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Fusion gene ID: 27588

FusionGeneSummary for PLEKHA5_ST8SIA1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: PLEKHA5_ST8SIA1
Fusion gene ID: 27588
HgeneTgene
Gene symbol

PLEKHA5

ST8SIA1

Gene ID

54477

6489

Gene namepleckstrin homology domain containing A5ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1
SynonymsPEPP-2|PEPP2GD3S|SIAT8|SIAT8-A|SIAT8A|ST8SiaI
Cytomap

12p12.3

12p12.1

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionpleckstrin homology domain-containing family A member 5PH domain-containing family A member 5phosphoinositol 3-phosphate-binding protein-2pleckstrin homology domain containing, family A member 5alpha-N-acetylneuraminide alpha-2,8-sialyltransferaseST8 alpha-N-acetylneuraminate alpha-2,8-sialyltransferase 1alpha-2,8-sialyltransferase 8Adisialoganglioside (GD3) synthaseganglioside GD3 synthaseganglioside GT3 synthaseganglioside-specific alpha
Modification date2018051920180519
UniProtAcc

Q9HAU0

Q92185

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000309364, ENST00000359180, 
ENST00000317589, ENST00000355397, 
ENST00000429027, ENST00000539256, 
ENST00000299275, ENST00000538714, 
ENST00000543806, ENST00000424268, 
ENST00000540972, ENST00000510738, 
ENST00000396037, ENST00000539510, 
ENST00000536558, ENST00000404299, 
ENST00000381424, 
Fusion gene scores* DoF score13 X 7 X 10=91011 X 9 X 7=693
# samples 1311
** MAII scorelog2(13/910*10)=-2.8073549220576
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(11/693*10)=-2.65535182861255
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: PLEKHA5 [Title/Abstract] AND ST8SIA1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID

check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGALDBRCATCGA-A8-A07W-01APLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
In-frameENST00000309364ENST00000396037PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-5UTRENST00000309364ENST00000539510PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000309364ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000309364ENST00000404299PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000309364ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
In-frameENST00000359180ENST00000396037PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-5UTRENST00000359180ENST00000539510PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000359180ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000359180ENST00000404299PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000359180ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
In-frameENST00000317589ENST00000396037PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-5UTRENST00000317589ENST00000539510PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000317589ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000317589ENST00000404299PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000317589ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
In-frameENST00000355397ENST00000396037PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-5UTRENST00000355397ENST00000539510PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000355397ENST00000536558PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000355397ENST00000404299PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000355397ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
In-frameENST00000429027ENST00000396037PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-5UTRENST00000429027ENST00000539510PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000429027ENST00000536558PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000429027ENST00000404299PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000429027ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5UTR-3CDSENST00000539256ENST00000396037PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
5UTR-5UTRENST00000539256ENST00000539510PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5UTR-intronENST00000539256ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5UTR-intronENST00000539256ENST00000404299PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

22440227

-
5UTR-intronENST00000539256ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
In-frameENST00000299275ENST00000396037PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-5UTRENST00000299275ENST00000539510PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000299275ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000299275ENST00000404299PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000299275ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
In-frameENST00000538714ENST00000396037PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-5UTRENST00000538714ENST00000539510PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000538714ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000538714ENST00000404299PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
5CDS-intronENST00000538714ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-3CDSENST00000543806ENST00000396037PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-5UTRENST00000543806ENST00000539510PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-intronENST00000543806ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-intronENST00000543806ENST00000404299PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-intronENST00000543806ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-3CDSENST00000424268ENST00000396037PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

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-
intron-5UTRENST00000424268ENST00000539510PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

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-
intron-intronENST00000424268ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-intronENST00000424268ENST00000404299PLEKHA5chr12

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+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-intronENST00000424268ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
In-frameENST00000540972ENST00000396037PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-5UTRENST00000540972ENST00000539510PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000540972ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000540972ENST00000404299PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
5CDS-intronENST00000540972ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-3CDSENST00000510738ENST00000396037PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-5UTRENST00000510738ENST00000539510PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-intronENST00000510738ENST00000536558PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-intronENST00000510738ENST00000404299PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-
intron-intronENST00000510738ENST00000381424PLEKHA5chr12

