTTGATACAGATGATCTTGATCTCAACAGTCTCAGGATCCAGCCAGTCCGCTCTGACCCC
GTCAGCATGCCAGGGTCATCCCGTCCAGTCTCTGATCGAAGGGGAGTTTCCACAGTGATTGATGCTGCCTCAGTTTCCACAGTGCCTACA
CAACCTGATAATCCATTTTCTCACCCTGACAAACTCAAAAGGATGAGCAAGTCTGTTCCAGCATTTCTCCAAGATGAGAGTGATGACAGA
GAAACAGATACAGCATCAGAAAGCAGTTACCAGCTCAGCAGACACAAGAAGAGCCCGAGCTCTTTAACCAATCTTAGCAGCTCCTCTGGC
ATGACGTCCTTGTCTTCTGTGAGTGGCAGTGTGATGAGTGTTTATAGTGGAGACTTTGGCAATCTGGAAGTTAAAGGAAATATTCAGTTT
GCAATTGAATATGTGGAGTCACTGAAGGAGTTGCATGTTTTTGTGGCCCAGTGTAAGGACTTAGCAGCAGCGGATGTAAAAAAACAGCGT
TCAGACCCATATGTAAAGGCCTATTTGCTACCAGACAAAGGCAAAATGGGCAAGAAGAAAACACTCGTAGTGAAGAAAACCTTGAATCCT
GTGTATAACGAAATACTGCGGTATAAAATTGAAAAACAAATCTTAAAGACACAGAAATTGAACCTGTCCATTTGGCATCGGGATACATTT
AAGCGCAATAGTTTCCTAGGGGAGGTGGAACTTGATTTGGAAACATGGGACTGGGATAACAAACAGAATAAACAATTGAGATGGTACCCT
CTGAAGCGGAAGACAGCACCAGTTGCCCTTGAAGCAGAAAACAGAGGTGAAATGAAACTAGCTCTCCAGTATGTCCCAGAGCCAGTCCCT
GGTAAAAAGCTTCCTACAACTGGAGAAGTGCACATCTGGGTGAAGGAATGCCTTGATCTACCACTGCTAAGGGGAAGTCATCTAAATTCT
TTTGTTAAATGTACCATCCTTCCAGATACAAGTAGGAAAAGTCGCCAGAAGACAAGAGCTGTAGGGAAAACCACCAACCCTATCTTCAAC
CACACTATGGTGTATGATGGGTTCAGGCCTGAAGATCTGATGGAAGCCTGTGTAGAGCTTACTGTCTGGGACCATTACAAATTAACCAAC
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>In-frame_BCAS3_ENST00000585744_chr17_59161925_+_SYTL2_ENST00000528231_chr11_85425550_-_2973nt
ATGAATCCTATTGCTCTTGGGAGCCGCTGGCTTGCTTATGCAGAAAACAAGTTGATTCGATGTCATCAGTCCCGTGGTGGAGCCTGTGGA
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* Fusion transcript sequences (Full-length transcript).
