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Fusion gene ID: 15117 |
FusionGeneSummary for GOSR1_ZNF207 |
 Fusion gene summary |
| Fusion gene information | Fusion gene name: GOSR1_ZNF207 | Fusion gene ID: 15117 | Hgene | Tgene | Gene symbol | GOSR1 | ZNF207 | Gene ID | 9527 | 7756 |
| Gene name | golgi SNAP receptor complex member 1 | zinc finger protein 207 | |
| Synonyms | GOLIM2|GOS-28|GOS28|GOS28/P28|GS28|P28 | BuGZ|hBuGZ | |
| Cytomap | 17q11.2 | 17q11.2 | |
| Type of gene | protein-coding | protein-coding | |
| Description | Golgi SNAP receptor complex member 128 kDa Golgi SNARE protein28 kDa cis-Golgi SNARE p28Golgi SNARE 28 kDacis-golgi SNAREgolgi integral membrane protein 2 | BUB3-interacting and GLEBS motif-containing protein ZNF207 | |
| Modification date | 20180523 | 20180523 | |
| UniProtAcc | O95249 | O43670 | |
| Ensembl transtripts involved in fusion gene | ENST00000225724, ENST00000451249, ENST00000467337, ENST00000581721, ENST00000579905, | ENST00000394670, ENST00000321233, ENST00000394673, ENST00000341711, ENST00000342555, ENST00000577908, ENST00000584416, | |
| Fusion gene scores | * DoF score | 7 X 4 X 7=196 | 5 X 6 X 4=120 |
| # samples | 8 | 6 | |
| ** MAII score | log2(8/196*10)=-1.29278174922785 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | log2(6/120*10)=-1 possibly effective Gene in Pan-Cancer Fusion Genes (peGinPCFGs). DoF>8 and MAII<0 | |
| Context | PubMed: GOSR1 [Title/Abstract] AND ZNF207 [Title/Abstract] AND fusion [Title/Abstract] | ||
| Functional or gene categories assigned by FusionGDB annotation | |||
| * DoF score (Degree of Frequency) = # partners X # break points X # cancer types ** MAII score (Major Active Isofusion Index) = log2(# samples/DoF score*10) |
| Gene ontology of each fusion partner gene with evidence of Inferred from Direct Assay (IDA) from Entrez |
| Partner | Gene | GO ID | GO term | PubMed ID |
| Hgene | GOSR1 | GO:0042147 | retrograde transport, endosome to Golgi | 15215310 |
| Tgene | ZNF207 | GO:0090307 | mitotic spindle assembly | 26388440 |
| Fusion gene information from three resources (ChiTars (NAR, 2018), tumorfusions (NAR, 2018), Gao et al. (Cell, 2018)) * All genome coordinats were lifted-over on hg19. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| Data type | Source | Cancer type | Sample | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| TCGA | LD | LAML | TCGA-AB-2820-03A | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| * LD: Li Ding group's fusion gene list RV: Roel Verhaak group's fusion gene list ChiTaRs fusion database |
| Open reading frame (ORF) analsis of fusion genes based on Ensembl gene isoform structure. * Click on the break point to see the gene structure around the break point region using the UCSC Genome Browser. |
| ORF | Henst | Tenst | Hgene | Hchr | Hbp | Hstrand | Tgene | Tchr | Tbp | Tstrand |