19285384

+ST8SIA1chr12

22440227

-

Top

FusionProtFeatures for PLEKHA5_ST8SIA1


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
PLEKHA5

Q9HAU0

ST8SIA1

Q92185

Involved in the production of gangliosides GD3 and GT3from GM3; gangliosides are a subfamily of complexglycosphinglolipds that contain one or more residues of sialicacid. {ECO:0000269|PubMed:7937974, ECO:0000269|PubMed:8058740,ECO:0000269|PubMed:8195250, ECO:0000269|PubMed:8631981}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000299275+32610_43751375DomainWW 1
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000309364+31310_4375651DomainWW 1
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000317589+32710_43751410DomainWW 1
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000355397+32810_43751405DomainWW 1
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000359180+32410_43751291DomainWW 1
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000429027+33210_43751532DomainWW 1
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000538714+32810_43752126DomainWW 1
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000540972+3410_437577DomainWW 1
TgeneST8SIA1chr12:19285384chr12:22440227ENST00000396037-05188_19078357RegionSubstrate binding
TgeneST8SIA1chr12:19285384chr12:22440227ENST00000396037-05274_27678357RegionSubstrate binding

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000299275+326169_268751375DomainPH
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000299275+32656_89751375DomainWW 2
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000309364+313169_26875651DomainPH
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000309364+31356_8975651DomainWW 2
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000317589+327169_268751410DomainPH
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000317589+32756_89751410DomainWW 2
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000355397+328169_268751405DomainPH
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000355397+32856_89751405DomainWW 2
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000359180+324169_268751291DomainPH
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000359180+32456_89751291DomainWW 2
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000429027+332169_268751532DomainPH
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000429027+33256_89751532DomainWW 2
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000538714+328169_268752126DomainPH
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000538714+32856_89752126DomainWW 2
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000540972+34169_2687577DomainPH
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000540972+3456_897577DomainWW 2
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000543806+12610_43-721152DomainWW 1
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000543806+126169_268-721152DomainPH
HgenePLEKHA5chr12:19285384chr12:22440227ENST00000543806+12656_89-721152DomainWW 2
TgeneST8SIA1chr12:19285384chr12:22440227ENST00000396037-051_2978357Topological domainCytoplasmic
TgeneST8SIA1chr12:19285384chr12:22440227ENST00000396037-0549_35678357Topological domainLumenal
TgeneST8SIA1chr12:19285384chr12:22440227ENST00000396037-0530_4878357TransmembraneHelical%3B Signal-anchor for type II membrane protein


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FusionGeneSequence for PLEKHA5_ST8SIA1


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(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
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* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
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GGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGAAACAAATGGAAGACTGCTGCGACCCTGCCCATCTCTTTGCT
ATGACTAAAATGAATTCCCCTATGGGGAAGAGCATGTGGTATGACGGGGAGTTTTTATACTCATTCACCATTGACAATTCAACTTACTCT
CTCTTCCCACAGGCAACCCCATTCCAGCTGCCATTGAAGAAATGCGCGGTGGTGGGAAATGGTGGGATTCTGAAGAAGAGTGGCTGTGGC
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TTAGTGACAGCTAATCCCAGCATAATTCGGCAAAGGTTTCAGAACCTTCTGTGGTCCAGAAAGACATTTGTGGACAACATGAAAATTTAT
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TCCACAGGACTTTTTCTGGTGAGCGCAGCTCTGGGTCTCTGTGAAGAGGTGGCCATCTATGGCTTCTGGCCCTTCTCTGTGAATATGCAT
GAGCAGCCCATCAGCCACCACTACTATGACAACGTCTTACCCTTTTCTGGCTTCCATGCCATGCCCGAGGAATTTCTCCAACTCTGGTAT

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GAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACT
GGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGAAACAAATGGAAGACTGCTGCGACCCTGCCCATCTCTTTGCT
ATGACTAAAATGAATTCCCCTATGGGGAAGAGCATGTGGTATGACGGGGAGTTTTTATACTCATTCACCATTGACAATTCAACTTACTCT
CTCTTCCCACAGGCAACCCCATTCCAGCTGCCATTGAAGAAATGCGCGGTGGTGGGAAATGGTGGGATTCTGAAGAAGAGTGGCTGTGGC
CGTCAAATAGATGAAGCAAATTTTGTCATGCGATGCAATCTCCCTCCTTTGTCAAGTGAATACACTAAGGATGTTGGATCCAAAAGTCAG
TTAGTGACAGCTAATCCCAGCATAATTCGGCAAAGGTTTCAGAACCTTCTGTGGTCCAGAAAGACATTTGTGGACAACATGAAAATTTAT
AACCACAGTTACATCTACATGCCTGCCTTTTCTATGAAGACAGGAACAGAGCCATCTTTGAGGGTTTATTATACACTGTCAGATGTTGGT
GCCAATCAAACAGTGCTGTTTGCCAACCCCAACTTTCTGCGTAGCATTGGAAAGTTCTGGAAAAGTAGAGGAATCCATGCCAAGCGCCTG
TCCACAGGACTTTTTCTGGTGAGCGCAGCTCTGGGTCTCTGTGAAGAGGTGGCCATCTATGGCTTCTGGCCCTTCTCTGTGAATATGCAT
GAGCAGCCCATCAGCCACCACTACTATGACAACGTCTTACCCTTTTCTGGCTTCCATGCCATGCCCGAGGAATTTCTCCAACTCTGGTAT