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GCCCTTCTGGGTCACCCTTGCATGGGAAACTGAACAGCCAAGACTCCTATAACAATTTTACCAACAACAACCCTGGCAACCCTCGGCTCT
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ATCCATTTTCTCACCCTGACAAACTCAAAAGGATGAGCAAGTCTGTTCCAGCATTTCTCCAAGATGAGAGTGATGACAGAGAAACAGATA
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TGTATGATGGGTTCAGGCCTGAAGATCTGATGGAAGCCTGTGTAGAGCTTACTGTCTGGGACCATTACAAATTAACCAACCAATTTTTGG
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CTGGCACAAGCCCACCGTACTGTTGTGTGGATCTGTATTCACTTCGTACTGGGGAGATGGTCAAGTCCATTCAATTTAAGACACCTATTT
ATGATCTCCATTGCAATAAACGGATCCTTGTCGTAGTCTTGCAGGAGAAAATTGCTGCCTTTGATAGCTGTACTTTCACGAAGAAATTCT
TTGTTACAAGCTGCTATCCATGTCCAGGGCCAAACATGAATCCTATTGCTCTTGGGAGCCGCTGGCTTGCTTATGCAGAAAACAAGTTGA
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CTCTTCACAGGGGAGAAACTGAAGCCAAAGTACAGGACATCTGCTTCAGCCATGACTGTCGCTGGGTTGTGGTCAGTACTCTCCGGGGTA
CTTCCCACGTTTTCCCCATCAACCCTTATGGTGGCCAGCCTTGTGTTCGTACACATATGTCACCACGAGTAGTGAATCGCATGAGCCGTT
TCCAGAAAAGTGCTGGACTGGAAGAGATTGAACAAGAACTGACGTCTAAGCAAGGAGGTCGCTGTAGCCCTGTTCCAGGTCTATCAAGCA
GCCCTTCTGGGTCACCCTTGCATGGGAAACTGAACAGCCAAGACTCCTATAACAATTTTACCAACAACAACCCTGGCAACCCTCGGCTCT
CTCCTCTTCCCAGCTTGATGGTAGTGATGCCTCTTGCACAAATCAAGCAGCCAATGACATTGGGGACCATCACCAAACGAACCGGCAAAG
TTAAACCTCCTCCACAAATTTCACCCAGCAAATCGATGGGCGGAGAATTTTGTGTGGCTGCTATCTTCGGAACATCCAGGTCATGGTTTG
CAAATAATGCAGGTCTGAAAAGAGAAAAAGATCAGTCCAAACAAGTTGTAGTTGAGTCCCTGTACATTATCAGTTGCTATGGCACCTTAG
TGGAACACATGATGGAGCCGCGACCCCTCAGCACTGCACCCAAGATTAGTGACGACACACCACTGGAAATGATGACATCGCCTCGAGCCA
GCTGGACTCTGGTTAGAACCCCTCAATGGAATGAATTGCAGCCACCGTTTAATGCAAACCACCCTCTGCTCCTCGCTGCAGATGCAGTAC
AGTATTATCAGTTCCTGCTTGCTGGCCTGGTTCCCCCTGGAAGTCCTGGGCCCATTACTCGACATGGGTCTTACGACAGTTTAGCTTCTG
ACCATAGTGGACAGGAAGATGAAGAATGGCTTTCCCAGGTTGAAATTGTAACACACACTGGACCCCATAGACGTCTGTGGATGGGTCCAC
AGTTCCAGTTCAAAACCATCCATCCCTCAGGCCAAACCACAGTTATCTCATCCAGTTCATCTGTGTTGCAGTCTCATGGTCCGAGTGACA
CGCCACAGCCTCTTTTGGATTTTGATACAGATGATCTTGATCTCAACAGTCTCAGGATCCAGCCAGTCCGCTCTGACCCCGTCAGCATGC
CAGGGTCATCCCGTCCAGTCTCTGATCGAAGGGGAGTTTCCACAGTGATTGATGCTGCCTCAGTTTCCACAGTGCCTACACAACCTGATA
ATCCATTTTCTCACCCTGACAAACTCAAAAGGATGAGCAAGTCTGTTCCAGCATTTCTCCAAGATGAGAGTGATGACAGAGAAACAGATA
CAGCATCAGAAAGCAGTTACCAGCTCAGCAGACACAAGAAGAGCCCGAGCTCTTTAACCAATCTTAGCAGCTCCTCTGGCATGACGTCCT