| In-frame | ENST00000225724 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000225724 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000225724 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000225724 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000225724 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000225724 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000225724 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000451249 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000451249 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000451249 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000451249 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000451249 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000451249 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000451249 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000467337 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000467337 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000467337 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000467337 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000467337 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000467337 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000467337 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000581721 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000581721 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000581721 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000581721 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000581721 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| In-frame | ENST00000581721 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| 5CDS-intron | ENST00000581721 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000394670 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000321233 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000394673 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000341711 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000342555 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| intron-3CDS | ENST00000579905 | ENST00000577908 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
| intron-intron | ENST00000579905 | ENST00000584416 | GOSR1 | chr17 | 28811788 | + | ZNF207 | chr17 | 30696314 | + |
Top |
FusionProtFeatures for GOSR1_ZNF207 |
| Main function of each fusion partner protein. (from UniProt) |
| Hgene | Tgene |
| GOSR1 | ZNF207 |
| Involved in transport from the ER to the Golgi apparatusas well as in intra-Golgi transport. It belongs to a super-familyof proteins called t-SNAREs or soluble NSF (N-ethylmaleimide-sensitive factor) attachment protein receptor. May play aprotective role against hydrogen peroxide induced cytotoxicityunder glutathione depleted conditions in neuronal cells byregulating the intracellular ROS levels via inhibition of p38 MAPK(MAPK11, MAPK12, MAPK13 and MAPK14). Participates in docking andfusion stage of ER to cis-Golgi transport. Plays an importantphysiological role in VLDL-transport vesicle-Golgi fusion and thusin VLDL delivery to the hepatic cis-Golgi.