>In-frame_PLEKHA5_ENST00000317589_chr12_19285384_+_ST8SIA1_ENST00000396037_chr12_22440227_-_1062nt
ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCGAGTCTTCTTCATCAAC
GAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACT
GGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGAAACAAATGGAAGACTGCTGCGACCCTGCCCATCTCTTTGCT
ATGACTAAAATGAATTCCCCTATGGGGAAGAGCATGTGGTATGACGGGGAGTTTTTATACTCATTCACCATTGACAATTCAACTTACTCT
CTCTTCCCACAGGCAACCCCATTCCAGCTGCCATTGAAGAAATGCGCGGTGGTGGGAAATGGTGGGATTCTGAAGAAGAGTGGCTGTGGC
CGTCAAATAGATGAAGCAAATTTTGTCATGCGATGCAATCTCCCTCCTTTGTCAAGTGAATACACTAAGGATGTTGGATCCAAAAGTCAG
TTAGTGACAGCTAATCCCAGCATAATTCGGCAAAGGTTTCAGAACCTTCTGTGGTCCAGAAAGACATTTGTGGACAACATGAAAATTTAT
AACCACAGTTACATCTACATGCCTGCCTTTTCTATGAAGACAGGAACAGAGCCATCTTTGAGGGTTTATTATACACTGTCAGATGTTGGT
GCCAATCAAACAGTGCTGTTTGCCAACCCCAACTTTCTGCGTAGCATTGGAAAGTTCTGGAAAAGTAGAGGAATCCATGCCAAGCGCCTG
TCCACAGGACTTTTTCTGGTGAGCGCAGCTCTGGGTCTCTGTGAAGAGGTGGCCATCTATGGCTTCTGGCCCTTCTCTGTGAATATGCAT
GAGCAGCCCATCAGCCACCACTACTATGACAACGTCTTACCCTTTTCTGGCTTCCATGCCATGCCCGAGGAATTTCTCCAACTCTGGTAT

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ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCGAGTCTTCTTCATCAAC
GAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACT
GGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGAAACAAATGGAAGACTGCTGCGACCCTGCCCATCTCTTTGCT
ATGACTAAAATGAATTCCCCTATGGGGAAGAGCATGTGGTATGACGGGGAGTTTTTATACTCATTCACCATTGACAATTCAACTTACTCT
CTCTTCCCACAGGCAACCCCATTCCAGCTGCCATTGAAGAAATGCGCGGTGGTGGGAAATGGTGGGATTCTGAAGAAGAGTGGCTGTGGC
CGTCAAATAGATGAAGCAAATTTTGTCATGCGATGCAATCTCCCTCCTTTGTCAAGTGAATACACTAAGGATGTTGGATCCAAAAGTCAG
TTAGTGACAGCTAATCCCAGCATAATTCGGCAAAGGTTTCAGAACCTTCTGTGGTCCAGAAAGACATTTGTGGACAACATGAAAATTTAT
AACCACAGTTACATCTACATGCCTGCCTTTTCTATGAAGACAGGAACAGAGCCATCTTTGAGGGTTTATTATACACTGTCAGATGTTGGT
GCCAATCAAACAGTGCTGTTTGCCAACCCCAACTTTCTGCGTAGCATTGGAAAGTTCTGGAAAAGTAGAGGAATCCATGCCAAGCGCCTG
TCCACAGGACTTTTTCTGGTGAGCGCAGCTCTGGGTCTCTGTGAAGAGGTGGCCATCTATGGCTTCTGGCCCTTCTCTGTGAATATGCAT
GAGCAGCCCATCAGCCACCACTACTATGACAACGTCTTACCCTTTTCTGGCTTCCATGCCATGCCCGAGGAATTTCTCCAACTCTGGTAT