TGTCTTCTGTGAGTGGCAGTGTGATGAGTGTTTATAGTGGAGACTTTGGCAATCTGGAAGTTAAAGGAAATATTCAGTTTGCAATTGAAT
ATGTGGAGTCACTGAAGGAGTTGCATGTTTTTGTGGCCCAGTGTAAGGACTTAGCAGCAGCGGATGTAAAAAAACAGCGTTCAGACCCAT
ATGTAAAGGCCTATTTGCTACCAGACAAAGGCAAAATGGGCAAGAAGAAAACACTCGTAGTGAAGAAAACCTTGAATCCTGTGTATAACG
AAATACTGCGGTATAAAATTGAAAAACAAATCTTAAAGACACAGAAATTGAACCTGTCCATTTGGCATCGGGATACATTTAAGCGCAATA
GTTTCCTAGGGGAGGTGGAACTTGATTTGGAAACATGGGACTGGGATAACAAACAGAATAAACAATTGAGATGGTACCCTCTGAAGCGGA
AGACAGCACCAGTTGCCCTTGAAGCAGAAAACAGAGGTGAAATGAAACTAGCTCTCCAGTATGTCCCAGAGCCAGTCCCTGGTAAAAAGC
TTCCTACAACTGGAGAAGTGCACATCTGGGTGAAGGAATGCCTTGATCTACCACTGCTAAGGGGAAGTCATCTAAATTCTTTTGTTAAAT
GTACCATCCTTCCAGATACAAGTAGGAAAAGTCGCCAGAAGACAAGAGCTGTAGGGAAAACCACCAACCCTATCTTCAACCACACTATGG
TGTATGATGGGTTCAGGCCTGAAGATCTGATGGAAGCCTGTGTAGAGCTTACTGTCTGGGACCATTACAAATTAACCAACCAATTTTTGG
GAGGTCTTCGTATTGGCTTTGGAACAGGTAAAAGTTATGGGACTGAAGTGGACTGGATGGACTCTACTTCAGAGGAAGTTGCTCTCTGGG
AGAAGATGGTAAACTCCCCCAATACTTGGATTGAAGCAACACTGCCTCTCAGAATGCTTTTGATTGCCAAGATTTCCAAATGAGCCCAAA
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>In-frame_BCAS3_ENST00000589222_chr17_59161925_+_SYTL2_ENST00000524452_chr11_85425550_-_3563nt
CTCGGGGAGACTCCAAACAGTGAGCCTAGAGCTGGAGACTAGCGTTAACCGGCGGGGCGGCCGGTTTTATGAATGAAGCTATGGCTACAG
ATTCCCCAAGAAGACCCAGTCGTTGTACTGGTGGAGTTGTGGTTCGCCCCCAGGCTGTCACAGAGCAGTCCTACATGGAAAGTGTTGTGA
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CTCGGGGAGACTCCAAACAGTGAGCCTAGAGCTGGAGACTAGCGTTAACCGGCGGGGCGGCCGGTTTTATGAATGAAGCTATGGCTACAG
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GAAGAGATTGAACAAGAACTGACGTCTAAGCAAGGAGGTCGCTGTAGCCCTGTTCCAGGTCTATCAAGCAGCCCTTCTGGGTCACCCTTG
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GTAGTGATGCCTCTTGCACAAATCAAGCAGCCAATGACATTGGGGACCATCACCAAACGAACCGGCAAAGTTAAACCTCCTCCACAAATT
TCACCCAGCAAATCGATGGGCGGAGAATTTTGTGTGGCTGCTATCTTCGGAACATCCAGGTCATGGTTTGCAAATAATGCAGGTCTGAAA
AGAGAAAAAGATCAGTCCAAACAAGTTGTAGTTGAGTCCCTGTACATTATCAGTTGCTATGGCACCTTAGTGGAACACATGATGGAGCCG
CGACCCCTCAGCACTGCACCCAAGATTAGTGACGACACACCACTGGAAATGATGACATCGCCTCGAGCCAGCTGGACTCTGGTTAGAACC
CCTCAATGGAATGAATTGCAGCCACCGTTTAATGCAAACCACCCTCTGCTCCTCGCTGCAGATGCAGTACAGTATTATCAGTTCCTGCTT
GCTGGCCTGGTTCCCCCTGGAAGTCCTGGGCCCATTACTCGACATGGGTCTTACGACAGTTTAGCTTCTGACCATAGTGGACAGGAAGAT
GAAGAATGGCTTTCCCAGGTTGAAATTGTAACACACACTGGACCCCATAGACGTCTGTGGATGGGTCCACAGTTCCAGTTCAAAACCATC
