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FusionGeneSummary

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RelatedDiseases

Fusion gene ID: 25591

FusionGeneSummary for OSCP1_NF1

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: OSCP1_NF1
Fusion gene ID: 25591
HgeneTgene
Gene symbol

OSCP1

NF1

Gene ID

127700

4763

Gene nameorganic solute carrier partner 1neurofibromin 1
SynonymsC1orf102|NOR1NFNS|VRNF|WSS
Cytomap

1p34.3

17q11.2

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptionprotein OSCP1organic solute carrier protein 1organic solute transport protein 1oxidored nitro domain containing proteinoxidored-nitro domain-containing protein 1neurofibrominneurofibromatosis 1neurofibromatosis-related protein NF-1truncated neurofibromin 1
Modification date2018051920180527
UniProtAcc

Q8WVF1

P21359

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000495222, ENST00000235532, 
ENST00000356637, ENST00000433045, 
ENST00000315643, ENST00000354267, 
ENST00000356175, ENST00000358273, 
ENST00000431387, ENST00000581113, 
ENST00000417592, ENST00000444181, 
Fusion gene scores* DoF score4 X 4 X 4=6415 X 13 X 12=2340
# samples 416
** MAII scorelog2(4/64*10)=-0.678071905112638
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(16/2340*10)=-3.8703647195834
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
Context

PubMed: OSCP1 [Title/Abstract] AND NF1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID
TgeneNF1

GO:0043547

positive regulation of GTPase activity

2121371


check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
TCGARVMESOTCGA-UD-AAC4-01AOSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
intron-3CDSENST00000495222ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-3CDSENST00000495222ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000495222ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000495222ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000495222ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000495222ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000235532ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000235532ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000235532ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000356637ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000356637ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000356637ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-3CDSENST00000433045ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-3CDSENST00000433045ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000433045ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000433045ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000433045ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
intron-intronENST00000433045ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000315643ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000315643ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000315643ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000354267ENST00000356175OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
In-frameENST00000354267ENST00000358273OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000431387OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000581113OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000417592OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+
5CDS-intronENST00000354267ENST00000444181OSCP1chr1

36915859

-NF1chr17

29701031

+

Top

FusionProtFeatures for OSCP1_NF1


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
OSCP1

Q8WVF1

NF1

P21359

May be involved in drug clearance in the placenta.{ECO:0000269|PubMed:16006562}. Stimulates the GTPase activity of Ras. NF1 shows greateraffinity for Ras GAP, but lower specific activity. May be aregulator of Ras activity. {ECO:0000269|PubMed:2121371,ECO:0000269|PubMed:8417346}.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note


Top

FusionGeneSequence for OSCP1_NF1


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.
>In-frame_OSCP1_ENST00000235532_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000356175_chr17_29701031_+_85aa

>In-frame_OSCP1_ENST00000235532_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000358273_chr17_29701031_+_85aa

>In-frame_OSCP1_ENST00000356637_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000356175_chr17_29701031_+_85aa

>In-frame_OSCP1_ENST00000356637_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000358273_chr17_29701031_+_85aa

>In-frame_OSCP1_ENST00000315643_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000356175_chr17_29701031_+_85aa

>In-frame_OSCP1_ENST00000315643_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000358273_chr17_29701031_+_85aa

>In-frame_OSCP1_ENST00000354267_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000356175_chr17_29701031_+_85aa

>In-frame_OSCP1_ENST00000354267_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000358273_chr17_29701031_+_85aa


* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).
>In-frame_OSCP1_ENST00000235532_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000356175_chr17_29701031_+_255nt
ATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATC
CCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCAC

>In-frame_OSCP1_ENST00000235532_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000358273_chr17_29701031_+_255nt
ATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATC
CCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCAC

>In-frame_OSCP1_ENST00000356637_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000356175_chr17_29701031_+_255nt
ATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATC
CCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCAC

>In-frame_OSCP1_ENST00000356637_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000358273_chr17_29701031_+_255nt
ATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATC
CCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCAC

>In-frame_OSCP1_ENST00000315643_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000356175_chr17_29701031_+_255nt
ATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATC
CCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCAC

>In-frame_OSCP1_ENST00000315643_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000358273_chr17_29701031_+_255nt
ATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATC
CCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCAC

>In-frame_OSCP1_ENST00000354267_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000356175_chr17_29701031_+_255nt
ATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATC
CCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCAC

>In-frame_OSCP1_ENST00000354267_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000358273_chr17_29701031_+_255nt
ATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATC
CCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCAC


* Fusion transcript sequences (Full-length transcript).
>In-frame_OSCP1_ENST00000235532_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000356175_chr17_29701031_+_3859nt
ATTGGGACGCTGCGGCCTGGCCTTCAGGCCACTGGCTACCGAACCCCGGGGCTCTTCACCAGTCCAGCTCGTTTCCAGCACCATGTCGGT
GCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATCCCGGGAGA
CAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCACGGATCCGC
AAGCCAAGTGCAGAAGCAAAGAAGCGCTGGCAGTTTCAAACGTAATAGCATTAAGAAGATCGTGTGAAGCTTGCTTGCTTTCTTTTTTAA
AATCAACTTAACATGGGCTCTTCACTAGTGACCCCTTCCCTGTCCTTGCCCTTTCCCCCCATGTTGTAATGCTGCACTTCCTGTTTTATA
ATGAACCCATCCGGTTTGCCATGTTGCCAGATGATCAACTCTTCGAAGCCTTGCCTAAATTTAATGCTGCCTTTTCTTTAACTTTTTTTC
TTCTACTTTTGGCGTGTATCTGGTATATGTAAGTGTTCAGAACAACTGCAAAGAAAGTGGGAGGTCAGGAAACTTTTAACTGAGAAATCT
CAATTGTAAGAGAGGATGAATTCTTGAATACTGCTACTACTGGCCAGTGATGAAAGCCATTTGCACAGAGCTCTGCCTTCTGTGGTTTTC
CCTTCTTCATCCTACAGAGTAAAGTGTTAGTCCTATTTATACATTTTTCAAGATACAAGTTTATGAGAGAAATAGTATTATAACCCCAGT
ATGTTTAATCTTTTAGCTGTGGACTTTTTTTTTAACCGTACAAAACTGAAAGAACCATAGAGGTCAAGCCTCAGTGACTTGACACCATAA
AGCCACAGACAAGGTACTTGGGGGGGAGGGCAGGGAAATTTCATATTTTATAGTGGATTCTTAAGAAATACTAACACTTGAGTATTAGCA
ATAATTACAGGAAAATAAGTGCGACCACATATATCTTAACATTACTGAATTAAAACTATGGCTTCTAAGTCCTTATCCAAACTCAGTCAT
CCAAACTAGTTTATTTTTTTCTCCAGTTGATTATCTTTTAATTTTTAATTTTGCTAAAGGTGGTTTTTTTGTGTTTTGTTTTTTGTAAAC
CAAAACTATACTAAGTATAGTAATTATATATATATATATATTTTTTCCCCTCCCCCTCTTCTTTCCTAACTAATTCTGAGCAGGGTAATC
AGTGAACAAAGTGTTGAAAATTGTTCCCAGAAGGTAATTTTCATAGATGTTTGCATTAGCTCCATAGCAAAATGGAATGGTACGTGACAT
TTAGGGTAGCTGATATTTTTATTTTGTTAAATAATTTCCAAGAATAGAGTATGGTGTATATTATAAATTTCTTTGATAAGATGTATTTTG
AATGTCTTTTAATCTTCCTCCTCCTCTCCAAAAAAATCAGAAACCTCTTTAAGAAAACATGTAGGTTATATATGCTAGAATTGCATTTAA
TCACTGTGAAAAGACTGGTCAGCCTGCATTAGTATGACAGTAGGGGGGCTGTTAGAATTGCTGCTATACTGGTGGTATGGATTATCATGG
CATTGGAATTTTCATAGTAATGCAGATCCAATTTCTTTGTGGTACCTGCAGTTTACAAAATAATTTGACTTCAGTGAGCATATTGGTATC
TGGATGTTCCAATTTAGAACTAAACCATATTTATTACAAAAAGATATTAATCCCTCTACTCCCAGGTTCCCTTTATATGTTAAGATATAA
TGGCTTTGAGGGGGGAAAAAATAAACCTAGGGGAGAGGGGAGTTTCCTGTAGTGCTGTTTCATTAGAGGATTTCAGTAAATTAAATTCCA
CAGCTAATTCAATAAATAATGGTACATTTAAGTGTTCTGATTTTAATAATATATTTCACATTTATCCACACAGTAACAATGTAATATGTT
AATGTAAATAAAATTGGTTTTGATACTCAGAAATAACAAGAATTTAATTTTTTAAATTTGTTTACAGTCCTGGGAAAAGTAAGAATTATT
TGCCAAAATAAGAGGAAAGAAAACCTTAGTATTATTAATGAGTTTACCATAGAATTGTTGGAAATACTGAAGACAGGTGCAATTTACTAA
ACTTTTGTTTTTAAACTATTGTAGAGGCTGCATTAGAAGAAAATGTTTATAATGACAGAGCAACTATGACTATATAAAAAAGCTGAAATT
AGAACTGTGTTTAGAAATAGATCAGTAACCCAGTGCCAAGGATGCCAAGCTGCCACCATGGTCTTGGCTCTCCCACAACCCAGTGTTTCT
GGGGTAAGTTTCACAGTTTCTAGGCCCTGGAATAGCAGGCAGTGTAAGCCTTTGATAACTTTAGTTCGATGTTTTTCTTGTTTTTGTTTG
TTGGTTTGGTGCATATGATAGTGGGTGTTATGCTATTTTGCTCTTCCCATCAAAATAAAGAAACTTCCAGAGGTTTACTGTTAAAAATAC
TGATATTTCCATAAACGGGTTTACCAAGGGTGTAGTATTTCATACCGCCTGAAATGATCAGCATTGGCACAAATCAAAATTCAGCCGCCT
TTGAAATGCAAAAATACCTTTGACTAGTAAGTACATCCTAGGAGTTTGAAAACTTAACTAAGGTTTAAAATTTACCTTGTTTAAAGAACT
TCTGACTTTTGAGGAAAATCTAGCTTTCCAAGTAACTAAAATGTACATGAGATAAACCTCTCACCACTATGTGTCCCTTGAGAAATGCAA
CACTTTTTTAGTCTTCATACTTGTAATCTATAAAAGAAATTCTGAAGTTTAGACCAAGTTGCCCATTTCTGCGTAATTGACATAAGTTCT
GTTAAAAATATTATAAGTAATTCGTTTCGGTTTGTAGATGTTTCCCCTGACTTGTTAAAGAGGAAACCAGGAACTCAGTCATGTTTTTGT
CCTGGATAATCTACCTGTTATGCCAGTACTCCCATCCGAGGGGCATGCCCTTAGTTGCCCAGATGGAGATGCAGTTCAGTAGATTTGGGG
CAAAGTGGCTACAGCTCTGTCTTCCATTCACTCAACACCTGTTCATGACTGAGCCAGGTGCCCAGGACACATCCTAAACAGTCAGCTTCT
ATCCTGTGTCCTAGTTGGGGAGACAGAGTGCCAGCCAGCAACCCTCCCAGGTTTGTAGGTTTTAGGGGTTTTCAGTTTTGTTTGGGTTTT
TTGTTTTTTGTTTTTGTTTCTACATCCTTCCCCGACTCCCAGGCATAATGAGGCATGTCTTACTCAATGTTATGCAATGGATTTAGGCAA
AAATTCATTCTTAGTGTCAGCCACACAATTTTTTTTAATGCAGTATATTCACCTGTAAATAGTTTGTGTAAAATTTGACAAAAAAAGTAT
ATTTACTATACTGTAAATATATGTGATGATATATTGTATTATTTTGCTTTTTTGTAAAGCAGTTAGTTGCTGCACATGGATAACAACAAA
AATTTGATTATTCTCGTGTTAGTATTGTTAACTTCTTTTTGCGACTGCGTTACATCATTTAAAGAAAATGCTGTGTATTGTAAACTTAAA
TTGTATATGATAACTTACTGTCCTTTCCATCCGGGCCTAAACTTTGGCAGTTCCTTTGTCTACAACCTTGTTAATACTGTAAACAGTTGT
ACGCCAGCAGGAAAAATACTGCCCAACAGACAAAATCGATCATTGTAGGGGAAAATCATAGAAATCCATTTCAGATCTTTATTGTTCCTC