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ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCGAGTCTTCTTCATCAAC
GAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACT
GGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGAAACAAATGGAAGACTGCTGCGACCCTGCCCATCTCTTTGCT
ATGACTAAAATGAATTCCCCTATGGGGAAGAGCATGTGGTATGACGGGGAGTTTTTATACTCATTCACCATTGACAATTCAACTTACTCT
CTCTTCCCACAGGCAACCCCATTCCAGCTGCCATTGAAGAAATGCGCGGTGGTGGGAAATGGTGGGATTCTGAAGAAGAGTGGCTGTGGC
CGTCAAATAGATGAAGCAAATTTTGTCATGCGATGCAATCTCCCTCCTTTGTCAAGTGAATACACTAAGGATGTTGGATCCAAAAGTCAG
TTAGTGACAGCTAATCCCAGCATAATTCGGCAAAGGTTTCAGAACCTTCTGTGGTCCAGAAAGACATTTGTGGACAACATGAAAATTTAT
AACCACAGTTACATCTACATGCCTGCCTTTTCTATGAAGACAGGAACAGAGCCATCTTTGAGGGTTTATTATACACTGTCAGATGTTGGT
GCCAATCAAACAGTGCTGTTTGCCAACCCCAACTTTCTGCGTAGCATTGGAAAGTTCTGGAAAAGTAGAGGAATCCATGCCAAGCGCCTG
TCCACAGGACTTTTTCTGGTGAGCGCAGCTCTGGGTCTCTGTGAAGAGGTGGCCATCTATGGCTTCTGGCCCTTCTCTGTGAATATGCAT
GAGCAGCCCATCAGCCACCACTACTATGACAACGTCTTACCCTTTTCTGGCTTCCATGCCATGCCCGAGGAATTTCTCCAACTCTGGTAT

>In-frame_PLEKHA5_ENST00000299275_chr12_19285384_+_ST8SIA1_ENST00000396037_chr12_22440227_-_1062nt
ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCGAGTCTTCTTCATCAAC
GAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACT
GGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGAAACAAATGGAAGACTGCTGCGACCCTGCCCATCTCTTTGCT
ATGACTAAAATGAATTCCCCTATGGGGAAGAGCATGTGGTATGACGGGGAGTTTTTATACTCATTCACCATTGACAATTCAACTTACTCT
CTCTTCCCACAGGCAACCCCATTCCAGCTGCCATTGAAGAAATGCGCGGTGGTGGGAAATGGTGGGATTCTGAAGAAGAGTGGCTGTGGC
CGTCAAATAGATGAAGCAAATTTTGTCATGCGATGCAATCTCCCTCCTTTGTCAAGTGAATACACTAAGGATGTTGGATCCAAAAGTCAG
TTAGTGACAGCTAATCCCAGCATAATTCGGCAAAGGTTTCAGAACCTTCTGTGGTCCAGAAAGACATTTGTGGACAACATGAAAATTTAT
AACCACAGTTACATCTACATGCCTGCCTTTTCTATGAAGACAGGAACAGAGCCATCTTTGAGGGTTTATTATACACTGTCAGATGTTGGT
GCCAATCAAACAGTGCTGTTTGCCAACCCCAACTTTCTGCGTAGCATTGGAAAGTTCTGGAAAAGTAGAGGAATCCATGCCAAGCGCCTG
TCCACAGGACTTTTTCTGGTGAGCGCAGCTCTGGGTCTCTGTGAAGAGGTGGCCATCTATGGCTTCTGGCCCTTCTCTGTGAATATGCAT
GAGCAGCCCATCAGCCACCACTACTATGACAACGTCTTACCCTTTTCTGGCTTCCATGCCATGCCCGAGGAATTTCTCCAACTCTGGTAT