CATCCCTCAGGCCAAACCACAGTTATCTCATCCAGTTCATCTGTGTTGCAGTCTCATGGTCCGAGTGACACGCCACAGCCTCTTTTGGAT
TTTGATACAGATGATCTTGATCTCAACAGTCTCAGGATCCAGCCAGTCCGCTCTGACCCCGTCAGCATGCCAGGGTCATCCCGTCCAGTC
TCTGATCGAAGGGGAGTTTCCACAGTGATTGATGCTGCCTCAGTTTCCACAGTGCCTACACAACCTGATAATCCATTTTCTCACCCTGAC
AAACTCAAAAGGATGAGCAAGTCTGTTCCAGCATTTCTCCAAGATGAGGTGAGTGGCAGTGTGATGAGTGTTTATAGTGGAGACTTTGGC
AATCTGGAAGTTAAAGGAAATATTCAGTTTGCAATTGAATATGTGGAGTCACTGAAGGAGTTGCATGTTTTTGTGGCCCAGTGTAAGGAC
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ACACTCGTAGTGAAGAAAACCTTGAATCCTGTGTATAACGAAATACTGCGGTATAAAATTGAAAAACAAATCTTAAAGACACAGAAATTG
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AAACAGAATAAACAATTGAGATGGTACCCTCTGAAGCGGAAGACAGCACCAGTTGCCCTTGAAGCAGAAAACAGAGGTGAAATGAAACTA
GCTCTCCAGTATGTCCCAGAGCCAGTCCCTGGTAAAAAGCTTCCTACAACTGGAGAAGTGCACATCTGGGTGAAGGAATGCCTTGATCTA
CCACTGCTAAGGGGAAGTCATCTAAATTCTTTTGTTAAATGTACCATCCTTCCAGATACAAGTAGGAAAAGTCGCCAGAAGACAAGAGCT
GTAGGGAAAACCACCAACCCTATCTTCAACCACACTATGGTGTATGATGGGTTCAGGCCTGAAGATCTGATGGAAGCCTGTGTAGAGCTT
ACTGTCTGGGACCATTACAAATTAACCAACCAATTTTTGGGAGGTCTTCGTATTGGCTTTGGAACAGGTAAAAGTTATGGGACTGAAGTG
GACTGGATGGACTCTACTTCAGAGGAAGTTGCTCTCTGGGAGAAGATGGTAAACTCCCCCAATACTTGGATTGAAGCAACACTGCCTCTC
AGAATGCTTTTGATTGCCAAGATTTCCAAATGAGCCCAAATTCCACTGGCTCCTCCACTGAAAACTACTAAACCGGTGGAATCTGATCTT
GAAAATCTGAGTAGGTGGACAAATATCCTCACTTTCTATCTATTGCACCTAAGGAATACTACACAGCATGTAAAAGTCAATCTGCATGTG
CTTCTTTGATTACAAGGCCCAAGGGATTTAAATATAACAAAATGTGTAATTTGTGACTCTAATATTAAATAAGATATTTGAACAAGCTAG
GAAAATTGAATTTCTGCTGCTGCTTCAAAGAAAAAGCTGCCCCAGAGCATTAAACATGGGGTATTGTTAAGAAGCAAAATGTTCTTGTTT
GCCATCATGTGTTTCACACCACAATTCTGTGCCACAGTTAAGAGGGTCTGGTACCCTTGCAGGACCTTTGTAGGTTGTGGGAAAAAGTCG
CAGAAAGATACTCAAAGTGGAGCAGGGAATGGAGACAGACATCAGTGATGATAAAAAAAAAAATGGACCTTAAGAAACTATTTACTCTGT
AATCTCTAATAAAATATGGAATTCCATATTAGGGCAATGAGACTGAAACTACTGGTGTTTTTCTGCCTTGAGAAAACAAACAGTTAAAAC
AAGCCTCAAATGTATTTTAGTGCCACCCACTGGCCATAGGTACAATTCAGTTGTTGGCTTGTTTTGACTTAATTCTAAAATAGGTCTCAA
GCCTGTATTTTTATGAGTTTATTTTTTTAAAACCCTGCATATATATGATTGTTTTTCTTATAACTTTACTATATGAAAGCAGCATAAGAG
TAGTCACAAACATGTTTTGCAACAAAGTTTTAATTAGAATGTAAGTTGCTCAGTTATACTGTTCTTCTTATGTATGTAAAATTTTCGTAT
TTTGTAAAAACCCTTAGAATAAATTATCATTTGATTTAAATTGTATTAGAAAATTAGCGTGACTTCTCATTTTAAATAAAATATTTTAGG