{ECO:0000269|PubMed:15215310, ECO:0000269|PubMed:21860593}. | Kinetochore- and microtubule-binding protein that playsa key role in spindle assembly (PubMed:24462186, PubMed:24462187,PubMed:26388440). ZNF207/BuGZ is mainly composed of disorderedlow-complexity regions and undergoes phase transition orcoacervation to form temperature-dependent liquid droplets.Coacervation promotes microtubule bundling and concentratestubulin, promoting microtubule polymerization and assembly ofspindle and spindle matrix by concentrating its building blocks(PubMed:26388440). Also acts as a regulator of mitotic chromosomealignment by mediating the stability and kinetochore loading ofBUB3 (PubMed:24462186, PubMed:24462187). Mechanisms by which BUB3is protected are unclear: according to a first report, ZNF207/BuGZmay act by blocking ubiquitination and proteasomal degradation ofBUB3 (PubMed:24462186). According to another report, thestabilization is independent of the proteasome (PubMed:24462187).{ECO:0000269|PubMed:24462186, ECO:0000269|PubMed:24462187,ECO:0000269|PubMed:26388440}. |
| Retention analysis result of each fusion partner protein across 39 protein features of UniProt such as six molecule processing features, 13 region features, four site features, six amino acid modification features, two natural variation features, five experimental info features, and 3 secondary structure features. Here, because of limited space for viewing, we only show the protein feature retention information belong to the 13 regional features. All retention annotation result can be downloaded at . * Minus value of BPloci means that the break pointn is located before the CDS. |
| - In-frame and retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000225724 | + | 4 | 9 | 68_95 | 116 | 251 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000225724 | + | 4 | 9 | 9_30 | 116 | 251 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Hgene | GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000467337 | + | 4 | 9 | 9_30 | 51 | 186 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Tgene | >ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000341711 | + | 8 | 11 | 359_391 | 289 | 396 | Region | GLEBS |
| Tgene | >ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394673 | + | 8 | 11 | 359_391 | 357 | 464 | Region | GLEBS |
| - In-frame and not-retained protein feature among the 13 regional features. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Protein feature | Protein feature note |
| Hgene | >GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000467337 | + | 4 | 9 | 68_95 | 51 | 186 | Coiled coil | Ontology_term=ECO:0000255 |
| Hgene | >GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000225724 | + | 4 | 9 | 2_229 | 116 | 251 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000467337 | + | 4 | 9 | 2_229 | 51 | 186 | Topological domain | Cytoplasmic |
| Hgene | >GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000225724 | + | 4 | 9 | 230_250 | 116 | 251 | Transmembrane | Helical%3B Anchor for type IV membrane protein |