>In-frame_PLEKHA5_ENST00000538714_chr12_19285384_+_ST8SIA1_ENST00000396037_chr12_22440227_-_1062nt
ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCGAGTCTTCTTCATCAAC
GAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACT
GGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGAAACAAATGGAAGACTGCTGCGACCCTGCCCATCTCTTTGCT
ATGACTAAAATGAATTCCCCTATGGGGAAGAGCATGTGGTATGACGGGGAGTTTTTATACTCATTCACCATTGACAATTCAACTTACTCT
CTCTTCCCACAGGCAACCCCATTCCAGCTGCCATTGAAGAAATGCGCGGTGGTGGGAAATGGTGGGATTCTGAAGAAGAGTGGCTGTGGC
CGTCAAATAGATGAAGCAAATTTTGTCATGCGATGCAATCTCCCTCCTTTGTCAAGTGAATACACTAAGGATGTTGGATCCAAAAGTCAG
TTAGTGACAGCTAATCCCAGCATAATTCGGCAAAGGTTTCAGAACCTTCTGTGGTCCAGAAAGACATTTGTGGACAACATGAAAATTTAT
AACCACAGTTACATCTACATGCCTGCCTTTTCTATGAAGACAGGAACAGAGCCATCTTTGAGGGTTTATTATACACTGTCAGATGTTGGT
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GAGCAGCCCATCAGCCACCACTACTATGACAACGTCTTACCCTTTTCTGGCTTCCATGCCATGCCCGAGGAATTTCTCCAACTCTGGTAT

>In-frame_PLEKHA5_ENST00000540972_chr12_19285384_+_ST8SIA1_ENST00000396037_chr12_22440227_-_1062nt
ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCGAGTCTTCTTCATCAAC
GAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACT
GGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGAAACAAATGGAAGACTGCTGCGACCCTGCCCATCTCTTTGCT
ATGACTAAAATGAATTCCCCTATGGGGAAGAGCATGTGGTATGACGGGGAGTTTTTATACTCATTCACCATTGACAATTCAACTTACTCT
CTCTTCCCACAGGCAACCCCATTCCAGCTGCCATTGAAGAAATGCGCGGTGGTGGGAAATGGTGGGATTCTGAAGAAGAGTGGCTGTGGC
CGTCAAATAGATGAAGCAAATTTTGTCATGCGATGCAATCTCCCTCCTTTGTCAAGTGAATACACTAAGGATGTTGGATCCAAAAGTCAG
TTAGTGACAGCTAATCCCAGCATAATTCGGCAAAGGTTTCAGAACCTTCTGTGGTCCAGAAAGACATTTGTGGACAACATGAAAATTTAT
AACCACAGTTACATCTACATGCCTGCCTTTTCTATGAAGACAGGAACAGAGCCATCTTTGAGGGTTTATTATACACTGTCAGATGTTGGT
GCCAATCAAACAGTGCTGTTTGCCAACCCCAACTTTCTGCGTAGCATTGGAAAGTTCTGGAAAAGTAGAGGAATCCATGCCAAGCGCCTG
TCCACAGGACTTTTTCTGGTGAGCGCAGCTCTGGGTCTCTGTGAAGAGGTGGCCATCTATGGCTTCTGGCCCTTCTCTGTGAATATGCAT
GAGCAGCCCATCAGCCACCACTACTATGACAACGTCTTACCCTTTTCTGGCTTCCATGCCATGCCCGAGGAATTTCTCCAACTCTGGTAT