>In-frame_BCAS3_ENST00000407086_chr17_59161925_+_SYTL2_ENST00000316356_chr11_85425550_-_4583nt
TGAGCCTAGAGCTGGAGACTAGCGTTAACCGGCGGGGCGGCCGGTTTTATGAATGAAGCTATGGCTACAGATTCCCCAAGAAGACCCAGT
CGTTGTACTGGTGGAGTTGTGGTTCGCCCCCAGGCTGTCACAGAGCAGTCCTACATGGAAAGTGTTGTGACTTTTCTGCAGGATGTTGTG
CCACAGGCTTACAGTGGAACACCTCTAACAGAAGAAAAGGAGAAAATAGTCTGGGTCAGATTTGAAAATGCAGATTTAAATGATACATCA
AGAAATCTGGAATTTCATGAAATACATAGTACTGGGAATGAACCGCCTTTGTTGATTATGATTGGCTACAGTGATGGAATGCAGGTCTGG
AGCATCCCTATCAGTGGTGAAGCACAAGAGCTCTTCTCTGTTCGACATGGCCCAATTCGAGCGGCTAGAATCTTGCCTGCTCCACAGTTT
GGTGCTCAAAAATGTGATAACTTTGCTGAAAAAAGACCCCTCCTTGGTGTTTGTAAGAGCATTGGATCTTCTGGCACAAGCCCACCGTAC
TGTTGTGTGGATCTGTATTCACTTCGTACTGGGGAGATGGTCAAGTCCATTCAATTTAAGACACCTATTTATGATCTCCATTGCAATAAA
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ATTAGAATGTAAGTTGCTCAGTTATACTGTTCTTCTTATGTATGTAAAATTTTCGTATTTTGTAAAAACCCTTAGAATAAATTATCATTT

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ATGAATGAAGCTATGGCTACAGATTCCCCAAGAAGACCCAGTCGTTGTACTGGTGGAGTTGTGGTTCGCCCCCAGGCTGTCACAGAGCAG
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TCTTACGACAGTTTAGCTTCTGACCATAGTGGACAGGAAGATGAAGAATGGCTTTCCCAGGTTGAAATTGTAACACACACTGGACCCCAT
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CGCTCTGACCCCGTCAGCATGCCAGGGTCATCCCGTCCAGTCTCTGATCGAAGGGGAGTTTCCACAGTGATTGATGCTGCCTCAGTTTCC
ACAGTGCCTACACAACCTGATAATCCATTTTCTCACCCTGACAAACTCAAAAGGATGAGCAAGTCTGTTCCAGCATTTCTCCAAGATGAG
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GGCCTGGTTCCCCCTGGAAGTCCTGGGCCCATTACTCGACATGGGTCTTACGACAGTTTAGCTTCTGACCATAGTGGACAGGAAGATGAA
GAATGGCTTTCCCAGGTTGAAATTGTAACACACACTGGACCCCATAGACGTCTGTGGATGGGTCCACAGTTCCAGTTCAAAACCATCCAT
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GGGAAAACCACCAACCCTATCTTCAACCACACTATGGTGTATGATGGGTTCAGGCCTGAAGATCTGATGGAAGCCTGTGTAGAGCTTACT
GTCTGGGACCATTACAAATTAACCAACCAATTTTTGGGAGGTCTTCGTATTGGCTTTGGAACAGGTAAAAGTTATGGGACTGAAGTGGAC
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ATGCTTTTGATTGCCAAGATTTCCAAATGAGCCCAAATTCCACTGGCTCCTCCACTGAAAACTACTAAACCGGTGGAATCTGATCTTGAA
AATCTGAGTAGGTGGACAAATATCCTCACTTTCTATCTATTGCACCTAAGGAATACTACACAGCATGTAAAAGTCAATCTGCATGTGCTT
CTTTGATTACAAGGCCCAAGGGATTTAAATATAACAAAATGTGTAATTTGTGACTCTAATATTAAATAAGATATTTGAACAAGCTAGGAA
AATTGAATTTCTGCTGCTGCTTCAAAGAAAAAGCTGCCCCAGAGCATTAAACATGGGGTATTGTTAAGAAGCAAAATGTTCTTGTTTGCC
