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Fusion gene ID: 18603 |
FusionGeneSummary for KIAA0391_FAM177A1 |
 Fusion gene summary |
| Fusion gene information | Fusion gene name: KIAA0391_FAM177A1 | Fusion gene ID: 18603 | Hgene | Tgene | Gene symbol | KIAA0391 | FAM177A1 | Gene ID | 9692 | 283635 |
| Gene name | KIAA0391 | family with sequence similarity 177 member A1 | |
| Synonyms | MRPP3|PRORP | C14orf24 | |
| Cytomap | 14q13.2 | 14q13.2 | |
| Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
| Description | mitochondrial ribonuclease P catalytic subunitmitochondrial RNase P protein 3mitochondrial RNase P subunit 3mitochondrial ribonuclease P protein 3proteinaceous RNase P | protein FAM177A1 | |
| Modification date | 20180523 | 20180519 | |
| UniProtAcc | O15091 | Q8N128 | |
| Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000604948, ENST00000557565, ENST00000250377, ENST00000321130, ENST00000534898, ENST00000603544, ENST00000605870, ENST00000603588, | ENST00000396472, ENST00000382406, ENST00000280987, ENST00000554052, | |
| Fusion gene scores | * DoF score | 2 X 1 X 3=6 | 7 X 7 X 4=196 |
| # samples | 3 | 9 | |
| ** MAII score | log2(3/6*10)=2.32192809488736 | log2(9/196*10)=-1.12285674778553 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | |
| Context | PubMed: KIAA0391 [Title/Abstract] AND FAM177A1 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
| Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation | |||
| * DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
| Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
| Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
| Hgene | KIAA0391 | GO:0097745 | mitochondrial tRNA 5'-end processing | 25953853 |
| Fusion gene information from three resources (ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018)) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| Data type | Source | Cancer type | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| TCGA | RV | HNSC | TCGA-CV-A45U-01A | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| TCGA | RV | KIRC | TCGA-B0-4849-01A | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| * LD: Li Ding group's fusion gene list RV: Roel Verhaak group's fusion gene list ChiTaRs fusion database |
| Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| In-frame | ENST00000604948 | ENST00000396472 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000604948 | ENST00000382406 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000604948 | ENST00000280987 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000604948 | ENST00000554052 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000557565 | ENST00000396472 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000557565 | ENST00000382406 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000557565 | ENST00000280987 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000557565 | ENST00000554052 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000250377 | ENST00000396472 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000250377 | ENST00000382406 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000250377 | ENST00000280987 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000250377 | ENST00000554052 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000321130 | ENST00000396472 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000321130 | ENST00000382406 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000321130 | ENST00000280987 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000321130 | ENST00000554052 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000534898 | ENST00000396472 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000534898 | ENST00000382406 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000534898 | ENST00000280987 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000534898 | ENST00000554052 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000603544 | ENST00000396472 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000603544 | ENST00000382406 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000603544 | ENST00000280987 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000603544 | ENST00000554052 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000605870 | ENST00000396472 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000605870 | ENST00000382406 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| In-frame | ENST00000605870 | ENST00000280987 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000605870 | ENST00000554052 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| intron-3CDS | ENST00000603588 | ENST00000396472 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| intron-3CDS | ENST00000603588 | ENST00000382406 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| intron-3CDS | ENST00000603588 | ENST00000280987 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
| intron-intron | ENST00000603588 | ENST00000554052 | KIAA0391 | chr14 | 35649983 | + | FAM177A1 | chr14 | 35546356 | + |
Top |
FusionProtFeatures for KIAA0391_FAM177A1 |
| Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
| Hgene | Tgene |
| KIAA0391 | FAM177A1 |
| Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at . * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
| - In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Tgene | >FAM177A1 | chr14:35649983 | chr14:35546356 | ENST00000280987 | + | 1 | 5 | 136_173 | 113 | 237 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | >FAM177A1 | chr14:35649983 | chr14:35546356 | ENST00000382406 | + | 2 | 6 | 136_173 | 90 | 214 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | >FAM177A1 | chr14:35649983 | chr14:35546356 | ENST00000396472 | + | 3 | 7 | 136_173 | 90 | 214 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| - In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Hgene | >KIAA0391 | chr14:35649983 | chr14:35546356 | ENST00000250377 | + | 5 | 8 | 342_578 | 330 | 489 | Domain | Note=PRORP |
| Hgene | >KIAA0391 | chr14:35649983 | chr14:35546356 | ENST00000321130 | + | 4 | 7 | 342_578 | 409 | 568 | Domain | Note=PRORP |
| Hgene | >KIAA0391 | chr14:35649983 | chr14:35546356 | ENST00000534898 | + | 5 | 8 | 342_578 | 425 | 584 | Domain | Note=PRORP |
| Hgene | >KIAA0391 | chr14:35649983 | chr14:35546356 | ENST00000603544 | + | 4 | 7 | 342_578 | 409 | 568 | Domain | Note=PRORP |
| Hgene | >KIAA0391 | chr14:35649983 | chr14:35546356 | ENST00000604948 | + | 5 | 8 | 342_578 | 330 | 489 | Domain | Note=PRORP |
| Hgene | >KIAA0391 | chr14:35649983 | chr14:35546356 | ENST00000605870 | + | 4 | 7 | 342_578 | 53 | 212 | Domain | Note=PRORP |
Top |
FusionGeneSequence for KIAA0391_FAM177A1 |
| For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. (nt: nucleotides, aa: amino acids) |
| * Fusion amino acid sequences. |
| >In-frame_KIAA0391_ENST00000604948_chr14_35649983_+_FAM177A1_ENST00000396472_chr14_35546356_+_454aa MNSQTEDHALAPVRNTIQLPTQPLNSEEWDKLKEDLKENTGKTSFESWIISQMAGCHSSIDVAKSLLAWVAAKNNGIVSYDLLVKYLYLC VFHMQTSEVIDVFEIMKARYKTLEPRGYSLLIRGLIHSDRWREALLLLEDIKKVITPSKKNYNDCIQGALLHQDVNTAWNLYQELLGHDI VPMLETLKAFFDFGKDIKDDNYSNKLLDILSYLRNNQLYPGESFAHSIKTWFESVPGKQWKGQFTTVRKSGQCSGCGKTIESIQLSPEEY ECLKGKIMRDVIDGGDQYRKTTPQELKRFENFIKSRPPFDVVIDGLNVAKMFPKVRESQLTKLTWGPYLWFYMLRAATSTLSVCDFLGEK IASVLGISTPKYQYAIDEYYRMKKEEEEEEEENRMSEEAEKQYQQNKLQTDSIVQTDQPETVISSSFVNVNFEMEGDSEVIMESKQNPVS >In-frame_KIAA0391_ENST00000604948_chr14_35649983_+_FAM177A1_ENST00000382406_chr14_35546356_+_454aa MNSQTEDHALAPVRNTIQLPTQPLNSEEWDKLKEDLKENTGKTSFESWIISQMAGCHSSIDVAKSLLAWVAAKNNGIVSYDLLVKYLYLC VFHMQTSEVIDVFEIMKARYKTLEPRGYSLLIRGLIHSDRWREALLLLEDIKKVITPSKKNYNDCIQGALLHQDVNTAWNLYQELLGHDI VPMLETLKAFFDFGKDIKDDNYSNKLLDILSYLRNNQLYPGESFAHSIKTWFESVPGKQWKGQFTTVRKSGQCSGCGKTIESIQLSPEEY ECLKGKIMRDVIDGGDQYRKTTPQELKRFENFIKSRPPFDVVIDGLNVAKMFPKVRESQLTKLTWGPYLWFYMLRAATSTLSVCDFLGEK IASVLGISTPKYQYAIDEYYRMKKEEEEEEEENRMSEEAEKQYQQNKLQTDSIVQTDQPETVISSSFVNVNFEMEGDSEVIMESKQNPVS >In-frame_KIAA0391_ENST00000604948_chr14_35649983_+_FAM177A1_ENST00000280987_chr14_35546356_+_454aa MNSQTEDHALAPVRNTIQLPTQPLNSEEWDKLKEDLKENTGKTSFESWIISQMAGCHSSIDVAKSLLAWVAAKNNGIVSYDLLVKYLYLC VFHMQTSEVIDVFEIMKARYKTLEPRGYSLLIRGLIHSDRWREALLLLEDIKKVITPSKKNYNDCIQGALLHQDVNTAWNLYQELLGHDI VPMLETLKAFFDFGKDIKDDNYSNKLLDILSYLRNNQLYPGESFAHSIKTWFESVPGKQWKGQFTTVRKSGQCSGCGKTIESIQLSPEEY ECLKGKIMRDVIDGGDQYRKTTPQELKRFENFIKSRPPFDVVIDGLNVAKMFPKVRESQLTKLTWGPYLWFYMLRAATSTLSVCDFLGEK IASVLGISTPKYQYAIDEYYRMKKEEEEEEEENRMSEEAEKQYQQNKLQTDSIVQTDQPETVISSSFVNVNFEMEGDSEVIMESKQNPVS >In-frame_KIAA0391_ENST00000557565_chr14_35649983_+_FAM177A1_ENST00000396472_chr14_35546356_+_549aa MTFYLFGIRSFPKLWKSPYLGLGPGHSYVSLFLADRCGIRNQQRLFSLKTMSPQNTKATNLIAKARYLRKDEGSNKQVYSVPHFFLAGAA 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TTTTTTTGAAAAAGGTAAGTTGCTGATTAAGTCTAATTGGAATTGATAATTCCATAGTCTTAGATTAAAATGAGGATATTTTCTCCTAGA TTTTCTCATGTTATGCCATGCATTTATATATCTAACCATTAATTTCACACTAAGGATGCTTCACCATATAATAAAAGGAGCAAGATGGAA GCACTTTGAATTTTCTTTCATTGAGAATAACTGTTTTATGTAAGAATCTGTATTTATAACACCAGATATTAAGATAGGCTTCCATTTTTT AATGCAAGCCACTTACTTAATCTTGTATTCTTTTTCAGGACTCAAATAACTAGCTTTGAACATAATATTAAAACACTACTTATAGAATAG ATTTATTAATGTTAATACCTAGTGAATATCCATGTGGCATCCTGGTTATGTTATCGGTTCAGCGTTAATCCTATAGAAAAGTGGTTTGGA GGGGATTGGGGGATAGTGGGACAGGTATAGATTTAATCCATCAGGAGCAATTAGATATTGTATAAGGTGCAATGATAGCCTAATGAAATT ACCCGTCATTCATCATTTAGAAGTAGCAACAGTGAAGACTGGACAGTTTACTTGAATCTGGTTGGCCACTCCTCTACCTACTTGGTTATT TGTAAACCTTACAAATGTATATATTGTGAAGCTAATTTTGAAAATATTCCTAAATATGGCCAGGTACGGTGCTCACACCTGTAATCCCAG CACTTTGGGAGGCTGAAGTGGGCAGATTACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACGTAGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAA TACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCACGTCTGTAATCCCAGCTGCTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGTG GAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTTGGGGGGAAAAAAGTATATATATA TACACACACACAGACACACACACACACACATATATCTCTAAATGTGTGTATAGAACCTTTTATCAGTATAACATTGATTTATAATTAAAT GTGGGTGAGGAAGAATGTGTGGAGTGTTTCAGAAATTTTGATCTTAAAAGCCTTTTCAGAAACTCAAAGCTTTCAGAAATTAATAGTTAT ATTAATAGCCTTCTAAACAGCATTAAGTTTTCAATTTTAATATATCTATATAAAATATAGTGTCAAAGAAAGTAACATCAATATAGTGGG TCTGTAATGGAAATCTGTCAATGAACATGAACTGAGTTCTTCAACTACAGGTTGAAGGATAATTAAACTTTTCATTAGGAGTGTTCAGCT ACATGGATTCATGGAATGGTGGTTCATAGTAAGTGATGGTAATCTTTTTATTCATGGGTGTAAACCCTTTATAACTTAGTGCTTAAAATA TTAATCTTTTGATTATATAATGTCCCATGAATTATAGTTTACCAATAGTTCTAAAACATGCTAACCTGACCTTTTCCTTCTAATTTGTTT TTAACTTCATTCGAGATAGTACCTCTCACTCACAGATATTTATTTGGTTATCAAGTGAAGATAGGTGTGTCTAAAAGTGATCTTCTGAAT CCTGTCTCCCTAGAGGTACTAGTATCTAGAGTTTACCCAGAAAATTTTATGATTGTAACAAAAGGAAGTAGTGACTTATGAAGGTTTTGT TTCTTGAATTTTACTTTTGCTACTTGTCCAATAGTGGCTAGTTTATGTTTATCAATATAGTTATTCACTGTGCCTTAAGTTTATACTTTG >In-frame_KIAA0391_ENST00000605870_chr14_35649983_+_FAM177A1_ENST00000396472_chr14_35546356_+_3003nt GTCCCCCCACCGGAGGAGTTTTGCGGTCTGTAGAGAGCTATGCAGGGTGAGGGCCCCTAGACTTCGGCTTTCGCCGCTGTTGGTGGTAGG CTGGAGTTGGGGGTCCCTGGATACGGTTTTGGCTTTACACCCCCTTTCCAGCAAGCTTCCCGTGGGAATCTGTTCCTTTTCAGGACAGCT GTGATCCACTGTTCCTGGAAAACAATGGAAAGGACAATTCACCACAGTCCGAAAAAGTGGCCAGTGTTCGGGCTGTGGAAAAACCATAGA GTCTATTCAGCTGAGTCCAGAAGAATATGAATGTCTTAAGGGAAAAATCATGAGGGATGTGATAGATGGAGGTGACCAGTACAGAAAGAC AACACCTCAGGAACTTAAGAGATTTGAGAACTTCATAAAATCTCGTCCTCCTTTTGATGTTGTCATTGATGGTCTCAATGTTGCCAAAAT GTTTCCTAAAGTTCGTGAATCTCAACTTACAAAACTTACCTGGGGTCCCTACTTATGGTTTTACATGCTTCGGGCTGCTACATCAACTCT CTCAGTGTGTGACTTCCTTGGAGAGAAGATTGCATCTGTTTTGGGTATCAGCACCCCAAAGTACCAATATGCCATTGATGAATATTATCG GATGAAGAAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACAGGATGTCTGAAGAAGCAGAAAAACAATATCAACAGAATAAATTGCAGACTGA TTCCATTGTTCAGACAGATCAACCAGAGACAGTGATATCCAGCTCATTTGTGAATGTCAATTTTGAAATGGAGGGAGACAGTGAAGTAAT TATGGAAAGCAAGCAAAATCCAGTCTCTGTCCCACCATAAAATGAAATGACTATCAAGCTTCAAACTCTTAAGTTTTTTTTTTTTAATAC AAAAACTTTCACATTCTTTATTCAGTGGGACTTAATACAATTATTTATATTTTAAATTATTAAAGTATCTGGAAAGGGAAAATGTTTTCT TCATTTTTAGGATCTATCTAGCAAAAGCCAGATCTGAAATTCAGATATTTGTACTGTTTTTACTGTGTATAGAAATTAGTGCTTTGGTTT TAAAATGATCTTTTAAAAAAGTTAAGGACATCCTAGAGCCTTAATAGTTAAGAAGAGTTAAATTATCAAGCCTATTTGTGCATTTGCTTT TTTTGAAAAAGGTAAGTTGCTGATTAAGTCTAATTGGAATTGATAATTCCATAGTCTTAGATTAAAATGAGGATATTTTCTCCTAGATTT TCTCATGTTATGCCATGCATTTATATATCTAACCATTAATTTCACACTAAGGATGCTTCACCATATAATAAAAGGAGCAAGATGGAAGCA CTTTGAATTTTCTTTCATTGAGAATAACTGTTTTATGTAAGAATCTGTATTTATAACACCAGATATTAAGATAGGCTTCCATTTTTTAAT GCAAGCCACTTACTTAATCTTGTATTCTTTTTCAGGACTCAAATAACTAGCTTTGAACATAATATTAAAACACTACTTATAGAATAGATT TATTAATGTTAATACCTAGTGAATATCCATGTGGCATCCTGGTTATGTTATCGGTTCAGCGTTAATCCTATAGAAAAGTGGTTTGGAGGG GATTGGGGGATAGTGGGACAGGTATAGATTTAATCCATCAGGAGCAATTAGATATTGTATAAGGTGCAATGATAGCCTAATGAAATTACC CGTCATTCATCATTTAGAAGTAGCAACAGTGAAGACTGGACAGTTTACTTGAATCTGGTTGGCCACTCCTCTACCTACTTGGTTATTTGT AAACCTTACAAATGTATATATTGTGAAGCTAATTTTGAAAATATTCCTAAATATGGCCAGGTACGGTGCTCACACCTGTAATCCCAGCAC TTTGGGAGGCTGAAGTGGGCAGATTACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACGTAGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAATAC AAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCACGTCTGTAATCCCAGCTGCTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGTGGAG GTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTTGGGGGGAAAAAAGTATATATATATAC ACACACACAGACACACACACACACACATATATCTCTAAATGTGTGTATAGAACCTTTTATCAGTATAACATTGATTTATAATTAAATGTG GGTGAGGAAGAATGTGTGGAGTGTTTCAGAAATTTTGATCTTAAAAGCCTTTTCAGAAACTCAAAGCTTTCAGAAATTAATAGTTATATT AATAGCCTTCTAAACAGCATTAAGTTTTCAATTTTAATATATCTATATAAAATATAGTGTCAAAGAAAGTAACATCAATATAGTGGGTCT GTAATGGAAATCTGTCAATGAACATGAACTGAGTTCTTCAACTACAGGTTGAAGGATAATTAAACTTTTCATTAGGAGTGTTCAGCTACA TGGATTCATGGAATGGTGGTTCATAGTAAGTGATGGTAATCTTTTTATTCATGGGTGTAAACCCTTTATAACTTAGTGCTTAAAATATTA ATCTTTTGATTATATAATGTCCCATGAATTATAGTTTACCAATAGTTCTAAAACATGCTAACCTGACCTTTTCCTTCTAATTTGTTTTTA ACTTCATTCGAGATAGTACCTCTCACTCACAGATATTTATTTGGTTATCAAGTGAAGATAGGTGTGTCTAAAAGTGATCTTCTGAATCCT GTCTCCCTAGAGGTACTAGTATCTAGAGTTTACCCAGAAAATTTTATGATTGTAACAAAAGGAAGTAGTGACTTATGAAGGTTTTGTTTC TTGAATTTTACTTTTGCTACTTGTCCAATAGTGGCTAGTTTATGTTTATCAATATAGTTATTCACTGTGCCTTAAGTTTATACTTTGTTT >In-frame_KIAA0391_ENST00000605870_chr14_35649983_+_FAM177A1_ENST00000382406_chr14_35546356_+_1009nt GTCCCCCCACCGGAGGAGTTTTGCGGTCTGTAGAGAGCTATGCAGGGTGAGGGCCCCTAGACTTCGGCTTTCGCCGCTGTTGGTGGTAGG CTGGAGTTGGGGGTCCCTGGATACGGTTTTGGCTTTACACCCCCTTTCCAGCAAGCTTCCCGTGGGAATCTGTTCCTTTTCAGGACAGCT GTGATCCACTGTTCCTGGAAAACAATGGAAAGGACAATTCACCACAGTCCGAAAAAGTGGCCAGTGTTCGGGCTGTGGAAAAACCATAGA GTCTATTCAGCTGAGTCCAGAAGAATATGAATGTCTTAAGGGAAAAATCATGAGGGATGTGATAGATGGAGGTGACCAGTACAGAAAGAC AACACCTCAGGAACTTAAGAGATTTGAGAACTTCATAAAATCTCGTCCTCCTTTTGATGTTGTCATTGATGGTCTCAATGTTGCCAAAAT GTTTCCTAAAGTTCGTGAATCTCAACTTACAAAACTTACCTGGGGTCCCTACTTATGGTTTTACATGCTTCGGGCTGCTACATCAACTCT CTCAGTGTGTGACTTCCTTGGAGAGAAGATTGCATCTGTTTTGGGTATCAGCACCCCAAAGTACCAATATGCCATTGATGAATATTATCG GATGAAGAAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACAGGATGTCTGAAGAAGCAGAAAAACAATATCAACAGAATAAATTGCAGACTGA TTCCATTGTTCAGACAGATCAACCAGAGACAGTGATATCCAGCTCATTTGTGAATGTCAATTTTGAAATGGAGGGAGACAGTGAAGTAAT TATGGAAAGCAAGCAAAATCCAGTCTCTGTCCCACCATAAAATGAAATGACTATCAAGCTTCAAACTCTTAAGTTTTTTTTTTTTAATAC AAAAACTTTCACATTCTTTATTCAGTGGGACTTAATACAATTATTTATATTTTAAATTATTAAAGTATCTGGAAAGGGAAAATGTTTTCT >In-frame_KIAA0391_ENST00000605870_chr14_35649983_+_FAM177A1_ENST00000280987_chr14_35546356_+_3005nt GTCCCCCCACCGGAGGAGTTTTGCGGTCTGTAGAGAGCTATGCAGGGTGAGGGCCCCTAGACTTCGGCTTTCGCCGCTGTTGGTGGTAGG CTGGAGTTGGGGGTCCCTGGATACGGTTTTGGCTTTACACCCCCTTTCCAGCAAGCTTCCCGTGGGAATCTGTTCCTTTTCAGGACAGCT GTGATCCACTGTTCCTGGAAAACAATGGAAAGGACAATTCACCACAGTCCGAAAAAGTGGCCAGTGTTCGGGCTGTGGAAAAACCATAGA GTCTATTCAGCTGAGTCCAGAAGAATATGAATGTCTTAAGGGAAAAATCATGAGGGATGTGATAGATGGAGGTGACCAGTACAGAAAGAC AACACCTCAGGAACTTAAGAGATTTGAGAACTTCATAAAATCTCGTCCTCCTTTTGATGTTGTCATTGATGGTCTCAATGTTGCCAAAAT GTTTCCTAAAGTTCGTGAATCTCAACTTACAAAACTTACCTGGGGTCCCTACTTATGGTTTTACATGCTTCGGGCTGCTACATCAACTCT CTCAGTGTGTGACTTCCTTGGAGAGAAGATTGCATCTGTTTTGGGTATCAGCACCCCAAAGTACCAATATGCCATTGATGAATATTATCG GATGAAGAAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACAGGATGTCTGAAGAAGCAGAAAAACAATATCAACAGAATAAATTGCAGACTGA TTCCATTGTTCAGACAGATCAACCAGAGACAGTGATATCCAGCTCATTTGTGAATGTCAATTTTGAAATGGAGGGAGACAGTGAAGTAAT TATGGAAAGCAAGCAAAATCCAGTCTCTGTCCCACCATAAAATGAAATGACTATCAAGCTTCAAACTCTTAAGTTTTTTTTTTTTAATAC AAAAACTTTCACATTCTTTATTCAGTGGGACTTAATACAATTATTTATATTTTAAATTATTAAAGTATCTGGAAAGGGAAAATGTTTTCT TCATTTTTAGGATCTATCTAGCAAAAGCCAGATCTGAAATTCAGATATTTGTACTGTTTTTACTGTGTATAGAAATTAGTGCTTTGGTTT TAAAATGATCTTTTAAAAAAGTTAAGGACATCCTAGAGCCTTAATAGTTAAGAAGAGTTAAATTATCAAGCCTATTTGTGCATTTGCTTT TTTTGAAAAAGGTAAGTTGCTGATTAAGTCTAATTGGAATTGATAATTCCATAGTCTTAGATTAAAATGAGGATATTTTCTCCTAGATTT TCTCATGTTATGCCATGCATTTATATATCTAACCATTAATTTCACACTAAGGATGCTTCACCATATAATAAAAGGAGCAAGATGGAAGCA CTTTGAATTTTCTTTCATTGAGAATAACTGTTTTATGTAAGAATCTGTATTTATAACACCAGATATTAAGATAGGCTTCCATTTTTTAAT GCAAGCCACTTACTTAATCTTGTATTCTTTTTCAGGACTCAAATAACTAGCTTTGAACATAATATTAAAACACTACTTATAGAATAGATT TATTAATGTTAATACCTAGTGAATATCCATGTGGCATCCTGGTTATGTTATCGGTTCAGCGTTAATCCTATAGAAAAGTGGTTTGGAGGG GATTGGGGGATAGTGGGACAGGTATAGATTTAATCCATCAGGAGCAATTAGATATTGTATAAGGTGCAATGATAGCCTAATGAAATTACC CGTCATTCATCATTTAGAAGTAGCAACAGTGAAGACTGGACAGTTTACTTGAATCTGGTTGGCCACTCCTCTACCTACTTGGTTATTTGT AAACCTTACAAATGTATATATTGTGAAGCTAATTTTGAAAATATTCCTAAATATGGCCAGGTACGGTGCTCACACCTGTAATCCCAGCAC TTTGGGAGGCTGAAGTGGGCAGATTACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACGTAGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAATAC AAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCACGTCTGTAATCCCAGCTGCTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCAGGGAGGTGGAG GTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTTGGGGGGAAAAAAGTATATATATATAC ACACACACAGACACACACACACACACATATATCTCTAAATGTGTGTATAGAACCTTTTATCAGTATAACATTGATTTATAATTAAATGTG GGTGAGGAAGAATGTGTGGAGTGTTTCAGAAATTTTGATCTTAAAAGCCTTTTCAGAAACTCAAAGCTTTCAGAAATTAATAGTTATATT AATAGCCTTCTAAACAGCATTAAGTTTTCAATTTTAATATATCTATATAAAATATAGTGTCAAAGAAAGTAACATCAATATAGTGGGTCT GTAATGGAAATCTGTCAATGAACATGAACTGAGTTCTTCAACTACAGGTTGAAGGATAATTAAACTTTTCATTAGGAGTGTTCAGCTACA TGGATTCATGGAATGGTGGTTCATAGTAAGTGATGGTAATCTTTTTATTCATGGGTGTAAACCCTTTATAACTTAGTGCTTAAAATATTA ATCTTTTGATTATATAATGTCCCATGAATTATAGTTTACCAATAGTTCTAAAACATGCTAACCTGACCTTTTCCTTCTAATTTGTTTTTA ACTTCATTCGAGATAGTACCTCTCACTCACAGATATTTATTTGGTTATCAAGTGAAGATAGGTGTGTCTAAAAGTGATCTTCTGAATCCT GTCTCCCTAGAGGTACTAGTATCTAGAGTTTACCCAGAAAATTTTATGATTGTAACAAAAGGAAGTAGTGACTTATGAAGGTTTTGTTTC TTGAATTTTACTTTTGCTACTTGTCCAATAGTGGCTAGTTTATGTTTATCAATATAGTTATTCACTGTGCCTTAAGTTTATACTTTGTTT |
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FusionGenePPI for KIAA0391_FAM177A1 |
| Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in . |
| Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
| Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
| KIAA0391 | EFNB2, F12, HIBCH, PLAUR, MRM1, RP2, SCN2B, OXLD1, POU5F1, COQ9, THEM4, BPNT1, NIT1, ADAM32, IL13RA2, GORASP1, NTRK3, YBEY, IL1R2, NDUFS7, MRPL12 | FAM177A1 | RHOJ, FAM204A, SLC27A2, C1orf27, SUGP1, UFSP2, EEF1A2, STEAP3, AAGAB, SLC4A1AP, FAM207A, SAR1B, TGS1, ARMCX3, DHX38, RIOK1, VPS13B, GTF2F2, DCUN1D5, OSTM1, GPKOW, C12orf43, CLCN7, DUSP22, MRPS31, NAPG, NCEH1 |
| - Retained PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
| - Lost PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
| - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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RelatedDrugs for KIAA0391_FAM177A1 |
| Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02) |
| Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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RelatedDiseases for KIAA0391_FAM177A1 |
| Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
| Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
Copyright 2018-Present -The University of Texas Health Science Center at Houston (UTHealth)
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