>In-frame_OSCP1_ENST00000235532_chr1_36915859_-_NF1_ENST00000358273_chr17_29701031_+_3859nt
ATTGGGACGCTGCGGCCTGGCCTTCAGGCCACTGGCTACCGAACCCCGGGGCTCTTCACCAGTCCAGCTCGTTTCCAGCACCATGTCGGT
GCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCGACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATCCCGGGAGA
CAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCCACTGTAACAGTGGACGAACTCGCCACGGATCCGC
AAGCCAAGTGCAGAAGCAAAGAAGCGCTGGCAGTTTCAAACGTAATAGCATTAAGAAGATCGTGTGAAGCTTGCTTGCTTTCTTTTTTAA
AATCAACTTAACATGGGCTCTTCACTAGTGACCCCTTCCCTGTCCTTGCCCTTTCCCCCCATGTTGTAATGCTGCACTTCCTGTTTTATA
ATGAACCCATCCGGTTTGCCATGTTGCCAGATGATCAACTCTTCGAAGCCTTGCCTAAATTTAATGCTGCCTTTTCTTTAACTTTTTTTC
TTCTACTTTTGGCGTGTATCTGGTATATGTAAGTGTTCAGAACAACTGCAAAGAAAGTGGGAGGTCAGGAAACTTTTAACTGAGAAATCT
CAATTGTAAGAGAGGATGAATTCTTGAATACTGCTACTACTGGCCAGTGATGAAAGCCATTTGCACAGAGCTCTGCCTTCTGTGGTTTTC
CCTTCTTCATCCTACAGAGTAAAGTGTTAGTCCTATTTATACATTTTTCAAGATACAAGTTTATGAGAGAAATAGTATTATAACCCCAGT
ATGTTTAATCTTTTAGCTGTGGACTTTTTTTTTAACCGTACAAAACTGAAAGAACCATAGAGGTCAAGCCTCAGTGACTTGACACCATAA
AGCCACAGACAAGGTACTTGGGGGGGAGGGCAGGGAAATTTCATATTTTATAGTGGATTCTTAAGAAATACTAACACTTGAGTATTAGCA
ATAATTACAGGAAAATAAGTGCGACCACATATATCTTAACATTACTGAATTAAAACTATGGCTTCTAAGTCCTTATCCAAACTCAGTCAT
CCAAACTAGTTTATTTTTTTCTCCAGTTGATTATCTTTTAATTTTTAATTTTGCTAAAGGTGGTTTTTTTGTGTTTTGTTTTTTGTAAAC
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CTTCCCGTCACGGCGTTGCCCCAGCAACCGGACTATTGGGACGCTGCGGCCTGGCCTTCAGGCCACTGGCTACCGAACCCCGGGGCTCTT
CACCAGTCCAGCTCGTTTCCAGCACCATGTCGGTGCGGACGCTACCGCTGCTCTTCTTGAACTTGGGCGGGGAGATGCTTTACATCCTCG
ACCAACGGCTGCGGGCCCAGAACATCCCGGGAGACAAGGCCCGCAAAGGAATCGACAAGGAGAACGTTGAACTCTCCCCTACCACTGGCC
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AGATCGTGTGAAGCTTGCTTGCTTTCTTTTTTAAAATCAACTTAACATGGGCTCTTCACTAGTGACCCCTTCCCTGTCCTTGCCCTTTCC
CCCCATGTTGTAATGCTGCACTTCCTGTTTTATAATGAACCCATCCGGTTTGCCATGTTGCCAGATGATCAACTCTTCGAAGCCTTGCCT
AAATTTAATGCTGCCTTTTCTTTAACTTTTTTTCTTCTACTTTTGGCGTGTATCTGGTATATGTAAGTGTTCAGAACAACTGCAAAGAAA
GTGGGAGGTCAGGAAACTTTTAACTGAGAAATCTCAATTGTAAGAGAGGATGAATTCTTGAATACTGCTACTACTGGCCAGTGATGAAAG
CCATTTGCACAGAGCTCTGCCTTCTGTGGTTTTCCCTTCTTCATCCTACAGAGTAAAGTGTTAGTCCTATTTATACATTTTTCAAGATAC
AAGTTTATGAGAGAAATAGTATTATAACCCCAGTATGTTTAATCTTTTAGCTGTGGACTTTTTTTTTAACCGTACAAAACTGAAAGAACC
ATAGAGGTCAAGCCTCAGTGACTTGACACCATAAAGCCACAGACAAGGTACTTGGGGGGGAGGGCAGGGAAATTTCATATTTTATAGTGG
ATTCTTAAGAAATACTAACACTTGAGTATTAGCAATAATTACAGGAAAATAAGTGCGACCACATATATCTTAACATTACTGAATTAAAAC
TATGGCTTCTAAGTCCTTATCCAAACTCAGTCATCCAAACTAGTTTATTTTTTTCTCCAGTTGATTATCTTTTAATTTTTAATTTTGCTA
AAGGTGGTTTTTTTGTGTTTTGTTTTTTGTAAACCAAAACTATACTAAGTATAGTAATTATATATATATATATATTTTTTCCCCTCCCCC
TCTTCTTTCCTAACTAATTCTGAGCAGGGTAATCAGTGAACAAAGTGTTGAAAATTGTTCCCAGAAGGTAATTTTCATAGATGTTTGCAT
TAGCTCCATAGCAAAATGGAATGGTACGTGACATTTAGGGTAGCTGATATTTTTATTTTGTTAAATAATTTCCAAGAATAGAGTATGGTG
TATATTATAAATTTCTTTGATAAGATGTATTTTGAATGTCTTTTAATCTTCCTCCTCCTCTCCAAAAAAATCAGAAACCTCTTTAAGAAA
ACATGTAGGTTATATATGCTAGAATTGCATTTAATCACTGTGAAAAGACTGGTCAGCCTGCATTAGTATGACAGTAGGGGGGCTGTTAGA
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GTTTCATTAGAGGATTTCAGTAAATTAAATTCCACAGCTAATTCAATAAATAATGGTACATTTAAGTGTTCTGATTTTAATAATATATTT
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TTAATCTTCCTCCTCCTCTCCAAAAAAATCAGAAACCTCTTTAAGAAAACATGTAGGTTATATATGCTAGAATTGCATTTAATCACTGTG
AAAAGACTGGTCAGCCTGCATTAGTATGACAGTAGGGGGGCTGTTAGAATTGCTGCTATACTGGTGGTATGGATTATCATGGCATTGGAA
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FusionGenePPI for OSCP1_NF1


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors
OSCP1WDR54, XPO1, GYG2, KANK4, DRG1NF1HRAS, SMARCA4, POLR2A, TIRAP, SIRT7, VCP, NSFL1C, CAV1, YWHAB, FAF2, NXF1, CCDC8, HLA-DPA1, EFNB2, CD274, TNFSF13B, CA14, SLAMF1, VSIG4, TGOLN2, HTR6, NOSIP, KRAS, CLK1, CDC5L, APP, YWHAH, PML, TRAF6, PTEN, SDC2, EGFR, CD79B, P4HA3, SCN3B, VSIG1, SIGLECL1, EPHA1, FAM174A, KCTD3, KIF13B, ZBTB21, KSR1, CGN, GIGYF1, LRFN1, RTKN, MAST3, DENND1A, SH3PXD2A, SRGAP2, DENND4C, PPM1H, EIF4E2, SIPA1L1, LIMA1, RALGPS2, MAGI1, CBY1, TESK2, CDC25C, DCLK1, GIGYF2, HDAC4, LPIN3, ZNF638, CAMSAP2, NADK, MAPKAP1, SRSF12, RASAL2, SYDE1, KIAA1804, TIAM1, AGAP1, CDC25B, CDK16, SH3RF3, PHLDB2, PLEKHA7, KIF1C, OSBPL6, FAM110B, USP21, NAV1, TANC2, PTPN13, FAM53C, ANKRD34A, STARD13, PTPN14, GAB2, DENND4A, INPP5E, TOP1, TOP2A, TOP3A, NRAS