| Hgene | >GOSR1 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000467337 | + | 4 | 9 | 230_250 | 51 | 186 | Transmembrane | Helical%3B Anchor for type IV membrane protein |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000321233 | + | 8 | 11 | 1_92 | 372 | 479 | Region | Microtubule-binding region |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000321233 | + | 8 | 11 | 359_391 | 372 | 479 | Region | GLEBS |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000341711 | + | 8 | 11 | 1_92 | 289 | 396 | Region | Microtubule-binding region |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394670 | + | 9 | 12 | 1_92 | 388 | 495 | Region | Microtubule-binding region |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394670 | + | 9 | 12 | 359_391 | 388 | 495 | Region | GLEBS |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394673 | + | 8 | 11 | 1_92 | 357 | 464 | Region | Microtubule-binding region |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000321233 | + | 8 | 11 | 11_34 | 372 | 479 | Zinc finger | Note=C2H2-type 1 |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000321233 | + | 8 | 11 | 35_58 | 372 | 479 | Zinc finger | Note=C2H2-type 2 |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000341711 | + | 8 | 11 | 11_34 | 289 | 396 | Zinc finger | Note=C2H2-type 1 |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000341711 | + | 8 | 11 | 35_58 | 289 | 396 | Zinc finger | Note=C2H2-type 2 |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394670 | + | 9 | 12 | 11_34 | 388 | 495 | Zinc finger | Note=C2H2-type 1 |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394670 | + | 9 | 12 | 35_58 | 388 | 495 | Zinc finger | Note=C2H2-type 2 |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394673 | + | 8 | 11 | 11_34 | 357 | 464 | Zinc finger | Note=C2H2-type 1 |
| Tgene | ZNF207 | chr17:28811788 | chr17:30696314 | ENST00000394673 | + | 8 | 11 | 35_58 | 357 | 464 | Zinc finger | Note=C2H2-type 2 |
Top |
FusionGeneSequence for GOSR1_ZNF207 |
| For in-frame fusion transcripts, we provide the fusion transcript sequences and fusion amino acid sequences. (nt: nucleotides, aa: amino acids) |
| * Fusion amino acid sequences. |
| >In-frame_GOSR1_ENST00000225724_chr17_28811788_+_ZNF207_ENST00000394670_chr17_30696314_+_223aa MAAGTSSYWEDLRKQARQLENELDLKLVSFSKLCTSYSHSSTRDGRRDRYSSDTTPLLNGSSQDRMFETMAIEIEQLLARLTGVNDKMAE YTNSAGVPSLNAALMHTLQRHRDILQEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMP >In-frame_GOSR1_ENST00000225724_chr17_28811788_+_ZNF207_ENST00000321233_chr17_30696314_+_223aa MAAGTSSYWEDLRKQARQLENELDLKLVSFSKLCTSYSHSSTRDGRRDRYSSDTTPLLNGSSQDRMFETMAIEIEQLLARLTGVNDKMAE YTNSAGVPSLNAALMHTLQRHRDILQEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMP >In-frame_GOSR1_ENST00000225724_chr17_28811788_+_ZNF207_ENST00000394673_chr17_30696314_+_223aa MAAGTSSYWEDLRKQARQLENELDLKLVSFSKLCTSYSHSSTRDGRRDRYSSDTTPLLNGSSQDRMFETMAIEIEQLLARLTGVNDKMAE YTNSAGVPSLNAALMHTLQRHRDILQEERRAQLPKYQRNLPRPGQAPIGNPPVGPIGGMMPPQPGIPQQQGMRPPMPPHGQYGGHHQGMP >In-frame_GOSR1_ENST00000225724_chr17_28811788_+_ZNF207_ENST00000341711_chr17_30696314_+_223aa 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CTAGTAAAGGCAAGTTCTGTAAGCTTACATTGCTATTTGTAAAGTTTGCCTTCACAGCATTTCAGATGCTGTTGGACTTCATGTCCCCAA CCTAGCTTGGTGAGGGCTGTAACTGTTTCCAAGTACTTGTACATTGGAAGTCTGAATGTGTAACAATATTTAATGTATTTAGAGTTCCTC ATGTTGCAGGGTTTAAGAAATCTGACCCACCAAGGTCATGTGACTTTTCTGTACTGTTAAACTTCATTGTAATAAAATGAGAGAAAAATT TATGCCTTTTTATTCATAACCCAGCTGTGGACCACTGCCTGAAAGGTTTGTACAGATGCATGCCACAGTAGATGTCCACATAATAAAATT >In-frame_GOSR1_ENST00000581721_chr17_28811788_+_ZNF207_ENST00000394673_chr17_30696314_+_1260nt GACAAAGATGGCGGCAGGGACCAGCAGTTACTGGGAAGATCTCAGGAAACAGGCTCGACAGCTGGAAAATGAACTTGACCTGAAACTAGT TTCCTTCAGCAAACTATGTACAAGTTACAGTCATAGCAGTACCCGAGATGGAAGACGCGACAGGTATAGTTCTGATACAACACCCCTTTT AAATGGATCAAGCCAAGACAGAATGTTTGAGACAATGGCGATTGAGATTGAACAACTTTTGGCAAGGCTTACAGGGGTAAATGATAAAAT GGCAGAATATACCAACAGTGCAGGTGTCCCCTCCTTGAATGCAGCCCTGATGCATACATTACAGCGGCATAGAGACATATTGCAGGAAGA GAGAAGGGCACAGTTACCTAAGTATCAACGTAATCTTCCTCGGCCAGGACAGGCCCCCATCGGTAATCCACCAGTTGGACCAATTGGAGG TATGATGCCACCACAGCCAGGCATCCCACAGCAACAAGGAATGAGACCCCCAATGCCACCTCATGGTCAGTATGGTGGTCATCATCAAGG CATGCCAGGATACCTTCCTGGTGCTATGCCCCCGTATGGGCAGGGACCGCCAATGGTGCCCCCTTACCAGGGTGGGCCTCCTCGACCTCC GATGGGAATGAGACCTCCTGTAATGTCGCAAGGTGGCCGTTACTGATCTTACTTCATCCAGTCTAATAGGTTTGGAGATTAAACCTTTTC TCAACTTGTGCTGTTTATATAGCCAAGCTTCCGTCAATAAGGCTTCATTGTGACTTTAACAAACATTATCTTCCCACATACCAGGAACTA TTGGACATTTATTTTACATGGGAAAAATTATTTGGAATAATAAAGCAGGAACTTTTCCTGAAGTTGCAATTTATACTGTATGGCTTCTTT TTCATGTTTCATCTAGGTTTTTAGAAGTGAAGTATAGTAAATTTGGTTCGTTAAATTGTGAAGGCGCTGGAATTACATGAACATACCACC CTAGTAAAGGCAAGTTCTGTAAGCTTACATTGCTATTTGTAAAGTTTGCCTTCACAGCATTTCAGATGCTGTTGGACTTCATGTCCCCAA CCTAGCTTGGTGAGGGCTGTAACTGTTTCCAAGTACTTGTACATTGGAAGTCTGAATGTGTAACAATATTTAATGTATTTAGAGTTCCTC ATGTTGCAGGGTTTAAGAAATCTGACCCACCAAGGTCATGTGACTTTTCTGTACTGTTAAACTTCATTGTAATAAAATGAGAGAAAAATT >In-frame_GOSR1_ENST00000581721_chr17_28811788_+_ZNF207_ENST00000341711_chr17_30696314_+_1365nt GACAAAGATGGCGGCAGGGACCAGCAGTTACTGGGAAGATCTCAGGAAACAGGCTCGACAGCTGGAAAATGAACTTGACCTGAAACTAGT TTCCTTCAGCAAACTATGTACAAGTTACAGTCATAGCAGTACCCGAGATGGAAGACGCGACAGGTATAGTTCTGATACAACACCCCTTTT AAATGGATCAAGCCAAGACAGAATGTTTGAGACAATGGCGATTGAGATTGAACAACTTTTGGCAAGGCTTACAGGGGTAAATGATAAAAT GGCAGAATATACCAACAGTGCAGGTGTCCCCTCCTTGAATGCAGCCCTGATGCATACATTACAGCGGCATAGAGACATATTGCAGGAAGA GAGAAGGGCACAGTTACCTAAGTATCAACGTAATCTTCCTCGGCCAGGACAGGCCCCCATCGGTAATCCACCAGTTGGACCAATTGGAGG TATGATGCCACCACAGCCAGGCATCCCACAGCAACAAGGAATGAGACCCCCAATGCCACCTCATGGTCAGTATGGTGGTCATCATCAAGG CATGCCAGGATACCTTCCTGGTGCTATGCCCCCGTATGGGCAGGGACCGCCAATGGTGCCCCCTTACCAGGGTGGGCCTCCTCGACCTCC GATGGGAATGAGACCTCCTGTAATGTCGCAAGGTGGCCGTTACTGATCTTACTTCATCCAGTCTAATAGGTTTGGAGATTAAACCTTTTC TCAACTTGTGCTGTTTATATAGCCAAGCTTCCGTCAATAAGGCTTCATTGTGACTTTAACAAACATTATCTTCCCACATACCAGGAACTA TTGGACATTTATTTTACATGGGAAAAATTATTTGGAATAATAAAGCAGGAACTTTTCCTGAAGTTGCAATTTATACTGTATGGCTTCTTT TTCATGTTTCATCTAGGTTTTTAGAAGTGAAGTATAGTAAATTTGGTTCGTTAAATTGTGAAGGCGCTGGAATTACATGAACATACCACC CTAGTAAAGGCAAGTTCTGTAAGCTTACATTGCTATTTGTAAAGTTTGCCTTCACAGCATTTCAGATGCTGTTGGACTTCATGTCCCCAA CCTAGCTTGGTGAGGGCTGTAACTGTTTCCAAGTACTTGTACATTGGAAGTCTGAATGTGTAACAATATTTAATGTATTTAGAGTTCCTC ATGTTGCAGGGTTTAAGAAATCTGACCCACCAAGGTCATGTGACTTTTCTGTACTGTTAAACTTCATTGTAATAAAATGAGAGAAAAATT TATGCCTTTTTATTCATAACCCAGCTGTGGACCACTGCCTGAAAGGTTTGTACAGATGCATGCCACAGTAGATGTCCACATAATAAAATT >In-frame_GOSR1_ENST00000581721_chr17_28811788_+_ZNF207_ENST00000342555_chr17_30696314_+_777nt GACAAAGATGGCGGCAGGGACCAGCAGTTACTGGGAAGATCTCAGGAAACAGGCTCGACAGCTGGAAAATGAACTTGACCTGAAACTAGT TTCCTTCAGCAAACTATGTACAAGTTACAGTCATAGCAGTACCCGAGATGGAAGACGCGACAGGTATAGTTCTGATACAACACCCCTTTT