* Fusion transcript sequences (Full-length transcript).
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GCGCTCCCTTCGCTCGCTCGTTCCCTCCTCCCTCGGCAGCCGCGGCGGCAGCAGGAGAAGGCGGCGGCGGCGGCTAGGGATCAGACATGG
CGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCGAGTCTTCTTCATCAACGAGG
AGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCGGACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACTGGCT
GGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTATATAAAGAAACAAATGGAAGACTGCTGCGACCCTGCCCATCTCTTTGCTATGA
CTAAAATGAATTCCCCTATGGGGAAGAGCATGTGGTATGACGGGGAGTTTTTATACTCATTCACCATTGACAATTCAACTTACTCTCTCT
TCCCACAGGCAACCCCATTCCAGCTGCCATTGAAGAAATGCGCGGTGGTGGGAAATGGTGGGATTCTGAAGAAGAGTGGCTGTGGCCGTC
AAATAGATGAAGCAAATTTTGTCATGCGATGCAATCTCCCTCCTTTGTCAAGTGAATACACTAAGGATGTTGGATCCAAAAGTCAGTTAG
TGACAGCTAATCCCAGCATAATTCGGCAAAGGTTTCAGAACCTTCTGTGGTCCAGAAAGACATTTGTGGACAACATGAAAATTTATAACC
ACAGTTACATCTACATGCCTGCCTTTTCTATGAAGACAGGAACAGAGCCATCTTTGAGGGTTTATTATACACTGTCAGATGTTGGTGCCA
ATCAAACAGTGCTGTTTGCCAACCCCAACTTTCTGCGTAGCATTGGAAAGTTCTGGAAAAGTAGAGGAATCCATGCCAAGCGCCTGTCCA
CAGGACTTTTTCTGGTGAGCGCAGCTCTGGGTCTCTGTGAAGAGGTGGCCATCTATGGCTTCTGGCCCTTCTCTGTGAATATGCATGAGC
AGCCCATCAGCCACCACTACTATGACAACGTCTTACCCTTTTCTGGCTTCCATGCCATGCCCGAGGAATTTCTCCAACTCTGGTATCTTC
ATAAAATCGGTGCACTGAGAATGCAGCTGGACCCATGTGAAGATACCTCACTCCAGCCCACTTCCTAGGAACAATGGAAGAAGAAAGGAC
TGAACCAGGGTATTTTTGTTAGGTTTTCTATGTGACTCCAAGAGGGAATGGTCAAGTTGTTTCATGAGTTTGCATGGGCCCTTGGAAAAA
CAGGAAAGGAGCAATGAAGATCCAAGCAAAACTTTACTTTCAGCGTTGGCTTGGAGGACAAATAAGAAATGAAACATCCTATGAAATACT
TTATAGCACATGGCAGATTTGCAACTAGTAAAATGCTGGTGAAATGCTGTTGGTAAAGCACATGGTTCAAATCTAGAAGATGCAGTTCAA
AAACAAGACAGACTCGAGTTGTTAGGGCTGAGGAACCAATCAAGGTAGAACAAAGAAAATGTTGGGGTAAAAGTGTTGCTGATTGTCAAC
ACAAACTGGCTTAATAATATTAATAAGAACCTGTCTTATTAAGACTGGCTTTAGAACCGTAGGTTTTTTTAAAAAATTATTATTTATTTT
TGCCCTCTTTGGGGAAGTGGGTGGGTAGATTTAAAAAATCCCTTCCTGAGTAATAAAGATACAAAATGTTACTGCTGATAATTGTGATTT
GTTGAGCCACGTCTATATTAACTATAGCTCCCCTCTATTTTTAAAATTTTACATAAGAATTGCTTCTTCCTCTTTTGTCAAGTCCACAGA
GACAATGTGAAGCATTATTGAATTTAGACTGTGTTGCTTCATAGTCTGGATAACAGGAGCCACTTTCCTTCCTCAGAATTTAGGACATAA
ACCCAATTTTAGGTCTGCATTATGTAAGCCTGTTTGCATTGTCATTTTTATTTTAGTGCAAAAGACTACCAATATGAGTGAATTATTTGT
TTGTAAATTGGCATAATTGTCTTCATAATTTAATGTTCAGAAATGCAGTAAAGCACGTTGATGAAAAGCTTAGTCTCTGTGGAAGACAGA
CCAGAAGACAAATCCCTTTTCTATCTACTGTGGCATATTCACTGCAAGGTAAAGGACATGTATGCATACATGCAAGAATGAATTGAGCGA
AACTTTGAATATGTTTCCTCTTTTGAGCTATTGTTATTTAGTAGTTACCTAAAAAAGAATACATTTTTACTAGTATACCATTAAAAATGT
AAAAGGCTTAACATGTATGCATACATGTAGACACACATACACACACACAAAGTTAAACAAAGCTCATTACTGTGCAACTATGAAAGCTGA
ACTCATATGACCTGGTATGGCAAAAATTTGTAACCAGTGTTGGAGAATCACAAATGTGTTATGCACTATCCATTACATGTTGATATAAGA
CAACCGAGCTCACTGGTTGCCGCACATAATACCCATAGCAGCACAAGATGCAAGTCTTACCCCCAAATGCTTACCCGGAATGAGCAGAAT