ATCATGTGTTTCACACCACAATTCTGTGCCACAGTTAAGAGGGTCTGGTACCCTTGCAGGACCTTTGTAGGTTGTGGGAAAAAGTCGCAG
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CCTCAAATGTATTTTAGTGCCACCCACTGGCCATAGGTACAATTCAGTTGTTGGCTTGTTTTGACTTAATTCTAAAATAGGTCTCAAGCC
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GTAAAAACCCTTAGAATAAATTATCATTTGATTTAAATTGTATTAGAAAATTAGCGTGACTTCTCATTTTAAATAAAATATTTTAGGAAT

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ATGAATGAAGCTATGGCTACAGATTCCCCAAGAAGACCCAGTCGTTGTACTGGTGGAGTTGTGGTTCGCCCCCAGGCTGTCACAGAGCAG
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GACAAATATCCTCACTTTCTATCTATTGCACCTAAGGAATACTACACAGCATGTAAAAGTCAATCTGCATGTGCTTCTTTGATTACAAGG
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GCCGCCTTGCAGTTTGATCTCAGACTGCTGTGCTGGCAATCAGCGAGACTCCGTGGGCGTAGGACCCTCCGAGCCAGGCTGCTATCCATG
TCCAGGGCCAAACATGAATCCTATTGCTCTTGGGAGCCGCTGGCTTGCTTATGCAGAAAACAAGTTGATTCGATGTCATCAGTCCCGTGG
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CCACTTCCCTGCCCATGAGAAGCCAGTGTGCTGCATGGCTTTTAATACAAGTGGAATGCTTCTAGTCACAACAGACACCCTTGGCCATGA
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GCTCCTCGCTGCAGATGCAGTACAGTATTATCAGTTCCTGCTTGCTGGCCTGGTTCCCCCTGGAAGTCCTGGGCCCATTACTCGACATGG
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CAGCTCCTCTGGCATGACGTCCTTGTCTTCTGTGAGTGGCAGTGTGATGAGTGTTTATAGTGGAGACTTTGGCAATCTGGAAGTTAAAGG
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GGAATGAATTGCAGCCACCGTTTAATGCAAACCACCCTCTGCTCCTCGCTGCAGATGCAGTACAGTATTATCAGTTCCTGCTTGCTGGCC
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CAGATGATCTTGATCTCAACAGTCTCAGGATCCAGCCAGTCCGCTCTGACCCCGTCAGCATGCCAGGGTCATCCCGTCCAGTCTCTGATC
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FusionGenePPI for BCAS3_SYTL2


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
BCAS3CTBP1, CTBP2, CDC23, C16orf70, ZDHHC17, ESR1, PELP1, HIST1H3A, KAT2B, WIPI2, ATM, BAG4, CCND1, FBXW7, KRAS, PALB2, PHB, PTPN1, SMAD4, STK11, TGFB1, TSG101, XRCC3, OFD1, CEP128, FBF1, NPHP1, SCLT1, XPO1, CD14, HDAC1, IRF3, MAGEE1, IL17RA, DOCK5, VWA5A, RAB2BSYTL2RAB27A, RAB27B, HNRNPA1, RPAP1, PPP1CA, FBXO25, MTERF1, NCOA1, KRAS


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for BCAS3_SYTL2


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for BCAS3_SYTL2


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource