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Fusion gene ID: 17037

FusionGeneSummary for IDS_IDS

check button Fusion gene summary
Fusion gene informationFusion gene name: IDS_IDS
Fusion gene ID: 17037
HgeneTgene
Gene symbol

IDS

IDS

Gene ID

3423

3423

Gene nameiduronate 2-sulfataseiduronate 2-sulfatase
SynonymsMPS2|SIDSMPS2|SIDS
Cytomap

Xq28

Xq28

Type of geneprotein-codingprotein-coding
Descriptioniduronate 2-sulfatasealpha-L-iduronate sulfate sulfataseiduronate 2-sulfatase 14 kDa chainiduronate 2-sulfatase 42 kDa chainidursulfaseiduronate 2-sulfatasealpha-L-iduronate sulfate sulfataseiduronate 2-sulfatase 14 kDa chainiduronate 2-sulfatase 42 kDa chainidursulfase
Modification date2018052320180523
UniProtAcc

P22304

P22304

Ensembl transtripts involved in fusion geneENST00000340855, ENST00000537071, 
ENST00000541269, ENST00000422081, 
ENST00000370441, ENST00000490775, 
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ENST00000428056, 
ENST00000340855, 
ENST00000537071, ENST00000541269, 
ENST00000422081, ENST00000370441, 
ENST00000490775, ENST00000370443, 
ENST00000427113, ENST00000428056, 
Fusion gene scores* DoF score7 X 9 X 2=1266 X 8 X 1=48
# samples 98
** MAII scorelog2(9/126*10)=-0.485426827170242
possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs).
DoF>8 and MAII<0
log2(8/48*10)=0.736965594166206
effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (eGinPCFGs).
DoF>8 and MAII>0
Context

PubMed: IDS [Title/Abstract] AND IDS [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract]

Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation
* DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types
** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10)

check button Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez
PartnerGeneGO IDGO termPubMed ID

check button Fusion gene information from three resources
(ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018))
* All genome coordinats were lifted-over on hg19.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
Data typeSourceCancer typeSampleHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
ChiTaRS3.1CB268858IDSchrX

148587469

-IDSchrX

148607295

-
ChiTaRS3.1CB306816IDSchrX

148564400

+IDSchrX

148564520

-
ChiTaRS3.1AW628693IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
* LD: Li Ding group's fusion gene list
  RV: Roel Verhaak group's fusion gene list
  ChiTaRs fusion database

check button Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure.
* Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser.
ORFHenstTenstHgeneHchrHbpHstrandTgeneTchrTbpTstrand
intron-intronENST00000340855ENST00000340855IDSchrX

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-IDSchrX

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-
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-IDSchrX

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-
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-IDSchrX

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-
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-
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-
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-IDSchrX

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-
intron-intronENST00000340855ENST00000370443IDSchrX

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-
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-
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148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000370443ENST00000541269IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000370443ENST00000422081IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000370443ENST00000370441IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000370443ENST00000490775IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000370443ENST00000370443IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000370443ENST00000427113IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000370443ENST00000428056IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000427113ENST00000340855IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000427113ENST00000537071IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000427113ENST00000541269IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000427113ENST00000422081IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000427113ENST00000370441IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000427113ENST00000490775IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000427113ENST00000370443IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000427113ENST00000427113IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000427113ENST00000428056IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000428056ENST00000340855IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000428056ENST00000537071IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000428056ENST00000541269IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000428056ENST00000422081IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000428056ENST00000370441IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000428056ENST00000490775IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000428056ENST00000370443IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000428056ENST00000427113IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+
intron-intronENST00000428056ENST00000428056IDSchrX

148593151

+IDSchrX

148571844

+

Top

FusionProtFeatures for IDS_IDS


check buttonMain function of each fusion partner protein. (from UniProt)
HgeneTgene
IDS

P22304

IDS

P22304

Required for the lysosomal degradation of heparansulfate and dermatan sulfate. Required for the lysosomal degradation of heparansulfate and dermatan sulfate.

check buttonRetention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at

download page

.

* Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS.
- In-frame and retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note

- In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenProtein featureProtein feature note


Top

FusionGeneSequence for IDS_IDS


check button For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences.
(nt: nucleotides, aa: amino acids)

* Fusion amino acid sequences.

* Fusion transcript sequences (only coding sequence (CDS) region).

* Fusion transcript sequences (Full-length transcript).

Top

FusionGenePPI for IDS_IDS


check button Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in

ChiPPI page

.

check button Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160)
HgeneHgene's interactorsTgeneTgene's interactors


check button - Retained PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenStill interaction with


check button - Lost PPIs in in-frame fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


check button - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion.
PartnerGeneHbpTbpENSTStrandBPexonTotalExonProtein feature loci*BPlociTotalLenInteraction lost with


Top

RelatedDrugs for IDS_IDS


check button Drugs targeting genes involved in this fusion gene.
(DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02)
PartnerGeneUniProtAccDrugBank IDDrug nameDrug activityDrug typeDrug status

Top

RelatedDiseases for IDS_IDS


check button Diseases associated with fusion partners.
(DisGeNet 4.0)
PartnerGeneDisease IDDisease name# pubmedsSource
HgeneIDSC0026705Mucopolysaccharidosis II28CTD_human;UNIPROT
TgeneIDSC0026705Mucopolysaccharidosis II28CTD_human;UNIPROT