TGTCTTACTCATCCTGATTTTACCCAAAATCTCATGAATGGGCTTGCTGTTGAGCGTGGTCACACAAGGTATAGTTTGTACAAGTAAAGA
AATGTGAATTAGTAGCTATTTATTTCCTTAGTAGCAGGTAGGACTACTTAGCTTGTTACAACAGCTTTGATACACAGTAAGAAAACTCTA
CTGACAGATTACAAGCAGCCAAATGTGTTTACATTTCAGAGAAGGGTAAGGGAAGCCTCTCGTTGTCTTCATACTTTGGAATGTCTTAAG
CTAAAATGTGACACTAGAGTTCAATTTCTTTTTTATTTTAAATGTCACTAAATTGTAGGTAAACTGTACCAAAAAGTTCTAGTTTAATTT
TAACAGTAAAAACTCAGCATACCATGTTACCACGTAAACAATAATGGCTGGTATTTTCTGTGGGTTAATTTAACATGACATAAACATAGG
AAAGCCCTTGGCAAAATTCTACATCATTGAAGTAGACCATTTCTAAATGCAATTAAATAGTGAGGTTATTATAAAAATTAGAATTTAAAA
TATGACTTGTTGATAGTGCAGATTATAATGTTACTTAGAAAGTTAAGAATTCGAGAGTAATGATGCTATTGGAGAACTGGTTTGCTATAC
GGCAGCAAAAACATAATGAGAATGTACCATGAAGAAATTGTGTTAAATATTCACTTTGAGTGAAACTTTAAATATGTTTCCTCTTTTGAG
CTACTGTTATTTAGCAGTTACCTAAAAAAGAATACATTTTTACTAGTCTACCATTAAAAATATAAAAGGCTTAACAAAAACGCATATAAA
AGTTAATAAAATGTTACTCAGATTAGTACTTTAATTGTTAAAATGTAATTAATGAGCTCCATAGAGCCCATACATCACAGTTCCATTGAA
AATATCATCTGGACTAGAATCTCTTAAACCCAGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAG
GGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAGAAAATATTATGTGGAAATTTTTCATCTTTTTATGATGCCTGGGA
TAGATTTATGCAGTAGATTTATATATAATGTTTAGTTTACAAACTTGTGAAACTATTTCATGTGGGTTCTGAAAGGCAAAACAGAAATGG
CCAGTGCTGGTGATGTTTGATTAGACCAGCTCTTCTCAGCTGGGGTGATTCATTATCCCTCTCTGGTGACATTTGGCAATGTCTGGAGAC
CAGAGACATTTTTTATTTTCATGACTCAAGGGTGCTAATAGCATGTACTTAGTAGAGGTTAGGGATCCTGCTAAAGATCTTACAATGCAC
AAGTCAGCCTCTCACAGCAAAATAATTATCCAGGCTGAGATGTCAGTAGTATCAAGGTTGACATCTCAGACCTGGATTAGACCTGGATTA
GACCAAAATGAAATTTTGATTGTTCCACCTTGTCTTCACTTAAAGATAGATATACATGCTCACAGCATTCAAAATATGACTACAATTTAA
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FusionGenePPI for PLEKHA5_ST8SIA1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
PLEKHA5DES, EVPL, EXTL3, KRT19, KTN1, LAMB2, PLEC, SPTAN1, SPTBN1, PROM1, CEP350, KIF3A, CEP250, PLEKHA6, ARHGEF9, PPP1R13B, BLOC1S6, KRT20, MAX, PLEKHA5, CCDC186, CCDC92, SH3BP5L, CCDC88B, KANSL1, SOGA1, WASH2P, ELAVL1, SH3KBP1, LSM4, UPF1, LATS2, YWHAB, CIAO1, AURKB, PDZD11, FHL3, GINM1, SRPK2, KIAA0753, SPICE1, DCTN1, DYNLT1, POC1A, TMEM17, XPO1, CLTC, HIF1A, KIF11, PPP2CB, PPP2R1A, SEC16A, CDH1, SSSCA1, IL17RA, KCTD3, KIF13B, ZBTB21, KSR1, GIGYF1, LRFN1, DENND1A, SH3PXD2A, SRGAP2, EIF4E2, SIPA1L1, LIMA1, MAGI1, TESK2, DCLK1, ZNF638, SRSF12, SYDE1, AGAP1, MAST3, RTKN, PPM1H, CDC25B, CDK16, CBY1, RAB3IPST8SIA1POTEF, RPIA, BRAT1, INTS12, NMD3, IPO13, HOOK2, INTS1, RUFY1, ZMYM2


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for PLEKHA5_ST8SIA1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for PLEKHA5_ST8SIA1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
TgeneST8SIA1C0023895Liver diseases1CTD_human
TgeneST8SIA1C0235032Neurotoxicity Syndromes1CTD_human