AAATGGATCAAGCCAAGACAGAATGTTTGAGACAATGGCGATTGAGATTGAACAACTTTTGGCAAGGCTTACAGGGGTAAATGATAAAAT GGCAGAATATACCAACAGTGCAGGTGTCCCCTCCTTGAATGCAGCCCTGATGCATACATTACAGCGGCATAGAGACATATTGCAGGAAGA GAGAAGGGCACAGTTACCTAAGTATCAACGTAATCTTCCTCGGCCAGGACAGGCCCCCATCGGTAATCCACCAGTTGGACCAATTGGAGG TATGATGCCACCACAGCCAGGCATCCCACAGCAACAAGGAATGAGACCCCCAATGCCACCTCATGGTCAGTATGGTGGTCATCATCAAGG CATGCCAGGATACCTTCCTGGTGCTATGCCCCCGTATGGGCAGGGACCGCCAATGGTGCCCCCTTACCAGGGTGGGCCTCCTCGACCTCC GATGGGAATGAGACCTCCTGTAATGTCGCAAGGTGGCCGTTACTGATCTTACTTCATCCAGTCTAATAGGTTTGGAGATTAAACCTTTTC >In-frame_GOSR1_ENST00000581721_chr17_28811788_+_ZNF207_ENST00000577908_chr17_30696314_+_3757nt GACAAAGATGGCGGCAGGGACCAGCAGTTACTGGGAAGATCTCAGGAAACAGGCTCGACAGCTGGAAAATGAACTTGACCTGAAACTAGT TTCCTTCAGCAAACTATGTACAAGTTACAGTCATAGCAGTACCCGAGATGGAAGACGCGACAGGTATAGTTCTGATACAACACCCCTTTT AAATGGATCAAGCCAAGACAGAATGTTTGAGACAATGGCGATTGAGATTGAACAACTTTTGGCAAGGCTTACAGGGGTAAATGATAAAAT GGCAGAATATACCAACAGTGCAGGTGTCCCCTCCTTGAATGCAGCCCTGATGCATACATTACAGCGGCATAGAGACATATTGCAGGAAGA GAGAAGGGCACAGTTACCTAAGTATCAACGTAATCTTCCTCGGCCAGGACAGGCCCCCATCGGTAATCCACCAGTTGGACCAATTGGAGG TATGATGCCACCACAGCCAGGCATCCCACAGCAACAAGGAATGAGACCCCCAATGCCACCTCATGGTCAGTATGGTGGTCATCATCAAGG CATGCCAGGATACCTTCCTGGTGCTATGCCCCCGTATGGGCAGGGACCGCCAATGGTGCCCCCTTACCAGGGTGGGCCTCCTCGACCTCC GATGGGAATGAGACCTCCTGTAATGTCGCAAGCCCTGCCATAGGACAGGCTGAGGCTGAGTCTCAGTGTTGCCCTGTTCAGTCTGAGGCA AAATTTCAGCATTTGCTACTTACTGGTAGAGAAGAAAAATCCCACAGCCCTGCCAGTACAGGTTAGTTTAATCTGTAAGTACCTGATGTT CCTATTTTTTTCAAACATATCCATATAACTCACACAAGGAAGAAAGCTGTGCGGTTACTTAAATGTTAGTATAACTAATAATAGATCCAT TGGACACTTTAAACACTCAGTACTTGGGCCAAAGTAGATCTAGGTTTGCTAACCCCAGTTGTAATAAAGGTGTAATACTGCTCCTTTGTT ATCTCCTTGTGGTTCAACCTAAGTAGATACATTGTACATAAAAGGAAAAGACAGTTTCAGTTGGCTATGCCCTTGTTGATAGATGATATG GAGTCCAGGGCTTTGGGTCCAGGGTCTTTTACTTAAGCTATTTCATGGTGGTTCTCTCATTCACCTTTTAACTTTTTACATTATGAATCA ACCTAAGAAAAAAGGCAAGTTTCCTCACATCTAGAAATGATAAATGGTGTACAGTCATAAGCTAGAATATGTTTTTATAATGCTTTTTTG TTCTTTTAGCAACACTTGTAAATACAAGTACTCCTCTATTTTTGTTCTTTTTTTGTAAACTATAACGTATCCCGTTGGTGTACCAGTGAG TTCATTTTACTGTAAACTAAGAATAACATACCTTTTTAATACTGAAAGTTGACTACTCATCAAGAAATGTAGCTAGATTCTTTATGTAAC ACTTTTGAGGGGCAGTGGGGACATAATGGGTTGTGGAAAATGTGTTTTAACATTTTTATTTTTTTTTTATTCTACCCGAGTTCATTGTTG TTTGAACCATCCTCTAAAGATTTCCTTTAACCTCTAAATGTTGTGCTTTTAGGTTGATAACAAATGTAAAGCACTGAGGAGGGAGGAATA AAGCATACAAGTTAATTTCTAATTTTCGCAAGCCTGAACCATCCTAATCTGATAGTAGGATGTATGGCTTCTTCCTTTTCACCTTGTGTG ATGTTTAATTTGAGACGATCTAGCCATAAAACTAGTAATCTTGAATTCCTCTTGAGCTGGATGGTGATTAGCCATTGTGAAAACAGATTA TATGGAAATTGTGCATATTGCTAAATTTTAAAACATGGATTTATCAACTGATAATAAAATATATCTTACAAGATAACCACTTGTTTTTTA ATGTAAAATTGCACAAGGGCTTAAGTTTCATTGCCTTTCACAGTTTAATCTGTATATGAAATGGTGTAGATACAGTGGAAATGGTTTTCC TTAAAACCATCTCTTTAAAGCTGCCTTTCTGGTGAGTACTGTTTTATACTTTTATATATTATAATTTTATCTTCTAAAATTAACTGAAAT AGGACACTTTGATTAAAGAGGTGAGCACTCTGAATTTCTACATCTTTGGATATTACTTGAATCAAGAATATTAGAAAATTATTTTACCAC CTGGCATTTCCCTTTTAATTTGCTAGTTCACTTTTTTCTGACCTTCACTTAACAGACTATAAATACAAAAACTTTGAACACATAAATTAT TTCATTTTGGTGAGATGGAATAAATGTTTAAAATTAGTATTTAAGAAAGTTCTTAAACATTTTTTTTAGTTGGCAGCCAAAAGATTTTTC TTAGTGCTTTGGAGACATTGCATAGGTGTAAAATTAAGATACCAGAACTTCATTCTGTTCTTGTTGAAGCTGTTGTTGTGGTGATTCATG AGCAGTAAGCTGGAGTTAGAGTGGAAGAAGGGTTTACCAAAATTCTTCCTGCAGACTAGTTGCTTACAGGGTTTCTTTGAGAGGCTTAAA AATTTCAAAAGTATTATTTAAGCCACTCTAACCCTGCATGAAAAATTGGAGTTAGAAATACTGATTTCTGAGACCACGTATACCAGTGAA AATTAGCTTCTGAGTAAATTTCTAATTTATGCCCTGCTTTATTTAGCCTCGCTATATGTAACACATGGATTATTTTTTCCCTCTAGTTTT TAACTATATCCTAGATTAAAACCAGCATATGCTAAGAATGTTTTTACATTCTGTTTCCTCCTGTGATCTTTCTGAACCAATAATAAACAG TCAACTGTGATGCTTTTTAGTATGAACAATGATAGTTTTCTAAAATCTGAAAATCAATACCTGAGTATGTGATGTGGCAATGCATTCTTC TAGATAAGCACTAAACAAAGTATGGACCCTCAATTTATGTCTTTAAGATTTAAAGTGAAGTAAATTTCTAAGGAACTGTGTCCTTTCCTA GCAGGAATAAACAGTGAAAATTTGGTAAGTATTTAACTTGAAGTGCATGTAATAGTGATGAGAGTAAGTAGCCAAATTTCCGTAATATAA GGTAATGTTTAAAAGTGAGCAATAATTATTGCATCTCTTTTGCGACTTCATGTAGATGTGATTAACATTTTTTACAAATTTGCCTGCATA AAGATTAAATTGGAACATACCTTACTCCTTTGTCTGGTTTTTTTATTTTGTATGGTGCTTTAAATACTAATTTTATATTTCAAGCTTTTT GCAGGGTAGAAATAAGTGGCTGTTAAAGAAAATATCTTCAAGAAGGATTATTTCAGTGTCCCTTTTTAAAACTCGATGATGGCTTTCAGT TTATTTAAGTCTTCTGTTTTTCAGCTCCAGTTAAAACTGACAATAGGCAGCTATCAAAAATGGAAAAAATCTTGTGCTCTTTCTGGAATA TTAGAGGAATCAGTTAATAATAGTAAAGTGGTATTAACCCAATACTTGATTTGCAGTTTTTAAAGCAGTTTTTAAATTGAGAGAAAAGGG GCTGGGCCCAGCTGAGGCGGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA TACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGGACGTGCCTGTAACCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAAAATCGCTTGAACCCAGGGGGAG |
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FusionGenePPI for GOSR1_ZNF207 |
| Go to ChiPPI (Chimeric Protein-Protein interactions) to see the chimeric PPI interaction in . |
| Protein-protein interactors with each fusion partner protein in wild-type (BIOGRID-3.4.160) |
| Hgene | Hgene's interactors | Tgene | Tgene's interactors |
| GOSR1 | STX5, USO1, YKT6, BET1, BET1L, SNAP25, SCFD1, NSF, SEC22B, PKP1, DSC1, APP, STX12, STX6, STX7, CLEC12A, STX3, TNFSF11, ATAD1, PHB2, TMEM17, TMEM216, PTPN1, RAB5C, VAPA, ATP6AP2, RHOA, PTAR1, TRAPPC13, STX11, CSGALNACT2, TMEM200A, VAMP4, MRAP2, SRPRB, TMEM150A | ZNF207 | USP7, ERBB3, SF3A2, BUB3, ZC3H14, TXNDC5, HNRNPUL1, WDR77, HNRNPM, MAP2K2, POLR1B, HECW2, WBP4, SHMT2, MOV10, NXF1, ABCE1, NTRK1, EWSR1, RNPS1, UBR5, KPNB1, HSPH1, ZNF207, PUF60, SRSF11, DPY30, S100A9, SETD1A, CS, PA2G4, TRAP1, SND1, ANXA5, SNRPB2, EIF5B, GPI, IDH2, PDIA3, UBE2N |
| - Retained PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Still interaction with |
| - Lost PPIs in in-frame fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
| - Retained PPIs, but lost function due to frame-shift fusion. |
| Partner | Gene | Hbp | Tbp | ENST | Strand | BPexon | TotalExon | Protein feature loci | *BPloci | TotalLen | Interaction lost with |
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RelatedDrugs for GOSR1_ZNF207 |
| Drugs targeting genes involved in this fusion gene. (DrugBank Version 5.1.0 2018-04-02) |
| Partner | Gene | UniProtAcc | DrugBank ID | Drug name | Drug activity | Drug type | Drug status |
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RelatedDiseases for GOSR1_ZNF207 |
| Diseases associated with fusion partners. (DisGeNet 4.0) |
| Partner | Gene | Disease ID | Disease name | # pubmeds | Source |
Copyright 2018-Present -The University of Texas Health Science Center at Houston (UTHealth)
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