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


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RelatedDrugs for OSCP1_NF1


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

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RelatedDiseases for OSCP1_NF1


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
TgeneNF1C0027831Neurofibromatosis 134CTD_human;ORPHANET;UNIPROT
TgeneNF1C2931482Neurofibromatosis-Noonan syndrome5CTD_human;ORPHANET;UNIPROT
TgeneNF1C0349639Juvenile Myelomonocytic Leukemia3CTD_human;HPO;ORPHANET
TgeneNF1C0004114Astrocytoma2CTD_human;HPO
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TgeneNF1C0025202melanoma2CTD_human
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TgeneNF1C0001430Adenoma1CTD_human
TgeneNF1C0004352Autistic Disorder1CTD_human
TgeneNF1C0016057Fibrosarcoma1CTD_human
TgeneNF1C0017636Glioblastoma1CTD_human
TgeneNF1C0017638Glioma1CTD_human
TgeneNF1C0023186Learning Disorders1CTD_human
TgeneNF1C0023827liposarcoma1CTD_human
TgeneNF1C0027809Neurilemmoma1CTD_human
TgeneNF1C0027830neurofibroma1CTD_human
TgeneNF1C0027962Melanocytic nevus1CTD_human
TgeneNF1C0031511Pheochromocytoma1CTD_human
TgeneNF1C0162678Neurofibromatoses1CTD_human;HPO
TgeneNF1C1261473Sarcoma1CTD_human
TgeneNF1C1834235NEUROFIBROMATOSIS, FAMILIAL SPINAL1CTD_human;UNIPROT
TgeneNF1C3714756Intellectual Disability1CTD_human;HPO